MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014323	CTACG	2	10	434133	434142	20 %	20 %	20 %	40 %	300309740
11002	NC_014323	CCA	2	6	434150	434155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309740
11003	NC_014323	CGA	2	6	434229	434234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309740
11004	NC_014323	GCT	2	6	434298	434303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309740
11005	NC_014323	GAACA	2	10	434371	434380	60 %	0 %	20 %	20 %	300309740
11006	NC_014323	GAC	2	6	434410	434415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309740
11007	NC_014323	GCC	2	6	434432	434437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309740
11008	NC_014323	TGA	2	6	434474	434479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309740
11009	NC_014323	GGC	2	6	434551	434556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309740
11010	NC_014323	CGG	2	6	434559	434564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309740
11011	NC_014323	GCC	2	6	434569	434574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309740
11012	NC_014323	CGC	2	6	434601	434606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309740
11013	NC_014323	CCA	2	6	434610	434615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309740
11014	NC_014323	CGC	2	6	434651	434656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309740
11015	NC_014323	GCG	2	6	434658	434663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309740
11016	NC_014323	TGG	2	6	434729	434734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309740
11017	NC_014323	CG	3	6	434747	434752	0 %	0 %	50 %	50 %	300309740
11018	NC_014323	CGC	2	6	434787	434792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309740
11019	NC_014323	CCA	2	6	434819	434824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309740
11020	NC_014323	GCTG	2	8	434846	434853	0 %	25 %	50 %	25 %	300309740
11021	NC_014323	GTG	2	6	434884	434889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309740
11022	NC_014323	GC	3	6	434959	434964	0 %	0 %	50 %	50 %	300309740
11023	NC_014323	CTG	2	6	434986	434991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309740
11024	NC_014323	GC	3	6	435022	435027	0 %	0 %	50 %	50 %	300309740
11025	NC_014323	CTG	2	6	435028	435033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309740
11026	NC_014323	GCCG	2	8	435039	435046	0 %	0 %	50 %	50 %	300309740
11027	NC_014323	GAG	2	6	435079	435084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309740
11028	NC_014323	GGC	2	6	435108	435113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309740
11029	NC_014323	CGC	2	6	435134	435139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309740
11030	NC_014323	CGG	2	6	435149	435154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309740
11031	NC_014323	CCCG	2	8	435177	435184	0 %	0 %	25 %	75 %	300309740
11032	NC_014323	ATG	2	6	435198	435203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309740
11033	NC_014323	GCT	2	6	435205	435210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_014323	TCTTT	2	10	435245	435254	0 %	80 %	0 %	20 %	300309741
11035	NC_014323	CTG	2	6	435256	435261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309741
11036	NC_014323	CTG	2	6	435293	435298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309741
11037	NC_014323	GCT	2	6	435319	435324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309741
11038	NC_014323	CGC	2	6	435355	435360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309741
11039	NC_014323	CGG	3	9	435475	435483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
11040	NC_014323	GGC	2	6	435556	435561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
11041	NC_014323	GGT	2	6	435571	435576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309741
11042	NC_014323	CAG	3	9	435587	435595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
11043	NC_014323	CGG	2	6	435596	435601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
11044	NC_014323	ATG	2	6	435602	435607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309741
11045	NC_014323	GCA	3	9	435625	435633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
11046	NC_014323	AGC	2	6	435648	435653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
11047	NC_014323	CG	4	8	435682	435689	0 %	0 %	50 %	50 %	300309741
11048	NC_014323	CG	4	8	435703	435710	0 %	0 %	50 %	50 %	300309741
11049	NC_014323	ACA	2	6	435756	435761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309741
11050	NC_014323	GAA	2	6	435769	435774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309741
11051	NC_014323	CCA	2	6	435870	435875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309741
11052	NC_014323	AAG	2	6	435884	435889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309741
11053	NC_014323	GCA	2	6	435933	435938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309741
11054	NC_014323	GGC	2	6	435953	435958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
11055	NC_014323	GTG	2	6	435959	435964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309741
11056	NC_014323	GGC	2	6	436000	436005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
11057	NC_014323	GGC	2	6	436064	436069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309741
11058	NC_014323	ATC	2	6	436088	436093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309741
11059	NC_014323	CG	3	6	436110	436115	0 %	0 %	50 %	50 %	300309741
11060	NC_014323	G	6	6	436138	436143	0 %	0 %	100 %	0 %	300309741
11061	NC_014323	GCT	2	6	436154	436159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_014323	GCG	2	6	436162	436167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_014323	ACA	2	6	436200	436205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_014323	ACA	2	6	436207	436212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_014323	CGT	2	6	436250	436255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309742
11066	NC_014323	GCC	2	6	436308	436313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
11067	NC_014323	CTG	2	6	436344	436349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309742
11068	NC_014323	GGC	2	6	436370	436375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309742
11069	NC_014323	GCG	2	6	436391	436396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309742
11070	NC_014323	GC	5	10	436469	436478	0 %	0 %	50 %	50 %	300309742
11071	NC_014323	ACA	2	6	436531	436536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309742
11072	NC_014323	CAT	2	6	436562	436567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309742
11073	NC_014323	GCC	2	6	436594	436599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
