MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131001	NC_014323	TGG	2	6	5189470	5189475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313812
131002	NC_014323	CAT	2	6	5189477	5189482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313812
131003	NC_014323	GCCT	2	8	5189490	5189497	0 %	25 %	25 %	50 %	300313812
131004	NC_014323	CTG	4	12	5189532	5189543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313812
131005	NC_014323	CCG	2	6	5189548	5189553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313812
131006	NC_014323	GACG	2	8	5189558	5189565	25 %	0 %	50 %	25 %	300313812
131007	NC_014323	GCA	2	6	5189641	5189646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313812
131008	NC_014323	A	9	9	5189717	5189725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131009	NC_014323	GCG	2	6	5189787	5189792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131010	NC_014323	GCC	3	9	5189796	5189804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131011	NC_014323	TGC	2	6	5189828	5189833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313813
131012	NC_014323	GCT	2	6	5189857	5189862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313813
131013	NC_014323	CAT	2	6	5189874	5189879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313813
131014	NC_014323	GA	3	6	5189885	5189890	50 %	0 %	50 %	0 %	300313813
131015	NC_014323	CTTGGC	2	12	5189908	5189919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313813
131016	NC_014323	ATG	2	6	5189984	5189989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313813
131017	NC_014323	CGT	2	6	5189997	5190002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313813
131018	NC_014323	GTA	2	6	5190025	5190030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313813
131019	NC_014323	AGA	2	6	5190084	5190089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313813
131020	NC_014323	GCA	2	6	5190107	5190112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313813
131021	NC_014323	CTT	2	6	5190127	5190132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313813
131022	NC_014323	GTA	2	6	5190133	5190138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313813
131023	NC_014323	GCTGG	2	10	5190169	5190178	0 %	20 %	60 %	20 %	300313813
131024	NC_014323	TGG	2	6	5190201	5190206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313813
131025	NC_014323	TGT	2	6	5190240	5190245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313813
131026	NC_014323	CCA	2	6	5190261	5190266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313813
131027	NC_014323	CCCAG	2	10	5190285	5190294	20 %	0 %	20 %	60 %	300313813
131028	NC_014323	CGC	2	6	5190369	5190374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313813
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131030	NC_014323	AGT	2	6	5190465	5190470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313813
131031	NC_014323	GGT	2	6	5190514	5190519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313813
131032	NC_014323	CCA	2	6	5190537	5190542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313813
131033	NC_014323	GCC	2	6	5190553	5190558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313813
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131035	NC_014323	GTT	2	6	5190763	5190768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313813
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131039	NC_014323	TTG	2	6	5190893	5190898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131040	NC_014323	TCT	2	6	5190946	5190951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131041	NC_014323	ACGG	2	8	5190987	5190994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131042	NC_014323	GCG	2	6	5191104	5191109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313814
131043	NC_014323	GC	3	6	5191115	5191120	0 %	0 %	50 %	50 %	300313814
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131050	NC_014323	TTG	3	9	5191385	5191393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313814
131051	NC_014323	CGG	2	6	5191407	5191412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313814
131052	NC_014323	GCG	2	6	5191446	5191451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313814
131053	NC_014323	CTG	2	6	5191456	5191461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313814
131054	NC_014323	TTG	2	6	5191475	5191480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313814
131055	NC_014323	AGC	2	6	5191481	5191486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313814
131056	NC_014323	CTT	2	6	5191587	5191592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313814
131057	NC_014323	CAG	2	6	5191630	5191635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313814
131058	NC_014323	GC	3	6	5191659	5191664	0 %	0 %	50 %	50 %	300313814
131059	NC_014323	GCT	3	9	5191680	5191688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313814
131060	NC_014323	GCC	2	6	5191690	5191695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313814
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131062	NC_014323	GC	4	8	5191903	5191910	0 %	0 %	50 %	50 %	300313814
131063	NC_014323	GC	3	6	5191976	5191981	0 %	0 %	50 %	50 %	300313814
131064	NC_014323	CAG	2	6	5192014	5192019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313814
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131068	NC_014323	ATG	2	6	5192129	5192134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313814
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131076	NC_014323	CTT	2	6	5192501	5192506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313815
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131083	NC_014323	GGCC	2	8	5192729	5192736	0 %	0 %	50 %	50 %	300313815
131084	NC_014323	GCC	2	6	5192853	5192858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313815
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131087	NC_014323	ATG	2	6	5193013	5193018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313815
131088	NC_014323	AGC	2	6	5193028	5193033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313815
131089	NC_014323	GC	4	8	5193093	5193100	0 %	0 %	50 %	50 %	300313815
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131099	NC_014323	GAA	2	6	5193324	5193329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313815
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131104	NC_014323	AGCCGA	2	12	5193623	5193634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313815
