MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62502	NC_014654	CAT	2	6	2306025	2306030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144419
62503	NC_014654	ATA	2	6	2306033	2306038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144419
62504	NC_014654	TTC	2	6	2306083	2306088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144419
62505	NC_014654	TGC	2	6	2306128	2306133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144419
62506	NC_014654	GCT	2	6	2306141	2306146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144419
62507	NC_014654	CAT	2	6	2306148	2306153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144419
62508	NC_014654	TAC	2	6	2306172	2306177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144419
62509	NC_014654	TTC	2	6	2306284	2306289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144419
62510	NC_014654	T	7	7	2306346	2306352	0 %	100 %	0 %	0 %	312144419
62511	NC_014654	CTG	2	6	2306361	2306366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144419
62512	NC_014654	ATT	2	6	2306402	2306407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144419
62513	NC_014654	CCT	2	6	2306412	2306417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62514	NC_014654	TTTTA	2	10	2306451	2306460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62515	NC_014654	AT	5	10	2306463	2306472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62516	NC_014654	TAAA	2	8	2306474	2306481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62517	NC_014654	TAT	2	6	2306492	2306497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62518	NC_014654	T	7	7	2306506	2306512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62519	NC_014654	AAT	2	6	2306516	2306521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62520	NC_014654	TA	3	6	2306544	2306549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62521	NC_014654	ATA	3	9	2306547	2306555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62522	NC_014654	AAAAG	2	10	2306579	2306588	80 %	0 %	20 %	0 %	312144420
62523	NC_014654	TAT	3	9	2306589	2306597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144420
62524	NC_014654	TAG	2	6	2306603	2306608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144420
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62526	NC_014654	TA	3	6	2306631	2306636	50 %	50 %	0 %	0 %	312144420
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62537	NC_014654	A	6	6	2307112	2307117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62540	NC_014654	TTAA	2	8	2307155	2307162	50 %	50 %	0 %	0 %	312144421
62541	NC_014654	GCA	2	6	2307175	2307180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144421
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62544	NC_014654	ATT	2	6	2307304	2307309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144421
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62556	NC_014654	CTG	2	6	2307651	2307656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144421
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62584	NC_014654	A	7	7	2308857	2308863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62585	NC_014654	ATTTA	2	10	2308866	2308875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62592	NC_014654	CTT	2	6	2309089	2309094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144422
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62603	NC_014654	ATTCT	2	10	2309383	2309392	20 %	60 %	0 %	20 %	312144422
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62607	NC_014654	AAATCA	2	12	2309496	2309507	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312144422
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62613	NC_014654	TAT	2	6	2309687	2309692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144422
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62736	NC_014654	AT	3	6	2314500	2314505	50 %	50 %	0 %	0 %	312144426
62737	NC_014654	CTA	2	6	2314506	2314511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144426
62738	NC_014654	T	7	7	2314522	2314528	0 %	100 %	0 %	0 %	312144426
62739	NC_014654	AATATC	2	12	2314537	2314548	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312144426
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62741	NC_014654	CAA	2	6	2314680	2314685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144426
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62743	NC_014654	TGA	2	6	2314711	2314716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144426
62744	NC_014654	GTA	2	6	2314724	2314729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144426
62745	NC_014654	TAA	2	6	2314739	2314744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144426
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62748	NC_014654	TAT	2	6	2314796	2314801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144427
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62762	NC_014654	TCCC	2	8	2315255	2315262	0 %	25 %	0 %	75 %	312144428
62763	NC_014654	TCT	2	6	2315265	2315270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144428
62764	NC_014654	T	6	6	2315270	2315275	0 %	100 %	0 %	0 %	312144428
62765	NC_014654	ATA	2	6	2315299	2315304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144428
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62767	NC_014654	T	6	6	2315328	2315333	0 %	100 %	0 %	0 %	312144428
62768	NC_014654	ATC	2	6	2315346	2315351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144428
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62770	NC_014654	TTCAG	2	10	2315398	2315407	20 %	40 %	20 %	20 %	312144428
62771	NC_014654	ATC	3	9	2315422	2315430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144428
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62773	NC_014654	TC	3	6	2315440	2315445	0 %	50 %	0 %	50 %	312144428
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62777	NC_014654	TTC	2	6	2315673	2315678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144428
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62780	NC_014654	TGA	2	6	2315766	2315771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144428
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62783	NC_014654	ATCTT	2	10	2315917	2315926	20 %	60 %	0 %	20 %	312144428
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62789	NC_014654	ATA	2	6	2316314	2316319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144429
62790	NC_014654	CTG	3	9	2316321	2316329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144429
62791	NC_014654	T	7	7	2316334	2316340	0 %	100 %	0 %	0 %	312144429
62792	NC_014654	AGT	2	6	2316490	2316495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144429