11074	NC_014323	TCC	2	6	436603	436608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309742
11075	NC_014323	CG	3	6	436630	436635	0 %	0 %	50 %	50 %	300309742
11076	NC_014323	TTG	2	6	436641	436646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309742
11077	NC_014323	TGC	2	6	436651	436656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309742
11078	NC_014323	AGC	2	6	436657	436662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
11079	NC_014323	TGG	3	9	436675	436683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309742
11080	NC_014323	CGC	2	6	436727	436732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
11081	NC_014323	GCA	2	6	436747	436752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
11082	NC_014323	CGA	2	6	436817	436822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
11083	NC_014323	GCC	2	6	436826	436831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
11084	NC_014323	GCC	2	6	436835	436840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
11085	NC_014323	ATG	2	6	436875	436880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309742
11086	NC_014323	CAG	2	6	436917	436922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309742
11087	NC_014323	TGG	2	6	436957	436962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309742
11088	NC_014323	GCC	2	6	436968	436973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
11089	NC_014323	GTG	2	6	436985	436990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309742
11090	NC_014323	CCG	2	6	437011	437016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309742
11091	NC_014323	CCGC	2	8	437061	437068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11092	NC_014323	GCT	2	6	437098	437103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11093	NC_014323	TGC	2	6	437118	437123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11094	NC_014323	CTGGTG	2	12	437126	437137	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300309743
11095	NC_014323	CTG	2	6	437138	437143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11096	NC_014323	TTC	2	6	437156	437161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309743
11097	NC_014323	TGG	3	9	437171	437179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309743
11098	NC_014323	GCT	2	6	437227	437232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11099	NC_014323	CAA	2	6	437293	437298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309743
11100	NC_014323	GC	3	6	437305	437310	0 %	0 %	50 %	50 %	300309743
11101	NC_014323	CAT	2	6	437311	437316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309743
11102	NC_014323	GGA	2	6	437323	437328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309743
11103	NC_014323	GAA	2	6	437386	437391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309743
11104	NC_014323	GAA	2	6	437395	437400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309743
11105	NC_014323	GGT	2	6	437407	437412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309743
11106	NC_014323	GGC	2	6	437417	437422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309743
11107	NC_014323	CAG	2	6	437435	437440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11108	NC_014323	TCA	3	9	437499	437507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309743
11109	NC_014323	CTG	2	6	437525	437530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11110	NC_014323	AGC	2	6	437535	437540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11111	NC_014323	GGC	2	6	437599	437604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309743
11112	NC_014323	TAC	2	6	437615	437620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309743
11113	NC_014323	CGG	2	6	437628	437633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309743
11114	NC_014323	TGC	2	6	437673	437678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309743
11115	NC_014323	GCC	2	6	437723	437728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309743
11116	NC_014323	GCG	2	6	437746	437751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309743
11117	NC_014323	CGC	2	6	437758	437763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309743
11118	NC_014323	GCCG	2	8	437770	437777	0 %	0 %	50 %	50 %	300309743
11119	NC_014323	GCA	2	6	437806	437811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11241	NC_014323	GGC	2	6	442442	442447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309748
11242	NC_014323	CAG	2	6	442459	442464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309748
11243	NC_014323	GTCCT	2	10	442503	442512	0 %	40 %	20 %	40 %	300309748
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11349	NC_014323	AATA	2	8	447492	447499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11350	NC_014323	ACC	2	6	447518	447523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11351	NC_014323	C	6	6	447522	447527	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11352	NC_014323	TTG	2	6	447533	447538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11353	NC_014323	CGT	2	6	447596	447601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309754
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11356	NC_014323	GACC	2	8	447659	447666	25 %	0 %	25 %	50 %	300309754
11357	NC_014323	AGC	2	6	447688	447693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309754
11358	NC_014323	TCCGA	2	10	447729	447738	20 %	20 %	20 %	40 %	300309754
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11360	NC_014323	GCGCG	2	10	447863	447872	0 %	0 %	60 %	40 %	300309754
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11386	NC_014323	GCAGG	2	10	448654	448663	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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11399	NC_014323	AGGC	2	8	449166	449173	25 %	0 %	50 %	25 %	300309756
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11474	NC_014323	GGC	2	6	452044	452049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11475	NC_014323	GTC	3	9	452098	452106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11477	NC_014323	GAG	2	6	452192	452197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309758
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11481	NC_014323	CGC	2	6	452302	452307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309758
11482	NC_014323	GT	3	6	452420	452425	0 %	50 %	50 %	0 %	300309758
11483	NC_014323	GCA	2	6	452446	452451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309758
11484	NC_014323	GC	3	6	452476	452481	0 %	0 %	50 %	50 %	300309758
11485	NC_014323	GTCGC	2	10	452500	452509	0 %	20 %	40 %	40 %	300309758
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