MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014654	TGA	2	6	251519	251524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142609
7002	NC_014654	TCA	2	6	251528	251533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142609
7003	NC_014654	GCA	2	6	251535	251540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142609
7004	NC_014654	ATA	2	6	251620	251625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142609
7005	NC_014654	AAT	3	9	251646	251654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142609
7006	NC_014654	AT	3	6	251724	251729	50 %	50 %	0 %	0 %	312142609
7007	NC_014654	AAG	2	6	251734	251739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142609
7008	NC_014654	GAA	2	6	251748	251753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142609
7009	NC_014654	ATTA	2	8	251754	251761	50 %	50 %	0 %	0 %	312142609
7010	NC_014654	A	6	6	251844	251849	100 %	0 %	0 %	0 %	312142609
7011	NC_014654	AT	3	6	251900	251905	50 %	50 %	0 %	0 %	312142609
7012	NC_014654	ATT	2	6	251911	251916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142609
7013	NC_014654	A	7	7	251999	252005	100 %	0 %	0 %	0 %	312142609
7014	NC_014654	A	6	6	252008	252013	100 %	0 %	0 %	0 %	312142609
7015	NC_014654	TCTT	2	8	252088	252095	0 %	75 %	0 %	25 %	312142609
7016	NC_014654	GTA	2	6	252114	252119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142609
7017	NC_014654	CAG	2	6	252126	252131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142609
7018	NC_014654	ATTT	2	8	252334	252341	25 %	75 %	0 %	0 %	312142609
7019	NC_014654	GAA	2	6	252342	252347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142609
7020	NC_014654	GAAA	2	8	252350	252357	75 %	0 %	25 %	0 %	312142609
7021	NC_014654	ATT	2	6	252406	252411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142609
7022	NC_014654	AGA	2	6	252417	252422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142609
7023	NC_014654	ATT	2	6	252469	252474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142609
7024	NC_014654	A	6	6	252492	252497	100 %	0 %	0 %	0 %	312142609
7025	NC_014654	AAAT	2	8	252529	252536	75 %	25 %	0 %	0 %	312142609
7026	NC_014654	AGA	2	6	252569	252574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142609
7027	NC_014654	TA	3	6	252613	252618	50 %	50 %	0 %	0 %	312142609
7028	NC_014654	AGGT	2	8	252682	252689	25 %	25 %	50 %	0 %	312142609
7029	NC_014654	CTTT	2	8	252690	252697	0 %	75 %	0 %	25 %	312142609
7030	NC_014654	AAT	2	6	252714	252719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142609
7031	NC_014654	ATA	2	6	252742	252747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142609
7032	NC_014654	A	7	7	252777	252783	100 %	0 %	0 %	0 %	312142609
7033	NC_014654	ATG	2	6	252847	252852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142609
7034	NC_014654	A	6	6	252971	252976	100 %	0 %	0 %	0 %	312142609
7035	NC_014654	A	6	6	252989	252994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_014654	GATAAA	2	12	253021	253032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312142610
7037	NC_014654	TA	3	6	253033	253038	50 %	50 %	0 %	0 %	312142610
7038	NC_014654	AGC	2	6	253143	253148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142610
7039	NC_014654	ACTA	2	8	253170	253177	50 %	25 %	0 %	25 %	312142610
7040	NC_014654	ATA	2	6	253223	253228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142610
7041	NC_014654	GTTAAT	2	12	253234	253245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312142610
7042	NC_014654	GGT	2	6	253252	253257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142610
7043	NC_014654	AAT	2	6	253263	253268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142610
7044	NC_014654	ATA	2	6	253285	253290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142610
7045	NC_014654	GGT	2	6	253324	253329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142610
7046	NC_014654	AAACC	2	10	253342	253351	60 %	0 %	0 %	40 %	312142610
7047	NC_014654	TAAA	2	8	253369	253376	75 %	25 %	0 %	0 %	312142610
7048	NC_014654	ATTGTT	2	12	253382	253393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_014654	ATT	2	6	253395	253400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_014654	AAG	2	6	253417	253422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_014654	AAT	2	6	253443	253448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_014654	ATTA	2	8	253466	253473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_014654	AT	3	6	253478	253483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_014654	GAGGAA	2	12	253710	253721	50 %	0 %	50 %	0 %	312142611
7055	NC_014654	AAT	2	6	253745	253750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142611
7056	NC_014654	T	6	6	253781	253786	0 %	100 %	0 %	0 %	312142611
7057	NC_014654	TTG	2	6	253858	253863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142611
7058	NC_014654	TA	3	6	253893	253898	50 %	50 %	0 %	0 %	312142611
7059	NC_014654	TGA	2	6	253905	253910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142611
7060	NC_014654	TAA	2	6	253934	253939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_014654	A	6	6	253948	253953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_014654	GGTG	2	8	254008	254015	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_014654	T	6	6	254035	254040	0 %	100 %	0 %	0 %	312142612
7064	NC_014654	GAA	2	6	254051	254056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7065	NC_014654	AGA	2	6	254074	254079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7066	NC_014654	AT	3	6	254093	254098	50 %	50 %	0 %	0 %	312142612
7067	NC_014654	TGC	2	6	254113	254118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142612
7068	NC_014654	TAA	2	6	254119	254124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7069	NC_014654	GAT	2	6	254146	254151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142612
7070	NC_014654	TGA	2	6	254179	254184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142612
7071	NC_014654	AGA	3	9	254245	254253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7072	NC_014654	ATAAG	2	10	254271	254280	60 %	20 %	20 %	0 %	312142612
7073	NC_014654	AAG	3	9	254322	254330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7074	NC_014654	AT	3	6	254349	254354	50 %	50 %	0 %	0 %	312142612
7075	NC_014654	TA	3	6	254382	254387	50 %	50 %	0 %	0 %	312142612
