MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_014323	CAG	2	6	753218	753223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310024
19003	NC_014323	CCA	2	6	753238	753243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310024
19004	NC_014323	GCG	2	6	753244	753249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310024
19005	NC_014323	GTC	3	9	753272	753280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310024
19006	NC_014323	CGG	2	6	753321	753326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310025
19007	NC_014323	GCC	2	6	753340	753345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310025
19008	NC_014323	GCA	2	6	753368	753373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310025
19009	NC_014323	TTG	2	6	753416	753421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300310025
19010	NC_014323	TTG	2	6	753440	753445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300310025
19011	NC_014323	CTGGC	2	10	753551	753560	0 %	20 %	40 %	40 %	300310025
19012	NC_014323	GGT	2	6	753562	753567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310025
19013	NC_014323	TCG	2	6	753686	753691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310025
19014	NC_014323	GTG	2	6	753766	753771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310025
19015	NC_014323	TGG	2	6	753852	753857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310025
19016	NC_014323	GCC	3	9	753878	753886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310025
19017	NC_014323	GCA	2	6	753903	753908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310025
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19019	NC_014323	ATG	2	6	754037	754042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310025
19020	NC_014323	ATG	2	6	754062	754067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_014323	GC	3	6	754171	754176	0 %	0 %	50 %	50 %	300310026
19022	NC_014323	ATG	2	6	754177	754182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310026
19023	NC_014323	GCGG	2	8	754188	754195	0 %	0 %	75 %	25 %	300310026
19024	NC_014323	CGT	2	6	754196	754201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310026
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19038	NC_014323	GAT	2	6	754698	754703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310026
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19052	NC_014323	GC	3	6	755333	755338	0 %	0 %	50 %	50 %	300310028
19053	NC_014323	TGT	2	6	755366	755371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300310028
19054	NC_014323	CTC	2	6	755388	755393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19055	NC_014323	TGGC	2	8	755406	755413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19056	NC_014323	GCTG	2	8	755433	755440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19057	NC_014323	ACC	2	6	755529	755534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19058	NC_014323	GATC	2	8	755537	755544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19059	NC_014323	GGT	2	6	755610	755615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_014323	TTG	2	6	755623	755628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_014323	CCT	2	6	755672	755677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19062	NC_014323	ATT	2	6	755704	755709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_014323	TGAT	2	8	755748	755755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_014323	GAT	2	6	755907	755912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310029
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19084	NC_014323	GCCGC	2	10	757013	757022	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19085	NC_014323	TGC	2	6	757023	757028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19089	NC_014323	GTC	2	6	757113	757118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310030
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19093	NC_014323	GC	3	6	757192	757197	0 %	0 %	50 %	50 %	300310030
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19107	NC_014323	CGC	2	6	757560	757565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19108	NC_014323	CCG	2	6	757611	757616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19109	NC_014323	CGG	2	6	757632	757637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19110	NC_014323	CAA	3	9	757672	757680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19121	NC_014323	CAC	2	6	758047	758052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310031
19122	NC_014323	GCC	2	6	758120	758125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310031
19123	NC_014323	TACC	2	8	758128	758135	25 %	25 %	0 %	50 %	300310031
19124	NC_014323	TCA	2	6	758193	758198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310031
19125	NC_014323	GGCC	2	8	758212	758219	0 %	0 %	50 %	50 %	300310031
19126	NC_014323	GAA	2	6	758345	758350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310031
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19129	NC_014323	GCC	2	6	758392	758397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310031
19130	NC_014323	CAT	3	9	758452	758460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310031
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19132	NC_014323	GGC	2	6	758567	758572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310031
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19134	NC_014323	CAT	2	6	758623	758628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310031
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19145	NC_014323	AAG	2	6	758876	758881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19147	NC_014323	CAT	2	6	758900	758905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310032
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19161	NC_014323	CAA	2	6	759308	759313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19162	NC_014323	GGA	2	6	759314	759319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19186	NC_014323	CGG	2	6	760310	760315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310034
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19201	NC_014323	GCAC	2	8	760655	760662	25 %	0 %	25 %	50 %	300310034
19202	NC_014323	TGGC	2	8	760726	760733	0 %	25 %	50 %	25 %	300310034
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19213	NC_014323	AGCGA	2	10	761245	761254	40 %	0 %	40 %	20 %	300310035
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19227	NC_014323	GGT	2	6	761768	761773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310035
