MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_014323	TAC	2	6	5265591	5265596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313871
133002	NC_014323	CTT	2	6	5265641	5265646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313871
133003	NC_014323	GGC	3	9	5265758	5265766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313871
133004	NC_014323	CCA	2	6	5265799	5265804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313871
133005	NC_014323	ACC	2	6	5265850	5265855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313871
133006	NC_014323	GCCGC	2	10	5265865	5265874	0 %	0 %	40 %	60 %	300313871
133007	NC_014323	TGCGC	2	10	5266016	5266025	0 %	20 %	40 %	40 %	300313871
133008	NC_014323	ATGCCG	2	12	5266042	5266053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300313871
133009	NC_014323	GGC	2	6	5266061	5266066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313871
133010	NC_014323	ATC	2	6	5266072	5266077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313871
133011	NC_014323	GC	3	6	5266081	5266086	0 %	0 %	50 %	50 %	300313871
133012	NC_014323	CGC	2	6	5266123	5266128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313871
133013	NC_014323	ATC	2	6	5266143	5266148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313871
133014	NC_014323	GC	3	6	5266185	5266190	0 %	0 %	50 %	50 %	300313871
133015	NC_014323	GGT	2	6	5266199	5266204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313871
133016	NC_014323	GCA	2	6	5266268	5266273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313871
133017	NC_014323	CGT	2	6	5266281	5266286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313871
133018	NC_014323	CGG	2	6	5266309	5266314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313871
133019	NC_014323	TCG	2	6	5266324	5266329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313871
133020	NC_014323	CG	3	6	5266346	5266351	0 %	0 %	50 %	50 %	300313871
133021	NC_014323	TGG	2	6	5266390	5266395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313871
133022	NC_014323	GCT	2	6	5266499	5266504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313871
133023	NC_014323	GC	3	6	5266505	5266510	0 %	0 %	50 %	50 %	300313871
133024	NC_014323	GGC	2	6	5266549	5266554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313871
133025	NC_014323	CGC	2	6	5266576	5266581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313871
133026	NC_014323	CCG	3	9	5266594	5266602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313871
133027	NC_014323	CAT	2	6	5266625	5266630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313871
133028	NC_014323	TC	3	6	5266660	5266665	0 %	50 %	0 %	50 %	300313871
133029	NC_014323	CGA	2	6	5266688	5266693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313871
133030	NC_014323	TCG	2	6	5266696	5266701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313871
133031	NC_014323	CGGCG	2	10	5266725	5266734	0 %	0 %	60 %	40 %	300313871
133032	NC_014323	CCGG	2	8	5266800	5266807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133033	NC_014323	TCC	2	6	5266834	5266839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133034	NC_014323	TCA	2	6	5266872	5266877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313872
133035	NC_014323	GCC	2	6	5266928	5266933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313872
133036	NC_014323	GC	3	6	5266980	5266985	0 %	0 %	50 %	50 %	300313872
133037	NC_014323	GCA	2	6	5266999	5267004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313872
133038	NC_014323	TGAGGA	2	12	5267005	5267016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	300313872
133039	NC_014323	CAG	2	6	5267066	5267071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313872
133040	NC_014323	GCG	2	6	5267209	5267214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313872
133041	NC_014323	CG	3	6	5267213	5267218	0 %	0 %	50 %	50 %	300313872
133042	NC_014323	GCC	2	6	5267246	5267251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313872
133043	NC_014323	ACC	2	6	5267261	5267266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313872
133044	NC_014323	CACGC	2	10	5267312	5267321	20 %	0 %	20 %	60 %	300313872
133045	NC_014323	GC	3	6	5267347	5267352	0 %	0 %	50 %	50 %	300313872
133046	NC_014323	CCAG	2	8	5267442	5267449	25 %	0 %	25 %	50 %	300313873
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133048	NC_014323	GCT	2	6	5267528	5267533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313873
133049	NC_014323	CGG	2	6	5267580	5267585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313873
133050	NC_014323	CCAG	2	8	5267587	5267594	25 %	0 %	25 %	50 %	300313873
133051	NC_014323	CGG	2	6	5267608	5267613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313873
133052	NC_014323	CGC	2	6	5267668	5267673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313873
133053	NC_014323	GCC	2	6	5267674	5267679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313873
133054	NC_014323	AGG	2	6	5267698	5267703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313873
133055	NC_014323	CAT	2	6	5267774	5267779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313873
133056	NC_014323	GTGC	2	8	5267784	5267791	0 %	25 %	50 %	25 %	300313873
133057	NC_014323	GCGG	2	8	5267792	5267799	0 %	0 %	75 %	25 %	300313873
133058	NC_014323	CGG	2	6	5267908	5267913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313873
133059	NC_014323	GC	4	8	5267985	5267992	0 %	0 %	50 %	50 %	300313873
133060	NC_014323	CGATG	2	10	5267995	5268004	20 %	20 %	40 %	20 %	300313873
133061	NC_014323	TCG	2	6	5268075	5268080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313873
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133064	NC_014323	GCA	2	6	5268232	5268237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313873
133065	NC_014323	CGGCG	2	10	5268268	5268277	0 %	0 %	60 %	40 %	300313873
133066	NC_014323	GCGT	2	8	5268295	5268302	0 %	25 %	50 %	25 %	300313873
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133068	NC_014323	GCGG	2	8	5268329	5268336	0 %	0 %	75 %	25 %	300313873
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133073	NC_014323	CGA	2	6	5268500	5268505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313873
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133081	NC_014323	CGG	2	6	5269052	5269057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313874
133082	NC_014323	GCC	2	6	5269063	5269068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313874
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133084	NC_014323	CGG	2	6	5269083	5269088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313874
133085	NC_014323	CG	3	6	5269099	5269104	0 %	0 %	50 %	50 %	300313874
133086	NC_014323	ATC	2	6	5269109	5269114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313874
