MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014323	GCT	3	9	556259	556267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309844
14002	NC_014323	GGC	2	6	556271	556276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309844
14003	NC_014323	GAG	2	6	556299	556304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309844
14004	NC_014323	CCG	2	6	556342	556347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309844
14005	NC_014323	CAG	2	6	556356	556361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309844
14006	NC_014323	TGG	2	6	556400	556405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309844
14007	NC_014323	GAG	2	6	556440	556445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309844
14008	NC_014323	CTT	2	6	556496	556501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309844
14009	NC_014323	TCA	2	6	556513	556518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_014323	GAC	2	6	556534	556539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_014323	AGCGC	2	10	556702	556711	20 %	0 %	40 %	40 %	300309845
14012	NC_014323	CT	3	6	556714	556719	0 %	50 %	0 %	50 %	300309845
14013	NC_014323	TTG	2	6	556762	556767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309845
14014	NC_014323	CGG	2	6	556901	556906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309845
14015	NC_014323	TCA	2	6	556916	556921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309845
14016	NC_014323	GCA	2	6	556997	557002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309845
14017	NC_014323	CG	3	6	557009	557014	0 %	0 %	50 %	50 %	300309845
14018	NC_014323	GTC	2	6	557040	557045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309845
14019	NC_014323	GC	3	6	557064	557069	0 %	0 %	50 %	50 %	300309845
14020	NC_014323	ACA	2	6	557108	557113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309845
14021	NC_014323	CGC	2	6	557147	557152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309845
14022	NC_014323	ACCG	2	8	557246	557253	25 %	0 %	25 %	50 %	300309845
14023	NC_014323	GTC	2	6	557331	557336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309845
14024	NC_014323	CCG	2	6	557393	557398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309845
14025	NC_014323	TGG	2	6	557417	557422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309845
14026	NC_014323	AGC	2	6	557446	557451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309845
14027	NC_014323	GCG	2	6	557529	557534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309845
14028	NC_014323	ATC	2	6	557575	557580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309845
14029	NC_014323	TTGT	2	8	557594	557601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_014323	CTG	2	6	557603	557608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_014323	CTG	2	6	557657	557662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_014323	GAT	2	6	557665	557670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_014323	CA	3	6	557823	557828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14034	NC_014323	TGC	2	6	557830	557835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309846
14035	NC_014323	CAT	2	6	557852	557857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309846
14036	NC_014323	CGG	2	6	557861	557866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
14037	NC_014323	GGGCT	2	10	557880	557889	0 %	20 %	60 %	20 %	300309846
14038	NC_014323	GCCG	2	8	557957	557964	0 %	0 %	50 %	50 %	300309846
14039	NC_014323	GCG	3	9	557967	557975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
14040	NC_014323	GCA	2	6	557987	557992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309846
14041	NC_014323	TGG	2	6	558001	558006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309846
14042	NC_014323	CTGC	2	8	558025	558032	0 %	25 %	25 %	50 %	300309846
14043	NC_014323	GGC	3	9	558035	558043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
14044	NC_014323	CGC	2	6	558044	558049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309846
14045	NC_014323	CAA	2	6	558086	558091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309846
14046	NC_014323	TGC	2	6	558196	558201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309846
14047	NC_014323	GCA	2	6	558215	558220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309846
14048	NC_014323	TCG	2	6	558243	558248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309846
14049	NC_014323	GCG	3	9	558262	558270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
14050	NC_014323	GGGC	2	8	558278	558285	0 %	0 %	75 %	25 %	300309846
14051	NC_014323	ACT	2	6	558289	558294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309846
14052	NC_014323	CGG	2	6	558295	558300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
14053	NC_014323	GC	4	8	558324	558331	0 %	0 %	50 %	50 %	300309846
14054	NC_014323	CAA	2	6	558404	558409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309846
14055	NC_014323	GAA	2	6	558428	558433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309846
14056	NC_014323	GCC	2	6	558463	558468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309846
14057	NC_014323	GAT	2	6	558480	558485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309846
14058	NC_014323	GCG	2	6	558490	558495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
14059	NC_014323	CGG	2	6	558557	558562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309846
14060	NC_014323	GCCG	2	8	558590	558597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14061	NC_014323	ACG	2	6	558649	558654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309847
14062	NC_014323	GC	3	6	558656	558661	0 %	0 %	50 %	50 %	300309847
14063	NC_014323	AAG	2	6	558663	558668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309847
14064	NC_014323	CGC	2	6	558678	558683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309847
