MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014323	GC	3	6	614069	614074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15502	NC_014323	TCG	2	6	614180	614185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_014323	CCGC	2	8	614193	614200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15504	NC_014323	GC	3	6	614204	614209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15505	NC_014323	CAA	2	6	614251	614256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_014323	CGC	2	6	614304	614309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15507	NC_014323	AGGC	2	8	614314	614321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15508	NC_014323	GC	3	6	614367	614372	0 %	0 %	50 %	50 %	300309893
15509	NC_014323	ACCCG	2	10	614415	614424	20 %	0 %	20 %	60 %	300309893
15510	NC_014323	ATC	2	6	614425	614430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309893
15511	NC_014323	CGA	2	6	614439	614444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309893
15512	NC_014323	CACCGC	2	12	614460	614471	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300309893
15513	NC_014323	CCA	2	6	614516	614521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309893
15514	NC_014323	GTG	3	9	614557	614565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309893
15515	NC_014323	CGT	2	6	614607	614612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309893
15516	NC_014323	CTT	2	6	614643	614648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309893
15517	NC_014323	CGC	2	6	614667	614672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309893
15518	NC_014323	ACC	2	6	614680	614685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309893
15519	NC_014323	TGA	2	6	614705	614710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309893
15520	NC_014323	GCC	2	6	614734	614739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309893
15521	NC_014323	TGG	2	6	614763	614768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309893
15522	NC_014323	CGG	2	6	614775	614780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309893
15523	NC_014323	TCC	2	6	614876	614881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309893
15524	NC_014323	GAA	2	6	614901	614906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309893
15525	NC_014323	GGC	3	9	614967	614975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309893
15526	NC_014323	GC	3	6	614980	614985	0 %	0 %	50 %	50 %	300309893
15527	NC_014323	CAC	2	6	615019	615024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309893
15528	NC_014323	ACG	2	6	615056	615061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309893
15529	NC_014323	CGG	2	6	615092	615097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309893
15530	NC_014323	CAT	2	6	615102	615107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309893
15531	NC_014323	CCG	2	6	615116	615121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309893
15532	NC_014323	GCG	2	6	615125	615130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309893
15533	NC_014323	GCA	2	6	615212	615217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309893
15534	NC_014323	GCG	2	6	615252	615257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309893
15535	NC_014323	CGG	2	6	615258	615263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309893
15536	NC_014323	TCA	2	6	615266	615271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309893
15537	NC_014323	CTG	2	6	615385	615390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309893
15538	NC_014323	CAT	2	6	615426	615431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309893
15539	NC_014323	CACC	2	8	615432	615439	25 %	0 %	0 %	75 %	300309893
15540	NC_014323	CGC	2	6	615456	615461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309893
15541	NC_014323	GC	3	6	615460	615465	0 %	0 %	50 %	50 %	300309893
15542	NC_014323	GGT	2	6	615507	615512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309893
15543	NC_014323	GCC	2	6	615527	615532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15544	NC_014323	CA	3	6	615642	615647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15545	NC_014323	ACC	2	6	615651	615656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15546	NC_014323	GCAG	2	8	615685	615692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15547	NC_014323	ATC	2	6	615740	615745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_014323	CGA	2	6	615787	615792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309894
15549	NC_014323	ACA	2	6	615810	615815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309894
15550	NC_014323	CAC	2	6	615823	615828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309894
15551	NC_014323	CAA	2	6	615895	615900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309894
15552	NC_014323	CAT	2	6	615964	615969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309894
15553	NC_014323	TCG	2	6	616044	616049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309894
15554	NC_014323	TCG	2	6	616080	616085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309894
15555	NC_014323	CGT	2	6	616126	616131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309894
15556	NC_014323	GCT	2	6	616132	616137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309894
15557	NC_014323	GCC	2	6	616252	616257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309894
