MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
127001	NC_014323	CCAG	2	8	5030892	5030899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127002	NC_014323	GA	3	6	5030927	5030932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127003	NC_014323	GAC	2	6	5030938	5030943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127004	NC_014323	CTC	2	6	5030965	5030970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313681
127005	NC_014323	GCA	2	6	5030995	5031000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313681
127006	NC_014323	GCA	3	9	5031133	5031141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313681
127007	NC_014323	CTGG	2	8	5031176	5031183	0 %	25 %	50 %	25 %	300313681
127008	NC_014323	CGG	2	6	5031214	5031219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127009	NC_014323	ATA	2	6	5031344	5031349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300313681
127010	NC_014323	GGA	2	6	5031376	5031381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313681
127011	NC_014323	GGC	2	6	5031471	5031476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127012	NC_014323	GTC	2	6	5031512	5031517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313681
127013	NC_014323	CGC	2	6	5031565	5031570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313681
127014	NC_014323	ACC	2	6	5031639	5031644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313681
127015	NC_014323	GCG	2	6	5031688	5031693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127016	NC_014323	GGC	2	6	5031698	5031703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127017	NC_014323	CTG	2	6	5031710	5031715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313681
127018	NC_014323	GC	3	6	5031723	5031728	0 %	0 %	50 %	50 %	300313681
127019	NC_014323	CG	4	8	5031773	5031780	0 %	0 %	50 %	50 %	300313681
127020	NC_014323	TGCCGG	2	12	5031814	5031825	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300313681
127021	NC_014323	CAG	2	6	5031836	5031841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313681
127022	NC_014323	GGC	2	6	5031863	5031868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127023	NC_014323	CGG	2	6	5031877	5031882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127024	NC_014323	GCG	2	6	5031910	5031915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127025	NC_014323	ACC	2	6	5031965	5031970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313681
127026	NC_014323	GTA	2	6	5031974	5031979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313681
127027	NC_014323	GCG	2	6	5031988	5031993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127028	NC_014323	GCC	2	6	5032034	5032039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313681
127029	NC_014323	GGC	2	6	5032085	5032090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313681
127030	NC_014323	AGTTGC	2	12	5032116	5032127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300313681
127031	NC_014323	GTA	2	6	5032140	5032145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313681
127032	NC_014323	ATCG	2	8	5032157	5032164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127033	NC_014323	GCC	2	6	5032260	5032265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313682
127034	NC_014323	GCCCTG	2	12	5032271	5032282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313682
127035	NC_014323	CG	3	6	5032323	5032328	0 %	0 %	50 %	50 %	300313682
127036	NC_014323	AAG	2	6	5032329	5032334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313682
127037	NC_014323	CTG	2	6	5032424	5032429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127038	NC_014323	GCC	2	6	5032436	5032441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313682
127039	NC_014323	CAA	2	6	5032468	5032473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313682
127040	NC_014323	CGC	2	6	5032498	5032503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313682
127041	NC_014323	TGC	2	6	5032560	5032565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127042	NC_014323	CGC	2	6	5032590	5032595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313682
127043	NC_014323	CAG	2	6	5032601	5032606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127044	NC_014323	CGT	2	6	5032609	5032614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127045	NC_014323	CTG	2	6	5032622	5032627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127046	NC_014323	CAATCC	2	12	5032642	5032653	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300313682
127047	NC_014323	GGC	2	6	5032681	5032686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313682
127048	NC_014323	CCA	2	6	5032698	5032703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313682
127049	NC_014323	CTG	2	6	5032706	5032711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127050	NC_014323	GTG	2	6	5032739	5032744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313682
127051	NC_014323	CCA	2	6	5032807	5032812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313682
127052	NC_014323	GCA	2	6	5032833	5032838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127053	NC_014323	ACC	2	6	5032898	5032903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313682
127054	NC_014323	CTG	2	6	5032904	5032909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313682
127055	NC_014323	GGC	2	6	5032916	5032921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313682
