MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014654	AGA	2	6	197476	197481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142572
5502	NC_014654	TGA	2	6	197482	197487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142572
5503	NC_014654	TAA	2	6	197533	197538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142572
5504	NC_014654	A	7	7	197537	197543	100 %	0 %	0 %	0 %	312142572
5505	NC_014654	TGGT	2	8	197544	197551	0 %	50 %	50 %	0 %	312142572
5506	NC_014654	AGC	2	6	197569	197574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142572
5507	NC_014654	TTAA	2	8	197615	197622	50 %	50 %	0 %	0 %	312142572
5508	NC_014654	AGA	2	6	197632	197637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142572
5509	NC_014654	AGA	2	6	197641	197646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142572
5510	NC_014654	ATG	2	6	197694	197699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142572
5511	NC_014654	TTCA	2	8	197769	197776	25 %	50 %	0 %	25 %	312142572
5512	NC_014654	CA	3	6	197775	197780	50 %	0 %	0 %	50 %	312142572
5513	NC_014654	A	6	6	197796	197801	100 %	0 %	0 %	0 %	312142572
5514	NC_014654	GCA	3	9	197804	197812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142572
5515	NC_014654	CTA	3	9	197889	197897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142572
5516	NC_014654	TAA	2	6	197920	197925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142572
5517	NC_014654	AT	3	6	198032	198037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014654	GTT	2	6	198128	198133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142573
5519	NC_014654	ATA	2	6	198156	198161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142573
5520	NC_014654	GAT	2	6	198170	198175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5521	NC_014654	GTA	2	6	198189	198194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5522	NC_014654	GGA	2	6	198269	198274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142573
5523	NC_014654	A	6	6	198356	198361	100 %	0 %	0 %	0 %	312142573
5524	NC_014654	TGT	2	6	198367	198372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142573
5525	NC_014654	TGAT	2	8	198378	198385	25 %	50 %	25 %	0 %	312142573
5526	NC_014654	A	7	7	198388	198394	100 %	0 %	0 %	0 %	312142573
5527	NC_014654	CAAAA	2	10	198424	198433	80 %	0 %	0 %	20 %	312142573
5528	NC_014654	A	6	6	198501	198506	100 %	0 %	0 %	0 %	312142573
5529	NC_014654	ATG	2	6	198530	198535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5530	NC_014654	AT	3	6	198547	198552	50 %	50 %	0 %	0 %	312142573
5531	NC_014654	ATT	2	6	198570	198575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142573
5532	NC_014654	TAG	2	6	198615	198620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5533	NC_014654	ATT	2	6	198634	198639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142573
5534	NC_014654	AAAT	2	8	198666	198673	75 %	25 %	0 %	0 %	312142573
5535	NC_014654	GAA	2	6	198695	198700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142573
5536	NC_014654	ATTGAT	2	12	198722	198733	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312142573
5537	NC_014654	ATG	2	6	198753	198758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5538	NC_014654	TA	3	6	198830	198835	50 %	50 %	0 %	0 %	312142573
5539	NC_014654	TGG	2	6	198949	198954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142573
5540	NC_014654	CAG	2	6	198963	198968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142573
5541	NC_014654	AAG	2	6	198978	198983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142573
5542	NC_014654	ATG	3	9	199005	199013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5543	NC_014654	TAA	2	6	199026	199031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142573
5544	NC_014654	TGG	2	6	199039	199044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142573
5545	NC_014654	TGA	2	6	199057	199062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5546	NC_014654	ATT	2	6	199115	199120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142573
5547	NC_014654	AAG	2	6	199140	199145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142573
5548	NC_014654	TGT	2	6	199180	199185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142573
5549	NC_014654	CTG	2	6	199188	199193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142573
5550	NC_014654	GAT	2	6	199239	199244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142573
5551	NC_014654	GTA	2	6	199326	199331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142574
5552	NC_014654	GGT	2	6	199353	199358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142574
5553	NC_014654	ATG	2	6	199414	199419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142574
5554	NC_014654	TAT	2	6	199432	199437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142574
5555	NC_014654	ACC	2	6	199442	199447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142574
5556	NC_014654	ATC	2	6	199549	199554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142574
5557	NC_014654	CA	3	6	199639	199644	50 %	0 %	0 %	50 %	312142574
