MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
138001	NC_014323	GCG	3	9	5452866	5452874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138002	NC_014323	TGGC	2	8	5452976	5452983	0 %	25 %	50 %	25 %	300314033
138003	NC_014323	CAG	2	6	5453029	5453034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314033
138004	NC_014323	AG	3	6	5453047	5453052	50 %	0 %	50 %	0 %	300314033
138005	NC_014323	GCC	2	6	5453072	5453077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314033
138006	NC_014323	AGC	2	6	5453126	5453131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314033
138007	NC_014323	GCG	2	6	5453132	5453137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138008	NC_014323	TCC	2	6	5453141	5453146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300314033
138009	NC_014323	CGG	2	6	5453157	5453162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138010	NC_014323	GCAGGC	2	12	5453166	5453177	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300314033
138011	NC_014323	ATC	2	6	5453209	5453214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314033
138012	NC_014323	CGG	2	6	5453286	5453291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138013	NC_014323	GGC	2	6	5453314	5453319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138014	NC_014323	TGT	2	6	5453346	5453351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300314033
138015	NC_014323	TACCG	2	10	5453419	5453428	20 %	20 %	20 %	40 %	300314033
138016	NC_014323	GTG	2	6	5453435	5453440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314033
138017	NC_014323	GTC	2	6	5453461	5453466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314033
138018	NC_014323	CGG	2	6	5453492	5453497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138019	NC_014323	ACC	2	6	5453504	5453509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314033
138020	NC_014323	CGT	3	9	5453520	5453528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314033
138021	NC_014323	GC	3	6	5453562	5453567	0 %	0 %	50 %	50 %	300314033
138022	NC_014323	CG	3	6	5453617	5453622	0 %	0 %	50 %	50 %	300314033
138023	NC_014323	GC	4	8	5453692	5453699	0 %	0 %	50 %	50 %	300314033
138024	NC_014323	GAA	2	6	5453716	5453721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300314033
138025	NC_014323	CTGG	2	8	5453737	5453744	0 %	25 %	50 %	25 %	300314033
138026	NC_014323	AGGTTG	2	12	5453759	5453770	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	300314033
138027	NC_014323	CGG	2	6	5453811	5453816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138028	NC_014323	ACG	2	6	5453850	5453855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314033
138029	NC_014323	GAA	2	6	5453934	5453939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300314033
138030	NC_014323	GCC	2	6	5453981	5453986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314033
138031	NC_014323	CTG	2	6	5454020	5454025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314033
138032	NC_014323	CGG	2	6	5454053	5454058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314033
138033	NC_014323	GCGG	2	8	5454106	5454113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138034	NC_014323	CGAA	2	8	5454166	5454173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138035	NC_014323	TGCT	2	8	5454186	5454193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138036	NC_014323	CTCACC	2	12	5454354	5454365	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	300314034
138037	NC_014323	ACT	2	6	5454385	5454390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314034
138038	NC_014323	CAG	2	6	5454396	5454401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314034
138039	NC_014323	GAG	2	6	5454417	5454422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300314034
138040	NC_014323	ATG	2	6	5454468	5454473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314034
138041	NC_014323	CGC	2	6	5454483	5454488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314034
138042	NC_014323	GC	3	6	5454522	5454527	0 %	0 %	50 %	50 %	300314034
138043	NC_014323	CTGG	2	8	5454542	5454549	0 %	25 %	50 %	25 %	300314034
138044	NC_014323	CCG	2	6	5454629	5454634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138045	NC_014323	CGC	2	6	5454710	5454715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314035
138046	NC_014323	GCCGCT	2	12	5454719	5454730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300314035
138047	NC_014323	CG	3	6	5454747	5454752	0 %	0 %	50 %	50 %	300314035
138048	NC_014323	GCG	3	9	5454771	5454779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314035
138049	NC_014323	GGCG	2	8	5454796	5454803	0 %	0 %	75 %	25 %	300314035
138050	NC_014323	CGC	2	6	5454874	5454879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314035
138051	NC_014323	CG	3	6	5454897	5454902	0 %	0 %	50 %	50 %	300314035
138052	NC_014323	CTG	2	6	5454956	5454961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314035
138053	NC_014323	ACC	2	6	5455010	5455015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314035
138054	NC_014323	CTT	2	6	5455045	5455050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314035
