MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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124002	NC_014323	CAGGCC	2	12	4910458	4910469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300313576
124003	NC_014323	GCC	2	6	4910476	4910481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313576
124004	NC_014323	CG	3	6	4910496	4910501	0 %	0 %	50 %	50 %	300313576
124005	NC_014323	CCG	2	6	4910545	4910550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313576
124006	NC_014323	CAT	2	6	4910597	4910602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313577
124007	NC_014323	GCT	2	6	4910606	4910611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313577
124008	NC_014323	CTGCCC	2	12	4910619	4910630	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	300313577
124009	NC_014323	GCT	2	6	4910663	4910668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313577
124010	NC_014323	GAA	2	6	4910739	4910744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300313577
124011	NC_014323	TGG	2	6	4910814	4910819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313577
124012	NC_014323	CTG	2	6	4910901	4910906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313577
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124014	NC_014323	ACG	2	6	4910998	4911003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313577
124015	NC_014323	GCC	2	6	4911028	4911033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313577
124016	NC_014323	GCT	2	6	4911053	4911058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313577
124017	NC_014323	GC	3	6	4911060	4911065	0 %	0 %	50 %	50 %	300313577
124018	NC_014323	CAT	2	6	4911083	4911088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313577
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124020	NC_014323	TGC	2	6	4911121	4911126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313577
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124023	NC_014323	CCGC	2	8	4911202	4911209	0 %	0 %	25 %	75 %	300313577
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124030	NC_014323	CT	3	6	4911482	4911487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124031	NC_014323	GTC	2	6	4911545	4911550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313578
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124109	NC_014323	A	7	7	4914257	4914263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124110	NC_014323	GCTGT	2	10	4914272	4914281	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124111	NC_014323	A	6	6	4914415	4914420	100 %	0 %	0 %	0 %	300313580
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124115	NC_014323	GCT	2	6	4914556	4914561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313580
124116	NC_014323	GCG	2	6	4914638	4914643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313580
124117	NC_014323	CGG	2	6	4914690	4914695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313580
124118	NC_014323	CCG	2	6	4914735	4914740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313580
124119	NC_014323	GGT	2	6	4914747	4914752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313580
124120	NC_014323	TGC	2	6	4914779	4914784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313580
124121	NC_014323	GTC	2	6	4914788	4914793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313580
124122	NC_014323	CGG	2	6	4914843	4914848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313580
124123	NC_014323	CAA	2	6	4914900	4914905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313580
124124	NC_014323	ACC	2	6	4914919	4914924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313580
124125	NC_014323	CTG	2	6	4914989	4914994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313580
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124127	NC_014323	ACT	2	6	4915052	4915057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313580
124128	NC_014323	GCT	2	6	4915105	4915110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313580
124129	NC_014323	GTG	2	6	4915174	4915179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300313580
124130	NC_014323	CGGCC	2	10	4915194	4915203	0 %	0 %	40 %	60 %	300313580
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124132	NC_014323	CG	3	6	4915223	4915228	0 %	0 %	50 %	50 %	300313580
124133	NC_014323	CAAG	2	8	4915230	4915237	50 %	0 %	25 %	25 %	300313580
124134	NC_014323	GCT	2	6	4915341	4915346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313580
124135	NC_014323	ACT	2	6	4915427	4915432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313580
124136	NC_014323	GC	3	6	4915476	4915481	0 %	0 %	50 %	50 %	300313580
124137	NC_014323	CGG	2	6	4915509	4915514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313580
124138	NC_014323	ATC	2	6	4915546	4915551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300313580
124139	NC_014323	CAA	2	6	4915609	4915614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124140	NC_014323	GCCA	2	8	4915736	4915743	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124141	NC_014323	T	6	6	4915764	4915769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124142	NC_014323	ACC	2	6	4915789	4915794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313581
124143	NC_014323	CTG	2	6	4915825	4915830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313581
124144	NC_014323	CTT	2	6	4915842	4915847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313581
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124147	NC_014323	CTG	3	9	4916044	4916052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313581
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124149	NC_014323	GCC	2	6	4916149	4916154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313581
124150	NC_014323	GC	3	6	4916194	4916199	0 %	0 %	50 %	50 %	300313581
124151	NC_014323	CAA	2	6	4916238	4916243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300313581
124152	NC_014323	CTGG	2	8	4916262	4916269	0 %	25 %	50 %	25 %	300313581
124153	NC_014323	ACG	2	6	4916270	4916275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313581
