MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
134501	NC_014323	TCA	2	6	5319324	5319329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313917
134502	NC_014323	TTG	2	6	5319332	5319337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313917
134503	NC_014323	GCC	2	6	5319353	5319358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313917
134504	NC_014323	GAA	2	6	5319440	5319445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313918
134505	NC_014323	CAG	2	6	5319522	5319527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313918
134506	NC_014323	GC	3	6	5319578	5319583	0 %	0 %	50 %	50 %	300313918
134507	NC_014323	TCGCTC	2	12	5319609	5319620	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300313918
134508	NC_014323	GC	3	6	5319657	5319662	0 %	0 %	50 %	50 %	300313918
134509	NC_014323	ACG	2	6	5319670	5319675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313918
134510	NC_014323	GCA	2	6	5319700	5319705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313918
134511	NC_014323	CCA	2	6	5319706	5319711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313918
134512	NC_014323	GTCA	2	8	5319714	5319721	25 %	25 %	25 %	25 %	300313918
134513	NC_014323	GGT	3	9	5319902	5319910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313918
134514	NC_014323	GTG	3	9	5319954	5319962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313918
134515	NC_014323	CAT	2	6	5320025	5320030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313918
134516	NC_014323	CAT	2	6	5320085	5320090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313918
134517	NC_014323	GC	3	6	5320130	5320135	0 %	0 %	50 %	50 %	300313918
134518	NC_014323	GAG	2	6	5320146	5320151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313918
134519	NC_014323	CTT	2	6	5320160	5320165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313918
134520	NC_014323	CCA	2	6	5320174	5320179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313918
134521	NC_014323	GCGT	2	8	5320186	5320193	0 %	25 %	50 %	25 %	300313918
134522	NC_014323	CCG	2	6	5320208	5320213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313918
134523	NC_014323	CTG	2	6	5320323	5320328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313918
134524	NC_014323	TGC	2	6	5320342	5320347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313918
134525	NC_014323	GCC	2	6	5320366	5320371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313918
134526	NC_014323	GC	3	6	5320404	5320409	0 %	0 %	50 %	50 %	300313918
134527	NC_014323	CCG	2	6	5320436	5320441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313918
134528	NC_014323	CTTC	2	8	5320498	5320505	0 %	50 %	0 %	50 %	300313918
134529	NC_014323	GCC	2	6	5320593	5320598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313918
134530	NC_014323	CGG	2	6	5320646	5320651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313918
134531	NC_014323	GTG	2	6	5320662	5320667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313918
134532	NC_014323	CTG	2	6	5320668	5320673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313918
134533	NC_014323	CAGA	2	8	5320677	5320684	50 %	0 %	25 %	25 %	300313918
134534	NC_014323	GAT	2	6	5320700	5320705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313918
134535	NC_014323	GTG	2	6	5320770	5320775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313918
134536	NC_014323	GGA	2	6	5320826	5320831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313918
134537	NC_014323	CAG	2	6	5320898	5320903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313918
134538	NC_014323	CAG	2	6	5320961	5320966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134539	NC_014323	CGC	2	6	5320972	5320977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134540	NC_014323	GCTC	2	8	5320984	5320991	0 %	25 %	25 %	50 %	300313919
134541	NC_014323	GCG	2	6	5320999	5321004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313919
134542	NC_014323	TCT	2	6	5321011	5321016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313919
134543	NC_014323	CTT	2	6	5321023	5321028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313919
134544	NC_014323	GCC	2	6	5321066	5321071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313919
134545	NC_014323	TGA	2	6	5321101	5321106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313919
134546	NC_014323	CCACGC	2	12	5321116	5321127	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300313919
134547	NC_014323	TCT	2	6	5321158	5321163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313919
134548	NC_014323	CCTTGG	2	12	5321179	5321190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313919
134549	NC_014323	CAC	3	9	5321207	5321215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313919
134550	NC_014323	CGAC	2	8	5321217	5321224	25 %	0 %	25 %	50 %	300313919
134551	NC_014323	CCA	2	6	5321230	5321235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313919
134552	NC_014323	CGC	2	6	5321245	5321250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313919
134553	NC_014323	ATC	2	6	5321277	5321282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313919
134554	NC_014323	GCC	2	6	5321345	5321350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313919
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134560	NC_014323	GC	4	8	5321595	5321602	0 %	0 %	50 %	50 %	300313919
134561	NC_014323	GC	3	6	5321647	5321652	0 %	0 %	50 %	50 %	300313920
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134568	NC_014323	TTG	2	6	5321830	5321835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313920
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134573	NC_014323	GC	3	6	5322010	5322015	0 %	0 %	50 %	50 %	300313920
134574	NC_014323	TTCCAG	2	12	5322048	5322059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300313920
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134581	NC_014323	CGG	2	6	5322385	5322390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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134587	NC_014323	CCG	2	6	5322779	5322784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313921
134588	NC_014323	CGA	2	6	5322846	5322851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313921
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134599	NC_014323	GCA	3	9	5323386	5323394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313922
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134601	NC_014323	T	6	6	5323477	5323482	0 %	100 %	0 %	0 %	300313922
134602	NC_014323	CTT	2	6	5323483	5323488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313922
134603	NC_014323	TCC	2	6	5323553	5323558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313922
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134606	NC_014323	CCA	2	6	5323695	5323700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313922
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134610	NC_014323	CG	3	6	5323827	5323832	0 %	0 %	50 %	50 %	300313922
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134614	NC_014323	CGG	2	6	5323917	5323922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313922
134615	NC_014323	GCC	2	6	5323935	5323940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313922
134616	NC_014323	GCA	2	6	5323953	5323958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313922
134617	NC_014323	CG	3	6	5323961	5323966	0 %	0 %	50 %	50 %	300313922
134618	NC_014323	ACC	2	6	5324003	5324008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313922
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134621	NC_014323	ATCC	2	8	5324095	5324102	25 %	25 %	0 %	50 %	300313922
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134623	NC_014323	AAAC	2	8	5324131	5324138	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134624	NC_014323	ATG	2	6	5324180	5324185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134625	NC_014323	AC	3	6	5324210	5324215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134626	NC_014323	CATCGC	2	12	5324297	5324308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300313923
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134643	NC_014323	CAT	2	6	5324926	5324931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313924
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134721	NC_014323	GC	3	6	5328297	5328302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134722	NC_014323	CGT	4	12	5328401	5328412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313926
134723	NC_014323	TGG	2	6	5328418	5328423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313926
134724	NC_014323	GCA	2	6	5328424	5328429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313926
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134726	NC_014323	TGC	2	6	5328517	5328522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313926
134727	NC_014323	GGC	2	6	5328600	5328605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313926
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134729	NC_014323	CAG	2	6	5328666	5328671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313926
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134731	NC_014323	CAG	2	6	5328768	5328773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313926
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134844	NC_014323	CGG	2	6	5333105	5333110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313929
134845	NC_014323	GCT	2	6	5333135	5333140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313929
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