MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014323	CG	3	6	139527	139532	0 %	0 %	50 %	50 %	300309468
3502	NC_014323	GTG	2	6	139545	139550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309468
3503	NC_014323	ACA	2	6	139584	139589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309468
3504	NC_014323	ATC	2	6	139607	139612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309468
3505	NC_014323	CAC	2	6	139669	139674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309468
3506	NC_014323	CGA	3	9	139687	139695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309468
3507	NC_014323	CGC	2	6	139711	139716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309468
3508	NC_014323	GC	3	6	139784	139789	0 %	0 %	50 %	50 %	300309469
3509	NC_014323	GAA	2	6	139799	139804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309469
3510	NC_014323	TGC	2	6	139808	139813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309469
3511	NC_014323	GC	3	6	139817	139822	0 %	0 %	50 %	50 %	300309469
3512	NC_014323	TAT	2	6	139835	139840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300309469
3513	NC_014323	CGA	2	6	139841	139846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309469
3514	NC_014323	GAA	2	6	139860	139865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309469
3515	NC_014323	CTCCG	2	10	139910	139919	0 %	20 %	20 %	60 %	300309469
3516	NC_014323	GC	3	6	139939	139944	0 %	0 %	50 %	50 %	300309469
3517	NC_014323	GCG	2	6	140017	140022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309469
3518	NC_014323	AGCT	2	8	140042	140049	25 %	25 %	25 %	25 %	300309469
3519	NC_014323	GAA	2	6	140060	140065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014323	CGT	2	6	140140	140145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309470
3521	NC_014323	CG	3	6	140391	140396	0 %	0 %	50 %	50 %	300309470
3522	NC_014323	TGA	2	6	140400	140405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309470
3523	NC_014323	AAG	2	6	140589	140594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309471
3524	NC_014323	GGT	2	6	140600	140605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309471
3525	NC_014323	CAA	3	9	140606	140614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309471
3526	NC_014323	TGA	2	6	140639	140644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309471
3527	NC_014323	CAA	2	6	140690	140695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309471
3528	NC_014323	AAG	2	6	140727	140732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309471
3529	NC_014323	GCACAA	2	12	140760	140771	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300309471
3530	NC_014323	ATCG	2	8	140880	140887	25 %	25 %	25 %	25 %	300309471
3531	NC_014323	GGT	2	6	140891	140896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309471
3532	NC_014323	CGC	2	6	140906	140911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309471
3533	NC_014323	CG	3	6	140919	140924	0 %	0 %	50 %	50 %	300309471
3534	NC_014323	CAAGGG	2	12	140945	140956	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	300309471
3535	NC_014323	GTG	2	6	140976	140981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309471
3536	NC_014323	AAG	3	9	140997	141005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309471
3537	NC_014323	TGC	2	6	141230	141235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309472
3538	NC_014323	GCT	2	6	141237	141242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309472
3539	NC_014323	GCTG	2	8	141344	141351	0 %	25 %	50 %	25 %	300309472
3540	NC_014323	TGA	2	6	141434	141439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309473
3541	NC_014323	A	6	6	141451	141456	100 %	0 %	0 %	0 %	300309473
3542	NC_014323	GGT	2	6	141482	141487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309473
3543	NC_014323	CAT	2	6	141500	141505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309473
3544	NC_014323	GGGCAA	2	12	141557	141568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	300309473
3545	NC_014323	GAA	2	6	141606	141611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309473
3546	NC_014323	GAA	2	6	141641	141646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309473
3547	NC_014323	AC	3	6	141659	141664	50 %	0 %	0 %	50 %	300309473
3548	NC_014323	CCT	2	6	141685	141690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309473
3549	NC_014323	TGA	2	6	141694	141699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309473
3550	NC_014323	CGG	2	6	141734	141739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309473
3551	NC_014323	GC	3	6	141746	141751	0 %	0 %	50 %	50 %	300309473
3552	NC_014323	GTG	2	6	141780	141785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309473
3553	NC_014323	ACA	2	6	141814	141819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309473
3554	NC_014323	TGC	2	6	141872	141877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309473
3555	NC_014323	GTCG	2	8	141890	141897	0 %	25 %	50 %	25 %	300309473
3556	NC_014323	ACC	2	6	141980	141985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309474
3557	NC_014323	GGTCTG	2	12	142000	142011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300309474
3558	NC_014323	CAA	2	6	142068	142073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309474
3559	NC_014323	GCGTC	2	10	142178	142187	0 %	20 %	40 %	40 %	300309475
3560	NC_014323	CGGC	2	8	142219	142226	0 %	0 %	50 %	50 %	300309475
3561	NC_014323	GGC	2	6	142284	142289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309475
