MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130001	NC_014323	GC	3	6	5150668	5150673	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
130002	NC_014323	CCG	3	9	5150725	5150733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313783
130003	NC_014323	GCC	2	6	5150736	5150741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313783
130004	NC_014323	GCGCA	2	10	5150747	5150756	20 %	0 %	40 %	40 %	300313783
130005	NC_014323	GC	3	6	5150765	5150770	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
130006	NC_014323	CTT	2	6	5150798	5150803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313783
130007	NC_014323	GGC	2	6	5150837	5150842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313783
130008	NC_014323	GCCG	2	8	5150867	5150874	0 %	0 %	50 %	50 %	300313783
130009	NC_014323	CAG	2	6	5150921	5150926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313783
130010	NC_014323	CAT	2	6	5150933	5150938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313783
130011	NC_014323	CGGCG	2	10	5150956	5150965	0 %	0 %	60 %	40 %	300313783
130012	NC_014323	G	6	6	5150983	5150988	0 %	0 %	100 %	0 %	300313783
130013	NC_014323	G	6	6	5151002	5151007	0 %	0 %	100 %	0 %	300313783
130014	NC_014323	TCG	2	6	5151025	5151030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313783
130015	NC_014323	TGG	2	6	5151056	5151061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130016	NC_014323	TTC	2	6	5151067	5151072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130017	NC_014323	AG	3	6	5151074	5151079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130018	NC_014323	GGC	2	6	5151184	5151189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130019	NC_014323	CGG	2	6	5151259	5151264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
130020	NC_014323	GCG	2	6	5151276	5151281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
130021	NC_014323	CAT	2	6	5151283	5151288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313784
130022	NC_014323	CAA	2	6	5151298	5151303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313784
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130024	NC_014323	CT	3	6	5151333	5151338	0 %	50 %	0 %	50 %	300313784
130025	NC_014323	GACC	2	8	5151340	5151347	25 %	0 %	25 %	50 %	300313784
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130028	NC_014323	CAT	2	6	5151526	5151531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313784
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130031	NC_014323	GC	3	6	5151551	5151556	0 %	0 %	50 %	50 %	300313784
130032	NC_014323	GATC	2	8	5151613	5151620	25 %	25 %	25 %	25 %	300313784
130033	NC_014323	TCA	2	6	5151678	5151683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313784
130034	NC_014323	CTGG	2	8	5151718	5151725	0 %	25 %	50 %	25 %	300313784
130035	NC_014323	ACC	3	9	5151740	5151748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313784
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130039	NC_014323	CGG	2	6	5151985	5151990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
130040	NC_014323	GGTGCG	2	12	5151994	5152005	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300313784
130041	NC_014323	GC	3	6	5152011	5152016	0 %	0 %	50 %	50 %	300313784
130042	NC_014323	GCA	2	6	5152018	5152023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313784
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130048	NC_014323	CGG	2	6	5152342	5152347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313784
130049	NC_014323	CAT	2	6	5152384	5152389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313784
130050	NC_014323	TGG	2	6	5152413	5152418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313784
130051	NC_014323	GC	3	6	5152468	5152473	0 %	0 %	50 %	50 %	300313784
130052	NC_014323	GGT	2	6	5152513	5152518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313784
130053	NC_014323	T	8	8	5152622	5152629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130054	NC_014323	TCT	2	6	5152712	5152717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130055	NC_014323	TTG	2	6	5152771	5152776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130056	NC_014323	GCC	2	6	5152831	5152836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130057	NC_014323	GGC	2	6	5152852	5152857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130058	NC_014323	GCAA	2	8	5152894	5152901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130059	NC_014323	TTC	2	6	5152936	5152941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130060	NC_014323	TCC	2	6	5152986	5152991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313785
130061	NC_014323	TCG	2	6	5153022	5153027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130066	NC_014323	GC	3	6	5153215	5153220	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130067	NC_014323	TCA	3	9	5153265	5153273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313785
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130099	NC_014323	GCC	2	6	5154269	5154274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313785
130100	NC_014323	GCA	3	9	5154294	5154302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130102	NC_014323	CCG	2	6	5154525	5154530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313785
