MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_014654	ATT	2	6	2325155	2325160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63002	NC_014654	TTA	2	6	2325174	2325179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63003	NC_014654	GGA	2	6	2325199	2325204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312144436
63004	NC_014654	T	7	7	2325291	2325297	0 %	100 %	0 %	0 %	312144436
63005	NC_014654	ATT	2	6	2325319	2325324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144436
63006	NC_014654	TTC	2	6	2325357	2325362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144436
63007	NC_014654	TTC	2	6	2325381	2325386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144436
63008	NC_014654	TTC	2	6	2325494	2325499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144436
63009	NC_014654	TCT	2	6	2325532	2325537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144436
63010	NC_014654	A	6	6	2325544	2325549	100 %	0 %	0 %	0 %	312144436
63011	NC_014654	TATT	2	8	2325650	2325657	25 %	75 %	0 %	0 %	312144436
63012	NC_014654	CAT	2	6	2325668	2325673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144436
63013	NC_014654	TTA	2	6	2325700	2325705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144436
63014	NC_014654	TTA	3	9	2325727	2325735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63015	NC_014654	CTCAT	2	10	2325736	2325745	20 %	40 %	0 %	40 %	312144437
63016	NC_014654	TTA	2	6	2325858	2325863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144437
63017	NC_014654	GCA	2	6	2325869	2325874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144437
63018	NC_014654	T	7	7	2325883	2325889	0 %	100 %	0 %	0 %	312144437
63019	NC_014654	T	7	7	2325910	2325916	0 %	100 %	0 %	0 %	312144437
63020	NC_014654	T	6	6	2325963	2325968	0 %	100 %	0 %	0 %	312144437
63021	NC_014654	TCA	2	6	2325981	2325986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144437
63022	NC_014654	T	6	6	2325996	2326001	0 %	100 %	0 %	0 %	312144437
63023	NC_014654	TCT	2	6	2326103	2326108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144437
63024	NC_014654	CTGC	2	8	2326167	2326174	0 %	25 %	25 %	50 %	312144437
63025	NC_014654	A	6	6	2326272	2326277	100 %	0 %	0 %	0 %	312144437
63026	NC_014654	CAGTT	2	10	2326298	2326307	20 %	40 %	20 %	20 %	312144437
63027	NC_014654	CAGC	2	8	2326311	2326318	25 %	0 %	25 %	50 %	312144437
63028	NC_014654	T	7	7	2326332	2326338	0 %	100 %	0 %	0 %	312144437
63029	NC_014654	CAA	2	6	2326344	2326349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144437
63030	NC_014654	GCT	2	6	2326400	2326405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144437
63031	NC_014654	GATA	2	8	2326409	2326416	50 %	25 %	25 %	0 %	312144437
63032	NC_014654	CTT	2	6	2326422	2326427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144437
63033	NC_014654	ACA	2	6	2326448	2326453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144437
63034	NC_014654	TTC	2	6	2326527	2326532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144437
63035	NC_014654	C	6	6	2326532	2326537	0 %	0 %	0 %	100 %	312144437
63036	NC_014654	TGCC	2	8	2326551	2326558	0 %	25 %	25 %	50 %	312144437
63037	NC_014654	GAA	2	6	2326562	2326567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144437
63038	NC_014654	GAA	2	6	2326583	2326588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144437
63039	NC_014654	ACC	2	6	2326625	2326630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144437
63040	NC_014654	CAT	2	6	2326677	2326682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144437
63041	NC_014654	ATT	2	6	2326688	2326693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144437
63042	NC_014654	TCT	2	6	2326781	2326786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144437
63043	NC_014654	T	6	6	2326832	2326837	0 %	100 %	0 %	0 %	312144437
63044	NC_014654	AAT	2	6	2326872	2326877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144437
63045	NC_014654	ATC	2	6	2326909	2326914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144437
63046	NC_014654	T	6	6	2326945	2326950	0 %	100 %	0 %	0 %	312144437
63047	NC_014654	CAT	2	6	2327002	2327007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63048	NC_014654	T	6	6	2327014	2327019	0 %	100 %	0 %	0 %	312144438
63049	NC_014654	CAG	2	6	2327039	2327044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144438
63050	NC_014654	TTC	2	6	2327084	2327089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144438
63051	NC_014654	ACC	2	6	2327105	2327110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144438
63052	NC_014654	TTC	2	6	2327147	2327152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144438
63053	NC_014654	TGT	2	6	2327166	2327171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144438
63054	NC_014654	TCC	2	6	2327214	2327219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144438
63055	NC_014654	TTC	2	6	2327321	2327326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144438
63056	NC_014654	TA	3	6	2327338	2327343	50 %	50 %	0 %	0 %	312144438
63057	NC_014654	ATA	2	6	2327396	2327401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144438
63058	NC_014654	TCA	2	6	2327553	2327558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144438
63059	NC_014654	T	6	6	2327583	2327588	0 %	100 %	0 %	0 %	312144438
63060	NC_014654	AAT	2	6	2327776	2327781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144438
63061	NC_014654	CTT	2	6	2327812	2327817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144438
63062	NC_014654	TGC	2	6	2327822	2327827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144438
63063	NC_014654	GGT	2	6	2327851	2327856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144438
63064	NC_014654	TTC	2	6	2327864	2327869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144438
