MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_014323	GAA	2	6	595432	595437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309875
15003	NC_014323	ACGCGA	2	12	595446	595457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
15004	NC_014323	GCA	2	6	595467	595472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
15005	NC_014323	CAG	2	6	595582	595587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
15006	NC_014323	CTT	2	6	595641	595646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309875
15007	NC_014323	GCG	2	6	595662	595667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309875
15008	NC_014323	GGT	2	6	595669	595674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309875
15009	NC_014323	GGC	2	6	595687	595692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_014323	GGT	2	6	595706	595711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_014323	GGT	2	6	595732	595737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_014323	TCGG	2	8	595758	595765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15013	NC_014323	GGC	2	6	595786	595791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_014323	AAC	2	6	595800	595805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_014323	TGA	2	6	595887	595892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_014323	GCA	2	6	595922	595927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_014323	CAA	3	9	596053	596061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309876
15018	NC_014323	CGG	2	6	596209	596214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309876
15019	NC_014323	AGA	2	6	596223	596228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309876
15020	NC_014323	CCG	2	6	596253	596258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309876
15021	NC_014323	CAG	2	6	596266	596271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309876
15022	NC_014323	GCC	2	6	596312	596317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309876
15023	NC_014323	GCC	2	6	596329	596334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309876
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15025	NC_014323	GCG	2	6	596371	596376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309876
15026	NC_014323	GC	3	6	596386	596391	0 %	0 %	50 %	50 %	300309876
15027	NC_014323	GATCAG	2	12	596392	596403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300309876
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15030	NC_014323	AGGT	2	8	596549	596556	25 %	25 %	50 %	0 %	300309876
15031	NC_014323	TGCGA	2	10	596559	596568	20 %	20 %	40 %	20 %	300309876
15032	NC_014323	GCCT	2	8	596573	596580	0 %	25 %	25 %	50 %	300309876
15033	NC_014323	TGG	2	6	596609	596614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309876
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15036	NC_014323	CAG	2	6	596701	596706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309876
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15040	NC_014323	C	6	6	596825	596830	0 %	0 %	0 %	100 %	300309876
15041	NC_014323	GCCACG	2	12	596840	596851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309876
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15051	NC_014323	GC	3	6	597064	597069	0 %	0 %	50 %	50 %	300309876
15052	NC_014323	AGA	2	6	597114	597119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309876
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15055	NC_014323	CTGG	2	8	597283	597290	0 %	25 %	50 %	25 %	300309876
15056	NC_014323	GTG	2	6	597302	597307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309876
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15060	NC_014323	TGC	2	6	597412	597417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_014323	CCGG	2	8	597434	597441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15062	NC_014323	GTC	2	6	597446	597451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_014323	GC	3	6	597459	597464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15064	NC_014323	GCG	2	6	597487	597492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309877
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15070	NC_014323	CTGG	2	8	597585	597592	0 %	25 %	50 %	25 %	300309877
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15103	NC_014323	CG	3	6	598529	598534	0 %	0 %	50 %	50 %	300309878
15104	NC_014323	GCAC	2	8	598605	598612	25 %	0 %	25 %	50 %	300309878
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15120	NC_014323	TGA	2	6	599118	599123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309878
15121	NC_014323	GCA	2	6	599151	599156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309878
15122	NC_014323	CCA	2	6	599223	599228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309878
15123	NC_014323	GTC	2	6	599311	599316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309878
15124	NC_014323	CCA	2	6	599322	599327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309878
15125	NC_014323	CAC	2	6	599329	599334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309878
15126	NC_014323	CAGGC	2	10	599366	599375	20 %	0 %	40 %	40 %	300309878
15127	NC_014323	GAT	2	6	599392	599397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309878
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15129	NC_014323	CTG	2	6	599431	599436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309878
15130	NC_014323	GCT	3	9	599463	599471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309878
15131	NC_014323	CTG	2	6	599519	599524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_014323	CGG	2	6	599566	599571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309879
15133	NC_014323	GGCA	2	8	599631	599638	25 %	0 %	50 %	25 %	300309879
15134	NC_014323	CTTC	2	8	599701	599708	0 %	50 %	0 %	50 %	300309879
15135	NC_014323	GGC	2	6	599720	599725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309879
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15140	NC_014323	CGC	2	6	599899	599904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309879
