MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_014654	ACA	2	6	2065477	2065482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144181
56002	NC_014654	ATATT	2	10	2065489	2065498	40 %	60 %	0 %	0 %	312144181
56003	NC_014654	GCA	2	6	2065558	2065563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144181
56004	NC_014654	TTAT	2	8	2065573	2065580	25 %	75 %	0 %	0 %	312144181
56005	NC_014654	ATT	2	6	2065602	2065607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144181
56006	NC_014654	TA	3	6	2065608	2065613	50 %	50 %	0 %	0 %	312144181
56007	NC_014654	ACTAAA	2	12	2065638	2065649	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312144181
56008	NC_014654	TAT	2	6	2065658	2065663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144181
56009	NC_014654	TCA	2	6	2065667	2065672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144181
56010	NC_014654	AGC	2	6	2065713	2065718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144181
56011	NC_014654	ACC	2	6	2065734	2065739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144181
56012	NC_014654	AT	3	6	2065756	2065761	50 %	50 %	0 %	0 %	312144181
56013	NC_014654	CAT	2	6	2065793	2065798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144181
56014	NC_014654	ACC	2	6	2065860	2065865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144181
56015	NC_014654	T	7	7	2065890	2065896	0 %	100 %	0 %	0 %	312144181
56016	NC_014654	AGC	2	6	2065989	2065994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144181
56017	NC_014654	CAA	2	6	2066018	2066023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144181
56018	NC_014654	TCA	2	6	2066092	2066097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144181
56019	NC_014654	ACCAC	2	10	2066146	2066155	40 %	0 %	0 %	60 %	312144181
56020	NC_014654	T	6	6	2066160	2066165	0 %	100 %	0 %	0 %	312144181
56021	NC_014654	ACA	2	6	2066188	2066193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144181
56022	NC_014654	TCA	2	6	2066239	2066244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144181
56023	NC_014654	TCT	2	6	2066278	2066283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144181
56024	NC_014654	ATTA	2	8	2066313	2066320	50 %	50 %	0 %	0 %	312144182
56025	NC_014654	CTG	2	6	2066333	2066338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144182
56026	NC_014654	T	7	7	2066360	2066366	0 %	100 %	0 %	0 %	312144182
56027	NC_014654	GGTT	2	8	2066372	2066379	0 %	50 %	50 %	0 %	312144182
56028	NC_014654	ATT	2	6	2066459	2066464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144182
56029	NC_014654	TTCTGC	2	12	2066465	2066476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312144182
56030	NC_014654	AT	3	6	2066482	2066487	50 %	50 %	0 %	0 %	312144182
56031	NC_014654	TTC	2	6	2066549	2066554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144182
56032	NC_014654	ATA	2	6	2066569	2066574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144182
56033	NC_014654	ATT	2	6	2066585	2066590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144182
56034	NC_014654	TTTAA	2	10	2066622	2066631	40 %	60 %	0 %	0 %	312144182
56035	NC_014654	ATC	2	6	2066657	2066662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144182
56036	NC_014654	CTA	2	6	2066670	2066675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144182
56037	NC_014654	AAT	2	6	2066683	2066688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144182
56038	NC_014654	TA	3	6	2066723	2066728	50 %	50 %	0 %	0 %	312144182
56039	NC_014654	CT	3	6	2066734	2066739	0 %	50 %	0 %	50 %	312144182
56040	NC_014654	CAG	2	6	2066743	2066748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144182
56041	NC_014654	A	6	6	2066788	2066793	100 %	0 %	0 %	0 %	312144182
56042	NC_014654	TTC	2	6	2066794	2066799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144182
56043	NC_014654	TTCAA	2	10	2066889	2066898	40 %	40 %	0 %	20 %	312144182
56044	NC_014654	TGT	2	6	2066943	2066948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144182
56045	NC_014654	ATC	2	6	2066984	2066989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144182
56046	NC_014654	A	6	6	2067009	2067014	100 %	0 %	0 %	0 %	312144182
56047	NC_014654	AAC	2	6	2067052	2067057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144183
56048	NC_014654	CAC	2	6	2067089	2067094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144183
