MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 139543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014323	TGG	2	6	317816	317821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309640
8002	NC_014323	CCG	3	9	317831	317839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309640
8003	NC_014323	GGCCA	2	10	317842	317851	20 %	0 %	40 %	40 %	300309640
8004	NC_014323	ACC	2	6	317860	317865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309640
8005	NC_014323	GC	3	6	317872	317877	0 %	0 %	50 %	50 %	300309640
8006	NC_014323	CGA	2	6	317880	317885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309640
8007	NC_014323	AGC	2	6	317912	317917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309640
8008	NC_014323	CAA	2	6	317943	317948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309640
8009	NC_014323	CAT	2	6	317955	317960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309640
8010	NC_014323	GAG	2	6	317992	317997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309640
8011	NC_014323	ACGTCA	2	12	318014	318025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300309640
8012	NC_014323	CGC	3	9	318045	318053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309640
8013	NC_014323	TGC	2	6	318066	318071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309640
8014	NC_014323	CAT	2	6	318087	318092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309640
8015	NC_014323	GTC	2	6	318099	318104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309640
8016	NC_014323	CCA	2	6	318152	318157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309640
8017	NC_014323	GC	3	6	318168	318173	0 %	0 %	50 %	50 %	300309640
8018	NC_014323	CAC	2	6	318216	318221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309640
8019	NC_014323	CAT	2	6	318222	318227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309640
8020	NC_014323	CAG	2	6	318264	318269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309640
8021	NC_014323	CTG	2	6	318292	318297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309640
8022	NC_014323	TCCG	2	8	318321	318328	0 %	25 %	25 %	50 %	300309640
8023	NC_014323	GC	4	8	318337	318344	0 %	0 %	50 %	50 %	300309640
8024	NC_014323	GTG	2	6	318391	318396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309640
8025	NC_014323	CCG	2	6	318464	318469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_014323	CCTG	2	8	318476	318483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8027	NC_014323	T	6	6	318492	318497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_014323	CGG	2	6	318542	318547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_014323	TGT	2	6	318550	318555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_014323	CGC	2	6	318566	318571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_014323	AAG	2	6	318625	318630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_014323	GGCT	2	8	318688	318695	0 %	25 %	50 %	25 %	300309641
8033	NC_014323	CTG	3	9	318718	318726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309641
8034	NC_014323	TTC	2	6	318766	318771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309641
8035	NC_014323	CGA	2	6	318777	318782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309641
8036	NC_014323	CAGTT	2	10	318787	318796	20 %	40 %	20 %	20 %	300309641
8037	NC_014323	GCC	2	6	318839	318844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309641
8038	NC_014323	GCTC	2	8	318851	318858	0 %	25 %	25 %	50 %	300309641
8039	NC_014323	CTG	2	6	318865	318870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309641
8040	NC_014323	CTG	2	6	318931	318936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309641
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8042	NC_014323	GC	3	6	318972	318977	0 %	0 %	50 %	50 %	300309641
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8051	NC_014323	GCG	2	6	319254	319259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309641
8052	NC_014323	CGA	2	6	319260	319265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309641
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8054	NC_014323	CGG	2	6	319293	319298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309641
8055	NC_014323	TGGG	2	8	319352	319359	0 %	25 %	75 %	0 %	300309641
8056	NC_014323	GC	3	6	319501	319506	0 %	0 %	50 %	50 %	300309641
8057	NC_014323	AGC	2	6	319523	319528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309641
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8060	NC_014323	CTG	2	6	319597	319602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309641
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8084	NC_014323	GCAG	2	8	320461	320468	25 %	0 %	50 %	25 %	300309642
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8088	NC_014323	GGAC	2	8	320703	320710	25 %	0 %	50 %	25 %	300309642
8089	NC_014323	TGCA	2	8	320744	320751	25 %	25 %	25 %	25 %	300309642
8090	NC_014323	GGTG	2	8	320760	320767	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_014323	CGC	2	6	320863	320868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_014323	GGC	2	6	320875	320880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8098	NC_014323	AAC	2	6	320885	320890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8107	NC_014323	GC	3	6	321327	321332	0 %	0 %	50 %	50 %	300309643
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8123	NC_014323	CGG	2	6	321889	321894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309643
8124	NC_014323	CAT	2	6	321941	321946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309643
8125	NC_014323	TGG	2	6	321949	321954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309643
8126	NC_014323	CAC	2	6	321956	321961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309643
8127	NC_014323	GC	3	6	321983	321988	0 %	0 %	50 %	50 %	300309643
8128	NC_014323	CAT	2	6	322046	322051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309643
8129	NC_014323	TGC	2	6	322123	322128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309643
8130	NC_014323	TGC	3	9	322135	322143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309643
8131	NC_014323	GCC	2	6	322188	322193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309643
8132	NC_014323	TTG	2	6	322260	322265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309643
8133	NC_014323	TGG	2	6	322267	322272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309643
8134	NC_014323	ACCGCA	2	12	322318	322329	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300309643
8135	NC_014323	TGG	2	6	322372	322377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309643
8136	NC_014323	GGC	2	6	322385	322390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309643
