MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
126501	NC_014323	GCTC	2	8	5010274	5010281	0 %	25 %	25 %	50 %	300313662
126502	NC_014323	CGC	2	6	5010370	5010375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313662
126503	NC_014323	GCC	2	6	5010423	5010428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313662
126504	NC_014323	GCC	2	6	5010456	5010461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313662
126505	NC_014323	CTG	2	6	5010470	5010475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313662
126506	NC_014323	CGTC	2	8	5010555	5010562	0 %	25 %	25 %	50 %	300313662
126507	NC_014323	CG	4	8	5010591	5010598	0 %	0 %	50 %	50 %	300313662
126508	NC_014323	GCA	2	6	5010634	5010639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313662
126509	NC_014323	CCT	2	6	5010651	5010656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300313663
126510	NC_014323	ACGC	2	8	5010678	5010685	25 %	0 %	25 %	50 %	300313663
126511	NC_014323	AGC	2	6	5010806	5010811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313663
126512	NC_014323	CGC	2	6	5010840	5010845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313663
126513	NC_014323	AG	3	6	5010864	5010869	50 %	0 %	50 %	0 %	300313663
126514	NC_014323	GAA	2	6	5010913	5010918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313663
126515	NC_014323	GC	3	6	5010962	5010967	0 %	0 %	50 %	50 %	300313663
126516	NC_014323	TCA	3	9	5011017	5011025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313663
126517	NC_014323	TCG	2	6	5011095	5011100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313663
126518	NC_014323	CCAT	2	8	5011117	5011124	25 %	25 %	0 %	50 %	300313663
126519	NC_014323	GTC	2	6	5011162	5011167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313663
126520	NC_014323	GGC	2	6	5011174	5011179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313663
126521	NC_014323	CCAG	2	8	5011185	5011192	25 %	0 %	25 %	50 %	300313663
126522	NC_014323	GC	3	6	5011262	5011267	0 %	0 %	50 %	50 %	300313663
126523	NC_014323	GCC	3	9	5011283	5011291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313663
126524	NC_014323	GGC	2	6	5011333	5011338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313663
126525	NC_014323	GCCCC	2	10	5011436	5011445	0 %	0 %	20 %	80 %	300313664
126526	NC_014323	TTG	2	6	5011504	5011509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313664
126527	NC_014323	CGG	2	6	5011543	5011548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313664
126528	NC_014323	CTG	2	6	5011651	5011656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313664
126529	NC_014323	GTT	2	6	5011659	5011664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313664
126530	NC_014323	GCC	2	6	5011668	5011673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313664
126531	NC_014323	TTG	2	6	5011681	5011686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313664
126532	NC_014323	GCG	2	6	5011695	5011700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313664
126533	NC_014323	GAA	2	6	5011728	5011733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313664
126534	NC_014323	TGGCT	2	10	5011740	5011749	0 %	40 %	40 %	20 %	300313664
126535	NC_014323	TGCT	2	8	5011825	5011832	0 %	50 %	25 %	25 %	300313664
126536	NC_014323	GCC	2	6	5011848	5011853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313664
126537	NC_014323	GACC	2	8	5011857	5011864	25 %	0 %	25 %	50 %	300313664
126538	NC_014323	GC	3	6	5011927	5011932	0 %	0 %	50 %	50 %	300313664
126539	NC_014323	GCC	2	6	5012034	5012039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313664
126540	NC_014323	GTC	2	6	5012110	5012115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313664
126541	NC_014323	CG	4	8	5012139	5012146	0 %	0 %	50 %	50 %	300313664
126542	NC_014323	GCC	2	6	5012198	5012203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313664
126543	NC_014323	GCT	3	9	5012220	5012228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313664
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126545	NC_014323	CG	3	6	5012351	5012356	0 %	0 %	50 %	50 %	300313664
126546	NC_014323	CAC	2	6	5012369	5012374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313664
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126548	NC_014323	CGG	2	6	5012717	5012722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313664
126549	NC_014323	GC	3	6	5012739	5012744	0 %	0 %	50 %	50 %	300313664
126550	NC_014323	CG	3	6	5012769	5012774	0 %	0 %	50 %	50 %	300313664
126551	NC_014323	CTG	2	6	5012856	5012861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313664
126552	NC_014323	TG	3	6	5012860	5012865	0 %	50 %	50 %	0 %	300313664
126553	NC_014323	GTA	2	6	5012869	5012874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313664
126554	NC_014323	GCC	2	6	5012916	5012921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313664
