MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_014654	AAG	2	6	2103203	2103208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144228
57002	NC_014654	T	6	6	2103301	2103306	0 %	100 %	0 %	0 %	312144228
57003	NC_014654	CTT	2	6	2103321	2103326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144228
57004	NC_014654	ATC	2	6	2103371	2103376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144228
57005	NC_014654	ATA	2	6	2103384	2103389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144228
57006	NC_014654	TAAA	2	8	2103391	2103398	75 %	25 %	0 %	0 %	312144228
57007	NC_014654	GTA	2	6	2103450	2103455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144228
57008	NC_014654	ACC	2	6	2103553	2103558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144228
57009	NC_014654	TTC	2	6	2103567	2103572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144228
57010	NC_014654	TTC	2	6	2103603	2103608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144228
57011	NC_014654	CTG	2	6	2103616	2103621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144228
57012	NC_014654	ATA	2	6	2103629	2103634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144228
57013	NC_014654	TAA	2	6	2103645	2103650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144228
57014	NC_014654	ATA	2	6	2103746	2103751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144228
57015	NC_014654	ATA	2	6	2103764	2103769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144228
57016	NC_014654	CTG	2	6	2103834	2103839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144228
57017	NC_014654	TA	3	6	2103904	2103909	50 %	50 %	0 %	0 %	312144228
57018	NC_014654	TTC	2	6	2104009	2104014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144228
57019	NC_014654	TAC	2	6	2104027	2104032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144228
57020	NC_014654	AAT	2	6	2104048	2104053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144228
57021	NC_014654	CAC	2	6	2104110	2104115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144228
57022	NC_014654	CCA	2	6	2104145	2104150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144228
57023	NC_014654	CAT	2	6	2104234	2104239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144228
57024	NC_014654	AGCA	2	8	2104240	2104247	50 %	0 %	25 %	25 %	312144228
57025	NC_014654	TTC	2	6	2104270	2104275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144228
57026	NC_014654	CAG	2	6	2104333	2104338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144229
57027	NC_014654	T	6	6	2104431	2104436	0 %	100 %	0 %	0 %	312144229
57028	NC_014654	ATC	2	6	2104487	2104492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144229
57029	NC_014654	T	6	6	2104538	2104543	0 %	100 %	0 %	0 %	312144229
57030	NC_014654	TAT	2	6	2104549	2104554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144229
57031	NC_014654	TCC	2	6	2104595	2104600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144229
57032	NC_014654	ACC	2	6	2104622	2104627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144229
57033	NC_014654	T	6	6	2104712	2104717	0 %	100 %	0 %	0 %	312144229
57034	NC_014654	CCT	2	6	2104761	2104766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57035	NC_014654	TAT	2	6	2104771	2104776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144230
57036	NC_014654	AATT	2	8	2104779	2104786	50 %	50 %	0 %	0 %	312144230
57037	NC_014654	CTT	2	6	2104817	2104822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144230
57038	NC_014654	CCT	2	6	2104948	2104953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144230
57039	NC_014654	TAG	2	6	2105033	2105038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144230
57040	NC_014654	TAA	2	6	2105057	2105062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144230
57041	NC_014654	T	6	6	2105067	2105072	0 %	100 %	0 %	0 %	312144230
57042	NC_014654	TCA	2	6	2105149	2105154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144230
57043	NC_014654	ACA	2	6	2105158	2105163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144230
57044	NC_014654	TAC	2	6	2105226	2105231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144230
57045	NC_014654	TCA	2	6	2105236	2105241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144230
57046	NC_014654	TTGC	2	8	2105251	2105258	0 %	50 %	25 %	25 %	312144230
57047	NC_014654	T	7	7	2105264	2105270	0 %	100 %	0 %	0 %	312144230
57048	NC_014654	CCT	2	6	2105281	2105286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57049	NC_014654	CTT	2	6	2105304	2105309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144231
57050	NC_014654	CAA	2	6	2105409	2105414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144231
