MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_014323	GGC	2	6	714515	714520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309984
18004	NC_014323	GGCC	2	8	714541	714548	0 %	0 %	50 %	50 %	300309984
18005	NC_014323	AGG	2	6	714567	714572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309984
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18010	NC_014323	GCC	2	6	714669	714674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309984
18011	NC_014323	CAG	2	6	714791	714796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309984
18012	NC_014323	AGGC	2	8	714797	714804	25 %	0 %	50 %	25 %	300309984
18013	NC_014323	GGA	2	6	714896	714901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309984
18014	NC_014323	TTG	2	6	714927	714932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309984
18015	NC_014323	CTGG	2	8	714948	714955	0 %	25 %	50 %	25 %	300309984
18016	NC_014323	GC	3	6	714961	714966	0 %	0 %	50 %	50 %	300309984
18017	NC_014323	GGC	2	6	714986	714991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309984
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18019	NC_014323	A	6	6	715048	715053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_014323	CTG	2	6	715068	715073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309985
18021	NC_014323	CGT	2	6	715084	715089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309985
18022	NC_014323	GCCA	2	8	715097	715104	25 %	0 %	25 %	50 %	300309985
18023	NC_014323	GCA	2	6	715127	715132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309985
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18048	NC_014323	AGCC	2	8	715916	715923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18049	NC_014323	GGGA	2	8	715948	715955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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18056	NC_014323	GAT	2	6	716221	716226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309986
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18058	NC_014323	GC	3	6	716281	716286	0 %	0 %	50 %	50 %	300309986
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18101	NC_014323	CG	4	8	717667	717674	0 %	0 %	50 %	50 %	300309988
18102	NC_014323	GCG	2	6	717712	717717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309988
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18107	NC_014323	CGT	2	6	717835	717840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309988
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18240	NC_014323	GCT	2	6	722902	722907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309992
18241	NC_014323	TCG	2	6	723077	723082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309992
18242	NC_014323	GAA	2	6	723100	723105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309992
18243	NC_014323	TGGCCA	2	12	723194	723205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309992
18244	NC_014323	CGG	2	6	723228	723233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309992
18245	NC_014323	GCG	2	6	723260	723265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309992
18246	NC_014323	CCA	2	6	723269	723274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309992
18247	NC_014323	GAA	2	6	723309	723314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309992
18248	NC_014323	CGG	2	6	723348	723353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309992
18249	NC_014323	CAT	2	6	723354	723359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309992
18250	NC_014323	GCT	2	6	723391	723396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309992
18251	NC_014323	TGG	2	6	723425	723430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309992
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18253	NC_014323	ATC	2	6	723493	723498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309992
18254	NC_014323	GAA	2	6	723514	723519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309992
18255	NC_014323	GCC	2	6	723520	723525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309992
18256	NC_014323	GCC	2	6	723541	723546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309992
18257	NC_014323	AAGT	2	8	723547	723554	50 %	25 %	25 %	0 %	300309992
18258	NC_014323	GCGCG	2	10	723573	723582	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18259	NC_014323	GCC	2	6	723584	723589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18260	NC_014323	GCC	2	6	723616	723621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18261	NC_014323	GCG	2	6	723623	723628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18262	NC_014323	TCA	2	6	723664	723669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309993
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18264	NC_014323	TCG	2	6	723766	723771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309993
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18266	NC_014323	GCC	2	6	723881	723886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309993
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18268	NC_014323	CGTG	2	8	723965	723972	0 %	25 %	50 %	25 %	300309993
18269	NC_014323	CTG	3	9	724020	724028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309993
18270	NC_014323	CAT	2	6	724076	724081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309993
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18273	NC_014323	CTGGGC	2	12	724170	724181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300309993
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18282	NC_014323	GGT	2	6	724428	724433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309993
