MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_014323	GTC	2	6	772871	772876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19502	NC_014323	TGC	2	6	772930	772935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310045
19503	NC_014323	GCT	2	6	772991	772996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310045
19504	NC_014323	TCG	2	6	773038	773043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310045
19505	NC_014323	GAG	2	6	773052	773057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300310045
19506	NC_014323	CGA	2	6	773147	773152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310045
19507	NC_014323	GCC	2	6	773160	773165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310045
19508	NC_014323	GGC	2	6	773187	773192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310045
19509	NC_014323	AGA	2	6	773284	773289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310045
19510	NC_014323	CGC	2	6	773303	773308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310045
19511	NC_014323	GCC	2	6	773317	773322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19512	NC_014323	T	6	6	773355	773360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19513	NC_014323	CAT	2	6	773391	773396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310046
19514	NC_014323	CAG	2	6	773405	773410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310046
19515	NC_014323	GCC	2	6	773454	773459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310046
19516	NC_014323	TCG	2	6	773499	773504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310046
19517	NC_014323	GCA	2	6	773559	773564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310046
19518	NC_014323	GCT	3	9	773590	773598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310046
19519	NC_014323	CGC	2	6	773636	773641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310046
19520	NC_014323	CCG	2	6	773703	773708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310046
19521	NC_014323	GCA	2	6	773715	773720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310046
19522	NC_014323	GCT	2	6	773722	773727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310046
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19524	NC_014323	CAT	2	6	773830	773835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310046
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19526	NC_014323	GGCT	2	8	773860	773867	0 %	25 %	50 %	25 %	300310046
19527	NC_014323	GCC	2	6	773883	773888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310046
19528	NC_014323	CTGG	2	8	773894	773901	0 %	25 %	50 %	25 %	300310046
19529	NC_014323	CGC	3	9	773902	773910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310046
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19531	NC_014323	CGC	2	6	773934	773939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310046
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19533	NC_014323	GC	3	6	773989	773994	0 %	0 %	50 %	50 %	300310046
19534	NC_014323	TCA	2	6	774006	774011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310046
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19539	NC_014323	CTG	2	6	774163	774168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310046
19540	NC_014323	CGG	2	6	774243	774248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310046
19541	NC_014323	TCG	2	6	774261	774266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310046
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19549	NC_014323	GGC	2	6	774532	774537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310046
19550	NC_014323	CGG	2	6	774636	774641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310046
19551	NC_014323	CTG	2	6	774723	774728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19552	NC_014323	TGCGCC	2	12	774940	774951	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300310047
19553	NC_014323	GCG	2	6	774974	774979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310047
19554	NC_014323	TGA	2	6	774996	775001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310047
19555	NC_014323	CGC	2	6	775007	775012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310047
19556	NC_014323	TGCC	2	8	775013	775020	0 %	25 %	25 %	50 %	300310047
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19558	NC_014323	GCGCT	2	10	775070	775079	0 %	20 %	40 %	40 %	300310047
19559	NC_014323	CCG	3	9	775106	775114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310047
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19563	NC_014323	GCG	2	6	775298	775303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310047
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19584	NC_014323	GCC	2	6	776134	776139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310047
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19586	NC_014323	ACA	3	9	776174	776182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310047
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19591	NC_014323	GC	3	6	776631	776636	0 %	0 %	50 %	50 %	300310047
19592	NC_014323	CG	3	6	776681	776686	0 %	0 %	50 %	50 %	300310047
19593	NC_014323	ATG	2	6	776719	776724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310047
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19599	NC_014323	GAGC	2	8	777053	777060	25 %	0 %	50 %	25 %	300310047
19600	NC_014323	GGC	2	6	777074	777079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19601	NC_014323	AGA	2	6	777096	777101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310048
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19603	NC_014323	GCC	2	6	777270	777275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310048
19604	NC_014323	GC	3	6	777289	777294	0 %	0 %	50 %	50 %	300310048
19605	NC_014323	GTG	2	6	777320	777325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310048
19606	NC_014323	TTC	2	6	777400	777405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310048
19607	NC_014323	GC	4	8	777407	777414	0 %	0 %	50 %	50 %	300310048
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19610	NC_014323	GGC	2	6	777603	777608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310048
19611	NC_014323	GC	3	6	777607	777612	0 %	0 %	50 %	50 %	300310048
19612	NC_014323	GCT	2	6	777654	777659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310048
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19615	NC_014323	CGGC	2	8	777819	777826	0 %	0 %	50 %	50 %	300310048
19616	NC_014323	GCG	2	6	777837	777842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310048
19617	NC_014323	CAG	2	6	777844	777849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310048
19618	NC_014323	GGCG	2	8	777856	777863	0 %	0 %	75 %	25 %	300310048
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19833	NC_014323	TCA	2	6	785489	785494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19837	NC_014323	TGCG	2	8	785537	785544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19838	NC_014323	A	8	8	785548	785555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19841	NC_014323	TGC	3	9	785630	785638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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