57051	NC_014654	GCA	2	6	2105429	2105434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144231
57052	NC_014654	CTT	2	6	2105436	2105441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144231
57053	NC_014654	AT	4	8	2105536	2105543	50 %	50 %	0 %	0 %	312144231
57054	NC_014654	CATT	2	8	2105562	2105569	25 %	50 %	0 %	25 %	312144231
57055	NC_014654	ACTC	2	8	2105650	2105657	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57056	NC_014654	TACC	2	8	2105676	2105683	25 %	25 %	0 %	50 %	312144232
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57058	NC_014654	T	7	7	2105816	2105822	0 %	100 %	0 %	0 %	312144232
57059	NC_014654	AAT	2	6	2105854	2105859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144232
57060	NC_014654	AACC	2	8	2105874	2105881	50 %	0 %	0 %	50 %	312144232
57061	NC_014654	TTA	2	6	2105894	2105899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144232
57062	NC_014654	T	6	6	2105941	2105946	0 %	100 %	0 %	0 %	312144232
57063	NC_014654	CAA	2	6	2106042	2106047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144232
57064	NC_014654	CATA	2	8	2106242	2106249	50 %	25 %	0 %	25 %	312144233
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57067	NC_014654	TTTA	2	8	2106364	2106371	25 %	75 %	0 %	0 %	312144233
57068	NC_014654	TCA	2	6	2106425	2106430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144233
57069	NC_014654	CTTT	2	8	2106472	2106479	0 %	75 %	0 %	25 %	312144233
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57073	NC_014654	GCTT	2	8	2106663	2106670	0 %	50 %	25 %	25 %	312144234
57074	NC_014654	T	6	6	2106669	2106674	0 %	100 %	0 %	0 %	312144234
57075	NC_014654	TTG	2	6	2106808	2106813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144234
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57077	NC_014654	ATT	2	6	2106894	2106899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144235
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57079	NC_014654	CTT	2	6	2106916	2106921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144235
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57085	NC_014654	CATA	2	8	2107120	2107127	50 %	25 %	0 %	25 %	312144235
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57087	NC_014654	CT	3	6	2107169	2107174	0 %	50 %	0 %	50 %	312144235
57088	NC_014654	T	7	7	2107196	2107202	0 %	100 %	0 %	0 %	312144235
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57102	NC_014654	T	7	7	2107658	2107664	0 %	100 %	0 %	0 %	312144236
57103	NC_014654	T	7	7	2107733	2107739	0 %	100 %	0 %	0 %	312144236
57104	NC_014654	CCT	2	6	2107756	2107761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57105	NC_014654	ATT	3	9	2107855	2107863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144237
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57111	NC_014654	T	7	7	2107969	2107975	0 %	100 %	0 %	0 %	312144237
57112	NC_014654	CTT	2	6	2107995	2108000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144237
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57116	NC_014654	CTA	2	6	2108147	2108152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57117	NC_014654	TCA	2	6	2108266	2108271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144238
57118	NC_014654	T	7	7	2108283	2108289	0 %	100 %	0 %	0 %	312144238
57119	NC_014654	TTC	2	6	2108327	2108332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144238
57120	NC_014654	CAACAG	2	12	2108336	2108347	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312144238
57121	NC_014654	CTTT	2	8	2108389	2108396	0 %	75 %	0 %	25 %	312144238
57122	NC_014654	ATT	2	6	2108400	2108405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144238
57123	NC_014654	CCT	2	6	2108421	2108426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57124	NC_014654	A	6	6	2108430	2108435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57125	NC_014654	AAT	2	6	2108493	2108498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144239
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57131	NC_014654	AGCT	2	8	2108746	2108753	25 %	25 %	25 %	25 %	312144240
57132	NC_014654	ACT	2	6	2108777	2108782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144240
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57134	NC_014654	TACCT	2	10	2108875	2108884	20 %	40 %	0 %	40 %	312144240
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57137	NC_014654	CCT	2	6	2109074	2109079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57166	NC_014654	TAA	2	6	2110301	2110306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144243
