MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
135001	NC_014323	GCTG	2	8	5339203	5339210	0 %	25 %	50 %	25 %	300313933
135002	NC_014323	TGC	2	6	5339212	5339217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313933
135003	NC_014323	GCT	3	9	5339222	5339230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313933
135004	NC_014323	ATC	2	6	5339283	5339288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313933
135005	NC_014323	CAA	2	6	5339303	5339308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313933
135006	NC_014323	GCT	2	6	5339325	5339330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313933
135007	NC_014323	GCC	2	6	5339364	5339369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313934
135008	NC_014323	CCG	2	6	5339415	5339420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313934
135009	NC_014323	CAC	2	6	5339518	5339523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313934
135010	NC_014323	GCA	2	6	5339538	5339543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313934
135011	NC_014323	GC	3	6	5339606	5339611	0 %	0 %	50 %	50 %	300313934
135012	NC_014323	GCGT	2	8	5339646	5339653	0 %	25 %	50 %	25 %	300313934
135013	NC_014323	GGC	2	6	5339668	5339673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313934
135014	NC_014323	CG	3	6	5339681	5339686	0 %	0 %	50 %	50 %	300313934
135015	NC_014323	CTGC	2	8	5339733	5339740	0 %	25 %	25 %	50 %	300313934
135016	NC_014323	GC	3	6	5339739	5339744	0 %	0 %	50 %	50 %	300313934
135017	NC_014323	GCT	2	6	5339755	5339760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313934
135018	NC_014323	GC	3	6	5339791	5339796	0 %	0 %	50 %	50 %	300313934
135019	NC_014323	CATGGC	2	12	5339842	5339853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300313934
135020	NC_014323	GAC	2	6	5339856	5339861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313934
135021	NC_014323	GGGCAT	2	12	5339893	5339904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313934
135022	NC_014323	CGA	2	6	5339905	5339910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313934
135023	NC_014323	AGC	2	6	5339925	5339930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313934
135024	NC_014323	GCG	2	6	5339944	5339949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313934
135025	NC_014323	GGT	2	6	5339959	5339964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313934
135026	NC_014323	ACA	2	6	5339976	5339981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313934
135027	NC_014323	GCCG	2	8	5340052	5340059	0 %	0 %	50 %	50 %	300313934
135028	NC_014323	GCA	2	6	5340099	5340104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313934
135029	NC_014323	CTA	2	6	5340153	5340158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313935
135030	NC_014323	GGT	2	6	5340210	5340215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313935
135031	NC_014323	TCG	2	6	5340266	5340271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313935
135032	NC_014323	GTG	2	6	5340274	5340279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313935
135033	NC_014323	CCG	2	6	5340280	5340285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313935
135034	NC_014323	TCA	2	6	5340317	5340322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313935
135035	NC_014323	CCT	2	6	5340332	5340337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313935
135036	NC_014323	CGC	2	6	5340345	5340350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313935
135037	NC_014323	GCT	2	6	5340393	5340398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313935
135038	NC_014323	CG	3	6	5340426	5340431	0 %	0 %	50 %	50 %	300313935
135039	NC_014323	GGC	3	9	5340502	5340510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313935
135040	NC_014323	GCG	2	6	5340521	5340526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313935
135041	NC_014323	AGC	2	6	5340527	5340532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313935
135042	NC_014323	TGA	2	6	5340557	5340562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313935
135043	NC_014323	CG	3	6	5340569	5340574	0 %	0 %	50 %	50 %	300313935
135044	NC_014323	CAT	2	6	5340669	5340674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313935
135045	NC_014323	TGG	2	6	5340677	5340682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313935
135046	NC_014323	GT	3	6	5340697	5340702	0 %	50 %	50 %	0 %	300313935
135047	NC_014323	TCG	2	6	5340728	5340733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313935
135048	NC_014323	GCA	2	6	5340758	5340763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313935
135049	NC_014323	TGA	2	6	5340780	5340785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313935
135050	NC_014323	GGC	2	6	5340819	5340824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313935
135051	NC_014323	GT	3	6	5340838	5340843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135052	NC_014323	CGC	2	6	5340853	5340858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135053	NC_014323	GATG	2	8	5340909	5340916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135054	NC_014323	TCC	2	6	5340921	5340926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135055	NC_014323	GGC	2	6	5340942	5340947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135056	NC_014323	GCC	2	6	5341103	5341108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313936
135057	NC_014323	GACC	2	8	5341116	5341123	25 %	0 %	25 %	50 %	300313936
135058	NC_014323	GC	4	8	5341159	5341166	0 %	0 %	50 %	50 %	300313936
135059	NC_014323	GTG	2	6	5341180	5341185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313936
135060	NC_014323	GCC	2	6	5341214	5341219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313936
135061	NC_014323	CAA	2	6	5341227	5341232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313936
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135065	NC_014323	TGA	2	6	5341421	5341426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313936
135066	NC_014323	TCT	2	6	5341439	5341444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313936
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135081	NC_014323	GC	3	6	5342028	5342033	0 %	0 %	50 %	50 %	300313936
135082	NC_014323	CGG	2	6	5342039	5342044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313936
