MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_014654	AGC	2	6	2161882	2161887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144288
58502	NC_014654	C	6	6	2161952	2161957	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58503	NC_014654	TTA	2	6	2161983	2161988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58504	NC_014654	ATTT	2	8	2161989	2161996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58505	NC_014654	TAA	2	6	2162007	2162012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58506	NC_014654	TAAT	2	8	2162048	2162055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58507	NC_014654	A	6	6	2162098	2162103	100 %	0 %	0 %	0 %	312144289
58508	NC_014654	TTA	2	6	2162117	2162122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144289
58509	NC_014654	A	6	6	2162128	2162133	100 %	0 %	0 %	0 %	312144289
58510	NC_014654	CAT	2	6	2162164	2162169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144289
58511	NC_014654	TCA	2	6	2162229	2162234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144289
58512	NC_014654	A	7	7	2162243	2162249	100 %	0 %	0 %	0 %	312144289
58513	NC_014654	CCCATC	2	12	2162255	2162266	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	312144289
58514	NC_014654	T	6	6	2162305	2162310	0 %	100 %	0 %	0 %	312144289
58515	NC_014654	ATTT	2	8	2162311	2162318	25 %	75 %	0 %	0 %	312144289
58516	NC_014654	AAT	2	6	2162355	2162360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144289
58517	NC_014654	TGT	2	6	2162376	2162381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144289
58518	NC_014654	AATAA	2	10	2162461	2162470	80 %	20 %	0 %	0 %	312144289
58519	NC_014654	A	6	6	2162512	2162517	100 %	0 %	0 %	0 %	312144289
58520	NC_014654	AAT	2	6	2162557	2162562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144289
58521	NC_014654	AAG	2	6	2162635	2162640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144289
58522	NC_014654	A	6	6	2162653	2162658	100 %	0 %	0 %	0 %	312144289
58523	NC_014654	T	6	6	2162765	2162770	0 %	100 %	0 %	0 %	312144289
58524	NC_014654	AAG	2	6	2162779	2162784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144289
58525	NC_014654	CAA	2	6	2162793	2162798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144289
58526	NC_014654	ATT	2	6	2162822	2162827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144289
58527	NC_014654	ATG	2	6	2162837	2162842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144289
58528	NC_014654	TTA	2	6	2162843	2162848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144289
58529	NC_014654	CTC	2	6	2162862	2162867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58530	NC_014654	TAA	2	6	2162904	2162909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144290
58531	NC_014654	TTC	2	6	2162923	2162928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144290
58532	NC_014654	T	8	8	2162972	2162979	0 %	100 %	0 %	0 %	312144290
58533	NC_014654	CCA	2	6	2163110	2163115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144290
58534	NC_014654	GCA	2	6	2163125	2163130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144290
58535	NC_014654	TCA	2	6	2163131	2163136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144290
58536	NC_014654	TTTA	2	8	2163145	2163152	25 %	75 %	0 %	0 %	312144290
58537	NC_014654	TA	3	6	2163177	2163182	50 %	50 %	0 %	0 %	312144290
58538	NC_014654	ATC	2	6	2163187	2163192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144290
58539	NC_014654	GTT	2	6	2163221	2163226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144290
58540	NC_014654	TAACA	2	10	2163274	2163283	60 %	20 %	0 %	20 %	312144290
58541	NC_014654	TCT	2	6	2163289	2163294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144290
58542	NC_014654	TTC	2	6	2163313	2163318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144290
58543	NC_014654	T	7	7	2163321	2163327	0 %	100 %	0 %	0 %	312144290
58544	NC_014654	AT	4	8	2163337	2163344	50 %	50 %	0 %	0 %	312144290
58545	NC_014654	GAA	2	6	2163356	2163361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144290
58546	NC_014654	TAA	2	6	2163373	2163378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144290
58547	NC_014654	A	6	6	2163383	2163388	100 %	0 %	0 %	0 %	312144290
58548	NC_014654	GTT	2	6	2163389	2163394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144290
58549	NC_014654	TCC	2	6	2163397	2163402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144290
58550	NC_014654	ACT	2	6	2163406	2163411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144290
58551	NC_014654	TCC	2	6	2163506	2163511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58552	NC_014654	ATT	2	6	2163528	2163533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58553	NC_014654	ATT	2	6	2163552	2163557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58554	NC_014654	TAA	2	6	2163624	2163629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58555	NC_014654	TGT	2	6	2163656	2163661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144291
58556	NC_014654	AGT	2	6	2163676	2163681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144291
58557	NC_014654	CT	3	6	2163692	2163697	0 %	50 %	0 %	50 %	312144291
58558	NC_014654	TTC	2	6	2163709	2163714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58559	NC_014654	TCT	2	6	2163722	2163727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58560	NC_014654	AAT	2	6	2163730	2163735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58561	NC_014654	T	6	6	2163759	2163764	0 %	100 %	0 %	0 %	312144291
58562	NC_014654	TAA	2	6	2163859	2163864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58563	NC_014654	TTC	2	6	2163886	2163891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58564	NC_014654	CTT	2	6	2163906	2163911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58565	NC_014654	AGC	2	6	2163922	2163927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144291
