MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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130502	NC_014323	GCGCC	2	10	5170374	5170383	0 %	0 %	40 %	60 %	300313792
130503	NC_014323	GCCG	2	8	5170385	5170392	0 %	0 %	50 %	50 %	300313792
130504	NC_014323	CAG	2	6	5170395	5170400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313792
130505	NC_014323	CCA	2	6	5170445	5170450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313792
130506	NC_014323	GCA	3	9	5170487	5170495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313792
130507	NC_014323	CAT	2	6	5170517	5170522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313792
130508	NC_014323	GGC	2	6	5170542	5170547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313792
130509	NC_014323	GGC	3	9	5170566	5170574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313792
130510	NC_014323	GCG	2	6	5170603	5170608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313792
130511	NC_014323	TTATCG	2	12	5170639	5170650	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130512	NC_014323	GCT	2	6	5170805	5170810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130513	NC_014323	TCC	2	6	5170847	5170852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130514	NC_014323	CCG	2	6	5170907	5170912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313793
130515	NC_014323	CCA	4	12	5170925	5170936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313793
130516	NC_014323	CTG	3	9	5170939	5170947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313793
130517	NC_014323	GGC	2	6	5170948	5170953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313793
130518	NC_014323	CGCCC	2	10	5170977	5170986	0 %	0 %	20 %	80 %	300313793
130519	NC_014323	GGT	2	6	5171061	5171066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313793
130520	NC_014323	GATCCA	2	12	5171082	5171093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300313793
130521	NC_014323	GGC	2	6	5171155	5171160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313793
130522	NC_014323	CTG	2	6	5171176	5171181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313793
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130524	NC_014323	GGT	2	6	5171289	5171294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313793
130525	NC_014323	GCG	2	6	5171353	5171358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313793
130526	NC_014323	GCGCAC	2	12	5171391	5171402	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300313793
130527	NC_014323	GGC	2	6	5171418	5171423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130528	NC_014323	CGCTG	2	10	5171467	5171476	0 %	20 %	40 %	40 %	300313794
130529	NC_014323	GTA	2	6	5171483	5171488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313794
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130531	NC_014323	GCC	3	9	5171630	5171638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313794
130532	NC_014323	TGG	2	6	5171647	5171652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313794
130533	NC_014323	GC	3	6	5171663	5171668	0 %	0 %	50 %	50 %	300313794
130534	NC_014323	CCCAGC	2	12	5171670	5171681	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300313794
130535	NC_014323	C	6	6	5171707	5171712	0 %	0 %	0 %	100 %	300313794
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130538	NC_014323	GGC	2	6	5171810	5171815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313794
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130545	NC_014323	CCGTGG	2	12	5172052	5172063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300313794
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130591	NC_014323	TGGA	2	8	5173950	5173957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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130597	NC_014323	GACGAT	2	12	5174192	5174203	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300313795
130598	NC_014323	GCC	3	9	5174255	5174263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313795
130599	NC_014323	GC	3	6	5174266	5174271	0 %	0 %	50 %	50 %	300313795
130600	NC_014323	GCC	2	6	5174278	5174283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313795
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130603	NC_014323	CTGCC	2	10	5174334	5174343	0 %	20 %	20 %	60 %	300313795
130604	NC_014323	TGGA	2	8	5174383	5174390	25 %	25 %	50 %	0 %	300313795
130605	NC_014323	GCCC	2	8	5174421	5174428	0 %	0 %	25 %	75 %	300313795
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130609	NC_014323	CCA	2	6	5174522	5174527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313795
130610	NC_014323	GCG	2	6	5174556	5174561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313795
130611	NC_014323	GGC	2	6	5174583	5174588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313795
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130955	NC_014323	AGC	2	6	5187550	5187555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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130957	NC_014323	CATC	2	8	5187607	5187614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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