MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014323	CTG	2	6	575126	575131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
14502	NC_014323	AGT	2	6	575147	575152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309862
14503	NC_014323	TGC	2	6	575172	575177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
14504	NC_014323	CCG	2	6	575187	575192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
14505	NC_014323	GCCA	2	8	575246	575253	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
14506	NC_014323	GC	3	6	575288	575293	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
14507	NC_014323	CGA	2	6	575365	575370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309862
14508	NC_014323	CGC	2	6	575377	575382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
14509	NC_014323	CAGC	2	8	575551	575558	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
14510	NC_014323	GC	3	6	575650	575655	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
14511	NC_014323	CGC	3	9	575683	575691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
14512	NC_014323	TGCA	2	8	575751	575758	25 %	25 %	25 %	25 %	300309862
14513	NC_014323	GCT	2	6	575794	575799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
14514	NC_014323	GGC	2	6	575800	575805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309862
14515	NC_014323	GCA	2	6	575967	575972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309862
14516	NC_014323	GCA	2	6	575977	575982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309862
14517	NC_014323	ACC	2	6	576078	576083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309862
14518	NC_014323	CAGC	2	8	576103	576110	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
14519	NC_014323	GC	3	6	576146	576151	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
14520	NC_014323	GCCA	2	8	576164	576171	25 %	0 %	25 %	50 %	300309862
14521	NC_014323	GCC	2	6	576257	576262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
14522	NC_014323	AAG	2	6	576279	576284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309862
14523	NC_014323	GCC	2	6	576290	576295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
14524	NC_014323	CGC	2	6	576308	576313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
14525	NC_014323	GCC	2	6	576315	576320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309862
14526	NC_014323	GC	4	8	576373	576380	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
14527	NC_014323	GC	3	6	576384	576389	0 %	0 %	50 %	50 %	300309862
14528	NC_014323	ATG	2	6	576403	576408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309862
14529	NC_014323	CGTG	2	8	576423	576430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14530	NC_014323	CGC	2	6	576465	576470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14531	NC_014323	ATC	2	6	576518	576523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_014323	GCA	3	9	576550	576558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_014323	GC	3	6	576623	576628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14534	NC_014323	GCC	2	6	576748	576753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309863
14535	NC_014323	CTG	2	6	576793	576798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309863
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14537	NC_014323	TGCTGG	2	12	576902	576913	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300309863
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14543	NC_014323	CCA	2	6	577019	577024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309863
14544	NC_014323	CGTGGG	2	12	577041	577052	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300309863
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14549	NC_014323	ATC	2	6	577180	577185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309863
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14553	NC_014323	CG	3	6	577240	577245	0 %	0 %	50 %	50 %	300309863
14554	NC_014323	GC	3	6	577260	577265	0 %	0 %	50 %	50 %	300309864
14555	NC_014323	GC	4	8	577288	577295	0 %	0 %	50 %	50 %	300309864
14556	NC_014323	CGG	2	6	577307	577312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309864
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14560	NC_014323	TCG	2	6	577390	577395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309864
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14562	NC_014323	GC	3	6	577471	577476	0 %	0 %	50 %	50 %	300309864
14563	NC_014323	CCG	2	6	577535	577540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309864
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14622	NC_014323	GAA	2	6	579814	579819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309866
14623	NC_014323	ACC	2	6	579932	579937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309866
14624	NC_014323	TGC	2	6	579960	579965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
14625	NC_014323	TGC	3	9	580011	580019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
14626	NC_014323	GGGCT	2	10	580034	580043	0 %	20 %	60 %	20 %	300309866
14627	NC_014323	CCCG	2	8	580096	580103	0 %	0 %	25 %	75 %	300309866
14628	NC_014323	GCC	2	6	580136	580141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
14629	NC_014323	CAT	2	6	580177	580182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309866
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14632	NC_014323	CGGC	2	8	580338	580345	0 %	0 %	50 %	50 %	300309866
14633	NC_014323	CGCCAC	2	12	580348	580359	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300309866
14634	NC_014323	CAG	2	6	580363	580368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309866
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14636	NC_014323	CTGG	2	8	580405	580412	0 %	25 %	50 %	25 %	300309866
14637	NC_014323	CGC	2	6	580430	580435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
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14639	NC_014323	CCTCG	2	10	580597	580606	0 %	20 %	20 %	60 %	300309866
14640	NC_014323	CGG	2	6	580642	580647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309866
14641	NC_014323	CTG	2	6	580664	580669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
14642	NC_014323	GGC	2	6	580670	580675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309866
14643	NC_014323	CGC	2	6	580676	580681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
14644	NC_014323	ATG	2	6	580688	580693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309866
14645	NC_014323	CTG	2	6	580694	580699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
14646	NC_014323	TGA	2	6	580719	580724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309866
14647	NC_014323	CTG	3	9	580727	580735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
14648	NC_014323	GCC	2	6	580862	580867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309866
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14650	NC_014323	TGG	2	6	580971	580976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309866
14651	NC_014323	GCT	2	6	580984	580989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
14652	NC_014323	GCT	3	9	580999	581007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309866