14065	NC_014323	GCC	2	6	558711	558716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309847
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14067	NC_014323	GC	3	6	558812	558817	0 %	0 %	50 %	50 %	300309847
14068	NC_014323	CCA	2	6	558847	558852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309847
14069	NC_014323	GCC	2	6	558856	558861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309847
14070	NC_014323	GGC	2	6	558930	558935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309847
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14073	NC_014323	GC	4	8	559070	559077	0 %	0 %	50 %	50 %	300309847
14074	NC_014323	CAC	2	6	559139	559144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309847
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14076	NC_014323	CAT	2	6	559325	559330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309847
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14079	NC_014323	GC	3	6	559415	559420	0 %	0 %	50 %	50 %	300309847
14080	NC_014323	GCC	2	6	559476	559481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309847
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14085	NC_014323	GC	3	6	559619	559624	0 %	0 %	50 %	50 %	300309847
14086	NC_014323	CTG	2	6	559650	559655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309847
14087	NC_014323	GC	3	6	559669	559674	0 %	0 %	50 %	50 %	300309847
14088	NC_014323	CTT	2	6	559750	559755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_014323	CAG	2	6	559828	559833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309848
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14092	NC_014323	CAG	2	6	559924	559929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309848
14093	NC_014323	GCA	2	6	559956	559961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309848
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14096	NC_014323	CG	4	8	560064	560071	0 %	0 %	50 %	50 %	300309848
14097	NC_014323	CCA	2	6	560097	560102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309848
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14101	NC_014323	CGG	2	6	560163	560168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309848
14102	NC_014323	CGA	2	6	560169	560174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309848
14103	NC_014323	CCCAG	2	10	560217	560226	20 %	0 %	20 %	60 %	300309848
14104	NC_014323	GCC	3	9	560260	560268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309848
14105	NC_014323	GCA	3	9	560382	560390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309848
14106	NC_014323	ATT	2	6	560430	560435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_014323	CATG	2	8	560446	560453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14108	NC_014323	TTGC	2	8	560488	560495	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14109	NC_014323	GAT	2	6	560517	560522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_014323	GCC	2	6	560572	560577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_014323	CGG	2	6	560591	560596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_014323	TCG	2	6	560620	560625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_014323	GAC	2	6	560637	560642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_014323	TGT	2	6	560666	560671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_014323	GCT	2	6	560676	560681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_014323	ATG	2	6	560710	560715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_014323	TG	3	6	560722	560727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_014323	TCA	2	6	560777	560782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_014323	GCTG	2	8	560859	560866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14120	NC_014323	T	6	6	560905	560910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_014323	TGT	2	6	560941	560946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_014323	CTGG	2	8	561046	561053	0 %	25 %	50 %	25 %	300309849
14123	NC_014323	GGC	2	6	561056	561061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309849
14124	NC_014323	ACACGG	2	12	561123	561134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309849
14125	NC_014323	CGG	2	6	561171	561176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309849
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14128	NC_014323	CTG	2	6	561208	561213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309849
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14134	NC_014323	ATC	2	6	561397	561402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309849
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14170	NC_014323	GGTCG	2	10	562698	562707	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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14173	NC_014323	TGA	2	6	562738	562743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14175	NC_014323	CGTG	2	8	562803	562810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14176	NC_014323	A	6	6	562869	562874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14177	NC_014323	G	6	6	562926	562931	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14178	NC_014323	GGC	2	6	562936	562941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14195	NC_014323	ATG	2	6	563701	563706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14197	NC_014323	ACGCC	2	10	563797	563806	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14198	NC_014323	ATGA	2	8	563807	563814	50 %	25 %	25 %	0 %	300309851
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14202	NC_014323	GTCG	2	8	563932	563939	0 %	25 %	50 %	25 %	300309851
14203	NC_014323	CTG	2	6	563951	563956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309851
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14207	NC_014323	AAC	2	6	564280	564285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309852
