MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
126001	NC_014323	CGC	3	9	4990679	4990687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313642
126002	NC_014323	TCA	2	6	4990714	4990719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313642
126003	NC_014323	CTA	2	6	4990769	4990774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313642
126004	NC_014323	TCA	2	6	4990855	4990860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313642
126005	NC_014323	ACC	2	6	4990863	4990868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313642
126006	NC_014323	TGA	2	6	4990879	4990884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313642
126007	NC_014323	CGCA	2	8	4990943	4990950	25 %	0 %	25 %	50 %	300313642
126008	NC_014323	GGC	2	6	4990952	4990957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313642
126009	NC_014323	CAT	2	6	4990994	4990999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313642
126010	NC_014323	CG	3	6	4991056	4991061	0 %	0 %	50 %	50 %	300313642
126011	NC_014323	GGC	2	6	4991076	4991081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313642
126012	NC_014323	GC	3	6	4991114	4991119	0 %	0 %	50 %	50 %	300313642
126013	NC_014323	ACGCTG	2	12	4991121	4991132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300313642
126014	NC_014323	CAG	2	6	4991157	4991162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313642
126015	NC_014323	TCG	2	6	4991164	4991169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313642
126016	NC_014323	CTG	2	6	4991289	4991294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313642
126017	NC_014323	CG	3	6	4991296	4991301	0 %	0 %	50 %	50 %	300313642
126018	NC_014323	CAG	2	6	4991367	4991372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313642
126019	NC_014323	CTGG	2	8	4991404	4991411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126020	NC_014323	CTTGAG	2	12	4991470	4991481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300313643
126021	NC_014323	CCA	3	9	4991511	4991519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313643
126022	NC_014323	CCG	2	6	4991541	4991546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313643
126023	NC_014323	CAC	2	6	4991548	4991553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313643
126024	NC_014323	TGG	2	6	4991577	4991582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313643
126025	NC_014323	TTG	2	6	4991666	4991671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313643
126026	NC_014323	GTC	2	6	4991674	4991679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313643
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126030	NC_014323	GTC	2	6	4991812	4991817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313643
126031	NC_014323	TC	3	6	4991880	4991885	0 %	50 %	0 %	50 %	300313643
126032	NC_014323	TGCA	2	8	4991902	4991909	25 %	25 %	25 %	25 %	300313643
126033	NC_014323	CGG	2	6	4991988	4991993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313643
126034	NC_014323	GCA	2	6	4992042	4992047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313643
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126036	NC_014323	CTTGTG	2	12	4992058	4992069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	300313643
126037	NC_014323	CTG	3	9	4992085	4992093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313643
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126043	NC_014323	GC	4	8	4992373	4992380	0 %	0 %	50 %	50 %	300313644
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126050	NC_014323	CGC	2	6	4992630	4992635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313644
126051	NC_014323	GC	3	6	4992649	4992654	0 %	0 %	50 %	50 %	300313644
126052	NC_014323	ATG	2	6	4992685	4992690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313644
126053	NC_014323	GAAG	2	8	4992709	4992716	50 %	0 %	50 %	0 %	300313644
126054	NC_014323	GGA	2	6	4992717	4992722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300313644
126055	NC_014323	CTG	2	6	4992761	4992766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126056	NC_014323	GGC	2	6	4992855	4992860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126057	NC_014323	GC	3	6	4992863	4992868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126058	NC_014323	ATG	2	6	4992893	4992898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126059	NC_014323	TCA	2	6	4992944	4992949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126060	NC_014323	GCCA	2	8	4992958	4992965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126061	NC_014323	ACTGC	2	10	4992977	4992986	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126062	NC_014323	CGCTGC	2	12	4993006	4993017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126063	NC_014323	A	6	6	4993034	4993039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126064	NC_014323	CGG	3	9	4993149	4993157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313645
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126102	NC_014323	GACCG	2	10	4994750	4994759	20 %	0 %	40 %	40 %	300313646
126103	NC_014323	TCG	2	6	4994763	4994768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313646
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126115	NC_014323	GCA	2	6	4995409	4995414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313647
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126228	NC_014323	T	6	6	5000329	5000334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126229	NC_014323	GCA	2	6	5000340	5000345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126230	NC_014323	GCT	2	6	5000355	5000360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126231	NC_014323	A	6	6	5000433	5000438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126232	NC_014323	CGCC	2	8	5000533	5000540	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126233	NC_014323	GCG	2	6	5000544	5000549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126234	NC_014323	GTC	2	6	5000598	5000603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126235	NC_014323	TGC	2	6	5000633	5000638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126236	NC_014323	GCC	2	6	5000666	5000671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126237	NC_014323	TTG	2	6	5000850	5000855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300313654
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126274	NC_014323	GGGC	2	8	5002232	5002239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126275	NC_014323	GC	3	6	5002260	5002265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126276	NC_014323	GGTC	2	8	5002287	5002294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126277	NC_014323	CTGGC	2	10	5002332	5002341	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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126283	NC_014323	GCA	2	6	5002486	5002491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313655
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126329	NC_014323	GGAT	2	8	5004217	5004224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126330	NC_014323	GGCT	2	8	5004293	5004300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126331	NC_014323	GTCC	2	8	5004333	5004340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126332	NC_014323	TGC	2	6	5004391	5004396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313657
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