138055	NC_014323	GCC	2	6	5455093	5455098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314035
138056	NC_014323	CCG	2	6	5455122	5455127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314035
138057	NC_014323	TCGATT	2	12	5455155	5455166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300314035
138058	NC_014323	CGG	2	6	5455203	5455208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314035
138059	NC_014323	GCA	2	6	5455267	5455272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314035
138060	NC_014323	GCG	2	6	5455284	5455289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314035
138061	NC_014323	GCC	2	6	5455294	5455299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314035
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138063	NC_014323	TGG	2	6	5455416	5455421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314035
138064	NC_014323	GAA	2	6	5455460	5455465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300314035
138065	NC_014323	GCA	2	6	5455531	5455536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314035
138066	NC_014323	GCGCC	2	10	5455546	5455555	0 %	0 %	40 %	60 %	300314035
138067	NC_014323	CG	3	6	5455581	5455586	0 %	0 %	50 %	50 %	300314035
138068	NC_014323	CAG	2	6	5455598	5455603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314035
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138070	NC_014323	ACC	2	6	5455637	5455642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314035
138071	NC_014323	GCGCTG	2	12	5455723	5455734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300314035
138072	NC_014323	GCC	2	6	5455850	5455855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314035
138073	NC_014323	TGGG	2	8	5455902	5455909	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138074	NC_014323	GTG	2	6	5455930	5455935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138075	NC_014323	ATT	2	6	5455937	5455942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138076	NC_014323	GCG	2	6	5455947	5455952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138077	NC_014323	AAG	2	6	5455978	5455983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138078	NC_014323	TTG	2	6	5455999	5456004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138079	NC_014323	TGAT	2	8	5456028	5456035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138080	NC_014323	GCT	2	6	5456069	5456074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138081	NC_014323	CCG	2	6	5456127	5456132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314036
138082	NC_014323	TCG	2	6	5456211	5456216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314036
138083	NC_014323	CCA	2	6	5456232	5456237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314036
138084	NC_014323	GAA	2	6	5456249	5456254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300314036
138085	NC_014323	GCC	3	9	5456261	5456269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314036
138086	NC_014323	CTG	2	6	5456303	5456308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314036
138087	NC_014323	GCCCAG	2	12	5456321	5456332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300314036
138088	NC_014323	CTGG	2	8	5456369	5456376	0 %	25 %	50 %	25 %	300314036
138089	NC_014323	CCAACG	2	12	5456529	5456540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300314036
138090	NC_014323	GAA	2	6	5456560	5456565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300314036
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138092	NC_014323	CCA	2	6	5456610	5456615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314036
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138095	NC_014323	GCCA	2	8	5456677	5456684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138096	NC_014323	CAAAA	2	10	5456689	5456698	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138097	NC_014323	CGC	2	6	5456699	5456704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138098	NC_014323	GCG	2	6	5456719	5456724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138099	NC_014323	GGC	2	6	5456735	5456740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138100	NC_014323	CCAGCG	2	12	5456781	5456792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300314037
138101	NC_014323	GGC	2	6	5456818	5456823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314037
138102	NC_014323	ATG	2	6	5456828	5456833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314037
138103	NC_014323	GCCG	2	8	5456857	5456864	0 %	0 %	50 %	50 %	300314037
138104	NC_014323	GTC	2	6	5456902	5456907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314037
138105	NC_014323	CGT	2	6	5456961	5456966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314037
138106	NC_014323	CCA	2	6	5457135	5457140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314037
138107	NC_014323	GCC	3	9	5457163	5457171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314037
138108	NC_014323	CAC	2	6	5457256	5457261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314037
138109	NC_014323	ACC	2	6	5457317	5457322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314037