7076	NC_014654	GAA	2	6	254402	254407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7077	NC_014654	AAG	2	6	254426	254431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7078	NC_014654	AGA	2	6	254434	254439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7079	NC_014654	AAG	2	6	254514	254519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7080	NC_014654	A	6	6	254552	254557	100 %	0 %	0 %	0 %	312142612
7081	NC_014654	AAG	2	6	254583	254588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7082	NC_014654	AAGG	2	8	254615	254622	50 %	0 %	50 %	0 %	312142612
7083	NC_014654	A	8	8	254628	254635	100 %	0 %	0 %	0 %	312142612
7084	NC_014654	AAG	2	6	254702	254707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7085	NC_014654	CTA	2	6	254711	254716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142612
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7089	NC_014654	GAA	2	6	254897	254902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7090	NC_014654	ATT	2	6	254938	254943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142612
7091	NC_014654	GAG	2	6	254945	254950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142612
7092	NC_014654	AAT	2	6	254951	254956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7093	NC_014654	ATA	2	6	254990	254995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7094	NC_014654	ATT	2	6	255006	255011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142612
7095	NC_014654	GAA	2	6	255029	255034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7096	NC_014654	ATGAAG	2	12	255081	255092	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312142612
7097	NC_014654	TGC	2	6	255106	255111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142612
7098	NC_014654	AAT	2	6	255155	255160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7099	NC_014654	ATA	2	6	255221	255226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7100	NC_014654	T	6	6	255265	255270	0 %	100 %	0 %	0 %	312142612
7101	NC_014654	ACA	2	6	255273	255278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142612
7102	NC_014654	GAT	2	6	255305	255310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142612
7103	NC_014654	AAAGAA	2	12	255338	255349	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312142612
7104	NC_014654	A	8	8	255354	255361	100 %	0 %	0 %	0 %	312142612
7105	NC_014654	AAT	2	6	255452	255457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7106	NC_014654	T	6	6	255511	255516	0 %	100 %	0 %	0 %	312142612
7107	NC_014654	A	6	6	255565	255570	100 %	0 %	0 %	0 %	312142612
7108	NC_014654	ATT	2	6	255634	255639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142612
7109	NC_014654	T	7	7	255643	255649	0 %	100 %	0 %	0 %	312142612
7110	NC_014654	AG	4	8	255653	255660	50 %	0 %	50 %	0 %	312142612
7111	NC_014654	TGA	3	9	255673	255681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142612
7112	NC_014654	ATA	2	6	255687	255692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7113	NC_014654	ACT	2	6	255702	255707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142612
7114	NC_014654	TAA	2	6	255727	255732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142612
7115	NC_014654	A	8	8	255753	255760	100 %	0 %	0 %	0 %	312142612
7116	NC_014654	GATA	2	8	255763	255770	50 %	25 %	25 %	0 %	312142612
7117	NC_014654	AAAG	2	8	255898	255905	75 %	0 %	25 %	0 %	312142612
7118	NC_014654	GAA	2	6	255946	255951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7119	NC_014654	A	6	6	255961	255966	100 %	0 %	0 %	0 %	312142612
7120	NC_014654	AGA	2	6	256012	256017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7121	NC_014654	CAA	2	6	256021	256026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142612
7122	NC_014654	CTT	2	6	256041	256046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142612
7123	NC_014654	AGG	2	6	256053	256058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142612
7124	NC_014654	TTA	2	6	256124	256129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142612
7125	NC_014654	AGA	2	6	256138	256143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142612
7126	NC_014654	ATG	2	6	256167	256172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142612
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7128	NC_014654	ATA	2	6	256270	256275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7130	NC_014654	A	6	6	256335	256340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7251	NC_014654	ATT	2	6	261494	261499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142615
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7254	NC_014654	CTT	2	6	261545	261550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142615
7255	NC_014654	TCA	2	6	261615	261620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142615
7256	NC_014654	A	7	7	261649	261655	100 %	0 %	0 %	0 %	312142615
7257	NC_014654	AGA	2	6	261689	261694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142615
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7261	NC_014654	AT	3	6	261820	261825	50 %	50 %	0 %	0 %	312142615
7262	NC_014654	A	6	6	261842	261847	100 %	0 %	0 %	0 %	312142615
7263	NC_014654	T	7	7	261891	261897	0 %	100 %	0 %	0 %	312142615
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7276	NC_014654	TA	3	6	262375	262380	50 %	50 %	0 %	0 %	312142615
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7288	NC_014654	TATGG	2	10	262753	262762	20 %	40 %	40 %	0 %	312142615
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7338	NC_014654	A	7	7	264868	264874	100 %	0 %	0 %	0 %	312142615
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7342	NC_014654	CTTTGA	2	12	265007	265018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312142615
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7348	NC_014654	CTT	2	6	265416	265421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7369	NC_014654	A	6	6	266357	266362	100 %	0 %	0 %	0 %	312142617
7370	NC_014654	AAAG	2	8	266378	266385	75 %	0 %	25 %	0 %	312142617
7371	NC_014654	A	8	8	266395	266402	100 %	0 %	0 %	0 %	312142617
7372	NC_014654	ATT	2	6	266406	266411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142617
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7377	NC_014654	TTG	2	6	266525	266530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142617
7378	NC_014654	GAT	2	6	266576	266581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142617
7379	NC_014654	GAA	2	6	266584	266589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142617
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