MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 70906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014654	AAATA	2	10	159179	159188	80 %	20 %	0 %	0 %	312142539
4502	NC_014654	TGT	2	6	159240	159245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142539
4503	NC_014654	AAT	2	6	159314	159319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142539
4504	NC_014654	AT	3	6	159318	159323	50 %	50 %	0 %	0 %	312142539
4505	NC_014654	A	7	7	159342	159348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014654	AAT	2	6	159364	159369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
4507	NC_014654	TAA	2	6	159373	159378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
4508	NC_014654	T	6	6	159388	159393	0 %	100 %	0 %	0 %	312142540
4509	NC_014654	AGA	2	6	159394	159399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142540
4510	NC_014654	TTA	2	6	159486	159491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4511	NC_014654	GTAG	2	8	159560	159567	25 %	25 %	50 %	0 %	312142540
4512	NC_014654	TGA	2	6	159573	159578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142540
4513	NC_014654	TGC	2	6	159613	159618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
4514	NC_014654	ATATG	2	10	159649	159658	40 %	40 %	20 %	0 %	312142540
4515	NC_014654	CAG	2	6	159672	159677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142540
4516	NC_014654	GCA	2	6	159689	159694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142540
4517	NC_014654	ATT	2	6	159731	159736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4518	NC_014654	ATT	2	6	159760	159765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4519	NC_014654	TAT	2	6	159772	159777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4520	NC_014654	A	6	6	159818	159823	100 %	0 %	0 %	0 %	312142540
4521	NC_014654	TTA	2	6	159831	159836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4522	NC_014654	ACC	2	6	159853	159858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142540
4523	NC_014654	TAT	2	6	159898	159903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4524	NC_014654	ATT	2	6	159904	159909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4525	NC_014654	CT	4	8	159910	159917	0 %	50 %	0 %	50 %	312142540
4526	NC_014654	CTA	2	6	159951	159956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142540
4527	NC_014654	TAA	2	6	159969	159974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
4528	NC_014654	TTA	2	6	159981	159986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4529	NC_014654	TTG	2	6	160062	160067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142540
4530	NC_014654	CTG	2	6	160098	160103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
4531	NC_014654	ATT	2	6	160120	160125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4532	NC_014654	GCT	2	6	160148	160153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
4533	NC_014654	AT	3	6	160197	160202	50 %	50 %	0 %	0 %	312142540
4534	NC_014654	TAT	2	6	160245	160250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4535	NC_014654	TGC	2	6	160258	160263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
4536	NC_014654	GTT	2	6	160312	160317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142540
4537	NC_014654	CCA	2	6	160407	160412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142540
4538	NC_014654	ACA	2	6	160472	160477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142540
4539	NC_014654	TTA	2	6	160564	160569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
4540	NC_014654	ATA	2	6	160590	160595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
4541	NC_014654	AGA	2	6	160624	160629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142540
4542	NC_014654	TAA	2	6	160643	160648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
4543	NC_014654	AGG	2	6	160660	160665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014654	AAT	2	6	160669	160674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142541
4545	NC_014654	GAA	2	6	160781	160786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142541
4546	NC_014654	AGC	2	6	160795	160800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142541
4547	NC_014654	TAAA	2	8	160812	160819	75 %	25 %	0 %	0 %	312142541
4548	NC_014654	AAAC	2	8	160829	160836	75 %	0 %	0 %	25 %	312142541
4549	NC_014654	AAG	2	6	160851	160856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142541
4550	NC_014654	ATT	2	6	160882	160887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142541
4551	NC_014654	AATG	2	8	160912	160919	50 %	25 %	25 %	0 %	312142541
4552	NC_014654	TAG	2	6	160938	160943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142541
4553	NC_014654	AGG	2	6	160991	160996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142541
4554	NC_014654	A	6	6	161016	161021	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
4555	NC_014654	CAA	2	6	161035	161040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142542
4556	NC_014654	TGG	2	6	161042	161047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142542
4557	NC_014654	ATG	2	6	161095	161100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142542
4558	NC_014654	GAA	2	6	161136	161141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
4559	NC_014654	TTG	2	6	161161	161166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142542
4560	NC_014654	AGA	2	6	161189	161194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
4561	NC_014654	GATA	2	8	161201	161208	50 %	25 %	25 %	0 %	312142542