138110	NC_014323	GCC	2	6	5457341	5457346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314037
138111	NC_014323	GCC	2	6	5457355	5457360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314037
138112	NC_014323	GTG	2	6	5457403	5457408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314037
138113	NC_014323	GGATG	2	10	5457435	5457444	20 %	20 %	60 %	0 %	300314037
138114	NC_014323	CGC	2	6	5457537	5457542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314037
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138116	NC_014323	GCT	2	6	5457678	5457683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314037
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138221	NC_014323	GGC	2	6	5461462	5461467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314039
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138224	NC_014323	GCC	2	6	5461536	5461541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138225	NC_014323	AGG	2	6	5461741	5461746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300314040
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138231	NC_014323	CCA	2	6	5462063	5462068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314040
138232	NC_014323	GCA	2	6	5462126	5462131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314040
138233	NC_014323	GC	3	6	5462138	5462143	0 %	0 %	50 %	50 %	300314040
138234	NC_014323	TC	3	6	5462156	5462161	0 %	50 %	0 %	50 %	300314040
138235	NC_014323	GGA	2	6	5462192	5462197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300314040
138236	NC_014323	AGGC	2	8	5462228	5462235	25 %	0 %	50 %	25 %	300314040
138237	NC_014323	GC	3	6	5462256	5462261	0 %	0 %	50 %	50 %	300314040
138238	NC_014323	GCC	2	6	5462277	5462282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314040
138239	NC_014323	GC	3	6	5462292	5462297	0 %	0 %	50 %	50 %	300314040
138240	NC_014323	GC	3	6	5462308	5462313	0 %	0 %	50 %	50 %	300314040
138241	NC_014323	AGGC	2	8	5462331	5462338	25 %	0 %	50 %	25 %	300314040
138242	NC_014323	CCA	2	6	5462374	5462379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138243	NC_014323	GCA	2	6	5462384	5462389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138244	NC_014323	CT	3	6	5462483	5462488	0 %	50 %	0 %	50 %	300314041
138245	NC_014323	GGC	2	6	5462489	5462494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314041
138246	NC_014323	CTGG	2	8	5462524	5462531	0 %	25 %	50 %	25 %	300314041
138247	NC_014323	GCT	2	6	5462542	5462547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314041
138248	NC_014323	TTCGA	2	10	5462549	5462558	20 %	40 %	20 %	20 %	300314041
138249	NC_014323	CTG	2	6	5462636	5462641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314041
138250	NC_014323	GCC	2	6	5462675	5462680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314041
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138253	NC_014323	GCC	2	6	5462773	5462778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314041
138254	NC_014323	TGA	2	6	5462796	5462801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314041
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138256	NC_014323	TGC	2	6	5462832	5462837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314041
138257	NC_014323	CCTG	2	8	5462844	5462851	0 %	25 %	25 %	50 %	300314041
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138260	NC_014323	CAT	2	6	5462938	5462943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314041
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138264	NC_014323	GCC	2	6	5463008	5463013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314041
138265	NC_014323	GC	3	6	5463021	5463026	0 %	0 %	50 %	50 %	300314041
138266	NC_014323	GCT	3	9	5463106	5463114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314041
138267	NC_014323	GCT	2	6	5463148	5463153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314041
138268	NC_014323	TGC	2	6	5463186	5463191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314041
138269	NC_014323	CG	3	6	5463264	5463269	0 %	0 %	50 %	50 %	300314041
138270	NC_014323	CCA	2	6	5463300	5463305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314041
138271	NC_014323	CCTGG	2	10	5463316	5463325	0 %	20 %	40 %	40 %	300314041
138272	NC_014323	A	6	6	5463360	5463365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138273	NC_014323	GCC	2	6	5463367	5463372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138274	NC_014323	TCA	2	6	5463421	5463426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314042
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138276	NC_014323	GCT	2	6	5463529	5463534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138277	NC_014323	GC	3	6	5463578	5463583	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138278	NC_014323	ATG	2	6	5463591	5463596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314042
138279	NC_014323	CAT	2	6	5463613	5463618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314042
138280	NC_014323	GTC	2	6	5463719	5463724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138281	NC_014323	CTT	2	6	5463746	5463751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300314042
