MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_014654	TAT	2	6	2029369	2029374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144153
55002	NC_014654	GAAA	2	8	2029405	2029412	75 %	0 %	25 %	0 %	312144153
55003	NC_014654	TA	3	6	2029445	2029450	50 %	50 %	0 %	0 %	312144153
55004	NC_014654	TC	3	6	2029465	2029470	0 %	50 %	0 %	50 %	312144153
55005	NC_014654	T	6	6	2029487	2029492	0 %	100 %	0 %	0 %	312144153
55006	NC_014654	TAT	2	6	2029516	2029521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144153
55007	NC_014654	AGC	2	6	2029556	2029561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144153
55008	NC_014654	TCT	2	6	2029567	2029572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144153
55009	NC_014654	TAA	2	6	2029622	2029627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144153
55010	NC_014654	AC	3	6	2029640	2029645	50 %	0 %	0 %	50 %	312144153
55011	NC_014654	TAA	2	6	2029670	2029675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144153
55012	NC_014654	TCA	2	6	2029692	2029697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144153
55013	NC_014654	TC	3	6	2029708	2029713	0 %	50 %	0 %	50 %	312144153
55014	NC_014654	TTTA	2	8	2029715	2029722	25 %	75 %	0 %	0 %	312144153
55015	NC_014654	AAC	2	6	2029790	2029795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144153
55016	NC_014654	CAG	2	6	2029822	2029827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144153
55017	NC_014654	CTTT	2	8	2029839	2029846	0 %	75 %	0 %	25 %	312144153
55018	NC_014654	AGT	2	6	2029847	2029852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144153
55019	NC_014654	TTA	2	6	2029869	2029874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144153
55020	NC_014654	ATC	2	6	2029886	2029891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144153
55021	NC_014654	CAGC	2	8	2029897	2029904	25 %	0 %	25 %	50 %	312144153
55022	NC_014654	ATTT	2	8	2029910	2029917	25 %	75 %	0 %	0 %	312144153
55023	NC_014654	TCA	2	6	2029923	2029928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144153
55024	NC_014654	CTG	2	6	2029952	2029957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144153
55025	NC_014654	T	6	6	2029985	2029990	0 %	100 %	0 %	0 %	312144153
55026	NC_014654	T	6	6	2030049	2030054	0 %	100 %	0 %	0 %	312144153
55027	NC_014654	AATT	2	8	2030081	2030088	50 %	50 %	0 %	0 %	312144153
55028	NC_014654	T	6	6	2030106	2030111	0 %	100 %	0 %	0 %	312144153
55029	NC_014654	CTT	2	6	2030176	2030181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144153
55030	NC_014654	CCA	2	6	2030202	2030207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144153
55031	NC_014654	CTT	2	6	2030231	2030236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144153
55032	NC_014654	ATT	2	6	2030285	2030290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55033	NC_014654	AGC	2	6	2030324	2030329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55034	NC_014654	ATT	2	6	2030389	2030394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55035	NC_014654	TA	3	6	2030405	2030410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55036	NC_014654	AATC	2	8	2030415	2030422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55037	NC_014654	GGA	2	6	2030429	2030434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55038	NC_014654	TTA	2	6	2030486	2030491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144154
55039	NC_014654	TGT	2	6	2030545	2030550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144154
55040	NC_014654	AATCGG	2	12	2030629	2030640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312144154
55041	NC_014654	GGAATC	2	12	2030645	2030656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312144154
55042	NC_014654	TGC	2	6	2030716	2030721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144154
55043	NC_014654	ATG	2	6	2030735	2030740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144154
55044	NC_014654	GGT	2	6	2030750	2030755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144154
55045	NC_014654	TAG	2	6	2030757	2030762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144154
55046	NC_014654	ATT	2	6	2030768	2030773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144154
55047	NC_014654	T	8	8	2030779	2030786	0 %	100 %	0 %	0 %	312144154
55048	NC_014654	AAT	2	6	2030854	2030859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55049	NC_014654	TTCTAT	2	12	2030869	2030880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312144154
55050	NC_014654	T	6	6	2030880	2030885	0 %	100 %	0 %	0 %	312144154
55051	NC_014654	GTT	2	6	2030894	2030899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144154
55052	NC_014654	ATA	3	9	2030972	2030980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55053	NC_014654	TAT	2	6	2030989	2030994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144154
55054	NC_014654	TGG	2	6	2031002	2031007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144154
55055	NC_014654	TGC	2	6	2031034	2031039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144154
55056	NC_014654	TAA	2	6	2031063	2031068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55057	NC_014654	GTG	2	6	2031069	2031074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144154
55058	NC_014654	ATT	2	6	2031152	2031157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144154
55059	NC_014654	TA	3	6	2031167	2031172	50 %	50 %	0 %	0 %	312144154
55060	NC_014654	GGT	2	6	2031221	2031226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312144154
55061	NC_014654	GTA	2	6	2031252	2031257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144154
55062	NC_014654	TA	3	6	2031277	2031282	50 %	50 %	0 %	0 %	312144154
55063	NC_014654	TAT	2	6	2031343	2031348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144154
55064	NC_014654	ATA	2	6	2031366	2031371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55065	NC_014654	A	7	7	2031386	2031392	100 %	0 %	0 %	0 %	312144154
55066	NC_014654	CAA	2	6	2031429	2031434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144154