56049	NC_014654	TAA	2	6	2067095	2067100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144183
56050	NC_014654	TTA	2	6	2067112	2067117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144183
56051	NC_014654	TTATT	2	10	2067122	2067131	20 %	80 %	0 %	0 %	312144183
56052	NC_014654	AAAAT	2	10	2067142	2067151	80 %	20 %	0 %	0 %	312144183
56053	NC_014654	AAT	2	6	2067215	2067220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144183
56054	NC_014654	TTC	2	6	2067243	2067248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144183
56055	NC_014654	GGC	2	6	2067424	2067429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312144183
56056	NC_014654	TA	3	6	2067432	2067437	50 %	50 %	0 %	0 %	312144183
56057	NC_014654	AGC	2	6	2067438	2067443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144183
56058	NC_014654	T	6	6	2067446	2067451	0 %	100 %	0 %	0 %	312144183
56059	NC_014654	ACT	2	6	2067462	2067467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144183
56060	NC_014654	CT	3	6	2067466	2067471	0 %	50 %	0 %	50 %	312144183
56061	NC_014654	CAG	2	6	2067473	2067478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144183
56062	NC_014654	ATTT	2	8	2067511	2067518	25 %	75 %	0 %	0 %	312144183
56063	NC_014654	CTC	2	6	2067525	2067530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144184
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56066	NC_014654	AAG	2	6	2067593	2067598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144184
56067	NC_014654	GTC	2	6	2067613	2067618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144184
56068	NC_014654	C	6	6	2067618	2067623	0 %	0 %	0 %	100 %	312144184
56069	NC_014654	AGC	2	6	2067705	2067710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144184
56070	NC_014654	TTC	3	9	2067831	2067839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144184
56071	NC_014654	T	6	6	2067907	2067912	0 %	100 %	0 %	0 %	312144184
56072	NC_014654	CAA	2	6	2067941	2067946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144184
56073	NC_014654	ACA	2	6	2067973	2067978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144184
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56075	NC_014654	TTC	2	6	2067999	2068004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144184
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56079	NC_014654	CTG	2	6	2068151	2068156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144184
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56081	NC_014654	T	6	6	2068180	2068185	0 %	100 %	0 %	0 %	312144184
56082	NC_014654	ATC	2	6	2068194	2068199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144184
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56084	NC_014654	TTC	2	6	2068230	2068235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144184
56085	NC_014654	ATT	2	6	2068248	2068253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144184
56086	NC_014654	T	6	6	2068252	2068257	0 %	100 %	0 %	0 %	312144184
56087	NC_014654	AAT	2	6	2068299	2068304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144184
56088	NC_014654	TCA	2	6	2068313	2068318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144184
56089	NC_014654	CCT	2	6	2068322	2068327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56090	NC_014654	TA	3	6	2068366	2068371	50 %	50 %	0 %	0 %	312144185
56091	NC_014654	TAG	2	6	2068374	2068379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144185
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56097	NC_014654	GAA	2	6	2068695	2068700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144185
56098	NC_014654	T	6	6	2068710	2068715	0 %	100 %	0 %	0 %	312144185
56099	NC_014654	CT	3	6	2068739	2068744	0 %	50 %	0 %	50 %	312144185
56100	NC_014654	GCA	2	6	2068811	2068816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144185
56101	NC_014654	T	7	7	2068857	2068863	0 %	100 %	0 %	0 %	312144185
56102	NC_014654	TTA	2	6	2068886	2068891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144185
56103	NC_014654	AAT	2	6	2068998	2069003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144185
56104	NC_014654	GTT	2	6	2069042	2069047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144185
56105	NC_014654	CTT	2	6	2069082	2069087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144185
56106	NC_014654	AAT	2	6	2069101	2069106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144185
