MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_014323	CAC	3	9	655925	655933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309932
16503	NC_014323	GGA	2	6	655946	655951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309932
16504	NC_014323	CGG	2	6	655957	655962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309932
16505	NC_014323	GC	4	8	656115	656122	0 %	0 %	50 %	50 %	300309932
16506	NC_014323	TCGGTG	2	12	656124	656135	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300309932
16507	NC_014323	CGC	3	9	656144	656152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309932
16508	NC_014323	CGC	2	6	656190	656195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309932
16509	NC_014323	CTA	2	6	656246	656251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309932
16510	NC_014323	GC	3	6	656270	656275	0 %	0 %	50 %	50 %	300309932
16511	NC_014323	CCG	2	6	656326	656331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309932
16512	NC_014323	CGG	2	6	656332	656337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309932
16513	NC_014323	CAG	2	6	656343	656348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309932
16514	NC_014323	ATG	2	6	656349	656354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309932
16515	NC_014323	CTG	2	6	656400	656405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309932
16516	NC_014323	GC	4	8	656429	656436	0 %	0 %	50 %	50 %	300309932
16517	NC_014323	GTG	2	6	656523	656528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309932
16518	NC_014323	TGG	2	6	656569	656574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309932
16519	NC_014323	GC	3	6	656799	656804	0 %	0 %	50 %	50 %	300309933
16520	NC_014323	GCC	2	6	656825	656830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309933
16521	NC_014323	GCC	2	6	656926	656931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309933
16522	NC_014323	ACA	2	6	656934	656939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309933
16523	NC_014323	CGC	2	6	657052	657057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309933
16524	NC_014323	CAT	2	6	657145	657150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309933
16525	NC_014323	TCG	2	6	657258	657263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309933
16526	NC_014323	CGGTG	2	10	657271	657280	0 %	20 %	60 %	20 %	300309933
16527	NC_014323	GGC	2	6	657299	657304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309933
16528	NC_014323	AGA	2	6	657351	657356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309933
16529	NC_014323	CTG	2	6	657419	657424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309933
16530	NC_014323	ACCGTG	2	12	657500	657511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309933
16531	NC_014323	GAA	2	6	657532	657537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309933
16532	NC_014323	AAG	2	6	657560	657565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309933
16533	NC_014323	CTG	2	6	657578	657583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309933
16534	NC_014323	GGCCA	2	10	657593	657602	20 %	0 %	40 %	40 %	300309933
16535	NC_014323	GC	3	6	657631	657636	0 %	0 %	50 %	50 %	300309933
16536	NC_014323	AGCA	2	8	657787	657794	50 %	0 %	25 %	25 %	300309934
16537	NC_014323	TTC	2	6	657804	657809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309934
16538	NC_014323	GGCCA	2	10	657817	657826	20 %	0 %	40 %	40 %	300309934
16539	NC_014323	GCCC	2	8	657827	657834	0 %	0 %	25 %	75 %	300309934
16540	NC_014323	GCCA	2	8	657835	657842	25 %	0 %	25 %	50 %	300309934
16541	NC_014323	CGGG	2	8	657854	657861	0 %	0 %	75 %	25 %	300309934
16542	NC_014323	GCT	2	6	657919	657924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16543	NC_014323	TGG	2	6	657939	657944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309934
16544	NC_014323	CGG	3	9	658041	658049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309934
16545	NC_014323	GCT	3	9	658123	658131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16546	NC_014323	GTG	2	6	658166	658171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309934
16547	NC_014323	TCA	2	6	658185	658190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309934
16548	NC_014323	CG	3	6	658308	658313	0 %	0 %	50 %	50 %	300309934
16549	NC_014323	CGT	2	6	658324	658329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16550	NC_014323	GGC	2	6	658330	658335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309934
16551	NC_014323	GAA	2	6	658361	658366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309934
16552	NC_014323	TGC	2	6	658404	658409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16553	NC_014323	TGC	2	6	658416	658421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16554	NC_014323	TGC	2	6	658428	658433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16555	NC_014323	TCG	2	6	658445	658450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16556	NC_014323	GGC	2	6	658504	658509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309934
16557	NC_014323	TGC	2	6	658521	658526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309934
16558	NC_014323	CGG	2	6	658572	658577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309934
16559	NC_014323	GCTGGC	2	12	658618	658629	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300309934
16560	NC_014323	GC	3	6	658628	658633	0 %	0 %	50 %	50 %	300309934
16561	NC_014323	GCG	2	6	658647	658652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309934
16562	NC_014323	CGG	3	9	658656	658664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309934
