MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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134002	NC_014323	GC	3	6	5301807	5301812	0 %	0 %	50 %	50 %	300313900
134003	NC_014323	CCTT	2	8	5301846	5301853	0 %	50 %	0 %	50 %	300313900
134004	NC_014323	CGG	2	6	5302006	5302011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313900
134005	NC_014323	GCC	2	6	5302070	5302075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313900
134006	NC_014323	GAA	2	6	5302088	5302093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313900
134007	NC_014323	GCAG	2	8	5302117	5302124	25 %	0 %	50 %	25 %	300313900
134008	NC_014323	CAG	2	6	5302127	5302132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313900
134009	NC_014323	GCC	2	6	5302162	5302167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313900
134010	NC_014323	CAG	2	6	5302175	5302180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313900
134011	NC_014323	GAC	2	6	5302182	5302187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313900
134012	NC_014323	GCA	2	6	5302252	5302257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313900
134013	NC_014323	AGG	2	6	5302342	5302347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313900
134014	NC_014323	ACC	2	6	5302362	5302367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313900
134015	NC_014323	GC	3	6	5302394	5302399	0 %	0 %	50 %	50 %	300313900
134016	NC_014323	GAA	2	6	5302412	5302417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313900
134017	NC_014323	CGA	2	6	5302486	5302491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313900
134018	NC_014323	CGT	2	6	5302498	5302503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313900
134019	NC_014323	CAGGTG	2	12	5302517	5302528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313900
134020	NC_014323	CCA	2	6	5302564	5302569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313900
134021	NC_014323	GCCC	2	8	5302591	5302598	0 %	0 %	25 %	75 %	300313900
134022	NC_014323	GCC	2	6	5302629	5302634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313900
134023	NC_014323	GCC	2	6	5302647	5302652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313900
134024	NC_014323	ATG	2	6	5302653	5302658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313900
134025	NC_014323	GAT	2	6	5302679	5302684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313900
134026	NC_014323	TGC	2	6	5302690	5302695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313900
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134029	NC_014323	TGA	2	6	5302759	5302764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313900
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134031	NC_014323	GCC	2	6	5302842	5302847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313900
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134033	NC_014323	CG	4	8	5302927	5302934	0 %	0 %	50 %	50 %	300313900
134034	NC_014323	CAC	2	6	5302946	5302951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313900
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134036	NC_014323	TGG	2	6	5303017	5303022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313900
134037	NC_014323	CG	3	6	5303173	5303178	0 %	0 %	50 %	50 %	300313900
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134047	NC_014323	TTC	2	6	5303673	5303678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313900
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134049	NC_014323	TGCCCA	2	12	5303812	5303823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134050	NC_014323	TGCC	2	8	5303843	5303850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134051	NC_014323	TGT	2	6	5303949	5303954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134052	NC_014323	TCT	2	6	5303955	5303960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134053	NC_014323	GC	3	6	5303965	5303970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134054	NC_014323	TG	3	6	5304000	5304005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134055	NC_014323	AGG	2	6	5304007	5304012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134056	NC_014323	AGCG	2	8	5304046	5304053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134057	NC_014323	TCT	2	6	5304054	5304059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134058	NC_014323	CTGCC	2	10	5304130	5304139	0 %	20 %	20 %	60 %	300313901
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134070	NC_014323	GCTGC	2	10	5304759	5304768	0 %	20 %	40 %	40 %	300313901
134071	NC_014323	ACGC	2	8	5304774	5304781	25 %	0 %	25 %	50 %	300313901
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134084	NC_014323	GCA	2	6	5305127	5305132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313902
134085	NC_014323	CCGGC	2	10	5305167	5305176	0 %	0 %	40 %	60 %	300313902
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134099	NC_014323	GC	3	6	5305508	5305513	0 %	0 %	50 %	50 %	300313902
134100	NC_014323	GCG	2	6	5305669	5305674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313902
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134102	NC_014323	GTC	2	6	5305705	5305710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313902
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134105	NC_014323	GCG	2	6	5305801	5305806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313902
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134113	NC_014323	CGGC	2	8	5306407	5306414	0 %	0 %	50 %	50 %	300313903
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134230	NC_014323	GCC	2	6	5310593	5310598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313908
134231	NC_014323	TCA	2	6	5310604	5310609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313908
134232	NC_014323	GTC	2	6	5310620	5310625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313908
134233	NC_014323	GCCAG	2	10	5310715	5310724	20 %	0 %	40 %	40 %	300313908
134234	NC_014323	TGAAGA	2	12	5310759	5310770	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300313909
134235	NC_014323	AGCCGA	2	12	5310789	5310800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313909
