MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
125001	NC_014323	CTG	2	6	4950640	4950645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313611
125002	NC_014323	TGC	2	6	4950653	4950658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313611
125003	NC_014323	GCA	2	6	4950672	4950677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313611
125004	NC_014323	GCTG	2	8	4950710	4950717	0 %	25 %	50 %	25 %	300313611
125005	NC_014323	CTT	2	6	4950735	4950740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313611
125006	NC_014323	GCA	2	6	4950804	4950809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313611
125007	NC_014323	CTG	2	6	4950820	4950825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313611
125008	NC_014323	GC	3	6	4950841	4950846	0 %	0 %	50 %	50 %	300313611
125009	NC_014323	GCC	3	9	4950970	4950978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313611
125010	NC_014323	TGC	2	6	4951019	4951024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313611
125011	NC_014323	CCG	2	6	4951035	4951040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313611
125012	NC_014323	TGC	2	6	4951043	4951048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313611
125013	NC_014323	CGC	2	6	4951049	4951054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313611
125014	NC_014323	CG	3	6	4951131	4951136	0 %	0 %	50 %	50 %	300313611
125015	NC_014323	GC	3	6	4951253	4951258	0 %	0 %	50 %	50 %	300313611
125016	NC_014323	CCG	2	6	4951263	4951268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313611
125017	NC_014323	CGCC	2	8	4951284	4951291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125018	NC_014323	CGG	2	6	4951323	4951328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125019	NC_014323	ATC	2	6	4951330	4951335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125020	NC_014323	CTCC	2	8	4951364	4951371	0 %	25 %	0 %	75 %	300313612
125021	NC_014323	CCGGC	2	10	4951406	4951415	0 %	0 %	40 %	60 %	300313612
125022	NC_014323	GGC	2	6	4951425	4951430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313612
125023	NC_014323	GCC	2	6	4951441	4951446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313612
125024	NC_014323	TGGCC	2	10	4951449	4951458	0 %	20 %	40 %	40 %	300313612
125025	NC_014323	CTG	2	6	4951501	4951506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313612
125026	NC_014323	GGC	2	6	4951516	4951521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313612
125027	NC_014323	GC	3	6	4951626	4951631	0 %	0 %	50 %	50 %	300313612
125028	NC_014323	CG	3	6	4951688	4951693	0 %	0 %	50 %	50 %	300313612
125029	NC_014323	TGC	2	6	4951712	4951717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313612
125030	NC_014323	GC	3	6	4951716	4951721	0 %	0 %	50 %	50 %	300313612
125031	NC_014323	GCTG	2	8	4951772	4951779	0 %	25 %	50 %	25 %	300313612
125032	NC_014323	GCA	2	6	4951785	4951790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313612
125033	NC_014323	GCG	2	6	4951865	4951870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313612
125034	NC_014323	GCT	2	6	4951911	4951916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313612
125035	NC_014323	GC	3	6	4951921	4951926	0 %	0 %	50 %	50 %	300313612
125036	NC_014323	CAC	2	6	4951940	4951945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313612
125037	NC_014323	TGC	2	6	4951946	4951951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313612
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125040	NC_014323	GGC	2	6	4952053	4952058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313612
125041	NC_014323	CGGCG	2	10	4952068	4952077	0 %	0 %	60 %	40 %	300313612
125042	NC_014323	TCA	3	9	4952081	4952089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313612
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125046	NC_014323	CTG	2	6	4952185	4952190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313612
125047	NC_014323	GC	3	6	4952242	4952247	0 %	0 %	50 %	50 %	300313612
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125050	NC_014323	GCT	2	6	4952313	4952318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313612
125051	NC_014323	CCCG	2	8	4952393	4952400	0 %	0 %	25 %	75 %	300313612
125052	NC_014323	CAG	2	6	4952415	4952420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313612
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125054	NC_014323	CGA	2	6	4952448	4952453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313612
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125056	NC_014323	GC	3	6	4952466	4952471	0 %	0 %	50 %	50 %	300313612
125057	NC_014323	CGG	2	6	4952523	4952528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313612
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125061	NC_014323	AAG	2	6	4952653	4952658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125062	NC_014323	CATCGA	2	12	4952666	4952677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125063	NC_014323	CCA	2	6	4952690	4952695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125064	NC_014323	TGG	2	6	4952704	4952709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125065	NC_014323	AGA	2	6	4952743	4952748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125066	NC_014323	GAG	2	6	4952751	4952756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125067	NC_014323	TGC	3	9	4952764	4952772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125068	NC_014323	CCAG	2	8	4952809	4952816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125069	NC_014323	CCGCG	2	10	4952819	4952828	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125070	NC_014323	GCC	2	6	4952840	4952845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125071	NC_014323	ACT	2	6	4952848	4952853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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125089	NC_014323	CTG	2	6	4953564	4953569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313613
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125092	NC_014323	GCTG	2	8	4953755	4953762	0 %	25 %	50 %	25 %	300313613
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125101	NC_014323	GAA	2	6	4954351	4954356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313614
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125103	NC_014323	TCA	2	6	4954374	4954379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313614
125104	NC_014323	TGC	2	6	4954399	4954404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313614
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125106	NC_014323	CCCG	2	8	4954429	4954436	0 %	0 %	25 %	75 %	300313614
125107	NC_014323	CG	3	6	4954488	4954493	0 %	0 %	50 %	50 %	300313614
125108	NC_014323	GGT	2	6	4954501	4954506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313614
125109	NC_014323	GCA	2	6	4954509	4954514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313614
125110	NC_014323	GATC	2	8	4954525	4954532	25 %	25 %	25 %	25 %	300313614
125111	NC_014323	TGGC	2	8	4954540	4954547	0 %	25 %	50 %	25 %	300313614
125112	NC_014323	GCT	2	6	4954594	4954599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313614
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125114	NC_014323	CGA	2	6	4954684	4954689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313614
125115	NC_014323	CCG	2	6	4954737	4954742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313614
125116	NC_014323	CCG	2	6	4954795	4954800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313614
125117	NC_014323	GCAA	2	8	4954815	4954822	50 %	0 %	25 %	25 %	300313614
125118	NC_014323	CGC	2	6	4954899	4954904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313614
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125123	NC_014323	GCG	2	6	4955075	4955080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125124	NC_014323	CGC	2	6	4955111	4955116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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125126	NC_014323	CGA	2	6	4955198	4955203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313615
125127	NC_014323	GCT	2	6	4955246	4955251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313615
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125174	NC_014323	CTGAA	2	10	4957274	4957283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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125226	NC_014323	GC	3	6	4959535	4959540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125227	NC_014323	CAAAAA	2	12	4959590	4959601	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125228	NC_014323	GCGGA	2	10	4959635	4959644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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125230	NC_014323	TAT	2	6	4959749	4959754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125231	NC_014323	T	6	6	4959783	4959788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125332	NC_014323	TGA	2	6	4963960	4963965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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