MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_014323	GGC	2	6	732879	732884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310004
18502	NC_014323	CAT	2	6	732885	732890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310004
18503	NC_014323	CGG	2	6	732963	732968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310004
18504	NC_014323	TGC	2	6	732981	732986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310004
18505	NC_014323	TCT	2	6	732996	733001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310004
18506	NC_014323	TGT	2	6	733049	733054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300310004
18507	NC_014323	GGC	2	6	733074	733079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_014323	ACG	2	6	733143	733148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18509	NC_014323	CTT	2	6	733160	733165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18510	NC_014323	CCTA	2	8	733172	733179	25 %	25 %	0 %	50 %	300310005
18511	NC_014323	CAA	2	6	733211	733216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310005
18512	NC_014323	GAT	2	6	733269	733274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310005
18513	NC_014323	CAG	2	6	733335	733340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18514	NC_014323	TGC	2	6	733346	733351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18515	NC_014323	CTG	2	6	733443	733448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18516	NC_014323	TGG	2	6	733465	733470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310005
18517	NC_014323	GGT	2	6	733508	733513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310005
18518	NC_014323	GCT	2	6	733514	733519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18519	NC_014323	AGA	2	6	733549	733554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310005
18520	NC_014323	TGA	2	6	733559	733564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310005
18521	NC_014323	ACG	2	6	733606	733611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18522	NC_014323	CCA	2	6	733639	733644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310005
18523	NC_014323	GCT	2	6	733688	733693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18524	NC_014323	GGC	2	6	733694	733699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
18525	NC_014323	TGG	2	6	733747	733752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310005
18526	NC_014323	TGGC	2	8	733759	733766	0 %	25 %	50 %	25 %	300310005
18527	NC_014323	CCA	2	6	733777	733782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310005
18528	NC_014323	TCG	2	6	733828	733833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18529	NC_014323	GGC	2	6	733836	733841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
18530	NC_014323	GCC	2	6	733863	733868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310005
18531	NC_014323	TGG	2	6	733906	733911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310005
18532	NC_014323	ACG	2	6	733912	733917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18533	NC_014323	CAT	2	6	733925	733930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310005
18534	NC_014323	GTG	3	9	733977	733985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310005
18535	NC_014323	GGC	3	9	734024	734032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
18536	NC_014323	CGA	3	9	734042	734050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310005
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18538	NC_014323	AGC	2	6	734095	734100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18539	NC_014323	GTTCGA	2	12	734144	734155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300310005
18540	NC_014323	GGC	2	6	734166	734171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
18541	NC_014323	GC	4	8	734184	734191	0 %	0 %	50 %	50 %	300310005
18542	NC_014323	CGC	2	6	734195	734200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310005
18543	NC_014323	CTC	2	6	734201	734206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300310005
18544	NC_014323	CGG	2	6	734222	734227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
18545	NC_014323	GGC	2	6	734240	734245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
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18547	NC_014323	GGC	2	6	734295	734300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
18548	NC_014323	CGG	2	6	734335	734340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310005
18549	NC_014323	CTG	2	6	734349	734354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310005
18550	NC_014323	GCAG	2	8	734397	734404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18551	NC_014323	CGG	2	6	734415	734420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18552	NC_014323	CGC	2	6	734423	734428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18553	NC_014323	GCG	2	6	734436	734441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_014323	GGC	2	6	734444	734449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18555	NC_014323	CG	3	6	734501	734506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18556	NC_014323	CGGGC	2	10	734545	734554	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18557	NC_014323	CTT	2	6	734561	734566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18558	NC_014323	A	6	6	734571	734576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_014323	CAA	2	6	734607	734612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310006
18560	NC_014323	TCG	2	6	734616	734621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310006
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18563	NC_014323	CGA	2	6	734761	734766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310006
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18565	NC_014323	CAT	2	6	734785	734790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310006
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18572	NC_014323	GAT	3	9	735247	735255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310006
