MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_014323	ATG	2	6	492843	492848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309794
12503	NC_014323	GCC	2	6	492854	492859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309794
12504	NC_014323	GGCG	2	8	492895	492902	0 %	0 %	75 %	25 %	300309794
12505	NC_014323	AG	3	6	492983	492988	50 %	0 %	50 %	0 %	300309794
12506	NC_014323	TCGAT	2	10	492997	493006	20 %	40 %	20 %	20 %	300309794
12507	NC_014323	CG	3	6	493042	493047	0 %	0 %	50 %	50 %	300309794
12508	NC_014323	CTT	2	6	493049	493054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309794
12509	NC_014323	CG	3	6	493061	493066	0 %	0 %	50 %	50 %	300309794
12510	NC_014323	T	6	6	493101	493106	0 %	100 %	0 %	0 %	300309794
12511	NC_014323	CT	3	6	493108	493113	0 %	50 %	0 %	50 %	300309794
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12513	NC_014323	TTG	2	6	493133	493138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309795
12514	NC_014323	GC	3	6	493206	493211	0 %	0 %	50 %	50 %	300309795
12515	NC_014323	CAT	2	6	493231	493236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309795
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12518	NC_014323	TGA	2	6	493318	493323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309795
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12520	NC_014323	GC	4	8	493405	493412	0 %	0 %	50 %	50 %	300309795
12521	NC_014323	CGA	2	6	493450	493455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309795
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12527	NC_014323	GGCG	2	8	493987	493994	0 %	0 %	75 %	25 %	300309795
12528	NC_014323	TGG	2	6	494010	494015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309795
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12539	NC_014323	GC	3	6	494572	494577	0 %	0 %	50 %	50 %	300309795
12540	NC_014323	ATG	2	6	494649	494654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309795
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12553	NC_014323	TCG	2	6	495174	495179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309795
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12569	NC_014323	GCCC	2	8	495944	495951	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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12744	NC_014323	GGA	2	6	502264	502269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309800
12745	NC_014323	TTC	2	6	502271	502276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309800
12746	NC_014323	TGC	2	6	502314	502319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309800
12747	NC_014323	CCG	2	6	502325	502330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309800
12748	NC_014323	CGG	2	6	502417	502422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309800
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12750	NC_014323	CTG	2	6	502502	502507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309800
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12754	NC_014323	GCCT	2	8	502622	502629	0 %	25 %	25 %	50 %	300309800
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12759	NC_014323	GCCG	2	8	502799	502806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12760	NC_014323	AGC	2	6	502845	502850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12765	NC_014323	GC	3	6	502984	502989	0 %	0 %	50 %	50 %	300309801
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12782	NC_014323	CCGG	2	8	503795	503802	0 %	0 %	50 %	50 %	300309801
12783	NC_014323	TGC	3	9	503821	503829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309801
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12800	NC_014323	CG	3	6	504410	504415	0 %	0 %	50 %	50 %	300309802
12801	NC_014323	CTG	3	9	504434	504442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309802
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12806	NC_014323	CGGG	2	8	504607	504614	0 %	0 %	75 %	25 %	300309802
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12850	NC_014323	GC	3	6	506315	506320	0 %	0 %	50 %	50 %	300309804
12851	NC_014323	CATG	2	8	506325	506332	25 %	25 %	25 %	25 %	300309804
12852	NC_014323	GCTG	2	8	506366	506373	0 %	25 %	50 %	25 %	300309804
12853	NC_014323	GCT	2	6	506427	506432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309804
12854	NC_014323	GGC	2	6	506434	506439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309804
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12858	NC_014323	GGC	2	6	506668	506673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309804
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12860	NC_014323	ACC	2	6	506713	506718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309804
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12862	NC_014323	GC	4	8	506723	506730	0 %	0 %	50 %	50 %	300309804
12863	NC_014323	GGTC	2	8	506763	506770	0 %	25 %	50 %	25 %	300309804
12864	NC_014323	CGA	2	6	506799	506804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309804
12865	NC_014323	CGGG	2	8	506852	506859	0 %	0 %	75 %	25 %	300309804
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12874	NC_014323	GC	3	6	507217	507222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12875	NC_014323	CGA	2	6	507229	507234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12878	NC_014323	GCTGGA	2	12	507262	507273	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300309805
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12953	NC_014323	CGC	2	6	509742	509747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12982	NC_014323	GCT	2	6	511047	511052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309810
12983	NC_014323	GAC	2	6	511099	511104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309810
12984	NC_014323	GCT	2	6	511110	511115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309810
12985	NC_014323	GCT	3	9	511155	511163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309810
12986	NC_014323	GTCGCT	2	12	511164	511175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309810
12987	NC_014323	CGC	2	6	511248	511253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309810
12988	NC_014323	GCG	2	6	511348	511353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309810
12989	NC_014323	GCCA	2	8	511357	511364	25 %	0 %	25 %	50 %	300309810
12990	NC_014323	CCA	2	6	511415	511420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309810
12991	NC_014323	TGC	2	6	511454	511459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12992	NC_014323	CTTG	2	8	511469	511476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12993	NC_014323	CGA	3	9	511535	511543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12994	NC_014323	TGC	2	6	511583	511588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309811
12995	NC_014323	CAG	2	6	511651	511656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309811
12996	NC_014323	GCT	2	6	511692	511697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309811
12997	NC_014323	GCT	2	6	511752	511757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309811
12998	NC_014323	GCTG	2	8	511775	511782	0 %	25 %	50 %	25 %	300309811
12999	NC_014323	GGCT	2	8	511858	511865	0 %	25 %	50 %	25 %	300309811
13000	NC_014323	CG	3	6	511895	511900	0 %	0 %	50 %	50 %	300309811

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