56107	NC_014654	AT	3	6	2069221	2069226	50 %	50 %	0 %	0 %	312144185
56108	NC_014654	TCT	2	6	2069315	2069320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144185
56109	NC_014654	AGC	2	6	2069323	2069328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144185
56110	NC_014654	TTCT	2	8	2069361	2069368	0 %	75 %	0 %	25 %	312144185
56111	NC_014654	TC	3	6	2069412	2069417	0 %	50 %	0 %	50 %	312144185
56112	NC_014654	TCC	2	6	2069600	2069605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144186
56113	NC_014654	TCACT	2	10	2069629	2069638	20 %	40 %	0 %	40 %	312144186
56114	NC_014654	TTA	2	6	2069640	2069645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144186
56115	NC_014654	TCT	2	6	2069670	2069675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144186
56116	NC_014654	T	7	7	2069692	2069698	0 %	100 %	0 %	0 %	312144186
56117	NC_014654	TCA	2	6	2069703	2069708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144186
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56156	NC_014654	CT	3	6	2071295	2071300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56157	NC_014654	TTTA	2	8	2071301	2071308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56231	NC_014654	T	6	6	2074180	2074185	0 %	100 %	0 %	0 %	312144189
56232	NC_014654	TAG	2	6	2074231	2074236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144189
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56236	NC_014654	TAA	2	6	2074362	2074367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144189
56237	NC_014654	T	6	6	2074444	2074449	0 %	100 %	0 %	0 %	312144189
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56290	NC_014654	CCT	2	6	2076455	2076460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56335	NC_014654	TTTC	2	8	2078024	2078031	0 %	75 %	0 %	25 %	312144195
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56339	NC_014654	ATTT	2	8	2078182	2078189	25 %	75 %	0 %	0 %	312144195
56340	NC_014654	T	6	6	2078253	2078258	0 %	100 %	0 %	0 %	312144195
56341	NC_014654	A	8	8	2078309	2078316	100 %	0 %	0 %	0 %	312144195
56342	NC_014654	T	6	6	2078353	2078358	0 %	100 %	0 %	0 %	312144195
56343	NC_014654	TCAA	2	8	2078408	2078415	50 %	25 %	0 %	25 %	312144195
56344	NC_014654	CAGGA	2	10	2078451	2078460	40 %	0 %	40 %	20 %	312144195
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56348	NC_014654	CGG	2	6	2078507	2078512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312144195
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56350	NC_014654	GCA	2	6	2078525	2078530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144195
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56474	NC_014654	AT	3	6	2083343	2083348	50 %	50 %	0 %	0 %	312144202
56475	NC_014654	TAA	2	6	2083363	2083368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144202
56476	NC_014654	A	6	6	2083367	2083372	100 %	0 %	0 %	0 %	312144202
56477	NC_014654	AAT	2	6	2083384	2083389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144202
56478	NC_014654	TTTC	2	8	2083392	2083399	0 %	75 %	0 %	25 %	312144202
56479	NC_014654	CTT	2	6	2083407	2083412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144202
56480	NC_014654	A	6	6	2083469	2083474	100 %	0 %	0 %	0 %	312144202
56481	NC_014654	T	6	6	2083545	2083550	0 %	100 %	0 %	0 %	312144202
56482	NC_014654	ATC	2	6	2083556	2083561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144202
56483	NC_014654	ATC	2	6	2083586	2083591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144202
56484	NC_014654	T	6	6	2083592	2083597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56485	NC_014654	CTC	2	6	2083598	2083603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56486	NC_014654	ATTTT	2	10	2083606	2083615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56487	NC_014654	TAAT	2	8	2083668	2083675	50 %	50 %	0 %	0 %	312144203
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56490	NC_014654	GCT	3	9	2083758	2083766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144203
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56493	NC_014654	CCATT	2	10	2083840	2083849	20 %	40 %	0 %	40 %	312144203
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56497	NC_014654	TATT	2	8	2083972	2083979	25 %	75 %	0 %	0 %	312144203
56498	NC_014654	TC	3	6	2084011	2084016	0 %	50 %	0 %	50 %	312144203
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