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18574	NC_014323	GCT	2	6	735286	735291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310006
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18578	NC_014323	CAA	2	6	735412	735417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300310006
18579	NC_014323	GAT	2	6	735439	735444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310006
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18581	NC_014323	GC	3	6	735687	735692	0 %	0 %	50 %	50 %	300310006
18582	NC_014323	CAC	2	6	735704	735709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300310006
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18585	NC_014323	GTG	2	6	735929	735934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310006
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18587	NC_014323	T	6	6	736031	736036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18588	NC_014323	TCA	2	6	736052	736057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310007
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18590	NC_014323	AGC	2	6	736164	736169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310007
18591	NC_014323	GC	3	6	736181	736186	0 %	0 %	50 %	50 %	300310007
18592	NC_014323	CCG	2	6	736205	736210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310007
18593	NC_014323	CGG	2	6	736256	736261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310007
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18601	NC_014323	CTG	2	6	736777	736782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310007
18602	NC_014323	CGG	2	6	736800	736805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310007
18603	NC_014323	CG	3	6	736958	736963	0 %	0 %	50 %	50 %	300310007
18604	NC_014323	AGCC	2	8	736973	736980	25 %	0 %	25 %	50 %	300310007
18605	NC_014323	GC	3	6	737008	737013	0 %	0 %	50 %	50 %	300310007
18606	NC_014323	GCG	2	6	737093	737098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310007
18607	NC_014323	ACCG	2	8	737153	737160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18608	NC_014323	ACC	2	6	737207	737212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18609	NC_014323	CGA	2	6	737293	737298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310008
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18612	NC_014323	TGAA	2	8	737349	737356	50 %	25 %	25 %	0 %	300310008
18613	NC_014323	GGCAAG	2	12	737366	737377	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	300310008
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18616	NC_014323	GTG	2	6	737504	737509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310008
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18620	NC_014323	CCGG	2	8	737618	737625	0 %	0 %	50 %	50 %	300310008
18621	NC_014323	GCC	2	6	737669	737674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310008
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18625	NC_014323	CAT	3	9	737815	737823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310008
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18627	NC_014323	TGC	2	6	737865	737870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310008
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18629	NC_014323	CCG	2	6	737892	737897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310008
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18736	NC_014323	GTC	2	6	741928	741933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18737	NC_014323	T	6	6	741970	741975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18738	NC_014323	TGA	2	6	742014	742019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310013
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18973	NC_014323	GC	3	6	752108	752113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18974	NC_014323	TTTG	2	8	752116	752123	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18975	NC_014323	CGG	2	6	752143	752148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310023
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18981	NC_014323	TCT	2	6	752317	752322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310023
18982	NC_014323	GGC	2	6	752324	752329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310023
18983	NC_014323	GCA	2	6	752353	752358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300310023
18984	NC_014323	ATC	2	6	752379	752384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310023
18985	NC_014323	TGCA	2	8	752528	752535	25 %	25 %	25 %	25 %	300310023
18986	NC_014323	TGA	2	6	752590	752595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310023
18987	NC_014323	CGGA	2	8	752685	752692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18988	NC_014323	TCA	3	9	752719	752727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18989	NC_014323	A	9	9	752778	752786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18990	NC_014323	T	6	6	752894	752899	0 %	100 %	0 %	0 %	300310024
18991	NC_014323	GCC	2	6	752946	752951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310024
18992	NC_014323	GTG	2	6	752982	752987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310024
18993	NC_014323	GC	3	6	752994	752999	0 %	0 %	50 %	50 %	300310024
18994	NC_014323	GCT	2	6	753019	753024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310024
18995	NC_014323	GCG	4	12	753030	753041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310024
18996	NC_014323	CGC	2	6	753058	753063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310024
18997	NC_014323	TTC	2	6	753074	753079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310024
18998	NC_014323	AGA	2	6	753085	753090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300310024
18999	NC_014323	GGCT	2	8	753144	753151	0 %	25 %	50 %	25 %	300310024
19000	NC_014323	TGA	3	9	753202	753210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300310024

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