MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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136003	NC_014323	TGA	2	6	5375693	5375698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313967
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136114	NC_014323	CCG	2	6	5380136	5380141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313972
136115	NC_014323	GC	3	6	5380296	5380301	0 %	0 %	50 %	50 %	300313972
136116	NC_014323	GCATG	2	10	5380337	5380346	20 %	20 %	40 %	20 %	300313972
136117	NC_014323	CAT	2	6	5380355	5380360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313972
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136119	NC_014323	GCC	2	6	5380389	5380394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313972
136120	NC_014323	GCAC	2	8	5380402	5380409	25 %	0 %	25 %	50 %	300313972
136121	NC_014323	TGC	2	6	5380422	5380427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313972
136122	NC_014323	AAG	2	6	5380482	5380487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313972
136123	NC_014323	CCG	2	6	5380531	5380536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313972
136124	NC_014323	ATC	2	6	5380569	5380574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313972
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136127	NC_014323	GC	3	6	5380653	5380658	0 %	0 %	50 %	50 %	300313972
136128	NC_014323	G	6	6	5380670	5380675	0 %	0 %	100 %	0 %	300313972
136129	NC_014323	GCC	2	6	5380683	5380688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313972
136130	NC_014323	GC	3	6	5380725	5380730	0 %	0 %	50 %	50 %	300313972
136131	NC_014323	GGC	2	6	5380731	5380736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313972
136132	NC_014323	GCC	2	6	5380758	5380763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313972
136133	NC_014323	GC	3	6	5380821	5380826	0 %	0 %	50 %	50 %	300313972
136134	NC_014323	GAC	2	6	5380833	5380838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313972
136135	NC_014323	CCG	2	6	5380852	5380857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313972
136136	NC_014323	CGG	2	6	5380888	5380893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313972
136137	NC_014323	GAG	2	6	5380955	5380960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136138	NC_014323	GCC	2	6	5381092	5381097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
136139	NC_014323	TGA	2	6	5381100	5381105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313973
136140	NC_014323	GC	3	6	5381131	5381136	0 %	0 %	50 %	50 %	300313973
136141	NC_014323	ATC	2	6	5381161	5381166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313973
136142	NC_014323	GCC	2	6	5381167	5381172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
136143	NC_014323	ATCC	2	8	5381197	5381204	25 %	25 %	0 %	50 %	300313973
136144	NC_014323	GCCC	2	8	5381276	5381283	0 %	0 %	25 %	75 %	300313973
136145	NC_014323	GGC	2	6	5381313	5381318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313973
136146	NC_014323	TGCCG	2	10	5381343	5381352	0 %	20 %	40 %	40 %	300313973
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136148	NC_014323	TGC	2	6	5381393	5381398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313973
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136150	NC_014323	GGC	4	12	5381449	5381460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313973
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136153	NC_014323	CGA	2	6	5381544	5381549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313973
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136155	NC_014323	CGC	2	6	5381662	5381667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
136156	NC_014323	GAA	2	6	5381683	5381688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313973
136157	NC_014323	GCGCC	2	10	5381715	5381724	0 %	0 %	40 %	60 %	300313973
136158	NC_014323	GCC	2	6	5381737	5381742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
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136161	NC_014323	CGC	2	6	5381910	5381915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
136162	NC_014323	GGCA	2	8	5381918	5381925	25 %	0 %	50 %	25 %	300313973
136163	NC_014323	GC	3	6	5381974	5381979	0 %	0 %	50 %	50 %	300313973
136164	NC_014323	TGC	2	6	5382045	5382050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313973
136165	NC_014323	GC	3	6	5382077	5382082	0 %	0 %	50 %	50 %	300313973
136166	NC_014323	GA	3	6	5382120	5382125	50 %	0 %	50 %	0 %	300313973
136167	NC_014323	GAT	2	6	5382156	5382161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313973
136168	NC_014323	CGC	2	6	5382195	5382200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
136169	NC_014323	GC	4	8	5382216	5382223	0 %	0 %	50 %	50 %	300313973
136170	NC_014323	GGT	2	6	5382237	5382242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313973
136171	NC_014323	CCA	2	6	5382251	5382256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313973
136172	NC_014323	CAGGC	2	10	5382284	5382293	20 %	0 %	40 %	40 %	300313973
136173	NC_014323	CGG	2	6	5382302	5382307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313973
136174	NC_014323	CGC	2	6	5382353	5382358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
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136176	NC_014323	CCCTGG	2	12	5382380	5382391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313973
136177	NC_014323	CGC	2	6	5382396	5382401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313973
136178	NC_014323	GCA	2	6	5382408	5382413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313973
136179	NC_014323	GCAC	2	8	5382417	5382424	25 %	0 %	25 %	50 %	300313973
136180	NC_014323	CGCAA	2	10	5382449	5382458	40 %	0 %	20 %	40 %	300313973
136181	NC_014323	CTG	2	6	5382481	5382486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313973
136182	NC_014323	ACG	2	6	5382506	5382511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313973
136183	NC_014323	ATC	2	6	5382625	5382630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313973
136184	NC_014323	GGAC	2	8	5382636	5382643	25 %	0 %	50 %	25 %	300313973
136185	NC_014323	GC	3	6	5382651	5382656	0 %	0 %	50 %	50 %	300313973
136186	NC_014323	TGC	2	6	5382662	5382667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313973
136187	NC_014323	ACAGC	2	10	5382705	5382714	40 %	0 %	20 %	40 %	300313973
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136189	NC_014323	GCT	2	6	5382804	5382809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313973
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136194	NC_014323	GGCT	2	8	5383043	5383050	0 %	25 %	50 %	25 %	300313974
136195	NC_014323	GTC	2	6	5383051	5383056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313974
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136199	NC_014323	GGC	2	6	5383167	5383172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313974
136200	NC_014323	CTG	2	6	5383184	5383189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313974
136201	NC_014323	GCG	2	6	5383218	5383223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313974
136202	NC_014323	TGC	2	6	5383228	5383233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313974
136203	NC_014323	CAG	2	6	5383238	5383243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313974
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136210	NC_014323	AGG	2	6	5383464	5383469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313974
136211	NC_014323	CAT	2	6	5383513	5383518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313974
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136213	NC_014323	GAT	2	6	5383637	5383642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313974
136214	NC_014323	CGC	2	6	5383691	5383696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313974
136215	NC_014323	GAT	2	6	5383777	5383782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313974
136216	NC_014323	GCT	2	6	5383795	5383800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313974
136217	NC_014323	GAC	2	6	5383832	5383837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313974
136218	NC_014323	CTCGCC	2	12	5383838	5383849	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	300313974
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136221	NC_014323	CTG	2	6	5384058	5384063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313975
136222	NC_014323	TGC	2	6	5384095	5384100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313975
136223	NC_014323	GCC	2	6	5384133	5384138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313975
136224	NC_014323	CAT	2	6	5384171	5384176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313975
136225	NC_014323	CCG	2	6	5384180	5384185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313975
136226	NC_014323	CGA	2	6	5384192	5384197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313975
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136228	NC_014323	CGG	2	6	5384321	5384326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313975
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136259	NC_014323	CGC	2	6	5385679	5385684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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