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8141	NC_014323	GCA	2	6	322661	322666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309643
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8144	NC_014323	TGG	2	6	322864	322869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309643
8145	NC_014323	CG	3	6	322879	322884	0 %	0 %	50 %	50 %	300309643
8146	NC_014323	GCCGC	2	10	322887	322896	0 %	0 %	40 %	60 %	300309643
8147	NC_014323	CGGGTG	2	12	322920	322931	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300309643
8148	NC_014323	GCG	2	6	323025	323030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309643
8149	NC_014323	GCG	2	6	323061	323066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309643
8150	NC_014323	GCTGC	2	10	323070	323079	0 %	20 %	40 %	40 %	300309643
8151	NC_014323	GGC	2	6	323090	323095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309643
8152	NC_014323	GC	3	6	323100	323105	0 %	0 %	50 %	50 %	300309643
8153	NC_014323	CGC	2	6	323155	323160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309643
8154	NC_014323	ACG	2	6	323181	323186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309643
8155	NC_014323	GCC	2	6	323215	323220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8156	NC_014323	GCCTG	2	10	323318	323327	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8157	NC_014323	ATT	2	6	323332	323337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8158	NC_014323	GGGC	2	8	323424	323431	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8159	NC_014323	TTGC	2	8	323450	323457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8160	NC_014323	AGTC	2	8	323518	323525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8161	NC_014323	GCC	2	6	323542	323547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8162	NC_014323	T	6	6	323615	323620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8163	NC_014323	GAC	2	6	323627	323632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8164	NC_014323	CTC	2	6	323646	323651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8165	NC_014323	GCA	2	6	323673	323678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8166	NC_014323	GGC	2	6	323723	323728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8167	NC_014323	GATG	2	8	323801	323808	25 %	25 %	50 %	0 %	300309644
8168	NC_014323	TTC	2	6	323828	323833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309644
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8172	NC_014323	ACC	2	6	324054	324059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309644
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8182	NC_014323	CG	3	6	324754	324759	0 %	0 %	50 %	50 %	300309644
8183	NC_014323	GCG	2	6	324770	324775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309644
8184	NC_014323	GC	3	6	324797	324802	0 %	0 %	50 %	50 %	300309644
8185	NC_014323	CTGG	2	8	324812	324819	0 %	25 %	50 %	25 %	300309644
8186	NC_014323	TCA	2	6	324910	324915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309644
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8190	NC_014323	TAC	2	6	325068	325073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309644
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8193	NC_014323	AGCC	2	8	325140	325147	25 %	0 %	25 %	50 %	300309644
8194	NC_014323	TGG	2	6	325240	325245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309644
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8198	NC_014323	GCTG	2	8	325373	325380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8199	NC_014323	CTGT	2	8	325398	325405	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8200	NC_014323	AGG	2	6	325433	325438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8201	NC_014323	GAA	2	6	325447	325452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309645
8202	NC_014323	TCG	2	6	325458	325463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309645
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8204	NC_014323	GTC	2	6	325549	325554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309645
8205	NC_014323	CGG	2	6	325582	325587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309645
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8208	NC_014323	TCA	2	6	325641	325646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309645
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8213	NC_014323	CAT	2	6	325921	325926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309645
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8220	NC_014323	CAT	2	6	326209	326214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309645
8221	NC_014323	CGA	2	6	326236	326241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309645
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8224	NC_014323	TCA	2	6	326501	326506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309646
8225	NC_014323	GCT	2	6	326513	326518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309646
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8228	NC_014323	CGT	2	6	326607	326612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309646
8229	NC_014323	CCCA	2	8	326620	326627	25 %	0 %	0 %	75 %	300309646
8230	NC_014323	GC	3	6	326655	326660	0 %	0 %	50 %	50 %	300309646
8231	NC_014323	CT	3	6	326680	326685	0 %	50 %	0 %	50 %	300309646
8232	NC_014323	CCG	2	6	326702	326707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309646
8233	NC_014323	TTC	2	6	326713	326718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309646
8234	NC_014323	GCA	2	6	326726	326731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309646
8235	NC_014323	TGC	2	6	326771	326776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309646
8236	NC_014323	CGGCG	2	10	326830	326839	0 %	0 %	60 %	40 %	300309646
8237	NC_014323	TGC	2	6	326870	326875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309646
8238	NC_014323	GCAG	2	8	326886	326893	25 %	0 %	50 %	25 %	300309646
8239	NC_014323	GCTG	2	8	326901	326908	0 %	25 %	50 %	25 %	300309646
8240	NC_014323	GAA	2	6	327013	327018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309646
8241	NC_014323	GCG	2	6	327032	327037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309646
8242	NC_014323	GGAT	2	8	327038	327045	25 %	25 %	50 %	0 %	300309646
8243	NC_014323	T	7	7	327244	327250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8244	NC_014323	CTG	2	6	327344	327349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309647
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8246	NC_014323	GCCAG	2	10	327393	327402	20 %	0 %	40 %	40 %	300309647
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8487	NC_014323	TGT	2	6	336755	336760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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