MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014323	AAAG	2	8	395909	395916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_014323	AGA	2	6	395930	395935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309702
10003	NC_014323	GAA	3	9	396041	396049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309702
10004	NC_014323	TCA	2	6	396052	396057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309702
10005	NC_014323	CAT	2	6	396119	396124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309702
10006	NC_014323	CGC	2	6	396177	396182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309702
10007	NC_014323	AGG	2	6	396225	396230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_014323	GCG	3	9	396246	396254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309703
10009	NC_014323	AGA	2	6	396284	396289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309703
10010	NC_014323	CGAT	2	8	396305	396312	25 %	25 %	25 %	25 %	300309703
10011	NC_014323	CGC	2	6	396416	396421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309703
10012	NC_014323	GC	3	6	396432	396437	0 %	0 %	50 %	50 %	300309703
10013	NC_014323	TGGGC	2	10	396485	396494	0 %	20 %	60 %	20 %	300309703
10014	NC_014323	GC	4	8	396493	396500	0 %	0 %	50 %	50 %	300309703
10015	NC_014323	TGC	2	6	396647	396652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_014323	T	6	6	396658	396663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014323	AAT	2	6	396682	396687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_014323	T	6	6	396828	396833	0 %	100 %	0 %	0 %	300309704
10019	NC_014323	AAT	2	6	396855	396860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300309704
10020	NC_014323	CGG	2	6	396874	396879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309704
10021	NC_014323	GCG	2	6	396880	396885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309704
10022	NC_014323	GC	3	6	396914	396919	0 %	0 %	50 %	50 %	300309704
10023	NC_014323	TCG	2	6	396946	396951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10024	NC_014323	TGC	2	6	396955	396960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10025	NC_014323	TCG	2	6	396961	396966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10026	NC_014323	GTT	2	6	396998	397003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309704
10027	NC_014323	GCG	2	6	397004	397009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309704
10028	NC_014323	TGC	2	6	397015	397020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10029	NC_014323	GTC	2	6	397062	397067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10030	NC_014323	CGT	2	6	397115	397120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10031	NC_014323	CGG	3	9	397160	397168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309704
10032	NC_014323	TCG	2	6	397183	397188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10033	NC_014323	GC	3	6	397202	397207	0 %	0 %	50 %	50 %	300309704
10034	NC_014323	CTGG	2	8	397212	397219	0 %	25 %	50 %	25 %	300309704
10035	NC_014323	GCA	2	6	397307	397312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10036	NC_014323	TGG	2	6	397334	397339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309704
10037	NC_014323	CAT	2	6	397383	397388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309704
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10040	NC_014323	GCG	2	6	397432	397437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309704
10041	NC_014323	GCCGC	2	10	397467	397476	0 %	0 %	40 %	60 %	300309704
10042	NC_014323	CCA	2	6	397490	397495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309704
10043	NC_014323	CGT	2	6	397496	397501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309704
10044	NC_014323	GCA	2	6	397505	397510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309704
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10048	NC_014323	TGA	2	6	397631	397636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309704
10049	NC_014323	CGG	2	6	397684	397689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309704
10050	NC_014323	CGA	2	6	397718	397723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_014323	TTG	2	6	397740	397745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_014323	CGG	2	6	397760	397765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_014323	AGGC	2	8	397819	397826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10054	NC_014323	TGGA	2	8	397892	397899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_014323	TGGC	2	8	397922	397929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10056	NC_014323	GTC	2	6	397930	397935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_014323	TGT	2	6	397955	397960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_014323	AGC	2	6	397996	398001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_014323	ATTC	3	12	398056	398067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_014323	CGG	2	6	398100	398105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309705
10061	NC_014323	TGC	2	6	398121	398126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309705
10062	NC_014323	CGT	2	6	398311	398316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309705
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10064	NC_014323	CA	3	6	398444	398449	50 %	0 %	0 %	50 %	300309706
10065	NC_014323	A	6	6	398449	398454	100 %	0 %	0 %	0 %	300309706
10066	NC_014323	GGC	3	9	398455	398463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309706
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10070	NC_014323	CGTCGG	2	12	398589	398600	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300309706
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10072	NC_014323	A	6	6	398736	398741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_014323	TGG	2	6	398754	398759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_014323	CAA	2	6	398786	398791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_014323	GGGT	2	8	398825	398832	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_014323	CGA	2	6	398912	398917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309707
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10082	NC_014323	CGA	2	6	399149	399154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309707