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124158	NC_014323	CG	3	6	4916480	4916485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124159	NC_014323	TC	3	6	4916542	4916547	0 %	50 %	0 %	50 %	300313582
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124180	NC_014323	CGG	2	6	4917475	4917480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313582
124181	NC_014323	GCGCG	2	10	4917501	4917510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124182	NC_014323	AAAGCC	2	12	4917610	4917621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124183	NC_014323	CAG	2	6	4917636	4917641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124184	NC_014323	GCC	3	9	4917652	4917660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124185	NC_014323	GCC	2	6	4917664	4917669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313583
124186	NC_014323	CGA	2	6	4917867	4917872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313583
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124193	NC_014323	CGA	2	6	4918246	4918251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313584
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124199	NC_014323	GCA	2	6	4918438	4918443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313584
124200	NC_014323	CATG	2	8	4918480	4918487	25 %	25 %	25 %	25 %	300313584
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124203	NC_014323	TCT	2	6	4918582	4918587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300313584
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124205	NC_014323	GC	3	6	4918629	4918634	0 %	0 %	50 %	50 %	300313584
124206	NC_014323	TCG	2	6	4918650	4918655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313584
124207	NC_014323	CCACGC	2	12	4918684	4918695	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	300313584
124208	NC_014323	CAG	2	6	4918715	4918720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313584
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124210	NC_014323	TCG	2	6	4918773	4918778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313584
124211	NC_014323	GAT	2	6	4918811	4918816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313584
124212	NC_014323	GTA	2	6	4918902	4918907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313584
124213	NC_014323	AGCA	2	8	4918960	4918967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124214	NC_014323	CAG	2	6	4918981	4918986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124215	NC_014323	CCTG	2	8	4919035	4919042	0 %	25 %	25 %	50 %	300313585
124216	NC_014323	ACC	2	6	4919073	4919078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300313585
124217	NC_014323	CGC	2	6	4919089	4919094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313585
124218	NC_014323	GCC	2	6	4919122	4919127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313585
124219	NC_014323	GCT	3	9	4919132	4919140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313585
124220	NC_014323	CCAT	2	8	4919149	4919156	25 %	25 %	0 %	50 %	300313585
124221	NC_014323	GC	3	6	4919161	4919166	0 %	0 %	50 %	50 %	300313585
124222	NC_014323	GCC	3	9	4919208	4919216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313585
124223	NC_014323	GCTGGA	2	12	4919228	4919239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300313585
124224	NC_014323	CTG	2	6	4919307	4919312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313585
124225	NC_014323	CTGGCC	2	12	4919409	4919420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300313585
124226	NC_014323	GC	3	6	4919495	4919500	0 %	0 %	50 %	50 %	300313585
124227	NC_014323	GGC	2	6	4919505	4919510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300313585
124228	NC_014323	ACTGGA	2	12	4919516	4919527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300313585
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124230	NC_014323	CAG	2	6	4919574	4919579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313585
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124241	NC_014323	C	6	6	4919942	4919947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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124312	NC_014323	CTG	2	6	4922408	4922413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313588
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124340	NC_014323	GC	3	6	4923527	4923532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124341	NC_014323	GCGG	2	8	4923534	4923541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124342	NC_014323	CCG	2	6	4923643	4923648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300313590
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124347	NC_014323	CTG	2	6	4923720	4923725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300313590
124348	NC_014323	GC	3	6	4923798	4923803	0 %	0 %	50 %	50 %	300313590
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124407	NC_014323	CCCG	2	8	4926031	4926038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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124438	NC_014323	T	6	6	4927406	4927411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124461	NC_014323	C	6	6	4928377	4928382	0 %	0 %	0 %	100 %	300313594
124462	NC_014323	CGA	2	6	4928385	4928390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300313594
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124465	NC_014323	TGA	2	6	4928604	4928609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300313594
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124491	NC_014323	TAG	2	6	4929818	4929823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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124493	NC_014323	TTTA	2	8	4929847	4929854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124494	NC_014323	GCCAC	2	10	4930025	4930034	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
124495	NC_014323	GGCG	2	8	4930035	4930042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124496	NC_014323	GCAA	2	8	4930069	4930076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124497	NC_014323	TGGA	2	8	4930197	4930204	25 %	25 %	50 %	0 %	300313596
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