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14211	NC_014323	GCT	2	6	564454	564459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309852
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14226	NC_014323	GCA	3	9	564918	564926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309852
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14230	NC_014323	GCGT	2	8	565127	565134	0 %	25 %	50 %	25 %	300309852
14231	NC_014323	CAG	2	6	565150	565155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309852
14232	NC_014323	GC	3	6	565181	565186	0 %	0 %	50 %	50 %	300309852
14233	NC_014323	TGG	2	6	565361	565366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309852
14234	NC_014323	GCC	2	6	565372	565377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309852
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14236	NC_014323	TGCTCA	2	12	565424	565435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300309852
14237	NC_014323	CGC	2	6	565449	565454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309852
14238	NC_014323	GC	3	6	565536	565541	0 %	0 %	50 %	50 %	300309852
14239	NC_014323	CGCC	2	8	565553	565560	0 %	0 %	25 %	75 %	300309852
14240	NC_014323	GAG	2	6	565573	565578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309852
14241	NC_014323	CGG	3	9	565611	565619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309852
14242	NC_014323	GTT	2	6	565644	565649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309852
14243	NC_014323	CTG	2	6	565651	565656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309852
14244	NC_014323	GCG	2	6	565670	565675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309852
14245	NC_014323	CGC	2	6	565716	565721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309852
14246	NC_014323	GCT	2	6	565734	565739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309852
14247	NC_014323	GGT	2	6	565845	565850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309852
14248	NC_014323	GGC	2	6	565863	565868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14249	NC_014323	CAG	2	6	565985	565990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14250	NC_014323	CTG	2	6	566090	566095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309853
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14272	NC_014323	GCCG	2	8	566919	566926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14273	NC_014323	GCG	2	6	566938	566943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14274	NC_014323	T	7	7	566949	566955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14275	NC_014323	CATCAG	2	12	566977	566988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300309854
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14279	NC_014323	GTG	2	6	567172	567177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309854
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14282	NC_014323	GGC	2	6	567315	567320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309854
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14290	NC_014323	CGTG	2	8	567674	567681	0 %	25 %	50 %	25 %	300309855
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14297	NC_014323	CCTG	2	8	568074	568081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14298	NC_014323	CGAA	2	8	568090	568097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14299	NC_014323	GCA	3	9	568105	568113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14303	NC_014323	CG	3	6	568287	568292	0 %	0 %	50 %	50 %	300309856
14304	NC_014323	GCC	2	6	568304	568309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309856
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14349	NC_014323	ACCAGC	2	12	569774	569785	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300309858
14350	NC_014323	CGGG	2	8	569799	569806	0 %	0 %	75 %	25 %	300309858
14351	NC_014323	GGC	2	6	569845	569850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309858
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14358	NC_014323	CAG	2	6	570061	570066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309858
14359	NC_014323	CGC	2	6	570091	570096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309858
14360	NC_014323	CG	3	6	570108	570113	0 %	0 %	50 %	50 %	300309858
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14362	NC_014323	GCG	2	6	570189	570194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309858
14363	NC_014323	CAG	2	6	570232	570237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309858
14364	NC_014323	CAG	2	6	570244	570249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309858
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14481	NC_014323	CGG	2	6	574628	574633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309861
14482	NC_014323	CAT	2	6	574657	574662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309861
14483	NC_014323	TGA	2	6	574673	574678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309861
14484	NC_014323	CGC	2	6	574700	574705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309861
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14486	NC_014323	GCG	2	6	574770	574775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14487	NC_014323	CTT	2	6	574801	574806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14488	NC_014323	GTC	2	6	574840	574845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
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14491	NC_014323	TCA	2	6	574931	574936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309862
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14493	NC_014323	GCGT	2	8	574962	574969	0 %	25 %	50 %	25 %	300309862
14494	NC_014323	CTG	2	6	574998	575003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309862
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