MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12007	NC_014323	GCA	2	6	473902	473907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309777
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12122	NC_014323	CCA	2	6	478282	478287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309781
12123	NC_014323	TGA	2	6	478306	478311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309781
12124	NC_014323	AAG	2	6	478344	478349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309781
12125	NC_014323	GGCT	2	8	478350	478357	0 %	25 %	50 %	25 %	300309781
12126	NC_014323	CGG	2	6	478378	478383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309781
12127	NC_014323	ACG	2	6	478387	478392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309781
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12130	NC_014323	CTGC	2	8	478601	478608	0 %	25 %	25 %	50 %	300309781
12131	NC_014323	CAT	2	6	478640	478645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309781
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12147	NC_014323	GGCA	2	8	479288	479295	25 %	0 %	50 %	25 %	300309781
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12151	NC_014323	AAGT	2	8	479370	479377	50 %	25 %	25 %	0 %	300309781
12152	NC_014323	GCAT	2	8	479427	479434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12153	NC_014323	ATGC	2	8	479439	479446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12154	NC_014323	CGCAC	2	10	479513	479522	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12155	NC_014323	GT	3	6	479523	479528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12156	NC_014323	GGC	2	6	479529	479534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12157	NC_014323	CTCCA	2	10	479567	479576	20 %	20 %	0 %	60 %	300309782
12158	NC_014323	GTC	2	6	479584	479589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309782
12159	NC_014323	GAT	2	6	479599	479604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309782
12160	NC_014323	GCAG	2	8	479631	479638	25 %	0 %	50 %	25 %	300309782
12161	NC_014323	CCG	2	6	479648	479653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309782
12162	NC_014323	CTG	2	6	479708	479713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309782
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12166	NC_014323	CTG	2	6	479867	479872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309782
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12169	NC_014323	CTG	2	6	479912	479917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309782
12170	NC_014323	GC	3	6	479957	479962	0 %	0 %	50 %	50 %	300309782
12171	NC_014323	CTG	2	6	479963	479968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309782
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12175	NC_014323	CTGG	2	8	480091	480098	0 %	25 %	50 %	25 %	300309782
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12178	NC_014323	CTG	2	6	480167	480172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309782
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12180	NC_014323	TCT	3	9	480243	480251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309782
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12183	NC_014323	GGT	2	6	480286	480291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309782
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12189	NC_014323	TTC	2	6	480595	480600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309783
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12191	NC_014323	CGG	2	6	480788	480793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309783
12192	NC_014323	CTT	2	6	480807	480812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309783
12193	NC_014323	CGCA	2	8	480823	480830	25 %	0 %	25 %	50 %	300309783
12194	NC_014323	GCT	3	9	480834	480842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309783
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12223	NC_014323	CG	4	8	481708	481715	0 %	0 %	50 %	50 %	300309784
12224	NC_014323	GCCG	2	8	481785	481792	0 %	0 %	50 %	50 %	300309784
12225	NC_014323	GCC	2	6	481854	481859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309784
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12227	NC_014323	GC	3	6	481916	481921	0 %	0 %	50 %	50 %	300309784
12228	NC_014323	GCC	2	6	481929	481934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309784
12229	NC_014323	GCAT	2	8	481936	481943	25 %	25 %	25 %	25 %	300309784
12230	NC_014323	GC	3	6	481986	481991	0 %	0 %	50 %	50 %	300309784
12231	NC_014323	GTGA	2	8	482052	482059	25 %	25 %	50 %	0 %	300309784
12232	NC_014323	GAG	2	6	482112	482117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12233	NC_014323	GAC	2	6	482164	482169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309785
12234	NC_014323	TCG	2	6	482216	482221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309785
12235	NC_014323	TCG	2	6	482225	482230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309785
12236	NC_014323	TGC	2	6	482258	482263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309785
12237	NC_014323	GC	3	6	482314	482319	0 %	0 %	50 %	50 %	300309785
12238	NC_014323	GCG	2	6	482348	482353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309785
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12240	NC_014323	GCC	2	6	482458	482463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309785
12241	NC_014323	GCC	2	6	482473	482478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309785
12242	NC_014323	CGG	2	6	482529	482534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309785
12243	NC_014323	CCAGCG	2	12	482535	482546	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309785
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12245	NC_014323	CGA	2	6	482595	482600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309785
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12247	NC_014323	GAC	2	6	482665	482670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309785
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12252	NC_014323	GCGT	2	8	482969	482976	0 %	25 %	50 %	25 %	300309785
12253	NC_014323	CTG	2	6	483040	483045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309785
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12259	NC_014323	GTT	2	6	483271	483276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12260	NC_014323	CAC	2	6	483393	483398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12261	NC_014323	CGC	2	6	483492	483497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309786
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12289	NC_014323	ACCA	2	8	484546	484553	50 %	0 %	0 %	50 %	300309786
12290	NC_014323	GCC	2	6	484561	484566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309786
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12293	NC_014323	TGC	2	6	484652	484657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309786
12294	NC_014323	GCT	2	6	484738	484743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309786
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12296	NC_014323	GAG	2	6	484948	484953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12297	NC_014323	TGG	2	6	485025	485030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309787
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12300	NC_014323	GCCG	2	8	485089	485096	0 %	0 %	50 %	50 %	300309787
12301	NC_014323	TGG	2	6	485099	485104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309787
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12303	NC_014323	GCA	2	6	485163	485168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309787
12304	NC_014323	GGTGC	2	10	485201	485210	0 %	20 %	60 %	20 %	300309787
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12307	NC_014323	GCT	2	6	485359	485364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309787
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12329	NC_014323	GA	3	6	486443	486448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12330	NC_014323	TCT	2	6	486517	486522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309788
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12340	NC_014323	CTA	2	6	486924	486929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12341	NC_014323	GGT	2	6	486942	486947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12342	NC_014323	TTGAAC	2	12	486964	486975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300309789
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12358	NC_014323	CGC	3	9	487493	487501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309789
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12482	NC_014323	TGC	2	6	492039	492044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309793
12483	NC_014323	GCC	2	6	492084	492089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309793
12484	NC_014323	ATG	2	6	492090	492095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309793
12485	NC_014323	ATG	2	6	492165	492170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309793
12486	NC_014323	TCA	2	6	492212	492217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12487	NC_014323	GCC	2	6	492338	492343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12488	NC_014323	TGA	2	6	492358	492363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12489	NC_014323	CTG	2	6	492407	492412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309794
12490	NC_014323	CGGC	2	8	492418	492425	0 %	0 %	50 %	50 %	300309794
12491	NC_014323	CGC	2	6	492455	492460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309794
12492	NC_014323	TCG	2	6	492477	492482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309794
12493	NC_014323	GCA	2	6	492490	492495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309794
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12495	NC_014323	CCA	2	6	492553	492558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309794
12496	NC_014323	GCCC	2	8	492560	492567	0 %	0 %	25 %	75 %	300309794
12497	NC_014323	CCA	2	6	492580	492585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309794
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12499	NC_014323	GCC	2	6	492662	492667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309794
12500	NC_014323	GC	3	6	492713	492718	0 %	0 %	50 %	50 %	300309794

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