4562	NC_014654	AGA	2	6	161232	161237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
4563	NC_014654	A	6	6	161311	161316	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
4564	NC_014654	ACA	2	6	161349	161354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142542
4565	NC_014654	GAA	2	6	161421	161426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
4566	NC_014654	TAT	2	6	161471	161476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142542
4567	NC_014654	A	6	6	161545	161550	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
4568	NC_014654	ACC	2	6	161611	161616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142542
4569	NC_014654	GCT	2	6	161631	161636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142542
4570	NC_014654	TTC	2	6	161740	161745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142542
4571	NC_014654	GAA	2	6	161811	161816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
4572	NC_014654	AGC	2	6	161822	161827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142542
4573	NC_014654	AAGC	2	8	161869	161876	50 %	0 %	25 %	25 %	312142542
4574	NC_014654	AGA	2	6	161918	161923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
4575	NC_014654	GAA	2	6	161928	161933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
4576	NC_014654	AGG	2	6	161936	161941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142542
4577	NC_014654	TGC	2	6	161957	161962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142542
4578	NC_014654	AAT	2	6	162024	162029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142542
4579	NC_014654	AGAA	2	8	162065	162072	75 %	0 %	25 %	0 %	312142542
4580	NC_014654	CCT	2	6	162123	162128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142542
4581	NC_014654	TTA	2	6	162141	162146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142542
4582	NC_014654	TGC	2	6	162206	162211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142542
4583	NC_014654	CACT	2	8	162220	162227	25 %	25 %	0 %	50 %	312142542
4584	NC_014654	GAT	2	6	162270	162275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142542
4585	NC_014654	ATT	2	6	162276	162281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142542
4586	NC_014654	A	7	7	162283	162289	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
4587	NC_014654	ATTA	2	8	162291	162298	50 %	50 %	0 %	0 %	312142542
4588	NC_014654	TAA	2	6	162311	162316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142542
4589	NC_014654	AGG	2	6	162339	162344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_014654	GCA	2	6	162353	162358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142543
4591	NC_014654	AGA	2	6	162380	162385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142543
4592	NC_014654	T	6	6	162386	162391	0 %	100 %	0 %	0 %	312142543
4593	NC_014654	AGA	2	6	162533	162538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142543
4594	NC_014654	ATC	2	6	162600	162605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
4595	NC_014654	TGA	2	6	162662	162667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142543
4596	NC_014654	ACT	2	6	162668	162673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
4597	NC_014654	A	6	6	162735	162740	100 %	0 %	0 %	0 %	312142543
4598	NC_014654	GGT	2	6	162741	162746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142543
4599	NC_014654	ATA	2	6	162901	162906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142543
4600	NC_014654	ATC	2	6	162931	162936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
4601	NC_014654	TCA	2	6	162974	162979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
4602	NC_014654	AGCT	2	8	163034	163041	25 %	25 %	25 %	25 %	312142543
4603	NC_014654	AGA	2	6	163049	163054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142543
4604	NC_014654	GCA	2	6	163062	163067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142543
4605	NC_014654	ATT	2	6	163072	163077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142543
4606	NC_014654	GCA	2	6	163107	163112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142543
4607	NC_014654	ATT	2	6	163234	163239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142543
4608	NC_014654	ATA	2	6	163240	163245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142543
4609	NC_014654	AG	3	6	163283	163288	50 %	0 %	50 %	0 %	312142543
4610	NC_014654	AGA	2	6	163306	163311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142543
4611	NC_014654	AGA	2	6	163338	163343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142543
4612	NC_014654	AAC	2	6	163406	163411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142543
4613	NC_014654	GAG	2	6	163415	163420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142543
4614	NC_014654	CAG	2	6	163427	163432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142543
4615	NC_014654	ATG	2	6	163477	163482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142543
4616	NC_014654	TGA	2	6	163493	163498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142543
4617	NC_014654	CAAT	2	8	163501	163508	50 %	25 %	0 %	25 %	312142543
4618	NC_014654	GAT	2	6	163509	163514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142543
4619	NC_014654	ATT	2	6	163580	163585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142543
4620	NC_014654	TTAG	2	8	163614	163621	25 %	50 %	25 %	0 %	312142543
4621	NC_014654	TCA	2	6	163625	163630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
4622	NC_014654	TA	3	6	163655	163660	50 %	50 %	0 %	0 %	312142543
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