16563	NC_014323	AGC	2	6	658672	658677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16565	NC_014323	TGG	2	6	658741	658746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309935
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16567	NC_014323	TCG	2	6	658792	658797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309935
16568	NC_014323	CGCTG	2	10	658816	658825	0 %	20 %	40 %	40 %	300309935
16569	NC_014323	CCA	2	6	658855	658860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309935
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16571	NC_014323	GC	3	6	658938	658943	0 %	0 %	50 %	50 %	300309935
16572	NC_014323	CGG	2	6	658949	658954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309935
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16574	NC_014323	GC	3	6	658968	658973	0 %	0 %	50 %	50 %	300309935
16575	NC_014323	TGA	2	6	658990	658995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309935
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16579	NC_014323	CTT	2	6	659213	659218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309935
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16583	NC_014323	TCT	2	6	659404	659409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309935
16584	NC_014323	AGTC	2	8	659471	659478	25 %	25 %	25 %	25 %	300309935
16585	NC_014323	AAG	2	6	659493	659498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309936
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16587	NC_014323	CG	4	8	659547	659554	0 %	0 %	50 %	50 %	300309936
16588	NC_014323	ATCC	2	8	659576	659583	25 %	25 %	0 %	50 %	300309936
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16593	NC_014323	CTG	2	6	659852	659857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309936
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16598	NC_014323	GC	5	10	659936	659945	0 %	0 %	50 %	50 %	300309936
16599	NC_014323	CG	3	6	659958	659963	0 %	0 %	50 %	50 %	300309936
16600	NC_014323	TGC	3	9	659964	659972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309936
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16603	NC_014323	CTA	2	6	660166	660171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309936
16604	NC_014323	TGCCGC	2	12	660270	660281	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300309936
16605	NC_014323	GCC	2	6	660465	660470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309936
16606	NC_014323	TGG	2	6	660476	660481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309936
16607	NC_014323	GCA	2	6	660490	660495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309936
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16609	NC_014323	CCG	2	6	660632	660637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309937
16610	NC_014323	AGC	2	6	660677	660682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309937
16611	NC_014323	TCA	2	6	660698	660703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309937
16612	NC_014323	TGCC	2	8	660741	660748	0 %	25 %	25 %	50 %	300309937
16613	NC_014323	CTG	2	6	660757	660762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309937
16614	NC_014323	TAC	2	6	660781	660786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309937
16615	NC_014323	CTG	2	6	660787	660792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309937
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16617	NC_014323	TGCGC	2	10	660816	660825	0 %	20 %	40 %	40 %	300309937
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16619	NC_014323	G	6	6	660858	660863	0 %	0 %	100 %	0 %	300309937
16620	NC_014323	ATC	2	6	660890	660895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309937
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16980	NC_014323	GCG	2	6	676154	676159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309952
16981	NC_014323	GCCA	2	8	676219	676226	25 %	0 %	25 %	50 %	300309952
16982	NC_014323	ATC	2	6	676246	676251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309952
16983	NC_014323	GC	3	6	676253	676258	0 %	0 %	50 %	50 %	300309952
16984	NC_014323	CAG	2	6	676269	676274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309952
16985	NC_014323	GGC	2	6	676275	676280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309952
16986	NC_014323	CTT	2	6	676292	676297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309952
16987	NC_014323	GAT	2	6	676332	676337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309952
16988	NC_014323	CG	3	6	676355	676360	0 %	0 %	50 %	50 %	300309952
16989	NC_014323	CCG	3	9	676364	676372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309952
16990	NC_014323	GC	3	6	676471	676476	0 %	0 %	50 %	50 %	300309952
16991	NC_014323	GC	3	6	676537	676542	0 %	0 %	50 %	50 %	300309952
16992	NC_014323	GTGG	2	8	676557	676564	0 %	25 %	75 %	0 %	300309952
16993	NC_014323	GCG	2	6	676582	676587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309952
16994	NC_014323	GAA	2	6	676614	676619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16995	NC_014323	GC	3	6	676643	676648	0 %	0 %	50 %	50 %	300309953
16996	NC_014323	CTG	2	6	676660	676665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309953
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16998	NC_014323	CGT	2	6	676695	676700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309953
16999	NC_014323	A	6	6	676763	676768	100 %	0 %	0 %	0 %	300309953
17000	NC_014323	CGG	2	6	676864	676869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309953

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