63065	NC_014654	ATC	2	6	2327891	2327896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144438
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63067	NC_014654	CA	3	6	2328102	2328107	50 %	0 %	0 %	50 %	312144438
63068	NC_014654	AAC	2	6	2328157	2328162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144438
63069	NC_014654	CAT	2	6	2328274	2328279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144438
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63071	NC_014654	T	7	7	2328292	2328298	0 %	100 %	0 %	0 %	312144438
63072	NC_014654	AATT	2	8	2328389	2328396	50 %	50 %	0 %	0 %	312144438
63073	NC_014654	TTC	2	6	2328402	2328407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144438
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63075	NC_014654	TGCT	2	8	2328446	2328453	0 %	50 %	25 %	25 %	312144438
63076	NC_014654	T	6	6	2328470	2328475	0 %	100 %	0 %	0 %	312144438
63077	NC_014654	TAT	2	6	2328478	2328483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144438
63078	NC_014654	TTAA	2	8	2328515	2328522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63079	NC_014654	TA	3	6	2328532	2328537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63080	NC_014654	A	7	7	2328583	2328589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63081	NC_014654	AT	3	6	2328618	2328623	50 %	50 %	0 %	0 %	312144439
63082	NC_014654	GCT	2	6	2328674	2328679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144439
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63084	NC_014654	TGG	2	6	2328788	2328793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144439
63085	NC_014654	CT	3	6	2328802	2328807	0 %	50 %	0 %	50 %	312144439
63086	NC_014654	TCT	2	6	2328831	2328836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144439
63087	NC_014654	T	6	6	2328850	2328855	0 %	100 %	0 %	0 %	312144439
63088	NC_014654	TTGGTC	2	12	2328916	2328927	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312144439
63089	NC_014654	GTT	3	9	2328929	2328937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144439
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63091	NC_014654	ATTT	3	12	2329058	2329069	25 %	75 %	0 %	0 %	312144440
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63094	NC_014654	ATG	3	9	2329105	2329113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144440
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63096	NC_014654	T	6	6	2329132	2329137	0 %	100 %	0 %	0 %	312144440
63097	NC_014654	ACT	2	6	2329166	2329171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144440
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63100	NC_014654	A	6	6	2329399	2329404	100 %	0 %	0 %	0 %	312144440
63101	NC_014654	GTT	2	6	2329419	2329424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144440
63102	NC_014654	TAT	2	6	2329469	2329474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63103	NC_014654	GAA	2	6	2329568	2329573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144441
63104	NC_014654	CTG	2	6	2329611	2329616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144441
63105	NC_014654	CCA	2	6	2329676	2329681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144441
63106	NC_014654	CAT	2	6	2329707	2329712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144441
63107	NC_014654	ATA	2	6	2329756	2329761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144441
63108	NC_014654	TTTTA	2	10	2329780	2329789	20 %	80 %	0 %	0 %	312144441
63109	NC_014654	T	7	7	2329811	2329817	0 %	100 %	0 %	0 %	312144441
63110	NC_014654	CTT	3	9	2329821	2329829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144441
63111	NC_014654	GCT	2	6	2329847	2329852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144441
63112	NC_014654	CCT	2	6	2329910	2329915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144441
63113	NC_014654	GCA	2	6	2329916	2329921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144441
63114	NC_014654	CAG	2	6	2329929	2329934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144441
63115	NC_014654	TTC	2	6	2329935	2329940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144441
63116	NC_014654	TTA	2	6	2329946	2329951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144441
63117	NC_014654	CAG	2	6	2330019	2330024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144441
63118	NC_014654	T	6	6	2330101	2330106	0 %	100 %	0 %	0 %	312144441
63119	NC_014654	CAT	2	6	2330226	2330231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144441
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63225	NC_014654	T	6	6	2334797	2334802	0 %	100 %	0 %	0 %	312144445
63226	NC_014654	AAG	2	6	2334805	2334810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144445
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63228	NC_014654	A	6	6	2334951	2334956	100 %	0 %	0 %	0 %	312144445
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63232	NC_014654	ATA	2	6	2335111	2335116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144445
63233	NC_014654	A	6	6	2335138	2335143	100 %	0 %	0 %	0 %	312144445
63234	NC_014654	CAA	2	6	2335148	2335153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144445
63235	NC_014654	AACC	2	8	2335186	2335193	50 %	0 %	0 %	50 %	312144445
63236	NC_014654	ATCA	2	8	2335211	2335218	50 %	25 %	0 %	25 %	312144445
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63482	NC_014654	TAT	2	6	2342979	2342984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144452
63483	NC_014654	TTA	2	6	2343008	2343013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144452
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63485	NC_014654	ACT	2	6	2343140	2343145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144452
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