MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_014654	CTT	2	6	2010780	2010785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144132
54502	NC_014654	TTCT	2	8	2010828	2010835	0 %	75 %	0 %	25 %	312144132
54503	NC_014654	ACT	2	6	2010862	2010867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144132
54504	NC_014654	ATA	2	6	2010894	2010899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144132
54505	NC_014654	ATA	2	6	2010902	2010907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144132
54506	NC_014654	T	8	8	2010910	2010917	0 %	100 %	0 %	0 %	312144132
54507	NC_014654	ATC	2	6	2010926	2010931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54508	NC_014654	T	6	6	2010938	2010943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54509	NC_014654	T	6	6	2010964	2010969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54510	NC_014654	TAAA	2	8	2011028	2011035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54511	NC_014654	T	6	6	2011045	2011050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54512	NC_014654	AAT	2	6	2011094	2011099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144133
54513	NC_014654	ATT	2	6	2011142	2011147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144133
54514	NC_014654	GA	3	6	2011159	2011164	50 %	0 %	50 %	0 %	312144133
54515	NC_014654	GAA	2	6	2011258	2011263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144133
54516	NC_014654	TAT	3	9	2011306	2011314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144133
54517	NC_014654	TTC	2	6	2011376	2011381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144133
54518	NC_014654	CCA	2	6	2011443	2011448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144133
54519	NC_014654	ATC	2	6	2011460	2011465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144133
54520	NC_014654	GGAAAA	2	12	2011509	2011520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312144133
54521	NC_014654	CCA	2	6	2011530	2011535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144133
54522	NC_014654	ACC	2	6	2011538	2011543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144133
54523	NC_014654	CTA	2	6	2011567	2011572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144133
54524	NC_014654	CCT	2	6	2011584	2011589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144133
54525	NC_014654	CCA	2	6	2011590	2011595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144133
54526	NC_014654	T	7	7	2011666	2011672	0 %	100 %	0 %	0 %	312144133
54527	NC_014654	CCA	2	6	2011678	2011683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144133
54528	NC_014654	CAC	2	6	2011690	2011695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54529	NC_014654	AGC	2	6	2011716	2011721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54530	NC_014654	T	7	7	2011748	2011754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54531	NC_014654	TTAA	2	8	2011756	2011763	50 %	50 %	0 %	0 %	312144134
54532	NC_014654	TAT	2	6	2011775	2011780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144134
54533	NC_014654	TAA	2	6	2011807	2011812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144134
54534	NC_014654	TGA	2	6	2011836	2011841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144134
54535	NC_014654	TACC	2	8	2011861	2011868	25 %	25 %	0 %	50 %	312144134
54536	NC_014654	CAA	2	6	2011906	2011911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144134
54537	NC_014654	CTA	2	6	2011972	2011977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144134
54538	NC_014654	CCA	2	6	2012097	2012102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144134
54539	NC_014654	AT	3	6	2012141	2012146	50 %	50 %	0 %	0 %	312144134
54540	NC_014654	CGC	2	6	2012230	2012235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312144134
54541	NC_014654	GTA	2	6	2012258	2012263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144134
54542	NC_014654	TA	3	6	2012276	2012281	50 %	50 %	0 %	0 %	312144134
54543	NC_014654	TTCA	2	8	2012285	2012292	25 %	50 %	0 %	25 %	312144134
54544	NC_014654	CAG	2	6	2012308	2012313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144134
54545	NC_014654	ATT	2	6	2012406	2012411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144134
54546	NC_014654	ATT	2	6	2012477	2012482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144134
54547	NC_014654	AGC	2	6	2012507	2012512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144134
54548	NC_014654	ATT	2	6	2012556	2012561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144134
54549	NC_014654	AAT	2	6	2012562	2012567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144134
54550	NC_014654	CTC	2	6	2012584	2012589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54551	NC_014654	T	6	6	2012591	2012596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54552	NC_014654	AATT	3	12	2012683	2012694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54553	NC_014654	CCA	2	6	2012733	2012738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54554	NC_014654	TGT	2	6	2012752	2012757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54555	NC_014654	T	6	6	2012757	2012762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54556	NC_014654	CCAC	2	8	2012764	2012771	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54557	NC_014654	TACTTT	2	12	2012793	2012804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54558	NC_014654	TTA	2	6	2012805	2012810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54559	NC_014654	CTC	2	6	2012815	2012820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54560	NC_014654	A	7	7	2012821	2012827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54561	NC_014654	ATTA	2	8	2012871	2012878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54562	NC_014654	TAC	2	6	2012944	2012949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54563	NC_014654	A	6	6	2012953	2012958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54564	NC_014654	TAA	2	6	2012967	2012972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54565	NC_014654	TTA	2	6	2012977	2012982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54566	NC_014654	T	6	6	2012991	2012996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54567	NC_014654	ATTT	2	8	2012999	2013006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54568	NC_014654	T	6	6	2013008	2013013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54569	NC_014654	A	6	6	2013065	2013070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54570	NC_014654	A	7	7	2013076	2013082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54571	NC_014654	A	7	7	2013084	2013090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54572	NC_014654	GGT	2	6	2013102	2013107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54573	NC_014654	ATT	2	6	2013117	2013122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54574	NC_014654	TAAT	2	8	2013141	2013148	50 %	50 %	0 %	0 %	312144135