15558	NC_014323	CAG	2	6	616279	616284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309894
15559	NC_014323	GCGCC	2	10	616416	616425	0 %	0 %	40 %	60 %	300309894
15560	NC_014323	GCG	2	6	616443	616448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309894
15561	NC_014323	AGA	2	6	616512	616517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309894
15562	NC_014323	CCG	3	9	616548	616556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309894
15563	NC_014323	CCAGC	2	10	616567	616576	20 %	0 %	20 %	60 %	300309894
15564	NC_014323	GCC	2	6	616632	616637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309894
15565	NC_014323	TCA	2	6	616674	616679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309894
15566	NC_014323	TC	3	6	616730	616735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15567	NC_014323	A	7	7	616759	616765	100 %	0 %	0 %	0 %	300309895
15568	NC_014323	CCG	2	6	616781	616786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309895
15569	NC_014323	CTGG	2	8	616806	616813	0 %	25 %	50 %	25 %	300309895
15570	NC_014323	AGC	3	9	616904	616912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309895
15571	NC_014323	ACC	2	6	616966	616971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309895
15572	NC_014323	ACG	2	6	617036	617041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309895
15573	NC_014323	GACC	2	8	617121	617128	25 %	0 %	25 %	50 %	300309895
15574	NC_014323	CTC	2	6	617230	617235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309895
15575	NC_014323	GCG	2	6	617260	617265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309895
15576	NC_014323	CAT	2	6	617274	617279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309895
15577	NC_014323	TCT	2	6	617306	617311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309895
15578	NC_014323	GC	3	6	617349	617354	0 %	0 %	50 %	50 %	300309895
15579	NC_014323	ACTG	2	8	617419	617426	25 %	25 %	25 %	25 %	300309895
15580	NC_014323	GAA	2	6	617427	617432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309895
15581	NC_014323	GGC	2	6	617450	617455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309895
15582	NC_014323	AAG	2	6	617563	617568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309895
15583	NC_014323	GGC	2	6	617625	617630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309895
15584	NC_014323	GCGCC	2	10	617637	617646	0 %	0 %	40 %	60 %	300309895
15585	NC_014323	TGC	2	6	617733	617738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309895
15586	NC_014323	CCCA	2	8	617883	617890	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15587	NC_014323	TG	3	6	617937	617942	0 %	50 %	50 %	0 %	300309896
15588	NC_014323	CT	3	6	617997	618002	0 %	50 %	0 %	50 %	300309896
15589	NC_014323	GAC	2	6	618063	618068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309896
15590	NC_014323	GCG	2	6	618085	618090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309896
15591	NC_014323	CCAGGA	2	12	618137	618148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309896
15592	NC_014323	A	6	6	618178	618183	100 %	0 %	0 %	0 %	300309896
15593	NC_014323	GAG	2	6	618216	618221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309896
15594	NC_014323	CCG	2	6	618242	618247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309896
15595	NC_014323	GGC	2	6	618303	618308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309896
15596	NC_014323	GGT	2	6	618309	618314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309896
15597	NC_014323	GAT	2	6	618324	618329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309896
15598	NC_014323	CGC	2	6	618332	618337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309896
15599	NC_014323	ACC	2	6	618379	618384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309896
15600	NC_014323	CGTA	2	8	618498	618505	25 %	25 %	25 %	25 %	300309896
15601	NC_014323	GCC	2	6	618511	618516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309896
15602	NC_014323	CGCTCG	2	12	618526	618537	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300309896
15603	NC_014323	TCC	2	6	618613	618618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15604	NC_014323	TGG	2	6	618629	618634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_014323	TCC	2	6	618649	618654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15606	NC_014323	ATT	2	6	618668	618673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_014323	ATT	2	6	618680	618685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_014323	GGA	2	6	618729	618734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_014323	AGGCCG	2	12	618979	618990	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300309897
15610	NC_014323	TTC	2	6	619093	619098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309897
15611	NC_014323	CAG	2	6	619164	619169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309897
15612	NC_014323	CAC	2	6	619185	619190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309897
15613	NC_014323	TTC	2	6	619218	619223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309897
15614	NC_014323	GTG	2	6	619224	619229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309897
15615	NC_014323	ATGGC	2	10	619339	619348	20 %	20 %	40 %	20 %	300309898
15616	NC_014323	CTT	2	6	619351	619356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309898
15617	NC_014323	CCCT	2	8	619358	619365	0 %	25 %	0 %	75 %	300309898
