MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
127501	NC_014323	GC	3	6	5051398	5051403	0 %	0 %	50 %	50 %	300313704
127502	NC_014323	GCC	2	6	5051489	5051494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313704
127503	NC_014323	GAT	2	6	5051584	5051589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313704
127504	NC_014323	CTT	2	6	5051650	5051655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313704
127505	NC_014323	TGA	2	6	5051661	5051666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313704
127506	NC_014323	TGG	2	6	5051685	5051690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313704
127507	NC_014323	CG	3	6	5051755	5051760	0 %	0 %	50 %	50 %	300313704
127508	NC_014323	CGC	2	6	5051790	5051795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313704
127509	NC_014323	AGC	2	6	5051930	5051935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313704
127510	NC_014323	TTGA	2	8	5051947	5051954	25 %	50 %	25 %	0 %	300313704
127511	NC_014323	ATG	2	6	5051960	5051965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313704
127512	NC_014323	AGC	2	6	5052100	5052105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127513	NC_014323	TCG	2	6	5052142	5052147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127514	NC_014323	CAG	2	6	5052177	5052182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127515	NC_014323	CAT	2	6	5052204	5052209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313705
127516	NC_014323	CCG	2	6	5052344	5052349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313705
127517	NC_014323	TTC	2	6	5052369	5052374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313705
127518	NC_014323	GCT	2	6	5052380	5052385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127519	NC_014323	CAGC	2	8	5052419	5052426	25 %	0 %	25 %	50 %	300313705
127520	NC_014323	GC	4	8	5052429	5052436	0 %	0 %	50 %	50 %	300313705
127521	NC_014323	GC	3	6	5052491	5052496	0 %	0 %	50 %	50 %	300313705
127522	NC_014323	CTT	2	6	5052573	5052578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313705
127523	NC_014323	CTTGGG	2	12	5052582	5052593	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300313705
127524	NC_014323	CTG	2	6	5052603	5052608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127525	NC_014323	CGT	2	6	5052620	5052625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127526	NC_014323	GCA	2	6	5052635	5052640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127527	NC_014323	GCA	3	9	5052755	5052763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127528	NC_014323	CACC	2	8	5052789	5052796	25 %	0 %	0 %	75 %	300313705
127529	NC_014323	CCA	2	6	5052827	5052832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313705
127530	NC_014323	GATCA	2	10	5052861	5052870	40 %	20 %	20 %	20 %	300313705
127531	NC_014323	GCA	2	6	5052998	5053003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127532	NC_014323	GGT	2	6	5053020	5053025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313705
127533	NC_014323	TCG	2	6	5053033	5053038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313705
127534	NC_014323	CAA	2	6	5053041	5053046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313705
127535	NC_014323	GCC	2	6	5053088	5053093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127536	NC_014323	TGC	2	6	5053120	5053125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127537	NC_014323	GCC	3	9	5053126	5053134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127538	NC_014323	GCA	2	6	5053162	5053167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127539	NC_014323	AGC	2	6	5053256	5053261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127540	NC_014323	CCA	2	6	5053308	5053313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127541	NC_014323	TCC	2	6	5053372	5053377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313706
127542	NC_014323	CTG	2	6	5053414	5053419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
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127544	NC_014323	GC	3	6	5053442	5053447	0 %	0 %	50 %	50 %	300313706
127545	NC_014323	CGG	2	6	5053482	5053487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313706
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127549	NC_014323	GAC	2	6	5053711	5053716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313706
127550	NC_014323	TCG	2	6	5053766	5053771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
127551	NC_014323	GC	3	6	5053797	5053802	0 %	0 %	50 %	50 %	300313706
127552	NC_014323	CAT	2	6	5053824	5053829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313706
127553	NC_014323	CTGG	2	8	5053857	5053864	0 %	25 %	50 %	25 %	300313706
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127555	NC_014323	CGC	3	9	5053917	5053925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313706
127556	NC_014323	CTG	2	6	5054050	5054055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313706
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127559	NC_014323	GC	3	6	5054299	5054304	0 %	0 %	50 %	50 %	300313706
127560	NC_014323	CGA	2	6	5054328	5054333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313706
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127573	NC_014323	GCC	2	6	5054701	5054706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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127581	NC_014323	CAG	2	6	5054879	5054884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313707
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127603	NC_014323	ACA	2	6	5055818	5055823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127604	NC_014323	CCCA	2	8	5055864	5055871	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127605	NC_014323	GCCA	2	8	5055873	5055880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127606	NC_014323	GAA	2	6	5055887	5055892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127607	NC_014323	CG	3	6	5055905	5055910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127608	NC_014323	TGC	2	6	5055995	5056000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313708
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