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133089	NC_014323	CCTG	2	8	5269180	5269187	0 %	25 %	25 %	50 %	300313874
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133091	NC_014323	GCT	2	6	5269215	5269220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133092	NC_014323	AGCC	2	8	5269317	5269324	25 %	0 %	25 %	50 %	300313875
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133098	NC_014323	CGA	2	6	5269577	5269582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313875
133099	NC_014323	GCC	2	6	5269623	5269628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313875
133100	NC_014323	GGT	2	6	5269652	5269657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313875
133101	NC_014323	GCA	2	6	5269658	5269663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313875
133102	NC_014323	CCG	2	6	5269671	5269676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313875
133103	NC_014323	CTG	2	6	5269725	5269730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313875
133104	NC_014323	TGGC	2	8	5269824	5269831	0 %	25 %	50 %	25 %	300313876
133105	NC_014323	GCG	2	6	5269839	5269844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313876
133106	NC_014323	GTA	2	6	5269902	5269907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313876
133107	NC_014323	GGTC	2	8	5269952	5269959	0 %	25 %	50 %	25 %	300313876
133108	NC_014323	GCTC	2	8	5269984	5269991	0 %	25 %	25 %	50 %	300313876
133109	NC_014323	CAG	2	6	5270025	5270030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313876
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133111	NC_014323	GCA	2	6	5270165	5270170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313876
133112	NC_014323	CAC	2	6	5270178	5270183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313876
133113	NC_014323	GC	3	6	5270295	5270300	0 %	0 %	50 %	50 %	300313876
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133115	NC_014323	CAG	2	6	5270343	5270348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313876
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133231	NC_014323	CGA	2	6	5274608	5274613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313879
133232	NC_014323	TGA	2	6	5274614	5274619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313879
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133261	NC_014323	GAT	2	6	5275513	5275518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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133319	NC_014323	TTC	2	6	5277664	5277669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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133338	NC_014323	GGC	2	6	5278381	5278386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133339	NC_014323	GCC	2	6	5278396	5278401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133340	NC_014323	GAGGC	2	10	5278420	5278429	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133341	NC_014323	AAT	2	6	5278446	5278451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133342	NC_014323	GCGA	2	8	5278488	5278495	25 %	0 %	50 %	25 %	300313884
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133344	NC_014323	CCA	2	6	5278517	5278522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313884
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133346	NC_014323	AGC	2	6	5278588	5278593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313884
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133462	NC_014323	GCG	2	6	5283139	5283144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313888
133463	NC_014323	GC	3	6	5283149	5283154	0 %	0 %	50 %	50 %	300313888
133464	NC_014323	GCC	2	6	5283179	5283184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313888
133465	NC_014323	GAA	2	6	5283239	5283244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313888
133466	NC_014323	A	6	6	5283243	5283248	100 %	0 %	0 %	0 %	300313888
133467	NC_014323	ACC	2	6	5283263	5283268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313888
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133470	NC_014323	GCC	2	6	5283371	5283376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313889
133471	NC_014323	GCC	2	6	5283411	5283416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313889
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133473	NC_014323	GCG	3	9	5283442	5283450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313889
133474	NC_014323	CCA	2	6	5283480	5283485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313889
133475	NC_014323	CAGCG	2	10	5283514	5283523	20 %	0 %	40 %	40 %	300313889
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133478	NC_014323	CTC	2	6	5283589	5283594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313889
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133480	NC_014323	CAG	2	6	5283634	5283639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313889
133481	NC_014323	CTGG	2	8	5283643	5283650	0 %	25 %	50 %	25 %	300313889
133482	NC_014323	GCA	2	6	5283684	5283689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313889
133483	NC_014323	GCC	2	6	5283734	5283739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313889
133484	NC_014323	GAT	2	6	5283778	5283783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313889
133485	NC_014323	CGG	2	6	5283786	5283791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313889
133486	NC_014323	GGC	2	6	5283796	5283801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313889
133487	NC_014323	TGA	2	6	5283807	5283812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313889
133488	NC_014323	CCG	3	9	5283825	5283833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313889
133489	NC_014323	CAG	2	6	5283877	5283882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313889
133490	NC_014323	CAC	2	6	5283913	5283918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313889
133491	NC_014323	CG	3	6	5283939	5283944	0 %	0 %	50 %	50 %	300313889
133492	NC_014323	CGA	2	6	5283978	5283983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313889
133493	NC_014323	GA	4	8	5284090	5284097	50 %	0 %	50 %	0 %	300313889
133494	NC_014323	GCG	2	6	5284148	5284153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133495	NC_014323	CTG	2	6	5284165	5284170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133496	NC_014323	TGC	2	6	5284196	5284201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133497	NC_014323	TGC	2	6	5284204	5284209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133498	NC_014323	GTGCT	2	10	5284230	5284239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133499	NC_014323	CG	3	6	5284247	5284252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133500	NC_014323	ACG	2	6	5284280	5284285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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