127056	NC_014323	CG	3	6	5032941	5032946	0 %	0 %	50 %	50 %	300313682
127057	NC_014323	GCC	3	9	5033021	5033029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313683
127058	NC_014323	TCA	2	6	5033054	5033059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313683
127059	NC_014323	AAG	2	6	5033083	5033088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313683
127060	NC_014323	AGC	2	6	5033093	5033098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313683
127061	NC_014323	CCG	2	6	5033150	5033155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313683
127062	NC_014323	ACC	2	6	5033156	5033161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313683
127063	NC_014323	CGA	2	6	5033163	5033168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313683
127064	NC_014323	GTG	2	6	5033170	5033175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313683
127065	NC_014323	CGA	2	6	5033250	5033255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313683
127066	NC_014323	TGA	2	6	5033258	5033263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313683
127067	NC_014323	GTGC	2	8	5033287	5033294	0 %	25 %	50 %	25 %	300313683
127068	NC_014323	CGC	2	6	5033419	5033424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127069	NC_014323	T	6	6	5033437	5033442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127070	NC_014323	CTG	2	6	5033453	5033458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127071	NC_014323	CGC	2	6	5033472	5033477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127072	NC_014323	GGT	2	6	5033484	5033489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313684
127073	NC_014323	CAT	2	6	5033514	5033519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313684
127074	NC_014323	GCG	2	6	5033560	5033565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313684
127075	NC_014323	CTGCG	2	10	5033570	5033579	0 %	20 %	40 %	40 %	300313684
127076	NC_014323	GGC	2	6	5033634	5033639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313684
127077	NC_014323	GTG	2	6	5033674	5033679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313684
127078	NC_014323	TGG	2	6	5033708	5033713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313684
127079	NC_014323	TCG	2	6	5033753	5033758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313684
127080	NC_014323	ACG	2	6	5033774	5033779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313684
127081	NC_014323	CCGCG	2	10	5033855	5033864	0 %	0 %	40 %	60 %	300313685
127082	NC_014323	GCT	2	6	5033936	5033941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313685
127083	NC_014323	GAT	2	6	5033976	5033981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313685
127084	NC_014323	GC	3	6	5034018	5034023	0 %	0 %	50 %	50 %	300313685
127085	NC_014323	CTG	2	6	5034156	5034161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313685
127086	NC_014323	GCC	2	6	5034214	5034219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127087	NC_014323	CCCG	2	8	5034318	5034325	0 %	0 %	25 %	75 %	300313686
127088	NC_014323	GAT	2	6	5034338	5034343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313686
127089	NC_014323	ACC	2	6	5034396	5034401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313686
127090	NC_014323	AGCAC	2	10	5034409	5034418	40 %	0 %	20 %	40 %	300313686
127091	NC_014323	CAC	2	6	5034422	5034427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313686
127092	NC_014323	GCCC	2	8	5034449	5034456	0 %	0 %	25 %	75 %	300313686
127093	NC_014323	GCC	2	6	5034500	5034505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313686
127094	NC_014323	GCC	2	6	5034557	5034562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313686
127095	NC_014323	TGA	2	6	5034601	5034606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313686
127096	NC_014323	GCC	2	6	5034685	5034690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313686
127097	NC_014323	GAA	2	6	5034722	5034727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313686
127098	NC_014323	TGC	2	6	5034784	5034789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313686
127099	NC_014323	CCA	2	6	5034850	5034855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313686
127100	NC_014323	CCA	2	6	5034901	5034906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313686
127101	NC_014323	TGCC	2	8	5034913	5034920	0 %	25 %	25 %	50 %	300313686
127102	NC_014323	GCA	2	6	5035094	5035099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313687
127103	NC_014323	CGC	2	6	5035193	5035198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313687
127104	NC_014323	CAGC	2	8	5035208	5035215	25 %	0 %	25 %	50 %	300313687
127105	NC_014323	CCA	2	6	5035238	5035243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313687
127106	NC_014323	G	6	6	5035261	5035266	0 %	0 %	100 %	0 %	300313687
127107	NC_014323	AGT	2	6	5035271	5035276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313687
127108	NC_014323	GCG	2	6	5035278	5035283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313687
127109	NC_014323	GGC	2	6	5035314	5035319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313687
127110	NC_014323	GAA	2	6	5035404	5035409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313687
127111	NC_014323	GAA	2	6	5035491	5035496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313687
127112	NC_014323	GCA	2	6	5035499	5035504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313687