5558	NC_014654	AACT	2	8	199688	199695	50 %	25 %	0 %	25 %	312142574
5559	NC_014654	ATG	2	6	199713	199718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142574
5560	NC_014654	TGG	2	6	199757	199762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142574
5561	NC_014654	TGC	2	6	199795	199800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142574
5562	NC_014654	AGA	3	9	199808	199816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142574
5563	NC_014654	TGA	2	6	199862	199867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142574
5564	NC_014654	TGC	2	6	199874	199879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142574
5565	NC_014654	AT	3	6	199883	199888	50 %	50 %	0 %	0 %	312142574
5566	NC_014654	AAG	2	6	200026	200031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142574
5567	NC_014654	AT	3	6	200039	200044	50 %	50 %	0 %	0 %	312142574
5568	NC_014654	AT	3	6	200071	200076	50 %	50 %	0 %	0 %	312142574
5569	NC_014654	AGA	2	6	200078	200083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142574
5570	NC_014654	AGG	2	6	200210	200215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142575
5571	NC_014654	TGC	2	6	200234	200239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142575
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5573	NC_014654	AAT	2	6	200390	200395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142575
5574	NC_014654	GA	3	6	200429	200434	50 %	0 %	50 %	0 %	312142575
5575	NC_014654	GTT	2	6	200448	200453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142575
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5578	NC_014654	TAA	2	6	200527	200532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142575
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5580	NC_014654	AGT	2	6	200658	200663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142575
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5582	NC_014654	ATC	2	6	200706	200711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142575
5583	NC_014654	GAT	2	6	200790	200795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142575
5584	NC_014654	AT	3	6	200794	200799	50 %	50 %	0 %	0 %	312142575
5585	NC_014654	A	7	7	200846	200852	100 %	0 %	0 %	0 %	312142575
5586	NC_014654	GAT	2	6	200904	200909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142575
5587	NC_014654	CAGAT	2	10	200941	200950	40 %	20 %	20 %	20 %	312142575
5588	NC_014654	CTG	2	6	201070	201075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142575
5589	NC_014654	CTG	2	6	201130	201135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142575
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5592	NC_014654	TAG	2	6	201160	201165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142575
5593	NC_014654	GA	3	6	201179	201184	50 %	0 %	50 %	0 %	312142575
5594	NC_014654	TAATT	2	10	201185	201194	40 %	60 %	0 %	0 %	312142575
5595	NC_014654	CTGAAG	2	12	201241	201252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312142575
5596	NC_014654	A	6	6	201255	201260	100 %	0 %	0 %	0 %	312142575
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5598	NC_014654	A	6	6	201360	201365	100 %	0 %	0 %	0 %	312142575
5599	NC_014654	AGC	2	6	201425	201430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142575
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5601	NC_014654	GCT	2	6	201516	201521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142575
5602	NC_014654	TAAT	2	8	201552	201559	50 %	50 %	0 %	0 %	312142575
5603	NC_014654	ATT	2	6	201577	201582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_014654	AAT	3	9	201590	201598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_014654	GAG	2	6	201617	201622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_014654	TAT	3	9	201635	201643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_014654	GCT	2	6	201647	201652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_014654	TAC	2	6	201653	201658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_014654	AATAT	2	10	201688	201697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_014654	ATC	2	6	201721	201726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_014654	AT	3	6	201751	201756	50 %	50 %	0 %	0 %	312142576
5612	NC_014654	AGA	2	6	201766	201771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142576
5613	NC_014654	CAAA	2	8	201815	201822	75 %	0 %	0 %	25 %	312142576
5614	NC_014654	ATG	2	6	201834	201839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142576
5615	NC_014654	CTTT	2	8	201848	201855	0 %	75 %	0 %	25 %	312142576
5616	NC_014654	TAGAAA	2	12	201888	201899	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312142576
5617	NC_014654	TTG	2	6	201942	201947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142576
5618	NC_014654	GCA	2	6	201998	202003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142576
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5620	NC_014654	TCTG	2	8	202127	202134	0 %	50 %	25 %	25 %	312142576
5621	NC_014654	AGA	2	6	202150	202155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142576
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