MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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132502	NC_014323	CGG	2	6	5247459	5247464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313857
132503	NC_014323	GGC	2	6	5247483	5247488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313857
132504	NC_014323	GC	3	6	5247487	5247492	0 %	0 %	50 %	50 %	300313857
132505	NC_014323	CAC	2	6	5247546	5247551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313857
132506	NC_014323	CG	3	6	5247564	5247569	0 %	0 %	50 %	50 %	300313857
132507	NC_014323	CAC	2	6	5247630	5247635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313857
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132517	NC_014323	CGG	2	6	5247925	5247930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313858
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132519	NC_014323	TCG	2	6	5247966	5247971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313858
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132523	NC_014323	GAT	2	6	5248058	5248063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313858
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132525	NC_014323	GC	3	6	5248091	5248096	0 %	0 %	50 %	50 %	300313858
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132614	NC_014323	CAA	2	6	5251689	5251694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132615	NC_014323	GAG	2	6	5251747	5251752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132616	NC_014323	GCTCAC	2	12	5251792	5251803	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300313861
132617	NC_014323	GCT	2	6	5251825	5251830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313861
132618	NC_014323	GGC	2	6	5251861	5251866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313861
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132622	NC_014323	GCG	2	6	5251916	5251921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313861
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132642	NC_014323	GGTG	2	8	5252485	5252492	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132643	NC_014323	CGC	2	6	5252493	5252498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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132645	NC_014323	ACT	2	6	5252517	5252522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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132649	NC_014323	CAT	2	6	5252638	5252643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132650	NC_014323	CGG	2	6	5252667	5252672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132651	NC_014323	GCA	2	6	5252751	5252756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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132663	NC_014323	GA	3	6	5253324	5253329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132664	NC_014323	CGC	2	6	5253357	5253362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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132668	NC_014323	GGGC	2	8	5253477	5253484	0 %	0 %	75 %	25 %	300313863
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132684	NC_014323	GCAG	2	8	5254156	5254163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132685	NC_014323	GAA	2	6	5254266	5254271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313864
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132711	NC_014323	T	6	6	5255156	5255161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132712	NC_014323	GGC	2	6	5255178	5255183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132713	NC_014323	AGGT	2	8	5255188	5255195	25 %	25 %	50 %	0 %	300313865
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132715	NC_014323	TCG	2	6	5255284	5255289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313865
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132717	NC_014323	CCGGG	2	10	5255381	5255390	0 %	0 %	60 %	40 %	300313865
132718	NC_014323	TGC	2	6	5255416	5255421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313865
132719	NC_014323	TGC	2	6	5255506	5255511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313865
132720	NC_014323	GCCA	2	8	5255512	5255519	25 %	0 %	25 %	50 %	300313865
132721	NC_014323	GGC	2	6	5255541	5255546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313865
132722	NC_014323	TGC	2	6	5255563	5255568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313865
132723	NC_014323	GA	3	6	5255632	5255637	50 %	0 %	50 %	0 %	300313865
132724	NC_014323	CCA	2	6	5255690	5255695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313865
132725	NC_014323	TGCCG	2	10	5255706	5255715	0 %	20 %	40 %	40 %	300313865
132726	NC_014323	CG	3	6	5255858	5255863	0 %	0 %	50 %	50 %	300313865
132727	NC_014323	GC	3	6	5255872	5255877	0 %	0 %	50 %	50 %	300313865
132728	NC_014323	CG	3	6	5255884	5255889	0 %	0 %	50 %	50 %	300313865
132729	NC_014323	GAA	2	6	5255908	5255913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313865
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132848	NC_014323	CGC	2	6	5260089	5260094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132849	NC_014323	GCCC	2	8	5260140	5260147	0 %	0 %	25 %	75 %	300313868
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132851	NC_014323	GCTC	2	8	5260313	5260320	0 %	25 %	25 %	50 %	300313868
132852	NC_014323	GC	3	6	5260343	5260348	0 %	0 %	50 %	50 %	300313868
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132963	NC_014323	TGG	2	6	5263839	5263844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313869
132964	NC_014323	GCC	2	6	5263912	5263917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313869
132965	NC_014323	GC	4	8	5263938	5263945	0 %	0 %	50 %	50 %	300313869
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132967	NC_014323	TGCG	2	8	5264028	5264035	0 %	25 %	50 %	25 %	300313869
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132969	NC_014323	CGG	2	6	5264101	5264106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132970	NC_014323	CAGCA	2	10	5264174	5264183	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132971	NC_014323	CG	3	6	5264317	5264322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132972	NC_014323	GCG	2	6	5264325	5264330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132973	NC_014323	GATG	2	8	5264379	5264386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132974	NC_014323	CTG	2	6	5264403	5264408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132975	NC_014323	CTTC	2	8	5264437	5264444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132976	NC_014323	GCG	2	6	5264457	5264462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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132986	NC_014323	GC	3	6	5265040	5265045	0 %	0 %	50 %	50 %	300313870
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