130103	NC_014323	AGC	2	6	5154531	5154536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130105	NC_014323	GC	5	10	5154545	5154554	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130106	NC_014323	TGC	2	6	5154564	5154569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130111	NC_014323	GTGACG	2	12	5154812	5154823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313785
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130115	NC_014323	AGC	2	6	5154912	5154917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130215	NC_014323	ACCAGC	2	12	5159195	5159206	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300313785
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130217	NC_014323	GACC	2	8	5159290	5159297	25 %	0 %	25 %	50 %	300313785
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130221	NC_014323	CGG	2	6	5159419	5159424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
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130223	NC_014323	GAC	2	6	5159567	5159572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130226	NC_014323	GGCA	2	8	5159752	5159759	25 %	0 %	50 %	25 %	300313785
130227	NC_014323	GAT	2	6	5159861	5159866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313785
130228	NC_014323	GC	3	6	5159900	5159905	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130229	NC_014323	GCG	2	6	5159949	5159954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130230	NC_014323	GGC	2	6	5159972	5159977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130231	NC_014323	CGG	3	9	5159983	5159991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130232	NC_014323	CGA	2	6	5160232	5160237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130233	NC_014323	TCAACC	2	12	5160288	5160299	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300313785
130234	NC_014323	CGG	2	6	5160334	5160339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130235	NC_014323	TGT	2	6	5160369	5160374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313785
130236	NC_014323	GCAACG	2	12	5160399	5160410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130241	NC_014323	CAG	2	6	5160562	5160567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130244	NC_014323	GCCA	2	8	5160650	5160657	25 %	0 %	25 %	50 %	300313785
130245	NC_014323	CTG	2	6	5160671	5160676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130247	NC_014323	CCAC	2	8	5160693	5160700	25 %	0 %	0 %	75 %	300313785
130248	NC_014323	GC	4	8	5160741	5160748	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130249	NC_014323	CGC	2	6	5160751	5160756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313785
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130252	NC_014323	GCA	2	6	5160891	5160896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
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130254	NC_014323	GCG	2	6	5160930	5160935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130255	NC_014323	GCT	3	9	5161030	5161038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130256	NC_014323	CAA	3	9	5161057	5161065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313785
130257	NC_014323	GCA	2	6	5161086	5161091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130258	NC_014323	CGG	2	6	5161093	5161098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130259	NC_014323	GC	3	6	5161193	5161198	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130260	NC_014323	TGC	2	6	5161203	5161208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130261	NC_014323	GCCTGC	2	12	5161212	5161223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313785
130262	NC_014323	AAG	2	6	5161247	5161252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313785
130263	NC_014323	TGG	2	6	5161347	5161352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313785
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130278	NC_014323	CCTGGA	2	12	5161840	5161851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130279	NC_014323	AGC	2	6	5161880	5161885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130280	NC_014323	ACG	2	6	5162010	5162015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130281	NC_014323	GCA	2	6	5162049	5162054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130282	NC_014323	GCG	2	6	5162079	5162084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
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130288	NC_014323	ACC	2	6	5162294	5162299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313785
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130290	NC_014323	G	7	7	5162511	5162517	0 %	0 %	100 %	0 %	300313785
130291	NC_014323	CAG	2	6	5162542	5162547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130292	NC_014323	GCA	2	6	5162617	5162622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130293	NC_014323	GGCA	2	8	5162623	5162630	25 %	0 %	50 %	25 %	300313785
130294	NC_014323	GAT	2	6	5162690	5162695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313785
130295	NC_014323	ACC	2	6	5162706	5162711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313785
130296	NC_014323	CAA	2	6	5162833	5162838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313785
