MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_014323	GCC	2	6	356222	356227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309666
9003	NC_014323	GGC	2	6	356258	356263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309666
9004	NC_014323	CGC	2	6	356320	356325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309666
9005	NC_014323	CTG	2	6	356396	356401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309666
9006	NC_014323	GCC	2	6	356436	356441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309666
9007	NC_014323	TGG	2	6	356490	356495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309666
9008	NC_014323	GCA	2	6	356560	356565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309666
9009	NC_014323	TGG	2	6	356572	356577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309666
9010	NC_014323	GCCA	2	8	356619	356626	25 %	0 %	25 %	50 %	300309666
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9013	NC_014323	GTA	2	6	356687	356692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309666
9014	NC_014323	GCG	2	6	356725	356730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309666
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9016	NC_014323	CTGG	2	8	356765	356772	0 %	25 %	50 %	25 %	300309666
9017	NC_014323	TCA	2	6	356796	356801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309666
9018	NC_014323	TGG	2	6	356814	356819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309666
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9020	NC_014323	TCG	2	6	356894	356899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_014323	GAA	2	6	356908	356913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_014323	TGC	2	6	357048	357053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_014323	GCC	2	6	357091	357096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9024	NC_014323	AGG	2	6	357103	357108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_014323	CGG	2	6	357109	357114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_014323	GCG	2	6	357316	357321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9028	NC_014323	ATTCG	2	10	357405	357414	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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9030	NC_014323	GCC	3	9	357483	357491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309667
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9034	NC_014323	GCATCG	2	12	357532	357543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300309667
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9053	NC_014323	GCT	2	6	358328	358333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309667
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9055	NC_014323	GC	3	6	358360	358365	0 %	0 %	50 %	50 %	300309667
9056	NC_014323	CTGG	2	8	358376	358383	0 %	25 %	50 %	25 %	300309667
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9058	NC_014323	TCG	2	6	358480	358485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309667
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9066	NC_014323	ATT	2	6	358878	358883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300309668
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9081	NC_014323	TGA	2	6	359416	359421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9088	NC_014323	GT	3	6	359694	359699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_014323	TTA	2	6	359726	359731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9091	NC_014323	T	7	7	359814	359820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9098	NC_014323	GATGT	2	10	360228	360237	20 %	40 %	40 %	0 %	300309669
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9107	NC_014323	CG	3	6	360772	360777	0 %	0 %	50 %	50 %	300309670
9108	NC_014323	TGGC	2	8	360795	360802	0 %	25 %	50 %	25 %	300309670
9109	NC_014323	CGG	2	6	360805	360810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309670
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9114	NC_014323	TCAA	2	8	361015	361022	50 %	25 %	0 %	25 %	300309670
9115	NC_014323	GAA	2	6	361029	361034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309670
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9121	NC_014323	CCGCGC	2	12	361309	361320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309670
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9247	NC_014323	CGA	2	6	366208	366213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309674
9248	NC_014323	CGC	2	6	366217	366222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309674
9249	NC_014323	GCCGC	2	10	366245	366254	0 %	0 %	40 %	60 %	300309674
9250	NC_014323	CTT	2	6	366407	366412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309675
9251	NC_014323	TCA	2	6	366427	366432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309675
9252	NC_014323	CG	3	6	366438	366443	0 %	0 %	50 %	50 %	300309675
9253	NC_014323	CCG	2	6	366490	366495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309675
9254	NC_014323	GCG	2	6	366589	366594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309675
9255	NC_014323	CTGATC	2	12	366597	366608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300309675
9256	NC_014323	CTG	2	6	366627	366632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309675
9257	NC_014323	GGT	2	6	366722	366727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309675
9258	NC_014323	CG	3	6	366754	366759	0 %	0 %	50 %	50 %	300309675
9259	NC_014323	TGG	2	6	366790	366795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309675
9260	NC_014323	TCTCGG	2	12	366814	366825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309675
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9263	NC_014323	TCG	2	6	366985	366990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309675
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9270	NC_014323	GCG	2	6	367174	367179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309675
9271	NC_014323	GC	3	6	367240	367245	0 %	0 %	50 %	50 %	300309675
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9276	NC_014323	TGA	2	6	367345	367350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309675
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9278	NC_014323	GTT	2	6	367406	367411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309675
9279	NC_014323	CAT	2	6	367425	367430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309675
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9281	NC_014323	GGT	3	9	367463	367471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309675
9282	NC_014323	ATC	2	6	367482	367487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309675
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9332	NC_014323	TGC	2	6	369512	369517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309676
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9353	NC_014323	ATC	2	6	370212	370217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309677
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9356	NC_014323	GCT	5	15	370352	370366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309677
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9366	NC_014323	CTGG	2	8	370751	370758	0 %	25 %	50 %	25 %	300309677
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9484	NC_014323	ATCC	2	8	375513	375520	25 %	25 %	0 %	50 %	300309682
9485	NC_014323	GC	3	6	375522	375527	0 %	0 %	50 %	50 %	300309682
9486	NC_014323	GAA	2	6	375532	375537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309682
9487	NC_014323	TGG	2	6	375623	375628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309682
9488	NC_014323	CAAGGA	2	12	375633	375644	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	300309682
9489	NC_014323	CGG	2	6	375650	375655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309682
9490	NC_014323	CGAC	2	8	375701	375708	25 %	0 %	25 %	50 %	300309682
9491	NC_014323	CAG	2	6	375709	375714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309682
9492	NC_014323	CTG	2	6	375715	375720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309682
9493	NC_014323	TCG	2	6	375743	375748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309682
9494	NC_014323	CGGTG	2	10	375822	375831	0 %	20 %	60 %	20 %	300309682
9495	NC_014323	GTGC	2	8	375855	375862	0 %	25 %	50 %	25 %	300309682
9496	NC_014323	ACC	2	6	375928	375933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309682
9497	NC_014323	GTG	2	6	375952	375957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309682
9498	NC_014323	CGG	3	9	375969	375977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309682
9499	NC_014323	CAC	2	6	375978	375983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309682
9500	NC_014323	CCG	2	6	376022	376027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309682

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