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131114	NC_014323	GAC	2	6	5194060	5194065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131115	NC_014323	CGC	2	6	5194073	5194078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131116	NC_014323	GAAC	2	8	5194129	5194136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131117	NC_014323	ATG	2	6	5194222	5194227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131118	NC_014323	ATG	2	6	5194240	5194245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131119	NC_014323	AAT	2	6	5194248	5194253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131120	NC_014323	CTT	2	6	5194257	5194262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313816
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131181	NC_014323	GCT	2	6	5196541	5196546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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131228	NC_014323	GGC	2	6	5198495	5198500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313819
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131230	NC_014323	GGC	2	6	5198657	5198662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313819
131231	NC_014323	TGG	2	6	5198751	5198756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313819
131232	NC_014323	GTG	2	6	5198777	5198782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313819
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131286	NC_014323	C	6	6	5200660	5200665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131287	NC_014323	GAAATA	3	18	5200669	5200686	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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131292	NC_014323	CCG	2	6	5200774	5200779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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131342	NC_014323	GTTCT	2	10	5202510	5202519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131343	NC_014323	GGC	2	6	5202589	5202594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313822
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131346	NC_014323	GGCC	2	8	5202678	5202685	0 %	0 %	50 %	50 %	300313822
131347	NC_014323	CGT	2	6	5202696	5202701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313822
131348	NC_014323	GC	3	6	5202780	5202785	0 %	0 %	50 %	50 %	300313822
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131365	NC_014323	CGT	2	6	5203497	5203502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313822
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131430	NC_014323	GC	3	6	5205362	5205367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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131456	NC_014323	CTG	2	6	5206071	5206076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313824
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131458	NC_014323	TTA	2	6	5206206	5206211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131459	NC_014323	GC	3	6	5206250	5206255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131460	NC_014323	CAACA	2	10	5206289	5206298	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
131461	NC_014323	GCA	2	6	5206309	5206314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131462	NC_014323	TCA	2	6	5206326	5206331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131463	NC_014323	TTC	2	6	5206426	5206431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313825
131464	NC_014323	ATC	2	6	5206432	5206437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313825
131465	NC_014323	CCA	2	6	5206499	5206504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313825
131466	NC_014323	AATG	2	8	5206507	5206514	50 %	25 %	25 %	0 %	300313825
131467	NC_014323	CGC	2	6	5206518	5206523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313825
131468	NC_014323	GCC	3	9	5206543	5206551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313825
131469	NC_014323	TCA	2	6	5206583	5206588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313825
131470	NC_014323	GCG	2	6	5206604	5206609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313825
131471	NC_014323	CAC	2	6	5206620	5206625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313825
131472	NC_014323	AAGAC	2	10	5206637	5206646	60 %	0 %	20 %	20 %	300313825
131473	NC_014323	GCC	2	6	5206660	5206665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313825
131474	NC_014323	CCGC	2	8	5206694	5206701	0 %	0 %	25 %	75 %	300313825
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131476	NC_014323	AAG	2	6	5206771	5206776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313825
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131479	NC_014323	GTG	2	6	5206828	5206833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313825
131480	NC_014323	GCG	2	6	5206834	5206839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313825
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131482	NC_014323	CAA	2	6	5206959	5206964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313825
131483	NC_014323	GGAAT	2	10	5206974	5206983	40 %	20 %	40 %	0 %	300313825
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131485	NC_014323	CTGGTG	2	12	5207176	5207187	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300313825
131486	NC_014323	TGG	2	6	5207192	5207197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313825
131487	NC_014323	CAT	2	6	5207205	5207210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313825
131488	NC_014323	CAC	2	6	5207220	5207225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313825
131489	NC_014323	CG	3	6	5207246	5207251	0 %	0 %	50 %	50 %	300313825
131490	NC_014323	GCGCC	2	10	5207253	5207262	0 %	0 %	40 %	60 %	300313825
131491	NC_014323	GCG	2	6	5207394	5207399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313825
131492	NC_014323	CAG	2	6	5207400	5207405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313825
131493	NC_014323	TCC	2	6	5207422	5207427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313825
131494	NC_014323	TC	3	6	5207454	5207459	0 %	50 %	0 %	50 %	300313825
131495	NC_014323	GC	3	6	5207461	5207466	0 %	0 %	50 %	50 %	300313825
131496	NC_014323	GC	3	6	5207483	5207488	0 %	0 %	50 %	50 %	300313825
131497	NC_014323	GAA	2	6	5207491	5207496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313825
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131499	NC_014323	CGCC	2	8	5207550	5207557	0 %	0 %	25 %	75 %	300313825
131500	NC_014323	CGC	2	6	5207592	5207597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313825

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