130297	NC_014323	ACG	2	6	5162862	5162867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130298	NC_014323	GCCGC	2	10	5162871	5162880	0 %	0 %	40 %	60 %	300313785
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130300	NC_014323	GGC	2	6	5162909	5162914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130301	NC_014323	GC	3	6	5162924	5162929	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130302	NC_014323	GGCG	2	8	5163082	5163089	0 %	0 %	75 %	25 %	300313785
130303	NC_014323	GCG	3	9	5163087	5163095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130304	NC_014323	GCA	3	9	5163126	5163134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130305	NC_014323	CGG	3	9	5163259	5163267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130306	NC_014323	GTG	2	6	5163287	5163292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313785
130307	NC_014323	GGC	2	6	5163305	5163310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130308	NC_014323	CGA	2	6	5163325	5163330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130309	NC_014323	GGTG	2	8	5163331	5163338	0 %	25 %	75 %	0 %	300313785
130310	NC_014323	CGG	2	6	5163363	5163368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130311	NC_014323	CG	3	6	5163414	5163419	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130312	NC_014323	GCTGG	2	10	5163466	5163475	0 %	20 %	60 %	20 %	300313785
130313	NC_014323	GCG	2	6	5163482	5163487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130314	NC_014323	CGG	2	6	5163508	5163513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313785
130315	NC_014323	GAC	2	6	5163524	5163529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130316	NC_014323	GCA	2	6	5163557	5163562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130317	NC_014323	TCG	2	6	5163600	5163605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313785
130318	NC_014323	GCC	2	6	5163632	5163637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313785
130319	NC_014323	CGGC	2	8	5163729	5163736	0 %	0 %	50 %	50 %	300313785
130320	NC_014323	ACA	2	6	5163828	5163833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313785
130321	NC_014323	CCA	2	6	5163846	5163851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313785
130322	NC_014323	GGCA	2	8	5163876	5163883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130323	NC_014323	TGCC	2	8	5163900	5163907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130324	NC_014323	TAGCG	2	10	5163923	5163932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130325	NC_014323	GGC	2	6	5163946	5163951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130326	NC_014323	GCC	2	6	5163964	5163969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130327	NC_014323	CAG	2	6	5164008	5164013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130328	NC_014323	CAG	3	9	5164017	5164025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130329	NC_014323	GAT	2	6	5164026	5164031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130330	NC_014323	CCG	2	6	5164105	5164110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313786
130331	NC_014323	GCA	2	6	5164136	5164141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313786
130332	NC_014323	CCG	2	6	5164180	5164185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313786
130333	NC_014323	CAG	2	6	5164194	5164199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313786
130334	NC_014323	CAG	2	6	5164221	5164226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313786
130335	NC_014323	CGG	2	6	5164277	5164282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313786
130336	NC_014323	CCTTGG	2	12	5164286	5164297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313786
130337	NC_014323	GGC	2	6	5164299	5164304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313786
130338	NC_014323	GGC	2	6	5164326	5164331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313786
130339	NC_014323	CCA	2	6	5164388	5164393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313786
130340	NC_014323	CG	3	6	5164457	5164462	0 %	0 %	50 %	50 %	300313786
130341	NC_014323	AGCTC	2	10	5164484	5164493	20 %	20 %	20 %	40 %	300313786
130342	NC_014323	GGC	2	6	5164560	5164565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313786
130343	NC_014323	CGG	2	6	5164574	5164579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313786
130344	NC_014323	CGGCG	2	10	5164590	5164599	0 %	0 %	60 %	40 %	300313786
130345	NC_014323	GCT	2	6	5164608	5164613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313786
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130360	NC_014323	G	6	6	5165259	5165264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130361	NC_014323	GA	3	6	5165335	5165340	50 %	0 %	50 %	0 %	300313787
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130407	NC_014323	TGCT	2	8	5167206	5167213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130408	NC_014323	CGA	2	6	5167292	5167297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313789
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130451	NC_014323	CTG	3	9	5168894	5168902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313791
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