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57170	NC_014654	TCC	2	6	2110401	2110406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57198	NC_014654	ATTA	2	8	2111266	2111273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57199	NC_014654	TCA	2	6	2111303	2111308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144245
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57219	NC_014654	ACC	3	9	2112012	2112020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144246
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57221	NC_014654	AGCT	2	8	2112069	2112076	25 %	25 %	25 %	25 %	312144246
57222	NC_014654	TAC	2	6	2112084	2112089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144246
57223	NC_014654	ACA	2	6	2112097	2112102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144246
57224	NC_014654	TAT	2	6	2112116	2112121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144246
57225	NC_014654	TCC	2	6	2112201	2112206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57226	NC_014654	T	7	7	2112253	2112259	0 %	100 %	0 %	0 %	312144247
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57229	NC_014654	T	7	7	2112367	2112373	0 %	100 %	0 %	0 %	312144247
57230	NC_014654	CTT	2	6	2112387	2112392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144247
57231	NC_014654	AT	3	6	2112541	2112546	50 %	50 %	0 %	0 %	312144247
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57233	NC_014654	T	6	6	2112608	2112613	0 %	100 %	0 %	0 %	312144247
57234	NC_014654	GTTT	2	8	2112652	2112659	0 %	75 %	25 %	0 %	312144247
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57236	NC_014654	CAT	2	6	2112700	2112705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144247
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57239	NC_014654	T	7	7	2112815	2112821	0 %	100 %	0 %	0 %	312144247
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57345	NC_014654	T	6	6	2117101	2117106	0 %	100 %	0 %	0 %	312144252
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57470	NC_014654	AGC	2	6	2123072	2123077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144255
57471	NC_014654	ATC	2	6	2123123	2123128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57472	NC_014654	CTC	2	6	2123149	2123154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144255
57473	NC_014654	CAA	3	9	2123164	2123172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144255
57474	NC_014654	ATTT	2	8	2123185	2123192	25 %	75 %	0 %	0 %	312144255
57475	NC_014654	TCA	2	6	2123196	2123201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57476	NC_014654	TCT	2	6	2123235	2123240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144255
57477	NC_014654	TCA	2	6	2123241	2123246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57478	NC_014654	AAT	2	6	2123254	2123259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144255
57479	NC_014654	A	6	6	2123310	2123315	100 %	0 %	0 %	0 %	312144255
57480	NC_014654	ACC	2	6	2123459	2123464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144255
57481	NC_014654	TCT	2	6	2123483	2123488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144255
57482	NC_014654	A	6	6	2123552	2123557	100 %	0 %	0 %	0 %	312144255
57483	NC_014654	ACA	2	6	2123574	2123579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144255
57484	NC_014654	TAC	2	6	2123609	2123614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57485	NC_014654	TAC	2	6	2123645	2123650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57486	NC_014654	ATC	2	6	2123738	2123743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57487	NC_014654	TA	3	6	2123744	2123749	50 %	50 %	0 %	0 %	312144255
57488	NC_014654	CAT	3	9	2123752	2123760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57489	NC_014654	TAAAT	2	10	2123766	2123775	60 %	40 %	0 %	0 %	312144255
57490	NC_014654	AT	3	6	2123781	2123786	50 %	50 %	0 %	0 %	312144255
57491	NC_014654	ATC	2	6	2123804	2123809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57492	NC_014654	T	6	6	2123852	2123857	0 %	100 %	0 %	0 %	312144255
57493	NC_014654	CAG	2	6	2123878	2123883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144255
57494	NC_014654	CATAT	2	10	2123885	2123894	40 %	40 %	0 %	20 %	312144255
57495	NC_014654	A	6	6	2123906	2123911	100 %	0 %	0 %	0 %	312144255
57496	NC_014654	TA	3	6	2123974	2123979	50 %	50 %	0 %	0 %	312144255
57497	NC_014654	CTT	2	6	2123992	2123997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144255
57498	NC_014654	TC	4	8	2124015	2124022	0 %	50 %	0 %	50 %	312144255
57499	NC_014654	TCA	2	6	2124057	2124062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144255
57500	NC_014654	AAT	2	6	2124099	2124104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144255

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