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15155	NC_014323	TGGC	2	8	600540	600547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15156	NC_014323	GGT	2	6	600578	600583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15157	NC_014323	GT	3	6	600588	600593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15158	NC_014323	TGC	2	6	600668	600673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15161	NC_014323	GCG	2	6	600744	600749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15241	NC_014323	CTT	2	6	603632	603637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309882
15242	NC_014323	CG	3	6	603653	603658	0 %	0 %	50 %	50 %	300309882
15243	NC_014323	GC	3	6	603697	603702	0 %	0 %	50 %	50 %	300309882
15244	NC_014323	GC	3	6	603727	603732	0 %	0 %	50 %	50 %	300309882
15245	NC_014323	GGC	2	6	603753	603758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309882
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15248	NC_014323	GCT	2	6	603825	603830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309882
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15250	NC_014323	TCG	2	6	603910	603915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309882
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15271	NC_014323	GGAT	2	8	604756	604763	25 %	25 %	50 %	0 %	300309882
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15274	NC_014323	TCA	2	6	605117	605122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15275	NC_014323	ACT	2	6	605300	605305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309883
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15279	NC_014323	CTG	2	6	605494	605499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309883
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15323	NC_014323	GCT	2	6	607404	607409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15342	NC_014323	CAG	2	6	608176	608181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15351	NC_014323	GGGA	2	8	608562	608569	25 %	0 %	75 %	0 %	300309885
15352	NC_014323	CG	3	6	608624	608629	0 %	0 %	50 %	50 %	300309885
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15355	NC_014323	GTC	2	6	608664	608669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309885
15356	NC_014323	GC	4	8	608704	608711	0 %	0 %	50 %	50 %	300309885
15357	NC_014323	CGG	2	6	608714	608719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309885
15358	NC_014323	GGC	2	6	608769	608774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309885
15359	NC_014323	GCG	2	6	608804	608809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309885
15360	NC_014323	CGG	3	9	608852	608860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309885
15361	NC_014323	CTT	3	9	608882	608890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309885
15362	NC_014323	TTG	2	6	608923	608928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309885
15363	NC_014323	TTC	2	6	608970	608975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309885
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15458	NC_014323	GCCA	2	8	612070	612077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15461	NC_014323	GCGA	2	8	612176	612183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15462	NC_014323	GCA	2	6	612254	612259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15464	NC_014323	ACG	2	6	612344	612349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15466	NC_014323	CGT	2	6	612427	612432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15469	NC_014323	GCC	2	6	612575	612580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15470	NC_014323	TCA	2	6	612688	612693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309890
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15472	NC_014323	GCG	2	6	612737	612742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309890
15473	NC_014323	CGCGC	2	10	612751	612760	0 %	0 %	40 %	60 %	300309890
15474	NC_014323	GCG	2	6	612832	612837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15475	NC_014323	TACTG	2	10	612901	612910	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15476	NC_014323	GAA	3	9	612922	612930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15477	NC_014323	GGC	2	6	612979	612984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15478	NC_014323	GC	3	6	613075	613080	0 %	0 %	50 %	50 %	300309891
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15481	NC_014323	TC	3	6	613246	613251	0 %	50 %	0 %	50 %	300309891
15482	NC_014323	TTC	2	6	613263	613268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309891
15483	NC_014323	CCG	3	9	613308	613316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309891
15484	NC_014323	TGC	2	6	613333	613338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309891
15485	NC_014323	CGCC	2	8	613357	613364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15486	NC_014323	GGTTGC	2	12	613365	613376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15487	NC_014323	GT	3	6	613395	613400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15488	NC_014323	TTG	2	6	613416	613421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15489	NC_014323	TCC	2	6	613440	613445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15490	NC_014323	CAT	2	6	613531	613536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15491	NC_014323	TCA	2	6	613637	613642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309892
15492	NC_014323	GCG	2	6	613769	613774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309892
15493	NC_014323	GAC	2	6	613800	613805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309892
15494	NC_014323	CGG	2	6	613857	613862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309892
15495	NC_014323	CAG	2	6	613891	613896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309892
15496	NC_014323	TCC	3	9	613918	613926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309892
15497	NC_014323	GGCAGC	2	12	613927	613938	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300309892
15498	NC_014323	GGC	2	6	613954	613959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309892
15499	NC_014323	AGC	2	6	613982	613987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309892
15500	NC_014323	GCC	2	6	614063	614068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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