19228	NC_014323	CTG	2	6	761827	761832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19229	NC_014323	GCG	2	6	761851	761856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19230	NC_014323	CGC	2	6	761859	761864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19231	NC_014323	CGA	2	6	761899	761904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19232	NC_014323	GCA	2	6	761922	761927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19233	NC_014323	CAT	2	6	761952	761957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310036
19234	NC_014323	CAG	2	6	761967	761972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310036
19235	NC_014323	CG	3	6	761975	761980	0 %	0 %	50 %	50 %	300310036
19236	NC_014323	GGTC	2	8	762074	762081	0 %	25 %	50 %	25 %	300310036
19237	NC_014323	G	6	6	762140	762145	0 %	0 %	100 %	0 %	300310036
19238	NC_014323	GGCC	2	8	762209	762216	0 %	0 %	50 %	50 %	300310036
19239	NC_014323	GGC	2	6	762234	762239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310036
19240	NC_014323	CCA	2	6	762251	762256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310036
19241	NC_014323	GGGC	2	8	762274	762281	0 %	0 %	75 %	25 %	300310036
19242	NC_014323	GCC	2	6	762361	762366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310036
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19244	NC_014323	GCAC	2	8	762416	762423	25 %	0 %	25 %	50 %	300310036
19245	NC_014323	CGT	2	6	762440	762445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310036
19246	NC_014323	GCA	2	6	762452	762457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310036
19247	NC_014323	GAT	2	6	762531	762536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310036
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19250	NC_014323	TCT	2	6	762664	762669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310036
19251	NC_014323	CTG	2	6	762678	762683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310036
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19263	NC_014323	GCCG	2	8	763144	763151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19264	NC_014323	CAG	2	6	763251	763256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310037
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19272	NC_014323	CG	3	6	763803	763808	0 %	0 %	50 %	50 %	300310037
19273	NC_014323	GCA	2	6	763814	763819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310037
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19327	NC_014323	GCA	2	6	766211	766216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310039
19328	NC_014323	G	7	7	766273	766279	0 %	0 %	100 %	0 %	300310039
19329	NC_014323	GGA	2	6	766304	766309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19330	NC_014323	ATA	2	6	766337	766342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19331	NC_014323	A	6	6	766356	766361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19332	NC_014323	GGC	2	6	766436	766441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310040
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19335	NC_014323	CAGGAC	2	12	766549	766560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310040
19336	NC_014323	GACC	2	8	766646	766653	25 %	0 %	25 %	50 %	300310040
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19340	NC_014323	GGCG	2	8	766825	766832	0 %	0 %	75 %	25 %	300310040
19341	NC_014323	CGA	2	6	766863	766868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310040
19342	NC_014323	GC	3	6	766932	766937	0 %	0 %	50 %	50 %	300310040
19343	NC_014323	GACGT	2	10	766961	766970	20 %	20 %	40 %	20 %	300310040
19344	NC_014323	GCG	2	6	766982	766987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310040
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19347	NC_014323	TGC	2	6	767069	767074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310040
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19352	NC_014323	GCA	2	6	767402	767407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310040
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19355	NC_014323	CGATA	2	10	767563	767572	40 %	20 %	20 %	20 %	300310040
19356	NC_014323	TGG	2	6	767574	767579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310040
19357	NC_014323	TCA	2	6	767696	767701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310040
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19359	NC_014323	CAG	2	6	767758	767763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310040
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19477	NC_014323	AGGGC	2	10	772161	772170	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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19479	NC_014323	CTT	2	6	772311	772316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19480	NC_014323	A	7	7	772341	772347	100 %	0 %	0 %	0 %	300310044
19481	NC_014323	CCA	2	6	772366	772371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310044
19482	NC_014323	CTT	2	6	772374	772379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310044
19483	NC_014323	GCC	2	6	772389	772394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310044
19484	NC_014323	CGCC	2	8	772402	772409	0 %	0 %	25 %	75 %	300310044
19485	NC_014323	GGC	2	6	772425	772430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310044
19486	NC_014323	ATC	2	6	772455	772460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310044
19487	NC_014323	CGCCAA	2	12	772487	772498	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300310044
19488	NC_014323	CGC	2	6	772522	772527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310044
19489	NC_014323	CTA	2	6	772535	772540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310044
19490	NC_014323	GCC	2	6	772568	772573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310044
19491	NC_014323	GGT	2	6	772580	772585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310044
19492	NC_014323	CCG	3	9	772611	772619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310044
19493	NC_014323	TAC	2	6	772689	772694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310044
19494	NC_014323	TTGA	2	8	772706	772713	25 %	50 %	25 %	0 %	300310044
19495	NC_014323	TGC	2	6	772716	772721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19496	NC_014323	GAC	2	6	772760	772765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19497	NC_014323	T	7	7	772809	772815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19498	NC_014323	GGC	2	6	772819	772824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19499	NC_014323	CGG	2	6	772842	772847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19500	NC_014323	GCG	2	6	772848	772853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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