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10084	NC_014323	GACCT	2	10	399219	399228	20 %	20 %	20 %	40 %	300309707
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10086	NC_014323	GGC	2	6	399267	399272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309707
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10088	NC_014323	AAGG	2	8	399333	399340	50 %	0 %	50 %	0 %	300309707
10089	NC_014323	CGG	2	6	399430	399435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309707
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10092	NC_014323	CTG	3	9	399618	399626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309707
10093	NC_014323	TCG	2	6	399631	399636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309707
10094	NC_014323	GAA	2	6	399654	399659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309707
10095	NC_014323	GAA	2	6	399701	399706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309707
10096	NC_014323	GCTG	2	8	399736	399743	0 %	25 %	50 %	25 %	300309707
10097	NC_014323	GC	3	6	399779	399784	0 %	0 %	50 %	50 %	300309707
10098	NC_014323	GAA	2	6	399867	399872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309707
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10100	NC_014323	GC	3	6	399908	399913	0 %	0 %	50 %	50 %	300309707
10101	NC_014323	GC	4	8	399954	399961	0 %	0 %	50 %	50 %	300309707
10102	NC_014323	GC	3	6	400046	400051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_014323	ATC	2	6	400068	400073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_014323	CCGC	2	8	400091	400098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10105	NC_014323	AGA	2	6	400103	400108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_014323	TCA	3	9	400158	400166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309708
10107	NC_014323	ATG	2	6	400191	400196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309708
10108	NC_014323	ACGCCA	2	12	400209	400220	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300309708
10109	NC_014323	GC	4	8	400252	400259	0 %	0 %	50 %	50 %	300309708
10110	NC_014323	GTG	2	6	400271	400276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309708
10111	NC_014323	CATC	2	8	400342	400349	25 %	25 %	0 %	50 %	300309708
10112	NC_014323	GCC	2	6	400364	400369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309708
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10116	NC_014323	GGT	2	6	400552	400557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309708
10117	NC_014323	GC	3	6	400596	400601	0 %	0 %	50 %	50 %	300309708
10118	NC_014323	TGG	2	6	400602	400607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309708
10119	NC_014323	CGAAGC	2	12	400618	400629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309708
10120	NC_014323	TCA	2	6	400632	400637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309708
10121	NC_014323	GACC	2	8	400642	400649	25 %	0 %	25 %	50 %	300309708
10122	NC_014323	GCCTG	2	10	400651	400660	0 %	20 %	40 %	40 %	300309708
10123	NC_014323	CCG	2	6	400665	400670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309708
10124	NC_014323	GC	4	8	400709	400716	0 %	0 %	50 %	50 %	300309708
10125	NC_014323	CGGCAC	2	12	400747	400758	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300309708
10126	NC_014323	GGC	2	6	400772	400777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309708
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10137	NC_014323	ACA	2	6	401130	401135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309708
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10143	NC_014323	A	6	6	401276	401281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_014323	T	6	6	401297	401302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_014323	GCG	2	6	401336	401341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309709
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10181	NC_014323	CAGC	2	8	402663	402670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10182	NC_014323	CTC	2	6	402701	402706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10221	NC_014323	GGCG	2	8	404481	404488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10222	NC_014323	TTTG	2	8	404510	404517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10223	NC_014323	TACT	2	8	404530	404537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10224	NC_014323	ACTT	2	8	404541	404548	25 %	50 %	0 %	25 %	300309712
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10230	NC_014323	GCC	2	6	404883	404888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309712
10231	NC_014323	GCA	2	6	404917	404922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309712
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10233	NC_014323	GC	3	6	404982	404987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10234	NC_014323	TCA	2	6	404992	404997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10235	NC_014323	CTG	2	6	405019	405024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10238	NC_014323	TTTG	2	8	405277	405284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10239	NC_014323	CTT	2	6	405364	405369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309713
10240	NC_014323	TTC	2	6	405440	405445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309713
10241	NC_014323	CTT	2	6	405463	405468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309713
10242	NC_014323	GGC	2	6	405547	405552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309713
10243	NC_014323	GGC	2	6	405568	405573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309713
10244	NC_014323	CTT	2	6	405577	405582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309713
10245	NC_014323	GCT	2	6	405584	405589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309713
10246	NC_014323	TGC	2	6	405613	405618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309713
10247	NC_014323	GGC	3	9	405622	405630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309713
10248	NC_014323	GGC	2	6	405682	405687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309713
10249	NC_014323	GGC	2	6	405694	405699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309713
10250	NC_014323	GCG	2	6	405719	405724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309713
10251	NC_014323	TCG	2	6	405756	405761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309713
