MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_014323	CCGAC	2	10	376142	376151	20 %	0 %	20 %	60 %	300309682
9502	NC_014323	GGC	2	6	376215	376220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309682
9503	NC_014323	CG	3	6	376232	376237	0 %	0 %	50 %	50 %	300309682
9504	NC_014323	CCA	2	6	376260	376265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309682
9505	NC_014323	GGT	2	6	376266	376271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309682
9506	NC_014323	CGG	2	6	376320	376325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309682
9507	NC_014323	GAT	2	6	376332	376337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309682
9508	NC_014323	TCT	2	6	376367	376372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309682
9509	NC_014323	GCCC	2	8	376377	376384	0 %	0 %	25 %	75 %	300309682
9510	NC_014323	GTG	2	6	376423	376428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309682
9511	NC_014323	AAG	2	6	376474	376479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309682
9512	NC_014323	AGG	2	6	376511	376516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309682
9513	NC_014323	GGC	2	6	376581	376586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9514	NC_014323	GCA	2	6	376660	376665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_014323	GCA	2	6	376689	376694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9516	NC_014323	GCA	2	6	376697	376702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9517	NC_014323	GCAA	2	8	376739	376746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9518	NC_014323	CAG	2	6	376777	376782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9519	NC_014323	GTC	2	6	376796	376801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9520	NC_014323	AT	3	6	376841	376846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_014323	TCA	2	6	376856	376861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309683
9522	NC_014323	ATC	2	6	376900	376905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309683
9523	NC_014323	GGC	2	6	376930	376935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309683
9524	NC_014323	GCA	2	6	376944	376949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309683
9525	NC_014323	CGC	2	6	376986	376991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309683
9526	NC_014323	GCC	2	6	377087	377092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309683
9527	NC_014323	GCGCG	2	10	377133	377142	0 %	0 %	60 %	40 %	300309683
9528	NC_014323	GCG	2	6	377171	377176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309683
9529	NC_014323	GCT	2	6	377191	377196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309683
9530	NC_014323	GTG	2	6	377200	377205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309683
9531	NC_014323	GGT	2	6	377244	377249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309683
9532	NC_014323	ATC	3	9	377338	377346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309683
9533	NC_014323	GAC	2	6	377377	377382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309683
9534	NC_014323	CAA	2	6	377421	377426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309683
9535	NC_014323	ATC	2	6	377449	377454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309683
9536	NC_014323	ACG	2	6	377486	377491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309683
9537	NC_014323	CAT	2	6	377499	377504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309683
9538	NC_014323	ATG	2	6	377524	377529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309683
9539	NC_014323	GGC	2	6	377568	377573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309683
9540	NC_014323	CGC	2	6	377591	377596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309683
9541	NC_014323	GC	3	6	377621	377626	0 %	0 %	50 %	50 %	300309683
9542	NC_014323	CGTG	2	8	377697	377704	0 %	25 %	50 %	25 %	300309683
9543	NC_014323	GAC	2	6	377749	377754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309683
9544	NC_014323	CGA	2	6	377763	377768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309683
9545	NC_014323	CGT	2	6	377781	377786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309683
9546	NC_014323	GGC	2	6	377881	377886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309683
9547	NC_014323	GCCT	2	8	377916	377923	0 %	25 %	25 %	50 %	300309683
9548	NC_014323	CGG	2	6	377925	377930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309683
9549	NC_014323	CGG	2	6	377942	377947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309683
9550	NC_014323	GC	4	8	377979	377986	0 %	0 %	50 %	50 %	300309683
9551	NC_014323	TCG	3	9	378049	378057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9552	NC_014323	GCA	2	6	378084	378089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9553	NC_014323	CGC	2	6	378116	378121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9554	NC_014323	GCG	2	6	378131	378136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9555	NC_014323	T	6	6	378137	378142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_014323	GC	3	6	378145	378150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9557	NC_014323	GCCC	2	8	378153	378160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9558	NC_014323	GCA	2	6	378204	378209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NC_014323	C	7	7	378220	378226	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9560	NC_014323	CGAGAC	2	12	378313	378324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309684
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9562	NC_014323	GCGT	2	8	378645	378652	0 %	25 %	50 %	25 %	300309684
9563	NC_014323	AGC	2	6	378693	378698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309684
9564	NC_014323	CTG	2	6	378746	378751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309684
9565	NC_014323	TGC	2	6	378768	378773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_014323	AAG	2	6	378782	378787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_014323	TGC	2	6	378794	378799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9568	NC_014323	ATTGC	2	10	378831	378840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9569	NC_014323	CTG	2	6	378846	378851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_014323	GAC	2	6	378862	378867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9571	NC_014323	CAA	2	6	378891	378896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_014323	CGGGG	2	10	378909	378918	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9573	NC_014323	ACC	2	6	378982	378987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309685
9574	NC_014323	CAT	2	6	379053	379058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309685
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9582	NC_014323	GCAGGA	2	12	379302	379313	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	300309685
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9588	NC_014323	CG	4	8	379516	379523	0 %	0 %	50 %	50 %	300309685
9589	NC_014323	GC	3	6	379573	379578	0 %	0 %	50 %	50 %	300309685
9590	NC_014323	CAT	2	6	379698	379703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309685
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9593	NC_014323	CTG	2	6	379777	379782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309685
9594	NC_014323	CCTC	2	8	379884	379891	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9595	NC_014323	GCAA	3	12	379894	379905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9596	NC_014323	GAA	2	6	379957	379962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_014323	T	6	6	379974	379979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_014323	ACT	2	6	379999	380004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309686
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9603	NC_014323	AG	3	6	380147	380152	50 %	0 %	50 %	0 %	300309686
9604	NC_014323	CAG	2	6	380255	380260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309686
9605	NC_014323	GCC	2	6	380298	380303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309686
9606	NC_014323	TGC	2	6	380306	380311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309686
9607	NC_014323	GC	3	6	380317	380322	0 %	0 %	50 %	50 %	300309686
9608	NC_014323	GCCT	2	8	380336	380343	0 %	25 %	25 %	50 %	300309686
9609	NC_014323	CTG	2	6	380399	380404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309686
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9611	NC_014323	CCGG	2	8	380584	380591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9612	NC_014323	CTG	2	6	380674	380679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309687
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9621	NC_014323	CACCG	2	10	381076	381085	20 %	0 %	20 %	60 %	300309687
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9623	NC_014323	CTC	2	6	381177	381182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309687
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9987	NC_014323	GGC	2	6	395395	395400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309700
9988	NC_014323	AAG	2	6	395426	395431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309700
9989	NC_014323	CAGGAT	2	12	395440	395451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300309700
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9991	NC_014323	GCG	2	6	395531	395536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309701
9992	NC_014323	TGCC	2	8	395545	395552	0 %	25 %	25 %	50 %	300309701
9993	NC_014323	AGGC	2	8	395557	395564	25 %	0 %	50 %	25 %	300309701
9994	NC_014323	GGC	2	6	395572	395577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309701
9995	NC_014323	GGC	2	6	395637	395642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309701
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9997	NC_014323	TCC	2	6	395803	395808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9998	NC_014323	GCC	2	6	395825	395830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9999	NC_014323	CTG	2	6	395831	395836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10000	NC_014323	GTC	2	6	395845	395850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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