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127114	NC_014323	CGA	2	6	5035526	5035531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313687
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127230	NC_014323	TAC	2	6	5040497	5040502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313692
127231	NC_014323	ACA	2	6	5040504	5040509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313692
127232	NC_014323	GCA	2	6	5040660	5040665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313692
127233	NC_014323	TGC	2	6	5040684	5040689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313692
127234	NC_014323	ACT	2	6	5040693	5040698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313692
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127285	NC_014323	CTG	2	6	5042824	5042829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127286	NC_014323	GC	3	6	5042867	5042872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127287	NC_014323	ATCCG	2	10	5042918	5042927	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127288	NC_014323	CTC	2	6	5042943	5042948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127289	NC_014323	CTG	2	6	5042971	5042976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313695
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127326	NC_014323	GCCG	2	8	5044340	5044347	0 %	0 %	50 %	50 %	300313697
127327	NC_014323	CG	3	6	5044357	5044362	0 %	0 %	50 %	50 %	300313697
127328	NC_014323	GC	3	6	5044415	5044420	0 %	0 %	50 %	50 %	300313697
127329	NC_014323	CACCCG	2	12	5044451	5044462	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300313697
127330	NC_014323	AGC	2	6	5044486	5044491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313697
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127332	NC_014323	GCC	2	6	5044539	5044544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313697
127333	NC_014323	CGG	2	6	5044553	5044558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313697
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127337	NC_014323	GCT	2	6	5044724	5044729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313697
127338	NC_014323	CAG	2	6	5044821	5044826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313697
127339	NC_014323	GC	3	6	5044914	5044919	0 %	0 %	50 %	50 %	300313697
127340	NC_014323	CCA	2	6	5044922	5044927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313697
127341	NC_014323	CGC	2	6	5044975	5044980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313697
127342	NC_014323	CGC	4	12	5045009	5045020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313697
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127344	NC_014323	ATG	2	6	5045028	5045033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313697
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127459	NC_014323	GCA	2	6	5049616	5049621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313702
127460	NC_014323	GCT	2	6	5049667	5049672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313702
127461	NC_014323	GGC	2	6	5049757	5049762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313702
127462	NC_014323	CCTT	2	8	5049839	5049846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127463	NC_014323	TTC	2	6	5049853	5049858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127464	NC_014323	CAG	2	6	5049877	5049882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313703
127465	NC_014323	CTT	2	6	5049887	5049892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313703
127466	NC_014323	TAC	2	6	5049930	5049935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313703
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127470	NC_014323	GAT	2	6	5050061	5050066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313703
127471	NC_014323	ATC	2	6	5050083	5050088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313703
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127481	NC_014323	TCG	2	6	5050521	5050526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313703
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127483	NC_014323	CCG	2	6	5050654	5050659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313703
127484	NC_014323	GCT	2	6	5050667	5050672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313703
127485	NC_014323	ACG	2	6	5050765	5050770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313703
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127488	NC_014323	GC	3	6	5050865	5050870	0 %	0 %	50 %	50 %	300313703
127489	NC_014323	A	6	6	5050963	5050968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127490	NC_014323	AGTG	2	8	5051024	5051031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127491	NC_014323	CAGCT	2	10	5051037	5051046	20 %	20 %	20 %	40 %	300313704
127492	NC_014323	TGC	2	6	5051057	5051062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313704
127493	NC_014323	TCAGGC	2	12	5051067	5051078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300313704
127494	NC_014323	AGCC	2	8	5051091	5051098	25 %	0 %	25 %	50 %	300313704
127495	NC_014323	CCA	2	6	5051139	5051144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313704
127496	NC_014323	GTA	2	6	5051155	5051160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313704
127497	NC_014323	CAT	2	6	5051188	5051193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313704
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