138282	NC_014323	GGCC	2	8	5463754	5463761	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138283	NC_014323	TCA	3	9	5463790	5463798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300314042
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138287	NC_014323	GC	3	6	5464034	5464039	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138288	NC_014323	TGC	2	6	5464065	5464070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138289	NC_014323	GCA	2	6	5464135	5464140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138290	NC_014323	TCAT	2	8	5464206	5464213	25 %	50 %	0 %	25 %	300314042
138291	NC_014323	GTT	2	6	5464235	5464240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300314042
138292	NC_014323	TGA	2	6	5464285	5464290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314042
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138294	NC_014323	GCC	2	6	5464361	5464366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314042
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138296	NC_014323	ATG	2	6	5464452	5464457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300314042
138297	NC_014323	GC	3	6	5464475	5464480	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138298	NC_014323	GGC	2	6	5464513	5464518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314042
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138300	NC_014323	GGTCCA	2	12	5464585	5464596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138301	NC_014323	ACC	2	6	5464602	5464607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314042
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138303	NC_014323	GCA	2	6	5464663	5464668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138304	NC_014323	GCC	2	6	5464761	5464766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314042
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138307	NC_014323	GCA	2	6	5464855	5464860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314042
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138309	NC_014323	TGC	2	6	5464969	5464974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314042
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138312	NC_014323	GC	3	6	5465095	5465100	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138313	NC_014323	GTC	2	6	5465126	5465131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314042
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138320	NC_014323	CAG	2	6	5465267	5465272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138321	NC_014323	AGCG	2	8	5465295	5465302	25 %	0 %	50 %	25 %	300314042
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138329	NC_014323	GC	3	6	5465589	5465594	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138330	NC_014323	GGTC	2	8	5465605	5465612	0 %	25 %	50 %	25 %	300314042
138331	NC_014323	CGC	3	9	5465620	5465628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300314042
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138333	NC_014323	GGC	2	6	5465691	5465696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314042
138334	NC_014323	GAC	2	6	5465707	5465712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138335	NC_014323	GCG	2	6	5465724	5465729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314042
138336	NC_014323	GC	3	6	5465734	5465739	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138337	NC_014323	ACC	2	6	5465814	5465819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314042
138338	NC_014323	GCT	2	6	5465830	5465835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314042
138339	NC_014323	CCGG	2	8	5465890	5465897	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138340	NC_014323	CGTA	2	8	5465967	5465974	25 %	25 %	25 %	25 %	300314042
138341	NC_014323	CAC	2	6	5466056	5466061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300314042
138342	NC_014323	GC	3	6	5466108	5466113	0 %	0 %	50 %	50 %	300314042
138343	NC_014323	CGGCG	2	10	5466118	5466127	0 %	0 %	60 %	40 %	300314042
138344	NC_014323	TGG	2	6	5466166	5466171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300314042
138345	NC_014323	CGGTCG	2	12	5466181	5466192	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300314042
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138347	NC_014323	TTG	2	6	5466243	5466248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300314042
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138463	NC_014323	GGC	2	6	5470223	5470228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
138464	NC_014323	GCCA	2	8	5470242	5470249	25 %	0 %	25 %	50 %	300314045
138465	NC_014323	GGC	2	6	5470262	5470267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300314045
138466	NC_014323	CGC	2	6	5470272	5470277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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138493	NC_014323	CTG	2	6	5471070	5471075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314046
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138500	NC_014323	TGC	2	6	5471359	5471364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300314046

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