MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014323	TA	3	6	97531	97536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_014323	AG	3	6	97541	97546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_014323	GGCG	2	8	97637	97644	0 %	0 %	75 %	25 %	300309428
2504	NC_014323	CG	3	6	97685	97690	0 %	0 %	50 %	50 %	300309428
2505	NC_014323	TTG	2	6	97777	97782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309428
2506	NC_014323	A	6	6	97803	97808	100 %	0 %	0 %	0 %	300309428
2507	NC_014323	T	6	6	97944	97949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_014323	CTG	2	6	97989	97994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_014323	A	6	6	98039	98044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_014323	A	8	8	98109	98116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_014323	GCCT	2	8	98151	98158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_014323	A	6	6	98207	98212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_014323	GAA	2	6	98253	98258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309429
2514	NC_014323	CGC	2	6	98280	98285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309429
2515	NC_014323	AGA	2	6	98313	98318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309429
2516	NC_014323	CGC	2	6	98349	98354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309429
2517	NC_014323	CTACCG	2	12	98367	98378	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309429
2518	NC_014323	CCG	2	6	98512	98517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309429
2519	NC_014323	GGC	2	6	98554	98559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309429
2520	NC_014323	GCG	2	6	98564	98569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309429
2521	NC_014323	CGG	3	9	98574	98582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309429
2522	NC_014323	CGG	2	6	98598	98603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309429
2523	NC_014323	TAC	4	12	98608	98619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309429
2524	NC_014323	GCG	2	6	98642	98647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309429
2525	NC_014323	CTA	2	6	98793	98798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309429
2526	NC_014323	CGA	2	6	98898	98903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309429
2527	NC_014323	GGCCT	2	10	98923	98932	0 %	20 %	40 %	40 %	300309429
2528	NC_014323	ACC	2	6	98962	98967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309429
2529	NC_014323	GAA	2	6	98988	98993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309429
2530	NC_014323	ATC	2	6	99070	99075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309430
2531	NC_014323	GTC	2	6	99161	99166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309430
2532	NC_014323	CGCGG	2	10	99190	99199	0 %	0 %	60 %	40 %	300309430
2533	NC_014323	GGC	2	6	99237	99242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309430
2534	NC_014323	GAC	2	6	99247	99252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309430
2535	NC_014323	TCG	2	6	99257	99262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309430
2536	NC_014323	CG	3	6	99265	99270	0 %	0 %	50 %	50 %	300309430
2537	NC_014323	CTG	2	6	99337	99342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309430
2538	NC_014323	A	6	6	99389	99394	100 %	0 %	0 %	0 %	300309430
2539	NC_014323	GAA	2	6	99414	99419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309431
2540	NC_014323	GC	3	6	99431	99436	0 %	0 %	50 %	50 %	300309431
2541	NC_014323	GC	3	6	99446	99451	0 %	0 %	50 %	50 %	300309431
2542	NC_014323	CAGT	2	8	99461	99468	25 %	25 %	25 %	25 %	300309431
2543	NC_014323	GCT	3	9	99538	99546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2544	NC_014323	GCTGCC	2	12	99604	99615	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300309431
2545	NC_014323	CAA	2	6	99636	99641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309431
2546	NC_014323	GGGCCT	2	12	99699	99710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300309431
2547	NC_014323	CGG	2	6	99717	99722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309431
2548	NC_014323	GCA	2	6	99731	99736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2549	NC_014323	TCT	2	6	99773	99778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309431
2550	NC_014323	CTT	2	6	99840	99845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309431
2551	NC_014323	TCG	2	6	99938	99943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2552	NC_014323	GCTG	2	8	100148	100155	0 %	25 %	50 %	25 %	300309431
2553	NC_014323	GC	3	6	100166	100171	0 %	0 %	50 %	50 %	300309431
2554	NC_014323	GGC	2	6	100183	100188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309431
2555	NC_014323	GGT	2	6	100191	100196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309431
2556	NC_014323	CGC	2	6	100206	100211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309431
2557	NC_014323	CCTGAC	2	12	100287	100298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309431
2558	NC_014323	GCT	2	6	100314	100319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2559	NC_014323	CTG	2	6	100373	100378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2560	NC_014323	CGG	2	6	100409	100414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309431
2561	NC_014323	CTG	2	6	100415	100420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2562	NC_014323	GGCAAG	2	12	100450	100461	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	300309431
2563	NC_014323	CTGGT	2	10	100496	100505	0 %	40 %	40 %	20 %	300309431
2564	NC_014323	CGG	2	6	100517	100522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309431
2565	NC_014323	CTG	2	6	100573	100578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2566	NC_014323	GAA	2	6	100602	100607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309431
2567	NC_014323	CGA	2	6	100620	100625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2568	NC_014323	GGC	2	6	100657	100662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309431
2569	NC_014323	GGC	2	6	100708	100713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309431
2570	NC_014323	ACT	2	6	100754	100759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309431
2571	NC_014323	CGG	2	6	100764	100769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309431
2572	NC_014323	ACC	2	6	100801	100806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309431
2573	NC_014323	CGT	2	6	100854	100859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309431
2574	NC_014323	GAA	3	9	100882	100890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309431
2575	NC_014323	T	6	6	101021	101026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_014323	GCT	2	6	101043	101048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_014323	T	6	6	101048	101053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_014323	CG	3	6	101064	101069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_014323	CAT	2	6	101120	101125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_014323	GGCC	2	8	101173	101180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_014323	GTCGC	2	10	101208	101217	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2582	NC_014323	CTG	2	6	101322	101327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2583	NC_014323	GAA	2	6	101336	101341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309432