10252	NC_014323	GGC	2	6	405781	405786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309713
10253	NC_014323	TGC	2	6	405793	405798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309713
10254	NC_014323	CTT	2	6	405802	405807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309713
10255	NC_014323	GCT	3	9	405815	405823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309713
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10257	NC_014323	CTC	2	6	405849	405854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10258	NC_014323	GTG	2	6	405896	405901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_014323	T	6	6	405925	405930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_014323	AAC	2	6	405959	405964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_014323	CCG	2	6	406026	406031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10262	NC_014323	AGGA	2	8	406124	406131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_014323	AGG	2	6	406136	406141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10264	NC_014323	TGG	2	6	406147	406152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_014323	GCC	2	6	406163	406168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10266	NC_014323	GCC	2	6	406235	406240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309714
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10274	NC_014323	CGG	2	6	406369	406374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309714
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10287	NC_014323	CATC	2	8	406975	406982	25 %	25 %	0 %	50 %	300309714
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10293	NC_014323	CTGG	2	8	407096	407103	0 %	25 %	50 %	25 %	300309714
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10312	NC_014323	GC	3	6	407691	407696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10313	NC_014323	ATA	2	6	407801	407806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10314	NC_014323	CAA	2	6	407885	407890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10315	NC_014323	AC	3	6	407898	407903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10316	NC_014323	GCCCTG	2	12	407937	407948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300309715
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10332	NC_014323	TGA	2	6	408544	408549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309715
10333	NC_014323	CGTG	2	8	408656	408663	0 %	25 %	50 %	25 %	300309715
10334	NC_014323	ACG	2	6	408703	408708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309715
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10340	NC_014323	G	6	6	408884	408889	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10341	NC_014323	AGA	2	6	408905	408910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309716
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10345	NC_014323	GGCCT	2	10	409174	409183	0 %	20 %	40 %	40 %	300309716
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10348	NC_014323	CCG	2	6	409315	409320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309716
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10350	NC_014323	TGA	2	6	409361	409366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309716
10351	NC_014323	GC	3	6	409407	409412	0 %	0 %	50 %	50 %	300309716
10352	NC_014323	TGC	2	6	409460	409465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309716
10353	NC_014323	CGG	2	6	409466	409471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309716
10354	NC_014323	ATCGGC	2	12	409501	409512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309716
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10357	NC_014323	TGGGC	2	10	409560	409569	0 %	20 %	60 %	20 %	300309716
10358	NC_014323	CAT	2	6	409575	409580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309716
10359	NC_014323	GC	3	6	409585	409590	0 %	0 %	50 %	50 %	300309716
10360	NC_014323	ATC	2	6	409612	409617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309716
10361	NC_014323	CCT	2	6	409638	409643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309716
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10363	NC_014323	CAA	2	6	409677	409682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309716
10364	NC_014323	TGC	2	6	409688	409693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309716
10365	NC_014323	C	6	6	409740	409745	0 %	0 %	0 %	100 %	300309717
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10383	NC_014323	GCTGC	2	10	410688	410697	0 %	20 %	40 %	40 %	300309718
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10481	NC_014323	GC	3	6	415055	415060	0 %	0 %	50 %	50 %	300309721
10482	NC_014323	CAT	2	6	415130	415135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309721
10483	NC_014323	CTGG	2	8	415370	415377	0 %	25 %	50 %	25 %	300309721
10484	NC_014323	GCC	2	6	415383	415388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309721
10485	NC_014323	CTGGC	2	10	415479	415488	0 %	20 %	40 %	40 %	300309721
10486	NC_014323	ACC	2	6	415503	415508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309721
10487	NC_014323	TAC	2	6	415509	415514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309721
10488	NC_014323	CCAC	2	8	415531	415538	25 %	0 %	0 %	75 %	300309721
10489	NC_014323	CGG	2	6	415589	415594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309721
10490	NC_014323	GCCG	2	8	415631	415638	0 %	0 %	50 %	50 %	300309721
10491	NC_014323	CGG	2	6	415666	415671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309721
10492	NC_014323	GCG	2	6	415695	415700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309721
10493	NC_014323	CGGTC	2	10	415712	415721	0 %	20 %	40 %	40 %	300309721
10494	NC_014323	GTAA	2	8	415778	415785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10495	NC_014323	CTG	2	6	415807	415812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10496	NC_014323	GAT	2	6	415818	415823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10497	NC_014323	CGC	2	6	415931	415936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10498	NC_014323	CCG	2	6	415953	415958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10499	NC_014323	TAAAG	2	10	415970	415979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_014323	GAT	2	6	416003	416008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309722

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