MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_014654	CAA	2	6	403498	403503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142726
11003	NC_014654	CTG	2	6	403509	403514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142726
11004	NC_014654	CTG	2	6	403533	403538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142726
11005	NC_014654	ATA	2	6	403545	403550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142726
11006	NC_014654	CAG	2	6	403560	403565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142726
11007	NC_014654	CTAAAA	2	12	403566	403577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312142726
11008	NC_014654	A	6	6	403574	403579	100 %	0 %	0 %	0 %	312142726
11009	NC_014654	GCT	3	9	403604	403612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142726
11010	NC_014654	AGC	2	6	403625	403630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142726
11011	NC_014654	GCA	2	6	403689	403694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142726
11012	NC_014654	T	6	6	403707	403712	0 %	100 %	0 %	0 %	312142726
11013	NC_014654	GAA	2	6	403713	403718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142726
11014	NC_014654	T	6	6	403736	403741	0 %	100 %	0 %	0 %	312142726
11015	NC_014654	A	8	8	403755	403762	100 %	0 %	0 %	0 %	312142726
11016	NC_014654	ACTA	2	8	403781	403788	50 %	25 %	0 %	25 %	312142726
11017	NC_014654	A	6	6	403788	403793	100 %	0 %	0 %	0 %	312142726
11018	NC_014654	CTT	2	6	403798	403803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142726
11019	NC_014654	ATG	2	6	403860	403865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142726
11020	NC_014654	ATT	2	6	403876	403881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142726
11021	NC_014654	A	6	6	403892	403897	100 %	0 %	0 %	0 %	312142726
11022	NC_014654	GAAA	2	8	403940	403947	75 %	0 %	25 %	0 %	312142726
11023	NC_014654	ATT	2	6	403953	403958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142726
11024	NC_014654	AT	3	6	403991	403996	50 %	50 %	0 %	0 %	312142726
11025	NC_014654	TAT	2	6	404032	404037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142726
11026	NC_014654	T	6	6	404037	404042	0 %	100 %	0 %	0 %	312142726
11027	NC_014654	ATA	2	6	404070	404075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_014654	CCGC	2	8	404197	404204	0 %	0 %	25 %	75 %	312142727
11029	NC_014654	GAATA	2	10	404206	404215	60 %	20 %	20 %	0 %	312142727
11030	NC_014654	AGT	2	6	404222	404227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142727
11031	NC_014654	A	7	7	404234	404240	100 %	0 %	0 %	0 %	312142727
11032	NC_014654	AGA	2	6	404249	404254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142727
11033	NC_014654	GA	3	6	404319	404324	50 %	0 %	50 %	0 %	312142727
11034	NC_014654	GAA	3	9	404337	404345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142727
11035	NC_014654	TGA	2	6	404372	404377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142727
11036	NC_014654	ATC	2	6	404433	404438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142727
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11039	NC_014654	AGAAT	2	10	404511	404520	60 %	20 %	20 %	0 %	312142727
11040	NC_014654	TGG	2	6	404558	404563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142727
11041	NC_014654	CTG	2	6	404588	404593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142727
11042	NC_014654	TATC	2	8	404623	404630	25 %	50 %	0 %	25 %	312142727
11043	NC_014654	A	7	7	404639	404645	100 %	0 %	0 %	0 %	312142727
11044	NC_014654	A	6	6	404739	404744	100 %	0 %	0 %	0 %	312142727
11045	NC_014654	AC	3	6	404819	404824	50 %	0 %	0 %	50 %	312142727
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11053	NC_014654	ATG	2	6	405132	405137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142728
11054	NC_014654	TGTC	2	8	405148	405155	0 %	50 %	25 %	25 %	312142728
11055	NC_014654	T	6	6	405192	405197	0 %	100 %	0 %	0 %	312142728
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11061	NC_014654	AAT	2	6	405515	405520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142729
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11087	NC_014654	AG	3	6	406533	406538	50 %	0 %	50 %	0 %	312142730
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11097	NC_014654	AG	4	8	406840	406847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11105	NC_014654	TAG	2	6	407081	407086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142731
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11107	NC_014654	GATTAT	2	12	407122	407133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312142731
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11110	NC_014654	GTACT	2	10	407235	407244	20 %	40 %	20 %	20 %	312142731
11111	NC_014654	ACCG	2	8	407315	407322	25 %	0 %	25 %	50 %	312142731
11112	NC_014654	GAA	2	6	407335	407340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142731
11113	NC_014654	AATGA	2	10	407434	407443	60 %	20 %	20 %	0 %	312142731
11114	NC_014654	TGA	2	6	407466	407471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142731
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11235	NC_014654	CACTGC	2	12	412580	412591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312142736
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11239	NC_014654	TTTAA	2	10	412864	412873	40 %	60 %	0 %	0 %	312142736
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11242	NC_014654	A	6	6	412973	412978	100 %	0 %	0 %	0 %	312142736
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