55067	NC_014654	T	6	6	2031440	2031445	0 %	100 %	0 %	0 %	312144154
55068	NC_014654	CAAT	2	8	2031452	2031459	50 %	25 %	0 %	25 %	312144154
55069	NC_014654	TAA	2	6	2031484	2031489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55070	NC_014654	AATT	2	8	2031498	2031505	50 %	50 %	0 %	0 %	312144154
55071	NC_014654	AAT	2	6	2031565	2031570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55072	NC_014654	TTCTT	2	10	2031617	2031626	0 %	80 %	0 %	20 %	312144154
55073	NC_014654	T	6	6	2031625	2031630	0 %	100 %	0 %	0 %	312144154
55074	NC_014654	AAT	2	6	2031637	2031642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55075	NC_014654	TATT	2	8	2031662	2031669	25 %	75 %	0 %	0 %	312144154
55076	NC_014654	GCT	2	6	2031740	2031745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144154
55077	NC_014654	ATG	2	6	2031768	2031773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144154
55078	NC_014654	A	6	6	2031780	2031785	100 %	0 %	0 %	0 %	312144154
55079	NC_014654	TAA	2	6	2031790	2031795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144154
55080	NC_014654	CAAA	2	8	2031801	2031808	75 %	0 %	0 %	25 %	312144154
55081	NC_014654	TAT	2	6	2031833	2031838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55082	NC_014654	TGA	2	6	2031882	2031887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144155
55083	NC_014654	TCT	2	6	2031911	2031916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144155
55084	NC_014654	AAG	2	6	2031922	2031927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144155
55085	NC_014654	CTT	4	12	2031942	2031953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144155
55086	NC_014654	ATC	2	6	2031973	2031978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144155
55087	NC_014654	TA	3	6	2031990	2031995	50 %	50 %	0 %	0 %	312144155
55088	NC_014654	ACC	2	6	2032003	2032008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144155
55089	NC_014654	TTA	2	6	2032025	2032030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144155
55090	NC_014654	TA	3	6	2032093	2032098	50 %	50 %	0 %	0 %	312144155
55091	NC_014654	TCTTTA	2	12	2032100	2032111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312144155
55092	NC_014654	ATCTA	2	10	2032120	2032129	40 %	40 %	0 %	20 %	312144155
55093	NC_014654	AAT	2	6	2032213	2032218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144155
55094	NC_014654	TTC	2	6	2032219	2032224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144155
55095	NC_014654	CAG	2	6	2032287	2032292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144155
55096	NC_014654	AGG	2	6	2032333	2032338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312144155
55097	NC_014654	T	8	8	2032468	2032475	0 %	100 %	0 %	0 %	312144155
55098	NC_014654	AATT	2	8	2032480	2032487	50 %	50 %	0 %	0 %	312144155
55099	NC_014654	CAT	2	6	2032492	2032497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144155
55100	NC_014654	ATA	2	6	2032513	2032518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144155
55101	NC_014654	TTA	2	6	2032529	2032534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144155
55102	NC_014654	ACT	2	6	2032547	2032552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144155
55103	NC_014654	TTTCT	2	10	2032579	2032588	0 %	80 %	0 %	20 %	312144155
55104	NC_014654	AAT	2	6	2032609	2032614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144155
55105	NC_014654	TTTTC	2	10	2032658	2032667	0 %	80 %	0 %	20 %	312144155
55106	NC_014654	GTTAT	2	10	2032673	2032682	20 %	60 %	20 %	0 %	312144155
55107	NC_014654	GGC	2	6	2032684	2032689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312144155
55108	NC_014654	TGTT	2	8	2032700	2032707	0 %	75 %	25 %	0 %	312144155
55109	NC_014654	CCAG	2	8	2032715	2032722	25 %	0 %	25 %	50 %	312144155
55110	NC_014654	TAA	2	6	2032743	2032748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144155
55111	NC_014654	TAT	2	6	2032900	2032905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144155
55112	NC_014654	GTA	2	6	2032935	2032940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144155
55113	NC_014654	T	6	6	2032948	2032953	0 %	100 %	0 %	0 %	312144155
55114	NC_014654	TTTTCT	2	12	2032958	2032969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312144155
55115	NC_014654	TAA	2	6	2033083	2033088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144155
55116	NC_014654	ACC	3	9	2033143	2033151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144155
55117	NC_014654	ACT	2	6	2033153	2033158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144155
55118	NC_014654	AT	3	6	2033186	2033191	50 %	50 %	0 %	0 %	312144155
55119	NC_014654	CTT	2	6	2033235	2033240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144155
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55132	NC_014654	TTC	2	6	2033676	2033681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144156
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55229	NC_014654	ACC	2	6	2037244	2037249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144159
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55231	NC_014654	A	7	7	2037298	2037304	100 %	0 %	0 %	0 %	312144159
55232	NC_014654	GAA	2	6	2037320	2037325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144159
55233	NC_014654	TAAT	2	8	2037360	2037367	50 %	50 %	0 %	0 %	312144159
55234	NC_014654	CAT	2	6	2037375	2037380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144159
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55475	NC_014654	TATCTA	2	12	2046202	2046213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312144167
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55478	NC_014654	CTA	2	6	2046420	2046425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144167
55479	NC_014654	A	6	6	2046448	2046453	100 %	0 %	0 %	0 %	312144167
55480	NC_014654	AAT	2	6	2046486	2046491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144167
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55500	NC_014654	TAAA	2	8	2047174	2047181	75 %	25 %	0 %	0 %	312144167

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