MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014654	GAA	2	6	365497	365502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142691
10002	NC_014654	ATT	2	6	365519	365524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142691
10003	NC_014654	TATT	2	8	365530	365537	25 %	75 %	0 %	0 %	312142691
10004	NC_014654	AAG	2	6	365541	365546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142691
10005	NC_014654	T	6	6	365668	365673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_014654	T	6	6	365675	365680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_014654	AAT	2	6	365687	365692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_014654	A	6	6	365714	365719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_014654	TAAT	2	8	365736	365743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_014654	TA	3	6	365744	365749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_014654	AAG	2	6	365752	365757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_014654	ATTAA	2	10	365763	365772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_014654	GTG	2	6	365801	365806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142692
10014	NC_014654	TGA	3	9	365830	365838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142692
10015	NC_014654	CAA	2	6	365856	365861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142692
10016	NC_014654	AAT	2	6	365867	365872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142692
10017	NC_014654	AT	3	6	365875	365880	50 %	50 %	0 %	0 %	312142692
10018	NC_014654	GGT	2	6	365888	365893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142692
10019	NC_014654	GGA	2	6	365917	365922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142692
10020	NC_014654	TAA	2	6	365928	365933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142692
10021	NC_014654	AGA	2	6	365944	365949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142692
10022	NC_014654	TTCA	2	8	365964	365971	25 %	50 %	0 %	25 %	312142692
10023	NC_014654	GCT	2	6	365977	365982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142692
10024	NC_014654	ATG	2	6	366078	366083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142692
10025	NC_014654	GTGG	2	8	366100	366107	0 %	25 %	75 %	0 %	312142692
10026	NC_014654	ATT	2	6	366154	366159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142692
10027	NC_014654	TTA	2	6	366214	366219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142692
10028	NC_014654	AAT	2	6	366228	366233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_014654	ATTAA	2	10	366240	366249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_014654	ATT	2	6	366259	366264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_014654	ATTA	2	8	366273	366280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_014654	TAA	3	9	366281	366289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_014654	AAATT	2	10	366295	366304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_014654	CAG	2	6	366357	366362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_014654	GAT	2	6	366369	366374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_014654	A	7	7	366379	366385	100 %	0 %	0 %	0 %	312142693
10037	NC_014654	CAG	2	6	366419	366424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142693
10038	NC_014654	TAAT	2	8	366425	366432	50 %	50 %	0 %	0 %	312142693
10039	NC_014654	A	7	7	366462	366468	100 %	0 %	0 %	0 %	312142693
10040	NC_014654	CAG	2	6	366470	366475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142693
10041	NC_014654	TCT	2	6	366516	366521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142693
10042	NC_014654	A	6	6	366548	366553	100 %	0 %	0 %	0 %	312142693
10043	NC_014654	GAATTA	2	12	366562	366573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312142693
10044	NC_014654	GATC	2	8	366618	366625	25 %	25 %	25 %	25 %	312142693
10045	NC_014654	ATG	2	6	366629	366634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142693
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10047	NC_014654	AGA	2	6	366672	366677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142693
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10050	NC_014654	TAA	2	6	366815	366820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142693
10051	NC_014654	AT	3	6	366855	366860	50 %	50 %	0 %	0 %	312142693
10052	NC_014654	CAG	2	6	366891	366896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142693
10053	NC_014654	ATC	2	6	366922	366927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142693
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10055	NC_014654	GGCT	2	8	366949	366956	0 %	25 %	50 %	25 %	312142693
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10057	NC_014654	TATC	2	8	367008	367015	25 %	50 %	0 %	25 %	312142693
10058	NC_014654	GAAAA	2	10	367060	367069	80 %	0 %	20 %	0 %	312142693
10059	NC_014654	AT	3	6	367131	367136	50 %	50 %	0 %	0 %	312142693
10060	NC_014654	A	6	6	367177	367182	100 %	0 %	0 %	0 %	312142693
10061	NC_014654	TGG	2	6	367185	367190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142693
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10066	NC_014654	CTGG	2	8	367348	367355	0 %	25 %	50 %	25 %	312142693
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10069	NC_014654	GTG	2	6	367762	367767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142694
10070	NC_014654	GTA	2	6	367768	367773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142694
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10072	NC_014654	TTA	2	6	367867	367872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142694
10073	NC_014654	TAT	2	6	367898	367903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142694
10074	NC_014654	AC	3	6	367922	367927	50 %	0 %	0 %	50 %	312142694
10075	NC_014654	GGAA	2	8	367943	367950	50 %	0 %	50 %	0 %	312142694
10076	NC_014654	CAG	2	6	367957	367962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142694
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10082	NC_014654	CAG	2	6	368169	368174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142694
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10088	NC_014654	CAG	2	6	368423	368428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142694
10089	NC_014654	CAA	2	6	368437	368442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142694
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10093	NC_014654	ATT	2	6	368619	368624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_014654	CTTT	2	8	368643	368650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10095	NC_014654	GTTAA	2	10	368687	368696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_014654	AGCTA	2	10	368741	368750	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10097	NC_014654	ATT	2	6	368761	368766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_014654	AT	3	6	368825	368830	50 %	50 %	0 %	0 %	312142695
10099	NC_014654	GA	3	6	368870	368875	50 %	0 %	50 %	0 %	312142695
10100	NC_014654	GCA	3	9	368892	368900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142695
10101	NC_014654	A	7	7	368925	368931	100 %	0 %	0 %	0 %	312142695
10102	NC_014654	TCA	2	6	368932	368937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142695
10103	NC_014654	AAAC	2	8	369079	369086	75 %	0 %	0 %	25 %	312142695
10104	NC_014654	A	6	6	369120	369125	100 %	0 %	0 %	0 %	312142695
10105	NC_014654	AGC	2	6	369150	369155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142695
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10107	NC_014654	TGC	2	6	369224	369229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142695
10108	NC_014654	CAA	2	6	369251	369256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142695
10109	NC_014654	GATA	2	8	369335	369342	50 %	25 %	25 %	0 %	312142695
10110	NC_014654	GT	3	6	369383	369388	0 %	50 %	50 %	0 %	312142695
10111	NC_014654	AGC	2	6	369448	369453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142695
10112	NC_014654	T	7	7	369471	369477	0 %	100 %	0 %	0 %	312142695
10113	NC_014654	CAC	2	6	369541	369546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142695
10114	NC_014654	AAT	2	6	369563	369568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142696
10115	NC_014654	ATA	2	6	369607	369612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142696
10116	NC_014654	ATC	2	6	369658	369663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142696
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10121	NC_014654	AGGCT	2	10	369927	369936	20 %	20 %	40 %	20 %	312142696
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10123	NC_014654	GAT	2	6	369969	369974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142696
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10236	NC_014654	T	6	6	373899	373904	0 %	100 %	0 %	0 %	312142700
10237	NC_014654	AAG	2	6	373976	373981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142700
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10241	NC_014654	TCA	2	6	374066	374071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142700
10242	NC_014654	T	7	7	374095	374101	0 %	100 %	0 %	0 %	312142700
10243	NC_014654	T	8	8	374151	374158	0 %	100 %	0 %	0 %	312142700
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10493	NC_014654	A	6	6	384236	384241	100 %	0 %	0 %	0 %	312142709
10494	NC_014654	TGC	2	6	384329	384334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142709
10495	NC_014654	CTG	2	6	384345	384350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142709
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10498	NC_014654	AATTT	2	10	384519	384528	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_014654	TA	4	8	384545	384552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_014654	TTGT	2	8	384583	384590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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