134236	NC_014323	GGT	2	6	5310804	5310809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313909
134237	NC_014323	ACC	2	6	5310857	5310862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313909
134238	NC_014323	CGG	2	6	5310894	5310899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313909
134239	NC_014323	ATC	2	6	5310962	5310967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313909
134240	NC_014323	GAT	2	6	5311051	5311056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313909
134241	NC_014323	AAGG	2	8	5311117	5311124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134242	NC_014323	CCG	2	6	5311165	5311170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134243	NC_014323	GTT	2	6	5311264	5311269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313910
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134247	NC_014323	TGC	2	6	5311350	5311355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313910
134248	NC_014323	CG	3	6	5311447	5311452	0 %	0 %	50 %	50 %	300313910
134249	NC_014323	GCG	2	6	5311458	5311463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313910
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134252	NC_014323	GCT	2	6	5311556	5311561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313910
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134256	NC_014323	CGG	2	6	5311762	5311767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313910
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134262	NC_014323	GCGG	2	8	5311882	5311889	0 %	0 %	75 %	25 %	300313910
134263	NC_014323	TGAGG	2	10	5311920	5311929	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134264	NC_014323	G	6	6	5311928	5311933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134265	NC_014323	CTT	2	6	5311939	5311944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134266	NC_014323	TGCC	2	8	5311957	5311964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134267	NC_014323	GT	3	6	5312010	5312015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134268	NC_014323	AC	3	6	5312027	5312032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134269	NC_014323	CTGACA	3	18	5312120	5312137	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134270	NC_014323	GCCATC	2	12	5312186	5312197	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300313911
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134315	NC_014323	GCC	2	6	5313527	5313532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134316	NC_014323	TCG	2	6	5313630	5313635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313913
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134329	NC_014323	TGC	2	6	5314135	5314140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313913
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134336	NC_014323	C	6	6	5314413	5314418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134337	NC_014323	CT	3	6	5314421	5314426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134338	NC_014323	CAT	2	6	5314446	5314451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313914
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134341	NC_014323	CGG	2	6	5314482	5314487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313914
134342	NC_014323	TCA	2	6	5314544	5314549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313914
134343	NC_014323	CGG	2	6	5314551	5314556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313914
134344	NC_014323	CGC	2	6	5314558	5314563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313914
134345	NC_014323	GCT	2	6	5314569	5314574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313914
134346	NC_014323	GTG	2	6	5314582	5314587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313914
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134373	NC_014323	TTG	2	6	5315230	5315235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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134446	NC_014323	CG	4	8	5317512	5317519	0 %	0 %	50 %	50 %	300313916
134447	NC_014323	CGC	2	6	5317577	5317582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313916
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134451	NC_014323	AGGCC	2	10	5317643	5317652	20 %	0 %	40 %	40 %	300313916
134452	NC_014323	CGA	2	6	5317676	5317681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313916
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134455	NC_014323	CGG	2	6	5317721	5317726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313916
134456	NC_014323	TGC	2	6	5317730	5317735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313916
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134458	NC_014323	GTC	2	6	5317800	5317805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313916
134459	NC_014323	CGA	2	6	5317808	5317813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313916
134460	NC_014323	GC	3	6	5317821	5317826	0 %	0 %	50 %	50 %	300313916
134461	NC_014323	GCA	2	6	5317857	5317862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313917
134462	NC_014323	GAT	2	6	5317874	5317879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313917
134463	NC_014323	CCA	2	6	5317884	5317889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313917
134464	NC_014323	GAT	2	6	5317898	5317903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313917
134465	NC_014323	GCACCA	2	12	5317909	5317920	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300313917
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134477	NC_014323	TGG	2	6	5318356	5318361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313917
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134485	NC_014323	GCC	2	6	5318658	5318663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313917
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134489	NC_014323	GC	4	8	5318761	5318768	0 %	0 %	50 %	50 %	300313917
134490	NC_014323	GTCGA	2	10	5318775	5318784	20 %	20 %	40 %	20 %	300313917
134491	NC_014323	CGC	2	6	5318821	5318826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313917
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