15618	NC_014323	GCTT	2	8	619375	619382	0 %	50 %	25 %	25 %	300309898
15619	NC_014323	TTA	2	6	619424	619429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300309898
15620	NC_014323	GGC	2	6	619478	619483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309898
15621	NC_014323	CTTGC	2	10	619524	619533	0 %	40 %	20 %	40 %	300309898
15622	NC_014323	CTG	2	6	619536	619541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309898
15623	NC_014323	TTGC	2	8	619590	619597	0 %	50 %	25 %	25 %	300309898
15624	NC_014323	GT	3	6	619602	619607	0 %	50 %	50 %	0 %	300309898
15625	NC_014323	TTC	2	6	619634	619639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309898
15626	NC_014323	GTG	2	6	619749	619754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309898
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15629	NC_014323	CG	3	6	619795	619800	0 %	0 %	50 %	50 %	300309898
15630	NC_014323	ATG	2	6	619863	619868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309898
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15634	NC_014323	TGA	2	6	619973	619978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309898
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15652	NC_014323	GGC	2	6	620582	620587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309899
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15662	NC_014323	ATC	2	6	621202	621207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15663	NC_014323	TC	3	6	621206	621211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15664	NC_014323	GC	3	6	621254	621259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15665	NC_014323	TTGT	2	8	621282	621289	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15666	NC_014323	GA	3	6	621322	621327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15667	NC_014323	GCTCCT	2	12	621426	621437	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15668	NC_014323	CTT	2	6	621493	621498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15669	NC_014323	TGC	2	6	621543	621548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309900
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15672	NC_014323	GTCAGC	2	12	621706	621717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309900
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15675	NC_014323	CCT	2	6	621913	621918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15676	NC_014323	ACCAT	2	10	621937	621946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15677	NC_014323	ATT	2	6	621971	621976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15678	NC_014323	TCA	2	6	622010	622015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309901
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15741	NC_014323	GCT	2	6	624546	624551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309903
15742	NC_014323	ACAT	2	8	624596	624603	50 %	25 %	0 %	25 %	300309903
15743	NC_014323	GGC	2	6	624604	624609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309903
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15760	NC_014323	TCAG	2	8	625155	625162	25 %	25 %	25 %	25 %	300309904
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15861	NC_014323	GCA	2	6	629159	629164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309906
15862	NC_014323	GATC	2	8	629165	629172	25 %	25 %	25 %	25 %	300309906
15863	NC_014323	AAGG	2	8	629191	629198	50 %	0 %	50 %	0 %	300309906
15864	NC_014323	ATC	2	6	629209	629214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309906
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15880	NC_014323	CAT	2	6	629960	629965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15882	NC_014323	TGC	2	6	630020	630025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15884	NC_014323	TTGT	2	8	630048	630055	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15885	NC_014323	CAT	2	6	630106	630111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309907
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15981	NC_014323	AGA	2	6	635285	635290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309913
15982	NC_014323	CTC	2	6	635335	635340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309913
15983	NC_014323	TCT	2	6	635370	635375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309913
15984	NC_014323	CGG	3	9	635391	635399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309913
15985	NC_014323	TTC	2	6	635425	635430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309913
15986	NC_014323	T	6	6	635434	635439	0 %	100 %	0 %	0 %	300309913
15987	NC_014323	TTG	2	6	635513	635518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309913
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15990	NC_014323	TCT	2	6	635670	635675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309913
15991	NC_014323	TTG	2	6	635677	635682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309913
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15993	NC_014323	GGC	2	6	635782	635787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309913
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15997	NC_014323	CAC	2	6	636008	636013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15999	NC_014323	GA	4	8	636132	636139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16000	NC_014323	GAT	2	6	636157	636162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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