3562	NC_014323	CGT	2	6	142305	142310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309475
3563	NC_014323	AAGC	2	8	142416	142423	50 %	0 %	25 %	25 %	300309475
3564	NC_014323	TCGTG	2	10	142445	142454	0 %	40 %	40 %	20 %	300309475
3565	NC_014323	ATC	2	6	142458	142463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309475
3566	NC_014323	AAG	2	6	142482	142487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309475
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3568	NC_014323	GGT	2	6	142545	142550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309475
3569	NC_014323	ACT	2	6	142591	142596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309476
3570	NC_014323	CTG	2	6	142651	142656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3571	NC_014323	GGC	2	6	142747	142752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309476
3572	NC_014323	GGT	2	6	142780	142785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309476
3573	NC_014323	ATC	2	6	142843	142848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309476
3574	NC_014323	GCT	2	6	142854	142859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3575	NC_014323	GGT	2	6	142863	142868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309476
3576	NC_014323	CGC	2	6	142871	142876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309476
3577	NC_014323	GAA	2	6	142890	142895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309476
3578	NC_014323	GTC	2	6	142910	142915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3579	NC_014323	GGT	2	6	143046	143051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309476
3580	NC_014323	ATC	2	6	143131	143136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309476
3581	NC_014323	TGG	2	6	143264	143269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309476
3582	NC_014323	CAA	2	6	143328	143333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309476
3583	NC_014323	GGT	2	6	143341	143346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309476
3584	NC_014323	AGC	2	6	143350	143355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3585	NC_014323	CCG	2	6	143392	143397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309476
3586	NC_014323	TCG	2	6	143407	143412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3587	NC_014323	GGC	2	6	143496	143501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309476
3588	NC_014323	TCT	3	9	143555	143563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309476
3589	NC_014323	CTT	2	6	143565	143570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309476
3590	NC_014323	GAA	2	6	143616	143621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309476
3591	NC_014323	GTG	2	6	143624	143629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309476
3592	NC_014323	TCCG	2	8	143645	143652	0 %	25 %	25 %	50 %	300309476
3593	NC_014323	CG	3	6	143664	143669	0 %	0 %	50 %	50 %	300309476
3594	NC_014323	CTG	2	6	143734	143739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3595	NC_014323	GCT	2	6	143793	143798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3596	NC_014323	GCA	2	6	143856	143861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309476
3597	NC_014323	GAA	2	6	143936	143941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014323	GAC	2	6	143959	143964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309477
3599	NC_014323	GAAA	2	8	144181	144188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014323	ATC	2	6	144244	144249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309478
3601	NC_014323	AGC	2	6	144296	144301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309478
3602	NC_014323	TTAAC	2	10	144309	144318	40 %	40 %	0 %	20 %	300309478
3603	NC_014323	CG	3	6	144423	144428	0 %	0 %	50 %	50 %	300309479
3604	NC_014323	GCT	2	6	144443	144448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309479
3605	NC_014323	CAA	2	6	144463	144468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309479
3606	NC_014323	TCG	2	6	144528	144533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309479
3607	NC_014323	CGT	2	6	144614	144619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309479
3608	NC_014323	GAA	2	6	144697	144702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309479
3609	NC_014323	GAA	2	6	144740	144745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_014323	CAA	2	6	144763	144768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309480
3611	NC_014323	GCA	3	9	144770	144778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309480
3612	NC_014323	AAG	2	6	144800	144805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309480
3613	NC_014323	CAA	2	6	144844	144849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309480
3614	NC_014323	CAT	2	6	144853	144858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309480
3615	NC_014323	ACCG	2	8	144866	144873	25 %	0 %	25 %	50 %	300309480
3616	NC_014323	GTG	2	6	144906	144911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309480
3617	NC_014323	CGC	2	6	144958	144963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309480
3618	NC_014323	CCCGG	2	10	145028	145037	0 %	0 %	40 %	60 %	300309480
3619	NC_014323	GC	3	6	145054	145059	0 %	0 %	50 %	50 %	300309480
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3621	NC_014323	CCG	2	6	145130	145135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309480
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