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126556	NC_014323	TGA	2	6	5012971	5012976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313664
126557	NC_014323	GAA	2	6	5012985	5012990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313664
126558	NC_014323	GGC	2	6	5013027	5013032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313664
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126566	NC_014323	GCC	2	6	5013234	5013239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313664
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126570	NC_014323	CTG	2	6	5013477	5013482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313664
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126573	NC_014323	CG	3	6	5013587	5013592	0 %	0 %	50 %	50 %	300313664
126574	NC_014323	GGC	2	6	5013634	5013639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313664
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126577	NC_014323	GCC	2	6	5013823	5013828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126578	NC_014323	AT	4	8	5013893	5013900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126579	NC_014323	GC	3	6	5013957	5013962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126580	NC_014323	CTCATG	2	12	5014037	5014048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300313665
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126582	NC_014323	ACG	2	6	5014077	5014082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313665
126583	NC_014323	CTG	2	6	5014100	5014105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313665
126584	NC_014323	GCC	2	6	5014121	5014126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313665
126585	NC_014323	CCG	3	9	5014143	5014151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313665
126586	NC_014323	CAT	3	9	5014195	5014203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313665
126587	NC_014323	ATG	2	6	5014214	5014219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313665
126588	NC_014323	AAG	2	6	5014259	5014264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313665
126589	NC_014323	CGC	2	6	5014272	5014277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313665
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126591	NC_014323	TCG	2	6	5014317	5014322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313665
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126593	NC_014323	CTG	2	6	5014376	5014381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313665
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126598	NC_014323	CTG	2	6	5014559	5014564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313665
126599	NC_014323	CGG	2	6	5014574	5014579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313665
126600	NC_014323	CG	3	6	5014587	5014592	0 %	0 %	50 %	50 %	300313665
126601	NC_014323	TG	3	6	5014651	5014656	0 %	50 %	50 %	0 %	300313665
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126603	NC_014323	CG	3	6	5014692	5014697	0 %	0 %	50 %	50 %	300313665
126604	NC_014323	CGC	2	6	5014780	5014785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313666
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126607	NC_014323	CCGAC	2	10	5014921	5014930	20 %	0 %	20 %	60 %	300313666
126608	NC_014323	GCG	2	6	5014936	5014941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313666
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126610	NC_014323	GGCT	2	8	5015078	5015085	0 %	25 %	50 %	25 %	300313666
126611	NC_014323	CAA	2	6	5015099	5015104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313666
126612	NC_014323	TGC	2	6	5015144	5015149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313666
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126615	NC_014323	GCT	2	6	5015235	5015240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313666
126616	NC_014323	GCTG	2	8	5015297	5015304	0 %	25 %	50 %	25 %	300313666
126617	NC_014323	GTG	2	6	5015404	5015409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313666
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126620	NC_014323	GC	3	6	5015498	5015503	0 %	0 %	50 %	50 %	300313666
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126716	NC_014323	TATC	2	8	5019510	5019517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126717	NC_014323	CAG	2	6	5019542	5019547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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126722	NC_014323	CCTG	2	8	5019967	5019974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126723	NC_014323	TCAGC	2	10	5020067	5020076	20 %	20 %	20 %	40 %	300313670
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126847	NC_014323	AAC	2	6	5025049	5025054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313677
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