MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_014323	TCG	2	6	676949	676954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309953
17003	NC_014323	GCA	2	6	677067	677072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309953
17004	NC_014323	GAA	2	6	677074	677079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309953
17005	NC_014323	GCCGC	2	10	677100	677109	0 %	0 %	40 %	60 %	300309953
17006	NC_014323	GCCC	2	8	677209	677216	0 %	0 %	25 %	75 %	300309953
17007	NC_014323	GC	3	6	677279	677284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17008	NC_014323	GCG	2	6	677317	677322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_014323	TGTT	2	8	677342	677349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_014323	CTG	2	6	677427	677432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_014323	TGAC	2	8	677629	677636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17012	NC_014323	CGG	2	6	677654	677659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17013	NC_014323	CCGC	2	8	677677	677684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17014	NC_014323	TGA	3	9	677695	677703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_014323	TGT	3	9	677769	677777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_014323	ATG	2	6	677780	677785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_014323	GCA	2	6	677791	677796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_014323	TGG	2	6	677798	677803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_014323	TGG	2	6	677814	677819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_014323	CGG	2	6	677830	677835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_014323	ACCTG	2	10	677844	677853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17022	NC_014323	CGC	3	9	677865	677873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17023	NC_014323	GCC	2	6	677912	677917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309954
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17029	NC_014323	TCG	2	6	678055	678060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309954
17030	NC_014323	GCGG	2	8	678108	678115	0 %	0 %	75 %	25 %	300309954
17031	NC_014323	GGC	2	6	678156	678161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309954
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17035	NC_014323	ACG	2	6	678238	678243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309954
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17051	NC_014323	TCG	2	6	678838	678843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309955
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17061	NC_014323	GCA	2	6	679224	679229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_014323	GA	3	6	679282	679287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_014323	GCT	3	9	679337	679345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309956
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17106	NC_014323	CG	3	6	680692	680697	0 %	0 %	50 %	50 %	300309957
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17354	NC_014323	GCTG	2	8	689558	689565	0 %	25 %	50 %	25 %	300309964
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17367	NC_014323	GC	3	6	690220	690225	0 %	0 %	50 %	50 %	300309965
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17456	NC_014323	TGCC	2	8	693527	693534	0 %	25 %	25 %	50 %	300309969
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17474	NC_014323	GC	5	10	694460	694469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17475	NC_014323	TGC	2	6	694574	694579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309970
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17479	NC_014323	CAG	2	6	694826	694831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309970
17480	NC_014323	TGA	2	6	694852	694857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309970
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17482	NC_014323	GAT	2	6	695039	695044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309970
17483	NC_014323	GC	3	6	695045	695050	0 %	0 %	50 %	50 %	300309970
17484	NC_014323	TCC	2	6	695106	695111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309970
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17495	NC_014323	GC	3	6	695517	695522	0 %	0 %	50 %	50 %	300309970
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