MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014323	GTG	3	9	453116	453124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309758
11502	NC_014323	TCG	2	6	453183	453188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309758
11503	NC_014323	CGC	2	6	453232	453237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309758
11504	NC_014323	GC	3	6	453263	453268	0 %	0 %	50 %	50 %	300309758
11505	NC_014323	CCG	2	6	453335	453340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309758
11506	NC_014323	CCG	2	6	453350	453355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309758
11507	NC_014323	TGG	2	6	453386	453391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309758
11508	NC_014323	GCA	2	6	453396	453401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309758
11509	NC_014323	GGC	2	6	453433	453438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309758
11510	NC_014323	GCG	2	6	453445	453450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309758
11511	NC_014323	TGA	2	6	453451	453456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309758
11512	NC_014323	ACG	2	6	453499	453504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309759
11513	NC_014323	CAGC	2	8	453584	453591	25 %	0 %	25 %	50 %	300309759
11514	NC_014323	GC	3	6	453645	453650	0 %	0 %	50 %	50 %	300309759
11515	NC_014323	GCTGGC	2	12	453727	453738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300309759
11516	NC_014323	CCTGCG	2	12	453800	453811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300309759
11517	NC_014323	GCC	2	6	453847	453852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309759
11518	NC_014323	GCCT	2	8	453901	453908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11519	NC_014323	ACC	2	6	453970	453975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309760
11520	NC_014323	AC	3	6	454004	454009	50 %	0 %	0 %	50 %	300309760
11521	NC_014323	GTG	2	6	454096	454101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309760
11522	NC_014323	GCC	2	6	454123	454128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309760
11523	NC_014323	CGTCAA	2	12	454143	454154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300309760
11524	NC_014323	GCT	3	9	454167	454175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309760
11525	NC_014323	GCG	2	6	454192	454197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309760
11526	NC_014323	TGG	2	6	454208	454213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309760
11527	NC_014323	GGCC	2	8	454266	454273	0 %	0 %	50 %	50 %	300309760
11528	NC_014323	TGG	2	6	454307	454312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309760
11529	NC_014323	GCT	2	6	454317	454322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309760
11530	NC_014323	GCC	2	6	454351	454356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309760
11531	NC_014323	GC	3	6	454435	454440	0 %	0 %	50 %	50 %	300309760
11532	NC_014323	GCG	2	6	454457	454462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309760
11533	NC_014323	TTC	3	9	454480	454488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309761
11534	NC_014323	CAC	3	9	454521	454529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309761
11535	NC_014323	CAC	2	6	454533	454538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309761
11536	NC_014323	TGA	2	6	454651	454656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309761
11537	NC_014323	GCC	3	9	454683	454691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
11538	NC_014323	CAT	2	6	454734	454739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309761
11539	NC_014323	GCC	2	6	454750	454755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
11540	NC_014323	GGCGCT	2	12	454794	454805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300309761
11541	NC_014323	TGC	2	6	454810	454815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
11542	NC_014323	GCC	2	6	454827	454832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
11543	NC_014323	ATC	2	6	454833	454838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309761
11544	NC_014323	CCA	2	6	454856	454861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309761
11545	NC_014323	CCG	2	6	454874	454879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
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11550	NC_014323	TCG	2	6	455074	455079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
11551	NC_014323	GCG	2	6	455150	455155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309761
11552	NC_014323	GGC	2	6	455190	455195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309761
11553	NC_014323	TTC	2	6	455215	455220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309761
11554	NC_014323	CAC	2	6	455244	455249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309761
11555	NC_014323	GC	3	6	455266	455271	0 %	0 %	50 %	50 %	300309761
11556	NC_014323	CTG	2	6	455283	455288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
11557	NC_014323	GTC	2	6	455304	455309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
11558	NC_014323	CGG	2	6	455321	455326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309761
11559	NC_014323	TCT	2	6	455327	455332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309761
11560	NC_014323	GCC	2	6	455335	455340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309761
11561	NC_014323	TCA	2	6	455348	455353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309761
11562	NC_014323	TCG	2	6	455362	455367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
11563	NC_014323	GTC	2	6	455382	455387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309761
11564	NC_014323	A	6	6	455397	455402	100 %	0 %	0 %	0 %	300309761
11565	NC_014323	TCT	2	6	455430	455435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_014323	CT	3	6	455434	455439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_014323	G	6	6	455444	455449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_014323	ATC	2	6	455480	455485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_014323	CAC	2	6	455518	455523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11570	NC_014323	TTC	2	6	455553	455558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309762
11571	NC_014323	C	6	6	455570	455575	0 %	0 %	0 %	100 %	300309762
11572	NC_014323	CTG	2	6	455579	455584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309762
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11575	NC_014323	AAG	2	6	455882	455887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309762
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11584	NC_014323	CCG	2	6	456306	456311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309763
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11591	NC_014323	GCC	2	6	456461	456466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309763
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11601	NC_014323	CCCG	2	8	456724	456731	0 %	0 %	25 %	75 %	300309763
11602	NC_014323	TCG	2	6	456780	456785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309763
11603	NC_014323	GC	3	6	456792	456797	0 %	0 %	50 %	50 %	300309763
11604	NC_014323	CGCC	2	8	456805	456812	0 %	0 %	25 %	75 %	300309763
11605	NC_014323	CGC	2	6	456851	456856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309763
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11608	NC_014323	CGGT	2	8	456942	456949	0 %	25 %	50 %	25 %	300309763
11609	NC_014323	CGG	3	9	456997	457005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309763
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11612	NC_014323	CTG	2	6	457218	457223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_014323	AAC	2	6	457246	457251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_014323	TGA	2	6	457276	457281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_014323	AGA	2	6	457488	457493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309764
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11618	NC_014323	GAT	2	6	457609	457614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309764
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11620	NC_014323	GAA	2	6	457771	457776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309764
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11855	NC_014323	CAGT	2	8	468129	468136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11979	NC_014323	GC	3	6	472739	472744	0 %	0 %	50 %	50 %	300309776
11980	NC_014323	GAT	2	6	472765	472770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309776
11981	NC_014323	TCG	2	6	472784	472789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309776
11982	NC_014323	CTCA	2	8	472831	472838	25 %	25 %	0 %	50 %	300309776
11983	NC_014323	GTTCCA	2	12	472866	472877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300309776
11984	NC_014323	CAG	2	6	472888	472893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309776
11985	NC_014323	CAA	2	6	472897	472902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309776
11986	NC_014323	T	7	7	472907	472913	0 %	100 %	0 %	0 %	300309776
11987	NC_014323	CTG	2	6	472930	472935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309776
11988	NC_014323	TCG	2	6	472967	472972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309776
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11990	NC_014323	CTG	3	9	473053	473061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309776
11991	NC_014323	CGG	2	6	473067	473072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309776
11992	NC_014323	GCT	2	6	473076	473081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309776
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11995	NC_014323	GGT	2	6	473200	473205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309776
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11999	NC_014323	TGC	2	6	473288	473293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309776
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