MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_014654	GCA	2	6	1955988	1955993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144081
53003	NC_014654	CAATTG	2	12	1956115	1956126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312144081
53004	NC_014654	CAG	2	6	1956169	1956174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144081
53005	NC_014654	TCA	2	6	1956183	1956188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144081
53006	NC_014654	CTAAA	2	10	1956214	1956223	60 %	20 %	0 %	20 %	312144081
53007	NC_014654	TCA	2	6	1956255	1956260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144081
53008	NC_014654	ATT	2	6	1956263	1956268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144081
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53010	NC_014654	A	6	6	1956411	1956416	100 %	0 %	0 %	0 %	312144081
53011	NC_014654	ATC	2	6	1956428	1956433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144081
53012	NC_014654	GTT	2	6	1956454	1956459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144081
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53014	NC_014654	TAT	2	6	1956496	1956501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144081
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53016	NC_014654	TAA	2	6	1956653	1956658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144081
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53018	NC_014654	TAA	2	6	1956711	1956716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53019	NC_014654	A	7	7	1956745	1956751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53119	NC_014654	T	8	8	1960083	1960090	0 %	100 %	0 %	0 %	312144085
53120	NC_014654	GTT	2	6	1960103	1960108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144085
53121	NC_014654	TAT	2	6	1960122	1960127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144085
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53123	NC_014654	T	6	6	1960252	1960257	0 %	100 %	0 %	0 %	312144086
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53132	NC_014654	TAA	2	6	1960538	1960543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144086
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53139	NC_014654	A	6	6	1960802	1960807	100 %	0 %	0 %	0 %	312144086
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53143	NC_014654	CCT	2	6	1960912	1960917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53202	NC_014654	TCCC	2	8	1963139	1963146	0 %	25 %	0 %	75 %	312144089
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53208	NC_014654	TCTT	2	8	1963306	1963313	0 %	75 %	0 %	25 %	312144089
53209	NC_014654	ATTC	2	8	1963315	1963322	25 %	50 %	0 %	25 %	312144089
53210	NC_014654	AT	3	6	1963392	1963397	50 %	50 %	0 %	0 %	312144089
53211	NC_014654	TAC	2	6	1963399	1963404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144089
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53215	NC_014654	AT	3	6	1963530	1963535	50 %	50 %	0 %	0 %	312144089
53216	NC_014654	CTACT	2	10	1963545	1963554	20 %	40 %	0 %	40 %	312144089
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53218	NC_014654	ATGAGC	2	12	1963648	1963659	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312144089
53219	NC_014654	AGC	2	6	1963711	1963716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144089
53220	NC_014654	TAC	3	9	1963806	1963814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144089
53221	NC_014654	A	6	6	1963899	1963904	100 %	0 %	0 %	0 %	312144089
53222	NC_014654	TAA	2	6	1963908	1963913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312144089
53223	NC_014654	T	6	6	1963939	1963944	0 %	100 %	0 %	0 %	312144089
53224	NC_014654	CAG	2	6	1963977	1963982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144089
53225	NC_014654	TCT	2	6	1964003	1964008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144089
53226	NC_014654	CAT	2	6	1964016	1964021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144089
53227	NC_014654	A	6	6	1964030	1964035	100 %	0 %	0 %	0 %	312144089
53228	NC_014654	TCTTT	2	10	1964036	1964045	0 %	80 %	0 %	20 %	312144089
53229	NC_014654	TCA	2	6	1964052	1964057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144089
53230	NC_014654	GCT	2	6	1964090	1964095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144090
53231	NC_014654	CT	3	6	1964108	1964113	0 %	50 %	0 %	50 %	312144090
53232	NC_014654	CTT	3	9	1964128	1964136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144090
53233	NC_014654	T	6	6	1964140	1964145	0 %	100 %	0 %	0 %	312144090
53234	NC_014654	TCT	2	6	1964157	1964162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144090
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53236	NC_014654	TCCCA	2	10	1964216	1964225	20 %	20 %	0 %	60 %	312144090
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53357	NC_014654	CTAA	2	8	1968743	1968750	50 %	25 %	0 %	25 %	312144093
53358	NC_014654	T	6	6	1968777	1968782	0 %	100 %	0 %	0 %	312144093
53359	NC_014654	GCA	2	6	1968800	1968805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144093
53360	NC_014654	ATCT	2	8	1968855	1968862	25 %	50 %	0 %	25 %	312144093
53361	NC_014654	TCA	2	6	1968917	1968922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312144093
53362	NC_014654	AGC	2	6	1968931	1968936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312144093
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53365	NC_014654	TCT	2	6	1969013	1969018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144093
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53373	NC_014654	CTT	2	6	1969446	1969451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144093
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53431	NC_014654	TC	3	6	1972051	1972056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53432	NC_014654	AAG	2	6	1972068	1972073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53433	NC_014654	TAA	2	6	1972077	1972082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53434	NC_014654	AATA	2	8	1972118	1972125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53435	NC_014654	TGC	2	6	1972171	1972176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53438	NC_014654	T	6	6	1972244	1972249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53440	NC_014654	TAT	2	6	1972325	1972330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53443	NC_014654	T	7	7	1972366	1972372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53444	NC_014654	AT	3	6	1972392	1972397	50 %	50 %	0 %	0 %	312144095
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53459	NC_014654	GCT	2	6	1972812	1972817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312144095
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53472	NC_014654	TAT	2	6	1973212	1973217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312144095
53473	NC_014654	GATT	2	8	1973224	1973231	25 %	50 %	25 %	0 %	312144095
53474	NC_014654	CTT	2	6	1973242	1973247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144095
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53477	NC_014654	CTTTT	2	10	1973441	1973450	0 %	80 %	0 %	20 %	312144095
53478	NC_014654	TGT	2	6	1973543	1973548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312144095
53479	NC_014654	GTA	2	6	1973577	1973582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312144095
53480	NC_014654	TTC	2	6	1973603	1973608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312144095
53481	NC_014654	CAAT	2	8	1973796	1973803	50 %	25 %	0 %	25 %	312144095
53482	NC_014654	AAAT	2	8	1973828	1973835	75 %	25 %	0 %	0 %	312144095
53483	NC_014654	CAGG	2	8	1973904	1973911	25 %	0 %	50 %	25 %	312144095
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53485	NC_014654	CTTCTA	2	12	1973929	1973940	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312144095
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