62793	NC_014654	T	7	7	2316541	2316547	0 %	100 %	0 %	0 %	312144429
62794	NC_014654	ATT	2	6	2316568	2316573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144429
62795	NC_014654	CATT	2	8	2316605	2316612	25 %	50 %	0 %	25 %	312144429
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62799	NC_014654	CTG	2	6	2316731	2316736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144429
62800	NC_014654	CCTT	2	8	2316751	2316758	0 %	50 %	0 %	50 %	312144429
62801	NC_014654	CTG	2	6	2316759	2316764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144429
62802	NC_014654	TCT	2	6	2316827	2316832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144429
62803	NC_014654	TAT	2	6	2316894	2316899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144429
62804	NC_014654	TTC	2	6	2316907	2316912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144429
62805	NC_014654	CTTT	2	8	2316914	2316921	0 %	75 %	0 %	25 %	312144429
62806	NC_014654	GCA	2	6	2316926	2316931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144429
62807	NC_014654	TC	3	6	2316932	2316937	0 %	50 %	0 %	50 %	312144429
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62813	NC_014654	GCC	2	6	2317149	2317154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312144429
62814	NC_014654	A	6	6	2317178	2317183	100 %	0 %	0 %	0 %	312144429
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62816	NC_014654	ATCC	2	8	2317210	2317217	25 %	25 %	0 %	50 %	312144429
62817	NC_014654	TAC	2	6	2317353	2317358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144429
62818	NC_014654	TTA	2	6	2317410	2317415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144429
62819	NC_014654	TAA	2	6	2317429	2317434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144429
62820	NC_014654	TCC	2	6	2317447	2317452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62821	NC_014654	TCTA	2	8	2317468	2317475	25 %	50 %	0 %	25 %	312144430
62822	NC_014654	TAT	2	6	2317524	2317529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144430
62823	NC_014654	TCA	2	6	2317537	2317542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144430
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62826	NC_014654	CCA	2	6	2317651	2317656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144430
62827	NC_014654	CCAA	2	8	2317659	2317666	50 %	0 %	0 %	50 %	312144430
62828	NC_014654	GGTT	2	8	2317729	2317736	0 %	50 %	50 %	0 %	312144430
62829	NC_014654	CCA	2	6	2317750	2317755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144430
62830	NC_014654	GAA	2	6	2317855	2317860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144430
62831	NC_014654	GAA	2	6	2317939	2317944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144430
62832	NC_014654	GCC	2	6	2317990	2317995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312144430
62833	NC_014654	CTG	2	6	2318011	2318016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144430
62834	NC_014654	AT	3	6	2318074	2318079	50 %	50 %	0 %	0 %	312144430
62835	NC_014654	TTC	2	6	2318199	2318204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144430
62836	NC_014654	AGGATC	2	12	2318256	2318267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312144430
62837	NC_014654	ATCA	2	8	2318277	2318284	50 %	25 %	0 %	25 %	312144430
62838	NC_014654	AAC	2	6	2318322	2318327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144430
62839	NC_014654	TGG	2	6	2318334	2318339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144430
62840	NC_014654	CCA	2	6	2318344	2318349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144430
62841	NC_014654	CTG	2	6	2318405	2318410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144430
62842	NC_014654	CTA	2	6	2318429	2318434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144430
62843	NC_014654	GTT	2	6	2318479	2318484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144430
62844	NC_014654	CAG	2	6	2318510	2318515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144430
62845	NC_014654	AAGTTC	2	12	2318592	2318603	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312144430
62846	NC_014654	TGA	3	9	2318644	2318652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144430
62847	NC_014654	GAAAA	2	10	2318670	2318679	80 %	0 %	20 %	0 %	312144430
62848	NC_014654	TAA	2	6	2318693	2318698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144430
62849	NC_014654	TCA	2	6	2318707	2318712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144430
62850	NC_014654	TTC	2	6	2318732	2318737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144430
62851	NC_014654	TTTTA	2	10	2318745	2318754	20 %	80 %	0 %	0 %	312144430
62852	NC_014654	T	6	6	2318779	2318784	0 %	100 %	0 %	0 %	312144430
62853	NC_014654	TCAT	2	8	2318800	2318807	25 %	50 %	0 %	25 %	312144430
62854	NC_014654	GCA	2	6	2318870	2318875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144431
62855	NC_014654	CTG	2	6	2318896	2318901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144431
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62938	NC_014654	CAA	2	6	2322691	2322696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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62940	NC_014654	TTA	2	6	2322729	2322734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62941	NC_014654	ATT	2	6	2322776	2322781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62942	NC_014654	AT	3	6	2322782	2322787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62943	NC_014654	ATT	2	6	2322810	2322815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144434
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62955	NC_014654	TCCAT	2	10	2323220	2323229	20 %	40 %	0 %	40 %	312144434
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62957	NC_014654	T	6	6	2323330	2323335	0 %	100 %	0 %	0 %	312144434
62958	NC_014654	TAT	2	6	2323342	2323347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144434
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62963	NC_014654	TCTGGT	2	12	2323612	2323623	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312144434
62964	NC_014654	A	6	6	2323633	2323638	100 %	0 %	0 %	0 %	312144434
62965	NC_014654	T	6	6	2323697	2323702	0 %	100 %	0 %	0 %	312144434
62966	NC_014654	TATC	2	8	2323728	2323735	25 %	50 %	0 %	25 %	312144434
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62968	NC_014654	TAA	2	6	2323761	2323766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144434
62969	NC_014654	TCC	2	6	2323803	2323808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62970	NC_014654	T	6	6	2323839	2323844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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