54575	NC_014654	T	7	7	2013170	2013176	0 %	100 %	0 %	0 %	312144135
54576	NC_014654	ATT	2	6	2013200	2013205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144135
54577	NC_014654	ATT	2	6	2013219	2013224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144135
54578	NC_014654	CTCAT	2	10	2013240	2013249	20 %	40 %	0 %	40 %	312144135
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54580	NC_014654	T	6	6	2013316	2013321	0 %	100 %	0 %	0 %	312144135
54581	NC_014654	GCT	2	6	2013324	2013329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144135
54582	NC_014654	T	7	7	2013389	2013395	0 %	100 %	0 %	0 %	312144135
54583	NC_014654	AT	3	6	2013425	2013430	50 %	50 %	0 %	0 %	312144135
54584	NC_014654	T	6	6	2013430	2013435	0 %	100 %	0 %	0 %	312144135
54585	NC_014654	AT	3	6	2013439	2013444	50 %	50 %	0 %	0 %	312144135
54586	NC_014654	ATC	2	6	2013456	2013461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144135
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54588	NC_014654	ATT	2	6	2013548	2013553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144135
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54590	NC_014654	TC	3	6	2013596	2013601	0 %	50 %	0 %	50 %	312144135
54591	NC_014654	TAAA	2	8	2013668	2013675	75 %	25 %	0 %	0 %	312144135
54592	NC_014654	TCT	2	6	2013741	2013746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144135
54593	NC_014654	A	6	6	2013846	2013851	100 %	0 %	0 %	0 %	312144135
54594	NC_014654	AAAT	2	8	2013869	2013876	75 %	25 %	0 %	0 %	312144135
54595	NC_014654	AGT	2	6	2013912	2013917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144135
54596	NC_014654	TTTA	2	8	2013968	2013975	25 %	75 %	0 %	0 %	312144135
54597	NC_014654	CAA	2	6	2014043	2014048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144135
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54600	NC_014654	CAA	2	6	2014163	2014168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312144135
54601	NC_014654	TAC	2	6	2014195	2014200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144135
54602	NC_014654	TCC	2	6	2014214	2014219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312144135
54603	NC_014654	ACT	2	6	2014265	2014270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144135
54604	NC_014654	TA	3	6	2014347	2014352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54605	NC_014654	ATT	2	6	2014368	2014373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54606	NC_014654	T	7	7	2014372	2014378	0 %	100 %	0 %	0 %	312144136
54607	NC_014654	AGC	2	6	2014383	2014388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144136
54608	NC_014654	CT	3	6	2014410	2014415	0 %	50 %	0 %	50 %	312144136
54609	NC_014654	CAG	2	6	2014442	2014447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144136
54610	NC_014654	TAT	2	6	2014448	2014453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144136
54611	NC_014654	TAA	2	6	2014530	2014535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144136
54612	NC_014654	T	6	6	2014739	2014744	0 %	100 %	0 %	0 %	312144136
54613	NC_014654	AT	3	6	2014764	2014769	50 %	50 %	0 %	0 %	312144136
54614	NC_014654	AGC	2	6	2014812	2014817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144136
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54616	NC_014654	TTA	2	6	2014843	2014848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144136
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54618	NC_014654	AAGCAT	2	12	2014904	2014915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312144136
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54620	NC_014654	AATC	2	8	2014970	2014977	50 %	25 %	0 %	25 %	312144136
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54622	NC_014654	ATTT	2	8	2015051	2015058	25 %	75 %	0 %	0 %	312144136
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54742	NC_014654	CAT	2	6	2020194	2020199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144142
54743	NC_014654	CTT	2	6	2020239	2020244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144142
54744	NC_014654	CAC	2	6	2020341	2020346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312144142
54745	NC_014654	ATC	2	6	2020369	2020374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144142
54746	NC_014654	CAT	2	6	2020410	2020415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144142
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54748	NC_014654	CTT	2	6	2020527	2020532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144142
54749	NC_014654	CCAT	2	8	2020550	2020557	25 %	25 %	0 %	50 %	312144142
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54751	NC_014654	TC	3	6	2020648	2020653	0 %	50 %	0 %	50 %	312144142
54752	NC_014654	CATT	2	8	2020698	2020705	25 %	50 %	0 %	25 %	312144142
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54754	NC_014654	CTT	2	6	2020720	2020725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144142
54755	NC_014654	TTG	2	6	2020743	2020748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144142
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54757	NC_014654	ATA	2	6	2020817	2020822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144143
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54779	NC_014654	A	7	7	2021658	2021664	100 %	0 %	0 %	0 %	312144143
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54800	NC_014654	ATA	2	6	2022294	2022299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54802	NC_014654	T	7	7	2022361	2022367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54803	NC_014654	AAT	2	6	2022372	2022377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54852	NC_014654	A	6	6	2024112	2024117	100 %	0 %	0 %	0 %	312144146
54853	NC_014654	ATC	2	6	2024147	2024152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144146
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