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135087	NC_014323	GCC	2	6	5342382	5342387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313937
135088	NC_014323	GC	4	8	5342404	5342411	0 %	0 %	50 %	50 %	300313937
135089	NC_014323	GC	3	6	5342452	5342457	0 %	0 %	50 %	50 %	300313937
135090	NC_014323	GC	3	6	5342543	5342548	0 %	0 %	50 %	50 %	300313937
135091	NC_014323	CTG	2	6	5342574	5342579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313937
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135098	NC_014323	CCTCGG	2	12	5342884	5342895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313937
135099	NC_014323	GC	3	6	5342903	5342908	0 %	0 %	50 %	50 %	300313937
135100	NC_014323	GCC	2	6	5342925	5342930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313937
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135102	NC_014323	GCG	2	6	5343033	5343038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313937
135103	NC_014323	GGC	2	6	5343053	5343058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313937
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135105	NC_014323	GC	3	6	5343086	5343091	0 %	0 %	50 %	50 %	300313937
135106	NC_014323	GGGCC	2	10	5343156	5343165	0 %	0 %	60 %	40 %	300313937
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135235	NC_014323	GAT	2	6	5347761	5347766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313941
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135339	NC_014323	CTG	2	6	5352181	5352186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313944
135340	NC_014323	GTG	2	6	5352238	5352243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313944
135341	NC_014323	TCT	2	6	5352290	5352295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313944
135342	NC_014323	GGCC	2	8	5352322	5352329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135343	NC_014323	CCG	2	6	5352408	5352413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135344	NC_014323	TGACG	2	10	5352525	5352534	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135345	NC_014323	T	6	6	5352541	5352546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135451	NC_014323	CATTGC	2	12	5355967	5355978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300313947
135452	NC_014323	GGT	2	6	5355982	5355987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313947
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135454	NC_014323	ACT	2	6	5356044	5356049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313947
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135456	NC_014323	CCG	2	6	5356110	5356115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313947
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135458	NC_014323	CAA	2	6	5356252	5356257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135459	NC_014323	GAG	2	6	5356269	5356274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135460	NC_014323	ATC	2	6	5356310	5356315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313948
135461	NC_014323	GC	3	6	5356341	5356346	0 %	0 %	50 %	50 %	300313948
135462	NC_014323	CGGC	2	8	5356398	5356405	0 %	0 %	50 %	50 %	300313948
135463	NC_014323	CCGG	2	8	5356416	5356423	0 %	0 %	50 %	50 %	300313948
135464	NC_014323	TGG	2	6	5356449	5356454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
135465	NC_014323	CGC	2	6	5356474	5356479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313948
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135467	NC_014323	GCT	3	9	5356495	5356503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
135468	NC_014323	GCT	2	6	5356540	5356545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
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135471	NC_014323	TGG	2	6	5356608	5356613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
135472	NC_014323	TGC	2	6	5356686	5356691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
135473	NC_014323	GTG	2	6	5356706	5356711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
135474	NC_014323	GCG	2	6	5356712	5356717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313948
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135477	NC_014323	CTG	2	6	5356775	5356780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
135478	NC_014323	GCC	2	6	5356787	5356792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313948
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135481	NC_014323	GGT	2	6	5356873	5356878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313948
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135483	NC_014323	CCAGCG	2	12	5356900	5356911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300313948
135484	NC_014323	ATG	2	6	5356916	5356921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313948
135485	NC_014323	CGACC	2	10	5356927	5356936	20 %	0 %	20 %	60 %	300313948
135486	NC_014323	CAT	2	6	5356963	5356968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313948
135487	NC_014323	CGGG	2	8	5356992	5356999	0 %	0 %	75 %	25 %	300313948
135488	NC_014323	GCTG	2	8	5357013	5357020	0 %	25 %	50 %	25 %	300313948
135489	NC_014323	ACC	2	6	5357060	5357065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313948
135490	NC_014323	TCT	2	6	5357073	5357078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313948
135491	NC_014323	GAA	2	6	5357090	5357095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313948
135492	NC_014323	TGC	2	6	5357118	5357123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
135493	NC_014323	CTG	3	9	5357135	5357143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313948
135494	NC_014323	CCT	2	6	5357194	5357199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313948
135495	NC_014323	TCT	2	6	5357220	5357225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313948
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135497	NC_014323	GGC	2	6	5357306	5357311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313948
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135499	NC_014323	TGA	2	6	5357349	5357354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313948
135500	NC_014323	CG	3	6	5357574	5357579	0 %	0 %	50 %	50 %	300313949

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