14653	NC_014323	GGA	2	6	581044	581049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309866
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14655	NC_014323	AAT	2	6	581105	581110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14656	NC_014323	TA	3	6	581139	581144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14657	NC_014323	GCC	2	6	581195	581200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14658	NC_014323	GAG	2	6	581204	581209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14659	NC_014323	CAT	2	6	581215	581220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309867
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14662	NC_014323	GC	3	6	581284	581289	0 %	0 %	50 %	50 %	300309867
14663	NC_014323	CAT	2	6	581323	581328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309867
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14678	NC_014323	GC	3	6	581929	581934	0 %	0 %	50 %	50 %	300309867
14679	NC_014323	GCC	2	6	581937	581942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309867
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14698	NC_014323	CGG	2	6	582781	582786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309867
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14702	NC_014323	ATCGAC	2	12	582869	582880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300309867
14703	NC_014323	CGA	2	6	582916	582921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309867
14704	NC_014323	CGC	2	6	582961	582966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309867
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14706	NC_014323	GCC	2	6	583108	583113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14707	NC_014323	T	7	7	583132	583138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14708	NC_014323	GC	3	6	583154	583159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14709	NC_014323	CGC	2	6	583202	583207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309868
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14715	NC_014323	GC	3	6	583361	583366	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
14716	NC_014323	TGC	2	6	583420	583425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
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14720	NC_014323	GCGCA	2	10	583487	583496	20 %	0 %	40 %	40 %	300309868
14721	NC_014323	CAG	2	6	583502	583507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309868
14722	NC_014323	GTC	2	6	583520	583525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
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14724	NC_014323	GCT	2	6	583637	583642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
14725	NC_014323	AGC	2	6	583647	583652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309868
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14727	NC_014323	CTG	2	6	583745	583750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309868
14728	NC_014323	GC	3	6	583856	583861	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
14729	NC_014323	GAT	2	6	583868	583873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309868
14730	NC_014323	GC	3	6	583896	583901	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
14731	NC_014323	AGG	2	6	583944	583949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309868
14732	NC_014323	GCG	2	6	583968	583973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309868
14733	NC_014323	CCA	3	9	583987	583995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309868
14734	NC_014323	AGGA	2	8	584163	584170	50 %	0 %	50 %	0 %	300309868
14735	NC_014323	GCCA	2	8	584175	584182	25 %	0 %	25 %	50 %	300309868
14736	NC_014323	ATC	2	6	584217	584222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309868
14737	NC_014323	GC	3	6	584236	584241	0 %	0 %	50 %	50 %	300309868
14738	NC_014323	GCA	2	6	584260	584265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309868
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14740	NC_014323	CGG	2	6	584308	584313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309868
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14862	NC_014323	GGCCT	2	10	589853	589862	0 %	20 %	40 %	40 %	300309872
14863	NC_014323	CGT	2	6	589877	589882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309872
14864	NC_014323	TTG	2	6	589895	589900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309872
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14866	NC_014323	GGGCA	2	10	589967	589976	20 %	0 %	60 %	20 %	300309872
14867	NC_014323	CGG	2	6	590037	590042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309872
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14874	NC_014323	CAT	2	6	590326	590331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309872
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14882	NC_014323	TTCT	2	8	590708	590715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14883	NC_014323	CAA	2	6	590726	590731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14884	NC_014323	TC	3	6	590815	590820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14885	NC_014323	GGA	2	6	590843	590848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14887	NC_014323	GTC	2	6	590884	590889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309873
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14935	NC_014323	AGGGC	2	10	592711	592720	20 %	0 %	60 %	20 %	300309874
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14954	NC_014323	CCAGGC	2	12	593230	593241	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309874
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14966	NC_014323	GCC	2	6	593840	593845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309874
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14969	NC_014323	GTCATG	2	12	593910	593921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300309874
14970	NC_014323	TCA	2	6	593994	593999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309875
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14972	NC_014323	GAT	2	6	594034	594039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309875
14973	NC_014323	CCG	2	6	594066	594071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309875
14974	NC_014323	GCC	2	6	594154	594159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309875
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14977	NC_014323	CTTC	2	8	594258	594265	0 %	50 %	0 %	50 %	300309875
14978	NC_014323	ATGGCC	2	12	594278	594289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309875
14979	NC_014323	TGC	2	6	594345	594350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309875
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14982	NC_014323	GCA	2	6	594537	594542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
14983	NC_014323	CCAG	2	8	594555	594562	25 %	0 %	25 %	50 %	300309875
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14985	NC_014323	CAG	2	6	594646	594651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
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14987	NC_014323	GCA	2	6	594810	594815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309875
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