MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61002	NC_014654	A	8	8	2251888	2251895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61003	NC_014654	TAA	2	6	2251908	2251913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144369
61004	NC_014654	ATT	2	6	2251933	2251938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144369
61005	NC_014654	T	7	7	2252064	2252070	0 %	100 %	0 %	0 %	312144369
61006	NC_014654	T	8	8	2252077	2252084	0 %	100 %	0 %	0 %	312144369
61007	NC_014654	CAT	2	6	2252114	2252119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144369
61008	NC_014654	TAAT	2	8	2252128	2252135	50 %	50 %	0 %	0 %	312144369
61009	NC_014654	CTT	2	6	2252138	2252143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144369
61010	NC_014654	ATTT	2	8	2252163	2252170	25 %	75 %	0 %	0 %	312144369
61011	NC_014654	TAT	2	6	2252171	2252176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144369
61012	NC_014654	T	6	6	2252200	2252205	0 %	100 %	0 %	0 %	312144369
61013	NC_014654	TTGGTC	2	12	2252282	2252293	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312144369
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61015	NC_014654	TAATTC	2	12	2252337	2252348	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312144369
61016	NC_014654	AAG	2	6	2252414	2252419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144369
61017	NC_014654	T	6	6	2252448	2252453	0 %	100 %	0 %	0 %	312144369
61018	NC_014654	TAAA	2	8	2252548	2252555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61019	NC_014654	TAT	2	6	2252557	2252562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61020	NC_014654	ATA	2	6	2252575	2252580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61021	NC_014654	A	6	6	2252596	2252601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61022	NC_014654	A	7	7	2252631	2252637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61023	NC_014654	TTA	2	6	2252641	2252646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61024	NC_014654	AAT	2	6	2252649	2252654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61025	NC_014654	TAA	2	6	2252658	2252663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61026	NC_014654	A	7	7	2252743	2252749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61027	NC_014654	TCC	2	6	2252775	2252780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61028	NC_014654	TA	3	6	2252781	2252786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61029	NC_014654	GGA	2	6	2252787	2252792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61030	NC_014654	TTA	2	6	2252804	2252809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61031	NC_014654	TAAA	2	8	2252831	2252838	75 %	25 %	0 %	0 %	312144370
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61035	NC_014654	GTT	2	6	2252961	2252966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144370
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61039	NC_014654	TA	3	6	2253209	2253214	50 %	50 %	0 %	0 %	312144370
61040	NC_014654	TCA	2	6	2253219	2253224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144370
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61042	NC_014654	GAT	2	6	2253268	2253273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144370
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61053	NC_014654	AT	3	6	2253540	2253545	50 %	50 %	0 %	0 %	312144370
61054	NC_014654	TCA	2	6	2253549	2253554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144370
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61056	NC_014654	T	6	6	2253619	2253624	0 %	100 %	0 %	0 %	312144370
61057	NC_014654	AAC	2	6	2253632	2253637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144370
61058	NC_014654	TAC	2	6	2253692	2253697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144370
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61063	NC_014654	TTC	2	6	2254025	2254030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144370
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61092	NC_014654	ATTT	2	8	2255384	2255391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61114	NC_014654	ATT	2	6	2256498	2256503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144372
61115	NC_014654	TGC	2	6	2256514	2256519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144372
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61117	NC_014654	TTA	2	6	2256615	2256620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144372
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61359	NC_014654	TCA	2	6	2265363	2265368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144381
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61365	NC_014654	TCT	2	6	2265606	2265611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144381
61366	NC_014654	GTA	2	6	2265624	2265629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144381
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61378	NC_014654	TAT	2	6	2265853	2265858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61379	NC_014654	TA	3	6	2265915	2265920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61380	NC_014654	ATA	2	6	2265931	2265936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61441	NC_014654	T	6	6	2267821	2267826	0 %	100 %	0 %	0 %	312144383
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61445	NC_014654	ATTT	2	8	2267922	2267929	25 %	75 %	0 %	0 %	312144384
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61459	NC_014654	A	6	6	2268347	2268352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61460	NC_014654	AAT	2	6	2268358	2268363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144385
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61463	NC_014654	T	7	7	2268476	2268482	0 %	100 %	0 %	0 %	312144385
61464	NC_014654	CAG	2	6	2268488	2268493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144385
61465	NC_014654	CAG	2	6	2268500	2268505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144385
61466	NC_014654	GCA	2	6	2268511	2268516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144385
61467	NC_014654	CTT	2	6	2268524	2268529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144385
61468	NC_014654	ATC	2	6	2268552	2268557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144385
61469	NC_014654	TCA	2	6	2268599	2268604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144385
61470	NC_014654	TTTTA	2	10	2268609	2268618	20 %	80 %	0 %	0 %	312144385
61471	NC_014654	T	6	6	2268621	2268626	0 %	100 %	0 %	0 %	312144385
61472	NC_014654	CTC	2	6	2268648	2268653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144385
61473	NC_014654	CTT	2	6	2268673	2268678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144385
61474	NC_014654	CTA	2	6	2268680	2268685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144385
61475	NC_014654	ATA	4	12	2268706	2268717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144385
61476	NC_014654	CATCTA	2	12	2268827	2268838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144385
61477	NC_014654	A	7	7	2268838	2268844	100 %	0 %	0 %	0 %	312144385
61478	NC_014654	ATTT	2	8	2268877	2268884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61479	NC_014654	TACC	2	8	2268899	2268906	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61480	NC_014654	AC	3	6	2268916	2268921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61481	NC_014654	AATA	2	8	2268924	2268931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61482	NC_014654	ATA	2	6	2268984	2268989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61483	NC_014654	ATTT	2	8	2268996	2269003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61484	NC_014654	CCA	2	6	2269027	2269032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61485	NC_014654	ATTT	2	8	2269062	2269069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61486	NC_014654	TTA	2	6	2269070	2269075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144386
61487	NC_014654	CTT	2	6	2269090	2269095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144386
61488	NC_014654	GT	3	6	2269099	2269104	0 %	50 %	50 %	0 %	312144386
61489	NC_014654	GA	3	6	2269110	2269115	50 %	0 %	50 %	0 %	312144386
61490	NC_014654	T	6	6	2269152	2269157	0 %	100 %	0 %	0 %	312144386
61491	NC_014654	CTT	2	6	2269168	2269173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144386
61492	NC_014654	ATC	2	6	2269196	2269201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144386
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61494	NC_014654	TTAA	2	8	2269269	2269276	50 %	50 %	0 %	0 %	312144386
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61499	NC_014654	ATT	2	6	2269467	2269472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144386
61500	NC_014654	TCT	2	6	2269552	2269557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144387

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