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18286	NC_014323	AGGC	2	8	724578	724585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18287	NC_014323	CAGC	2	8	724704	724711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18288	NC_014323	GCG	2	6	724726	724731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18289	NC_014323	CATG	2	8	724749	724756	25 %	25 %	25 %	25 %	300309994
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18292	NC_014323	GCCATC	2	12	724910	724921	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309994
18293	NC_014323	TGC	2	6	724953	724958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309994
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18296	NC_014323	CTG	2	6	724994	724999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309994
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18302	NC_014323	GCCT	2	8	725397	725404	0 %	25 %	25 %	50 %	300309994
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18310	NC_014323	TGC	2	6	725488	725493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18311	NC_014323	GCG	2	6	725541	725546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18312	NC_014323	AGC	2	6	725668	725673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309995
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18314	NC_014323	TCG	2	6	725733	725738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309995
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18323	NC_014323	T	8	8	726209	726216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18324	NC_014323	GCC	2	6	726264	726269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309996
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18327	NC_014323	GGC	2	6	726435	726440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309996
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18329	NC_014323	ATG	2	6	726523	726528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309996
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18331	NC_014323	CTT	2	6	726561	726566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309996
18332	NC_014323	GAT	2	6	726582	726587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309996
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18339	NC_014323	GCG	2	6	726809	726814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309997
18340	NC_014323	GC	3	6	726893	726898	0 %	0 %	50 %	50 %	300309997
18341	NC_014323	CTG	2	6	726914	726919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309997
18342	NC_014323	CTG	3	9	726929	726937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309997
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18346	NC_014323	TTC	2	6	727190	727195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309997
18347	NC_014323	CGCCTT	2	12	727219	727230	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300309997
18348	NC_014323	GGC	2	6	727235	727240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309997
18349	NC_014323	GGC	2	6	727270	727275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309997
18350	NC_014323	GGCG	2	8	727294	727301	0 %	0 %	75 %	25 %	300309997
18351	NC_014323	CG	3	6	727342	727347	0 %	0 %	50 %	50 %	300309997
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18354	NC_014323	GC	3	6	727404	727409	0 %	0 %	50 %	50 %	300309997
18355	NC_014323	GTG	2	6	727431	727436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309997
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18357	NC_014323	CGA	2	6	727449	727454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309997
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18359	NC_014323	GGC	2	6	727553	727558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309997
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18475	NC_014323	GAAG	2	8	732025	732032	50 %	0 %	50 %	0 %	300310003
18476	NC_014323	GC	3	6	732049	732054	0 %	0 %	50 %	50 %	300310003
18477	NC_014323	CGG	2	6	732072	732077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310003
18478	NC_014323	CTG	2	6	732155	732160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310003
18479	NC_014323	TGC	2	6	732189	732194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310003
18480	NC_014323	TGG	2	6	732222	732227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300310003
18481	NC_014323	TTC	2	6	732230	732235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310003
18482	NC_014323	TCA	2	6	732261	732266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310003
18483	NC_014323	TCT	2	6	732267	732272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310003
18484	NC_014323	GCC	2	6	732275	732280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310003
18485	NC_014323	CGC	2	6	732314	732319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310003
18486	NC_014323	CTT	2	6	732331	732336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310003
18487	NC_014323	CTT	2	6	732358	732363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300310003
18488	NC_014323	CCGG	2	8	732398	732405	0 %	0 %	50 %	50 %	300310003
18489	NC_014323	GGCT	2	8	732440	732447	0 %	25 %	50 %	25 %	300310003
18490	NC_014323	CTG	2	6	732479	732484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310003
18491	NC_014323	GCCA	2	8	732485	732492	25 %	0 %	25 %	50 %	300310003
18492	NC_014323	CAT	2	6	732544	732549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300310003
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18495	NC_014323	TGC	2	6	732645	732650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300310003
18496	NC_014323	GCTG	2	8	732724	732731	0 %	25 %	50 %	25 %	300310003
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18499	NC_014323	GCC	2	6	732831	732836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300310004
18500	NC_014323	CGG	3	9	732866	732874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300310004

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