58566	NC_014654	CTT	2	6	2163930	2163935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58567	NC_014654	TCA	2	6	2163983	2163988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144291
58568	NC_014654	TGG	2	6	2164062	2164067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144291
58569	NC_014654	CTG	2	6	2164122	2164127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144291
58570	NC_014654	ACC	2	6	2164132	2164137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144291
58571	NC_014654	ATC	2	6	2164189	2164194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144291
58572	NC_014654	ACC	2	6	2164216	2164221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144291
58573	NC_014654	AAT	2	6	2164237	2164242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58574	NC_014654	TAA	2	6	2164273	2164278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58575	NC_014654	T	7	7	2164350	2164356	0 %	100 %	0 %	0 %	312144291
58576	NC_014654	CAT	2	6	2164386	2164391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144291
58577	NC_014654	T	7	7	2164413	2164419	0 %	100 %	0 %	0 %	312144291
58578	NC_014654	AGC	2	6	2164429	2164434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144291
58579	NC_014654	ATC	3	9	2164519	2164527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144291
58580	NC_014654	TAA	2	6	2164624	2164629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58581	NC_014654	AGC	2	6	2164660	2164665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144291
58582	NC_014654	ATA	2	6	2164673	2164678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58583	NC_014654	ATCC	2	8	2164695	2164702	25 %	25 %	0 %	50 %	312144291
58584	NC_014654	TCA	2	6	2164739	2164744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144291
58585	NC_014654	CCG	2	6	2164748	2164753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312144291
58586	NC_014654	GAC	2	6	2164773	2164778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144291
58587	NC_014654	TCA	2	6	2164793	2164798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144291
58588	NC_014654	ATA	2	6	2164805	2164810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58589	NC_014654	CAAA	2	8	2164836	2164843	75 %	0 %	0 %	25 %	312144291
58590	NC_014654	CACCAA	2	12	2164860	2164871	50 %	0 %	0 %	50 %	312144291
58591	NC_014654	TAA	2	6	2164899	2164904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58592	NC_014654	CAA	2	6	2165043	2165048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144291
58593	NC_014654	TTC	2	6	2165059	2165064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58594	NC_014654	CTT	2	6	2165070	2165075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
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58596	NC_014654	AACTT	2	10	2165097	2165106	40 %	40 %	0 %	20 %	312144291
58597	NC_014654	CAT	2	6	2165149	2165154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144291
58598	NC_014654	GCC	2	6	2165161	2165166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312144291
58599	NC_014654	ATA	2	6	2165183	2165188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144291
58600	NC_014654	CAA	2	6	2165199	2165204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144291
58601	NC_014654	CCA	2	6	2165245	2165250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144291
58602	NC_014654	GTTG	2	8	2165258	2165265	0 %	50 %	50 %	0 %	312144291
58603	NC_014654	ATG	2	6	2165313	2165318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144291
58604	NC_014654	CTT	2	6	2165376	2165381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58605	NC_014654	CTT	2	6	2165400	2165405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58606	NC_014654	ATT	2	6	2165410	2165415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144291
58607	NC_014654	GCT	2	6	2165417	2165422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144291
58608	NC_014654	CTT	2	6	2165424	2165429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58609	NC_014654	GAA	2	6	2165430	2165435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144291
58610	NC_014654	TTC	2	6	2165452	2165457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144291
58611	NC_014654	TGC	2	6	2165474	2165479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144291
58612	NC_014654	A	6	6	2165482	2165487	100 %	0 %	0 %	0 %	312144291
58613	NC_014654	AATCAA	2	12	2165512	2165523	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312144291
58614	NC_014654	AAT	2	6	2165557	2165562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58615	NC_014654	CTA	2	6	2165571	2165576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58616	NC_014654	TTAAA	2	10	2165641	2165650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58977	NC_014654	TTTC	2	8	2177274	2177281	0 %	75 %	0 %	25 %	312144305
58978	NC_014654	AAT	2	6	2177302	2177307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144305
58979	NC_014654	AT	3	6	2177337	2177342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58980	NC_014654	TA	3	6	2177354	2177359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58981	NC_014654	T	6	6	2177367	2177372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58982	NC_014654	A	7	7	2177409	2177415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58983	NC_014654	A	7	7	2177426	2177432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58984	NC_014654	GCT	2	6	2177435	2177440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58985	NC_014654	AT	3	6	2177455	2177460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58986	NC_014654	TCT	2	6	2177491	2177496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144306
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58998	NC_014654	AG	3	6	2177924	2177929	50 %	0 %	50 %	0 %	312144306
58999	NC_014654	ATC	2	6	2177937	2177942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144306
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