2584	NC_014323	CGC	2	6	101401	101406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309432
2585	NC_014323	CAA	2	6	101486	101491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309432
2586	NC_014323	TGC	2	6	101506	101511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2587	NC_014323	GGC	2	6	101525	101530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309432
2588	NC_014323	GCC	2	6	101535	101540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309432
2589	NC_014323	CTG	3	9	101571	101579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2590	NC_014323	CAAGCC	2	12	101696	101707	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300309432
2591	NC_014323	CAC	2	6	101726	101731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309432
2592	NC_014323	GCC	3	9	101767	101775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309432
2593	NC_014323	GAA	2	6	101783	101788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309432
2594	NC_014323	TGC	2	6	101806	101811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2595	NC_014323	CAA	2	6	101813	101818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309432
2596	NC_014323	TGC	2	6	101872	101877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2597	NC_014323	CGC	2	6	101924	101929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309432
2598	NC_014323	ATG	2	6	101932	101937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309432
2599	NC_014323	GGT	2	6	101939	101944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309432
2600	NC_014323	AAG	2	6	101946	101951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309432
2601	NC_014323	GGTCGA	2	12	101963	101974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300309432
2602	NC_014323	GCACCG	2	12	102031	102042	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309432
2603	NC_014323	TGT	2	6	102070	102075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309432
2604	NC_014323	AAG	2	6	102087	102092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309432
2605	NC_014323	AGC	2	6	102115	102120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2606	NC_014323	CTTCGT	2	12	102122	102133	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	300309432
2607	NC_014323	CAT	2	6	102164	102169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309432
2608	NC_014323	AGC	2	6	102211	102216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2609	NC_014323	GGC	2	6	102230	102235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309432
2610	NC_014323	AAGG	2	8	102240	102247	50 %	0 %	50 %	0 %	300309432
2611	NC_014323	GGT	2	6	102323	102328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309432
2612	NC_014323	TGG	2	6	102349	102354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309432
2613	NC_014323	GC	3	6	102412	102417	0 %	0 %	50 %	50 %	300309432
2614	NC_014323	CAG	2	6	102441	102446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2615	NC_014323	CATG	2	8	102461	102468	25 %	25 %	25 %	25 %	300309432
2616	NC_014323	CGG	2	6	102481	102486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309432
2617	NC_014323	GTG	2	6	102513	102518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309432
2618	NC_014323	GCT	2	6	102530	102535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309432
2619	NC_014323	GGC	2	6	102536	102541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309432
2620	NC_014323	TGGAAA	2	12	102547	102558	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300309432
2621	NC_014323	TTA	2	6	102581	102586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300309432
2622	NC_014323	ATG	2	6	102692	102697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309433
2623	NC_014323	CG	3	6	102706	102711	0 %	0 %	50 %	50 %	300309433
2624	NC_014323	GCTCAC	2	12	102790	102801	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309433
2625	NC_014323	TCT	2	6	102842	102847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309433
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2627	NC_014323	CAA	2	6	102961	102966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309433
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2854	NC_014323	AAGG	2	8	112632	112639	50 %	0 %	50 %	0 %	300309442
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2856	NC_014323	GAG	2	6	112862	112867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2857	NC_014323	TCAA	2	8	112910	112917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2858	NC_014323	AGA	2	6	112937	112942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309443
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2860	NC_014323	CGGCC	2	10	113001	113010	0 %	0 %	40 %	60 %	300309443
2861	NC_014323	CAT	2	6	113031	113036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309443
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2867	NC_014323	GCAA	2	8	113237	113244	50 %	0 %	25 %	25 %	300309443
2868	NC_014323	AGA	2	6	113264	113269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309443
2869	NC_014323	GCT	2	6	113284	113289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309443
2870	NC_014323	ATCG	2	8	113480	113487	25 %	25 %	25 %	25 %	300309444
2871	NC_014323	GTCC	2	8	113492	113499	0 %	25 %	25 %	50 %	300309444
2872	NC_014323	GAA	2	6	113516	113521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309444
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2875	NC_014323	TCG	2	6	113728	113733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309444
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2889	NC_014323	AAG	2	6	114413	114418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309445
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2921	NC_014323	CG	3	6	115589	115594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2922	NC_014323	TCCT	2	8	115620	115627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2990	NC_014323	AAG	2	6	118628	118633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309447
2991	NC_014323	CGA	3	9	118711	118719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309447
2992	NC_014323	AAG	2	6	118802	118807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309447
2993	NC_014323	GCC	2	6	118828	118833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309447
2994	NC_014323	AGA	2	6	118842	118847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309447
2995	NC_014323	GTC	2	6	118905	118910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309447
2996	NC_014323	CCG	2	6	118980	118985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309447
2997	NC_014323	CTGGG	2	10	119051	119060	0 %	20 %	60 %	20 %	300309447
2998	NC_014323	ACC	2	6	119138	119143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309447
2999	NC_014323	GAA	2	6	119192	119197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309447
3000	NC_014323	ATC	2	6	119198	119203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309447

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